MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 4503

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014962	CCCGG	2	10	548	557	0 %	0 %	40 %	60 %	320101556
2	NC_014962	GGTTG	2	10	738	747	0 %	40 %	60 %	0 %	320101556
3	NC_014962	GGTGG	2	10	1081	1090	0 %	20 %	80 %	0 %	320101556
4	NC_014962	CGTGG	2	10	1156	1165	0 %	20 %	60 %	20 %	320101556
5	NC_014962	ACCCA	2	10	1938	1947	40 %	0 %	0 %	60 %	320101557
6	NC_014962	GCGGG	2	10	2577	2586	0 %	0 %	80 %	20 %	320101557
7	NC_014962	CGGAT	2	10	3509	3518	20 %	20 %	40 %	20 %	320101558
8	NC_014962	GGCGG	2	10	4124	4133	0 %	0 %	80 %	20 %	320101559
9	NC_014962	CGATC	2	10	5663	5672	20 %	20 %	20 %	40 %	320101560
10	NC_014962	GGTCG	2	10	5769	5778	0 %	20 %	60 %	20 %	320101560
11	NC_014962	GGCCC	2	10	5918	5927	0 %	0 %	40 %	60 %	320101560
12	NC_014962	CCTGC	2	10	7001	7010	0 %	20 %	20 %	60 %	320101561
13	NC_014962	TTGAT	2	10	9556	9565	20 %	60 %	20 %	0 %	320101561
14	NC_014962	CGATC	2	10	10645	10654	20 %	20 %	20 %	40 %	320101562
15	NC_014962	GCGTC	2	10	11695	11704	0 %	20 %	40 %	40 %	320101564
16	NC_014962	TCGCG	2	10	12394	12403	0 %	20 %	40 %	40 %	320101565
17	NC_014962	AGGGC	2	10	12496	12505	20 %	0 %	60 %	20 %	320101565
18	NC_014962	TGCGG	2	10	15237	15246	0 %	20 %	60 %	20 %	320101566
19	NC_014962	CGACC	2	10	16197	16206	20 %	0 %	20 %	60 %	320101567
20	NC_014962	CGAAC	2	10	16669	16678	40 %	0 %	20 %	40 %	320101567
21	NC_014962	GCGCG	2	10	18167	18176	0 %	0 %	60 %	40 %	320101569
22	NC_014962	CACCG	2	10	18461	18470	20 %	0 %	20 %	60 %	320101569
23	NC_014962	CGCGG	2	10	19434	19443	0 %	0 %	60 %	40 %	320101570
24	NC_014962	GGCGC	2	10	20114	20123	0 %	0 %	60 %	40 %	320101570
25	NC_014962	CTTGG	2	10	20360	20369	0 %	40 %	40 %	20 %	320101570
26	NC_014962	CCGCG	2	10	22285	22294	0 %	0 %	40 %	60 %	320101572
27	NC_014962	CGATC	2	10	23407	23416	20 %	20 %	20 %	40 %	320101574
28	NC_014962	TCGAG	2	10	24498	24507	20 %	20 %	40 %	20 %	320101575
29	NC_014962	TCCGA	2	10	25732	25741	20 %	20 %	20 %	40 %	320101576
30	NC_014962	CCGCT	3	15	25743	25757	0 %	20 %	20 %	60 %	320101576
31	NC_014962	CCGGC	2	10	25792	25801	0 %	0 %	40 %	60 %	320101576
32	NC_014962	GGAAC	2	10	25836	25845	40 %	0 %	40 %	20 %	320101576
33	NC_014962	CTCGA	2	10	27090	27099	20 %	20 %	20 %	40 %	320101578
34	NC_014962	CCCGC	2	10	29730	29739	0 %	0 %	20 %	80 %	320101581
35	NC_014962	CGAAC	2	10	30019	30028	40 %	0 %	20 %	40 %	320101581
36	NC_014962	GTTGA	2	10	32417	32426	20 %	40 %	40 %	0 %	320101582
37	NC_014962	GAGCC	2	10	34371	34380	20 %	0 %	40 %	40 %	320101583
38	NC_014962	CGGCC	2	10	35529	35538	0 %	0 %	40 %	60 %	320101584
39	NC_014962	GGCCC	2	10	37456	37465	0 %	0 %	40 %	60 %	320101586
40	NC_014962	CCCAG	2	10	37621	37630	20 %	0 %	20 %	60 %	320101586
41	NC_014962	GGGGC	2	10	38045	38054	0 %	0 %	80 %	20 %	320101586
42	NC_014962	GTTGG	2	10	38647	38656	0 %	40 %	60 %	0 %	320101586
43	NC_014962	TCCGC	2	10	41479	41488	0 %	20 %	20 %	60 %	320101590
44	NC_014962	GCCCG	2	10	43176	43185	0 %	0 %	40 %	60 %	320101591
45	NC_014962	CCGCT	2	10	46180	46189	0 %	20 %	20 %	60 %	320101593
46	NC_014962	CGCGC	2	10	47317	47326	0 %	0 %	40 %	60 %	320101594
47	NC_014962	GATCG	2	10	47444	47453	20 %	20 %	40 %	20 %	320101594
48	NC_014962	GCTCC	2	10	48500	48509	0 %	20 %	20 %	60 %	320101597
49	NC_014962	ACCCC	2	10	50993	51002	20 %	0 %	0 %	80 %	320101597
50	NC_014962	GCTCC	2	10	53498	53507	0 %	20 %	20 %	60 %	320101597
51	NC_014962	CGACC	2	10	57678	57687	20 %	0 %	20 %	60 %	320101599
52	NC_014962	ACGCC	2	10	57866	57875	20 %	0 %	20 %	60 %	320101599
53	NC_014962	CCCAC	2	10	62448	62457	20 %	0 %	0 %	80 %	320101601
54	NC_014962	CAAAC	2	10	63870	63879	60 %	0 %	0 %	40 %	320101602
55	NC_014962	GACCC	2	10	64503	64512	20 %	0 %	20 %	60 %	320101602
56	NC_014962	GGTTT	2	10	64555	64564	0 %	60 %	40 %	0 %	320101602
57	NC_014962	CAGCG	2	10	66252	66261	20 %	0 %	40 %	40 %	320101603
58	NC_014962	TGCGG	2	10	66685	66694	0 %	20 %	60 %	20 %	320101603
59	NC_014962	ACCGC	2	10	67747	67756	20 %	0 %	20 %	60 %	320101604
60	NC_014962	TCCCC	2	10	71834	71843	0 %	20 %	0 %	80 %	320101607
61	NC_014962	CGCGG	2	10	71952	71961	0 %	0 %	60 %	40 %	320101607
62	NC_014962	CGTCA	2	10	72548	72557	20 %	20 %	20 %	40 %	320101607
63	NC_014962	TTGGT	2	10	73502	73511	0 %	60 %	40 %	0 %	320101608
64	NC_014962	CGTCG	2	10	73779	73788	0 %	20 %	40 %	40 %	320101608
65	NC_014962	TCCGA	2	10	77087	77096	20 %	20 %	20 %	40 %	320101610
66	NC_014962	GCGAC	2	10	77716	77725	20 %	0 %	40 %	40 %	320101610
67	NC_014962	GCGGT	2	10	78587	78596	0 %	20 %	60 %	20 %	320101610
68	NC_014962	CGGGG	2	10	80290	80299	0 %	0 %	80 %	20 %	320101612
69	NC_014962	CATGA	2	10	82874	82883	40 %	20 %	20 %	20 %	320101613
70	NC_014962	CGATC	2	10	84638	84647	20 %	20 %	20 %	40 %	320101614
71	NC_014962	CGATC	2	10	85172	85181	20 %	20 %	20 %	40 %	320101614
72	NC_014962	AGGCC	2	10	85896	85905	20 %	0 %	40 %	40 %	320101615
73	NC_014962	CGGTA	2	10	86488	86497	20 %	20 %	40 %	20 %	320101615
74	NC_014962	CCAAC	2	10	89476	89485	40 %	0 %	0 %	60 %	320101617
75	NC_014962	GTCGA	2	10	93777	93786	20 %	20 %	40 %	20 %	320101621
76	NC_014962	GGCGC	2	10	94042	94051	0 %	0 %	60 %	40 %	320101621
77	NC_014962	GGGCG	2	10	94663	94672	0 %	0 %	80 %	20 %	320101622
78	NC_014962	GTGGA	2	10	95317	95326	20 %	20 %	60 %	0 %	320101622
79	NC_014962	CGTCG	2	10	95950	95959	0 %	20 %	40 %	40 %	320101622
80	NC_014962	ATGAG	2	10	96021	96030	40 %	20 %	40 %	0 %	320101622
81	NC_014962	TGGGG	2	10	97522	97531	0 %	20 %	80 %	0 %	320101623
82	NC_014962	CGTGG	2	10	100415	100424	0 %	20 %	60 %	20 %	320101623
83	NC_014962	CGTGA	2	10	101359	101368	20 %	20 %	40 %	20 %	320101624
84	NC_014962	GTTGA	2	10	103933	103942	20 %	40 %	40 %	0 %	320101627
85	NC_014962	TTCCC	2	10	104936	104945	0 %	40 %	0 %	60 %	320101627
86	NC_014962	ACGGC	2	10	105119	105128	20 %	0 %	40 %	40 %	320101627
87	NC_014962	CGCCC	2	10	106126	106135	0 %	0 %	20 %	80 %	320101628
88	NC_014962	GCTGG	2	10	106591	106600	0 %	20 %	60 %	20 %	320101628
89	NC_014962	TGACG	2	10	107051	107060	20 %	20 %	40 %	20 %	320101628
90	NC_014962	GCCAA	2	10	107439	107448	40 %	0 %	20 %	40 %	320101629
91	NC_014962	CCGGT	2	10	109296	109305	0 %	20 %	40 %	40 %	320101631
92	NC_014962	TTTGA	2	10	109546	109555	20 %	60 %	20 %	0 %	320101631
93	NC_014962	CGAGG	2	10	109861	109870	20 %	0 %	60 %	20 %	320101631
94	NC_014962	GTGCT	2	10	111937	111946	0 %	40 %	40 %	20 %	320101633
95	NC_014962	CTTCG	2	10	112750	112759	0 %	40 %	20 %	40 %	320101633
96	NC_014962	CGCGT	2	10	114091	114100	0 %	20 %	40 %	40 %	320101634
97	NC_014962	GTTGG	2	10	114228	114237	0 %	40 %	60 %	0 %	320101635
98	NC_014962	CGGGC	2	10	114247	114256	0 %	0 %	60 %	40 %	320101635
99	NC_014962	CGGTC	2	10	114883	114892	0 %	20 %	40 %	40 %	320101635
100	NC_014962	CGATC	2	10	116474	116483	20 %	20 %	20 %	40 %	320101636
101	NC_014962	CCGAC	2	10	117820	117829	20 %	0 %	20 %	60 %	320101637
102	NC_014962	CTTGA	2	10	119921	119930	20 %	40 %	20 %	20 %	320101638
103	NC_014962	TGACG	2	10	125426	125435	20 %	20 %	40 %	20 %	320101642
104	NC_014962	CGCGG	2	10	127264	127273	0 %	0 %	60 %	40 %	320101643
105	NC_014962	GGCGG	2	10	130094	130103	0 %	0 %	80 %	20 %	320101644
106	NC_014962	TTACC	2	10	130876	130885	20 %	40 %	0 %	40 %	320101644
107	NC_014962	CCACA	2	10	131423	131432	40 %	0 %	0 %	60 %	320101645
108	NC_014962	CGCCC	2	10	132567	132576	0 %	0 %	20 %	80 %	320101645
109	NC_014962	CGCAG	2	10	133331	133340	20 %	0 %	40 %	40 %	320101646
110	NC_014962	CGCGG	2	10	133586	133595	0 %	0 %	60 %	40 %	320101647
111	NC_014962	GTCGC	2	10	133878	133887	0 %	20 %	40 %	40 %	320101647
112	NC_014962	GCTCG	2	10	134386	134395	0 %	20 %	40 %	40 %	320101647
113	NC_014962	GGCCC	2	10	134645	134654	0 %	0 %	40 %	60 %	320101648
114	NC_014962	CCGAA	2	10	134818	134827	40 %	0 %	20 %	40 %	320101648
115	NC_014962	CCGGC	2	10	138642	138651	0 %	0 %	40 %	60 %	320101650
116	NC_014962	GGATG	2	10	139308	139317	20 %	20 %	60 %	0 %	320101651
117	NC_014962	GCCGG	2	10	140299	140308	0 %	0 %	60 %	40 %	320101651
118	NC_014962	TAGGG	2	10	142777	142786	20 %	20 %	60 %	0 %	320101653
119	NC_014962	TGACC	2	10	143171	143180	20 %	20 %	20 %	40 %	320101653
120	NC_014962	GCTGG	2	10	143670	143679	0 %	20 %	60 %	20 %	320101653
121	NC_014962	TCGGG	2	10	143918	143927	0 %	20 %	60 %	20 %	320101653
122	NC_014962	CGCGT	2	10	144041	144050	0 %	20 %	40 %	40 %	320101653
123	NC_014962	CGCGG	2	10	147007	147016	0 %	0 %	60 %	40 %	320101654
124	NC_014962	TGCGC	2	10	147267	147276	0 %	20 %	40 %	40 %	320101654
125	NC_014962	CGCGA	2	10	147430	147439	20 %	0 %	40 %	40 %	320101654
126	NC_014962	CTGAC	2	10	148311	148320	20 %	20 %	20 %	40 %	320101655
127	NC_014962	AGCCA	2	10	152905	152914	40 %	0 %	20 %	40 %	320101659
128	NC_014962	GATCG	2	10	153072	153081	20 %	20 %	40 %	20 %	320101659
129	NC_014962	TTGAC	2	10	162980	162989	20 %	40 %	20 %	20 %	320101666
130	NC_014962	CACGT	2	10	163533	163542	20 %	20 %	20 %	40 %	320101667
131	NC_014962	GTCGC	2	10	165074	165083	0 %	20 %	40 %	40 %	320101668
132	NC_014962	GGCGA	2	10	166594	166603	20 %	0 %	60 %	20 %	320101669
133	NC_014962	GCCCG	2	10	166888	166897	0 %	0 %	40 %	60 %	320101669
134	NC_014962	TGGGA	2	10	168165	168174	20 %	20 %	60 %	0 %	320101670
135	NC_014962	ACACG	2	10	168243	168252	40 %	0 %	20 %	40 %	320101670
136	NC_014962	AGTCG	2	10	168969	168978	20 %	20 %	40 %	20 %	320101670
137	NC_014962	ACCAC	2	10	170307	170316	40 %	0 %	0 %	60 %	320101672
138	NC_014962	GGGAT	2	10	171265	171274	20 %	20 %	60 %	0 %	320101673
139	NC_014962	GATCA	2	10	171717	171726	40 %	20 %	20 %	20 %	320101673
140	NC_014962	TAGCA	2	10	171737	171746	40 %	20 %	20 %	20 %	320101673
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199	NC_014962	CGGTT	2	10	232110	232119	0 %	40 %	40 %	20 %	320101708
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243	NC_014962	GGCGT	2	10	278444	278453	0 %	20 %	60 %	20 %	320101742
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249	NC_014962	CAACC	2	10	286272	286281	40 %	0 %	0 %	60 %	320101748
250	NC_014962	CGGGG	2	10	286760	286769	0 %	0 %	80 %	20 %	320101749
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252	NC_014962	CGGCG	2	10	287852	287861	0 %	0 %	60 %	40 %	320101749
253	NC_014962	CCCGC	2	10	290222	290231	0 %	0 %	20 %	80 %	320101752
254	NC_014962	GGCGG	2	10	292889	292898	0 %	0 %	80 %	20 %	320101754
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256	NC_014962	GCCCG	2	10	301030	301039	0 %	0 %	40 %	60 %	320101758
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260	NC_014962	ATGGG	2	10	303248	303257	20 %	20 %	60 %	0 %	320101761
261	NC_014962	CCAGA	2	10	305574	305583	40 %	0 %	20 %	40 %	320101763
262	NC_014962	GGCCG	2	10	306971	306980	0 %	0 %	60 %	40 %	320101764
263	NC_014962	TGAGG	2	10	307824	307833	20 %	20 %	60 %	0 %	320101766
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