MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Thermoanaerobacter brockii subsp. finnii Ako-1 chromosome

Total Repeats: 33167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014964	ATA	2	6	18	23	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014964	TAT	2	6	24	29	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014964	AGG	2	6	73	78	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014964	ATC	2	6	96	101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
5	NC_014964	CCA	2	6	150	155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
6	NC_014964	ACA	2	6	159	164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114858
7	NC_014964	ATT	2	6	194	199	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114858
8	NC_014964	GAT	2	6	200	205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114858
9	NC_014964	TAA	2	6	246	251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
10	NC_014964	ACG	2	6	276	281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
11	NC_014964	AGA	2	6	328	333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
12	NC_014964	GAA	3	9	335	343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
13	NC_014964	ACT	2	6	392	397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
14	NC_014964	GGA	2	6	527	532	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114858
15	NC_014964	GAC	2	6	659	664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
16	NC_014964	GAA	2	6	671	676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
17	NC_014964	TTC	2	6	705	710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114858
18	NC_014964	GAT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114858
19	NC_014964	AAG	2	6	753	758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
20	NC_014964	CAA	2	6	793	798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114858
21	NC_014964	ACC	2	6	823	828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
22	NC_014964	AGA	2	6	847	852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
23	NC_014964	CCA	2	6	899	904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114858
24	NC_014964	CGA	2	6	967	972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114858
25	NC_014964	TAA	2	6	1032	1037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
26	NC_014964	TAA	2	6	1117	1122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114858
27	NC_014964	GAA	2	6	1154	1159	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
28	NC_014964	AGA	2	6	1186	1191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
29	NC_014964	GAA	2	6	1292	1297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114858
30	NC_014964	TAC	2	6	1312	1317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114858
31	NC_014964	TAA	2	6	1477	1482	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014964	ATT	2	6	1503	1508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014964	TCT	2	6	1565	1570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014964	ACT	2	6	1580	1585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014964	TAT	2	6	1602	1607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014964	ATT	2	6	1679	1684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
37	NC_014964	ACT	2	6	1725	1730	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114859
38	NC_014964	TTC	2	6	1738	1743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114859
39	NC_014964	AGA	3	9	1835	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
40	NC_014964	TAG	2	6	1852	1857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114859
41	NC_014964	TAA	2	6	2062	2067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
42	NC_014964	AGA	2	6	2264	2269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
43	NC_014964	AAT	2	6	2496	2501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
44	NC_014964	TTA	2	6	2530	2535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
45	NC_014964	TCT	2	6	2541	2546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114859
46	NC_014964	GAT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114859
47	NC_014964	TTA	2	6	2631	2636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114859
48	NC_014964	GAA	3	9	2658	2666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114859
49	NC_014964	TAA	3	9	2701	2709	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114859
50	NC_014964	GGA	2	6	2861	2866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114860
51	NC_014964	TTA	2	6	3117	3122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
52	NC_014964	TAA	2	6	3181	3186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
53	NC_014964	ATT	2	6	3199	3204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
54	NC_014964	AAT	2	6	3218	3223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
55	NC_014964	ATA	2	6	3372	3377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114861
56	NC_014964	AAG	2	6	3379	3384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114861
57	NC_014964	TGT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114861
58	NC_014964	TGA	2	6	3542	3547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
59	NC_014964	TAG	2	6	3553	3558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
60	NC_014964	TGA	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114861
61	NC_014964	ATT	2	6	3592	3597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
62	NC_014964	CAG	2	6	3652	3657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114861
63	NC_014964	GAA	2	6	3702	3707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114861
64	NC_014964	ACA	2	6	3771	3776	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114861
65	NC_014964	ATT	2	6	3807	3812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114861
66	NC_014964	TTC	2	6	3839	3844	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114861
67	NC_014964	TAC	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114861
68	NC_014964	GTT	2	6	4074	4079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114861
69	NC_014964	GGC	2	6	4118	4123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320114862
70	NC_014964	ACT	2	6	4178	4183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114862
71	NC_014964	GAA	3	9	4217	4225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114862
72	NC_014964	TAT	2	6	4294	4299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114862
73	NC_014964	AAG	2	6	4333	4338	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114862
74	NC_014964	TTG	2	6	4398	4403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114863
75	NC_014964	AAG	2	6	4418	4423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
76	NC_014964	ATT	2	6	4451	4456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
77	NC_014964	GGA	2	6	4664	4669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
78	NC_014964	AGA	2	6	4714	4719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
79	NC_014964	TAT	2	6	4943	4948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
80	NC_014964	ATT	2	6	4974	4979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
81	NC_014964	CAG	2	6	5075	5080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114863
82	NC_014964	AGC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114863
83	NC_014964	AGT	2	6	5272	5277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114863
84	NC_014964	GAG	2	6	5339	5344	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
85	NC_014964	ATT	2	6	5346	5351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
86	NC_014964	AAG	3	9	5427	5435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
87	NC_014964	TGG	2	6	5444	5449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114863
88	NC_014964	CTA	2	6	5532	5537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114863
89	NC_014964	ATA	2	6	5553	5558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
90	NC_014964	AAG	2	6	5592	5597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
91	NC_014964	GCT	2	6	5690	5695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114863
92	NC_014964	ACA	2	6	5736	5741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114863
93	NC_014964	CTT	2	6	5759	5764	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114863
94	NC_014964	ATG	3	9	5765	5773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114863
95	NC_014964	GAA	2	6	5852	5857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
96	NC_014964	AAG	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
97	NC_014964	TAT	2	6	6245	6250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
98	NC_014964	ATA	2	6	6272	6277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
99	NC_014964	AGG	2	6	6295	6300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114863
100	NC_014964	ATT	2	6	6304	6309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114863
101	NC_014964	AGA	2	6	6334	6339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
102	NC_014964	ATA	2	6	6356	6361	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114863
103	NC_014964	GAA	2	6	6380	6385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114863
104	NC_014964	TTG	2	6	6688	6693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114864
105	NC_014964	TCT	2	6	6851	6856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114864
106	NC_014964	ATT	3	9	6875	6883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114864
107	NC_014964	CCA	2	6	6939	6944	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114864
108	NC_014964	ATC	2	6	6992	6997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114864
109	NC_014964	ATA	2	6	7069	7074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114864
110	NC_014964	CCG	2	6	7094	7099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320114864
111	NC_014964	GCT	2	6	7133	7138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114864
112	NC_014964	CCT	2	6	7205	7210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114864
113	NC_014964	TCT	2	6	7297	7302	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114864
114	NC_014964	TAA	2	6	7342	7347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114864
115	NC_014964	TCC	2	6	7387	7392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114865
116	NC_014964	CAT	2	6	7415	7420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114865
117	NC_014964	TTC	2	6	7455	7460	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
118	NC_014964	TTA	2	6	7583	7588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
119	NC_014964	TCT	2	6	7618	7623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
120	NC_014964	TTA	2	6	7702	7707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
121	NC_014964	TAT	2	6	7764	7769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
122	NC_014964	CAA	2	6	7863	7868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114865
123	NC_014964	CAG	2	6	7874	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320114865
124	NC_014964	GCT	2	6	7885	7890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114865
125	NC_014964	TAG	2	6	7997	8002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114865
126	NC_014964	TCT	2	6	8076	8081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
127	NC_014964	AGA	2	6	8127	8132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114865
128	NC_014964	TGT	2	6	8150	8155	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114865
129	NC_014964	TCA	2	6	8218	8223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114865
130	NC_014964	TGT	2	6	8286	8291	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114865
131	NC_014964	TTA	3	9	8336	8344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
132	NC_014964	TCT	2	6	8362	8367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
133	NC_014964	TTA	2	6	8417	8422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114865
134	NC_014964	AGT	2	6	8454	8459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114865
135	NC_014964	CTT	2	6	8486	8491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114865
136	NC_014964	TGT	2	6	8492	8497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114865
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141	NC_014964	TAC	2	6	8794	8799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014964	CTT	2	6	8805	8810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_014964	CAT	2	6	8811	8816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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222	NC_014964	AAT	2	6	14677	14682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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257	NC_014964	GAA	2	6	17281	17286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114871
258	NC_014964	ATT	2	6	17315	17320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114871
259	NC_014964	TAA	2	6	17406	17411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114871
260	NC_014964	ACA	2	6	17474	17479	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114871
261	NC_014964	AAT	2	6	17493	17498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114871
262	NC_014964	AAT	2	6	17517	17522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114871
263	NC_014964	GAA	2	6	17555	17560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114871
264	NC_014964	AAT	2	6	17596	17601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114871
265	NC_014964	TGT	2	6	17691	17696	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114871
266	NC_014964	AGG	2	6	17729	17734	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114871
267	NC_014964	TAA	2	6	17945	17950	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114872
268	NC_014964	CGG	2	6	17962	17967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320114872
269	NC_014964	TGT	2	6	18089	18094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114872
270	NC_014964	GGC	2	6	18170	18175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320114872
271	NC_014964	TGA	2	6	18587	18592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114872
272	NC_014964	GTT	2	6	18618	18623	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320114872
273	NC_014964	CTA	3	9	18871	18879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114872
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275	NC_014964	GCG	2	6	18945	18950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320114872
276	NC_014964	AGG	2	6	18985	18990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114872
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280	NC_014964	GAA	2	6	19328	19333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114873
281	NC_014964	AAT	2	6	19432	19437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320114873
282	NC_014964	TGG	2	6	19444	19449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114873
283	NC_014964	TGC	2	6	19499	19504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114874
284	NC_014964	AGA	2	6	19533	19538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
285	NC_014964	AGA	2	6	19563	19568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
286	NC_014964	TCT	2	6	19752	19757	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114874
287	NC_014964	CTG	2	6	19799	19804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114874
288	NC_014964	TCC	2	6	19812	19817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320114874
289	NC_014964	AAG	2	6	19823	19828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
290	NC_014964	TTA	2	6	19849	19854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114874
291	NC_014964	TGG	2	6	19893	19898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320114874
292	NC_014964	TTC	2	6	20067	20072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320114874
293	NC_014964	AGA	2	6	20094	20099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
294	NC_014964	AGA	2	6	20286	20291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
295	NC_014964	AAG	2	6	20347	20352	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114874
296	NC_014964	ATG	2	6	20386	20391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114874
297	NC_014964	TGC	2	6	20418	20423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320114874
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299	NC_014964	CAA	2	6	20509	20514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114874
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322	NC_014964	TAG	2	6	22689	22694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114876
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329	NC_014964	AGG	2	6	23440	23445	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320114876
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374	NC_014964	ATT	2	6	27056	27061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
375	NC_014964	TAA	2	6	27083	27088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
376	NC_014964	ATG	2	6	27319	27324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114880
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379	NC_014964	TAC	3	9	27632	27640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320114881
380	NC_014964	TAT	2	6	27653	27658	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320114881
381	NC_014964	ACC	2	6	27774	27779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320114881
382	NC_014964	ATG	2	6	27828	27833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320114881
383	NC_014964	AAG	2	6	27902	27907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320114881
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385	NC_014964	CAA	2	6	28126	28131	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320114881
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