MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 chromosome

Total Repeats: 15452

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014962	GACG	2	8	192	199	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_014962	CAAC	2	8	496	503	50 %	0 %	0 %	50 %	320101556
3	NC_014962	GTCG	2	8	534	541	0 %	25 %	50 %	25 %	320101556
4	NC_014962	AGGG	2	8	998	1005	25 %	0 %	75 %	0 %	320101556
5	NC_014962	GCTG	2	8	1248	1255	0 %	25 %	50 %	25 %	320101556
6	NC_014962	ACAA	2	8	1702	1709	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014962	CGCC	2	8	1721	1728	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8	NC_014962	CGGA	2	8	1804	1811	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014962	GCGG	2	8	1899	1906	0 %	0 %	75 %	25 %	320101557
10	NC_014962	GACC	2	8	2234	2241	25 %	0 %	25 %	50 %	320101557
11	NC_014962	GGTG	2	8	2997	3004	0 %	25 %	75 %	0 %	320101558
12	NC_014962	CGGG	2	8	3012	3019	0 %	0 %	75 %	25 %	320101558
13	NC_014962	GTGG	2	8	3022	3029	0 %	25 %	75 %	0 %	320101558
14	NC_014962	TCTT	2	8	3758	3765	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_014962	GTTG	2	8	3822	3829	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014962	GGCA	2	8	4300	4307	25 %	0 %	50 %	25 %	320101559
17	NC_014962	TCGA	2	8	4932	4939	25 %	25 %	25 %	25 %	320101559
18	NC_014962	ATCT	2	8	5910	5917	25 %	50 %	0 %	25 %	320101560
19	NC_014962	TGGA	2	8	6001	6008	25 %	25 %	50 %	0 %	320101560
20	NC_014962	GACC	2	8	6677	6684	25 %	0 %	25 %	50 %	320101561
21	NC_014962	TCGA	2	8	7209	7216	25 %	25 %	25 %	25 %	320101561
22	NC_014962	CGGG	2	8	7388	7395	0 %	0 %	75 %	25 %	320101561
23	NC_014962	GTCG	2	8	7646	7653	0 %	25 %	50 %	25 %	320101561
24	NC_014962	GTCG	2	8	7862	7869	0 %	25 %	50 %	25 %	320101561
25	NC_014962	GGGC	3	12	8681	8692	0 %	0 %	75 %	25 %	320101561
26	NC_014962	CCTC	2	8	8924	8931	0 %	25 %	0 %	75 %	320101561
27	NC_014962	CCGG	2	8	9386	9393	0 %	0 %	50 %	50 %	320101561
28	NC_014962	CCGC	2	8	9457	9464	0 %	0 %	25 %	75 %	320101561
29	NC_014962	CCCT	2	8	9868	9875	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
30	NC_014962	TTCC	2	8	9969	9976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014962	TGAA	2	8	10011	10018	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014962	CAGT	2	8	10484	10491	25 %	25 %	25 %	25 %	320101562
33	NC_014962	ACCG	2	8	10553	10560	25 %	0 %	25 %	50 %	320101562
34	NC_014962	GCCC	2	8	11132	11139	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014962	TCCC	2	8	11168	11175	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_014962	GAAA	2	8	11208	11215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014962	AGCG	2	8	11457	11464	25 %	0 %	50 %	25 %	320101563
38	NC_014962	TCAA	2	8	11622	11629	50 %	25 %	0 %	25 %	320101563
39	NC_014962	GGGT	2	8	11774	11781	0 %	25 %	75 %	0 %	320101564
40	NC_014962	GGAT	2	8	11835	11842	25 %	25 %	50 %	0 %	320101564
41	NC_014962	CGAG	2	8	12165	12172	25 %	0 %	50 %	25 %	320101564
42	NC_014962	TGGC	2	8	12438	12445	0 %	25 %	50 %	25 %	320101565
43	NC_014962	CCTT	2	8	12945	12952	0 %	50 %	0 %	50 %	320101565
44	NC_014962	CCGA	2	8	13155	13162	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014962	AATC	2	8	13310	13317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_014962	CGAA	2	8	13333	13340	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014962	GGTT	2	8	13507	13514	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014962	GTCG	2	8	14292	14299	0 %	25 %	50 %	25 %	320101566
49	NC_014962	GCCC	2	8	15169	15176	0 %	0 %	25 %	75 %	320101566
50	NC_014962	GGCG	2	8	15416	15423	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014962	CCGC	2	8	15626	15633	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_014962	CCCG	2	8	15895	15902	0 %	0 %	25 %	75 %	320101567
53	NC_014962	CTTC	2	8	16895	16902	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014962	GGGT	2	8	17039	17046	0 %	25 %	75 %	0 %	320101568
55	NC_014962	CGAC	2	8	17172	17179	25 %	0 %	25 %	50 %	320101568
56	NC_014962	GCCC	2	8	17418	17425	0 %	0 %	25 %	75 %	320101568
57	NC_014962	TCGC	2	8	17890	17897	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014962	CGCC	2	8	18085	18092	0 %	0 %	25 %	75 %	320101569
59	NC_014962	GCCG	2	8	18491	18498	0 %	0 %	50 %	50 %	320101569
60	NC_014962	GCTG	2	8	18653	18660	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014962	ATGA	2	8	18683	18690	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014962	GAGG	2	8	18835	18842	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014962	GATG	2	8	18890	18897	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014962	CACG	2	8	19108	19115	25 %	0 %	25 %	50 %	320101570
65	NC_014962	GTCA	2	8	19515	19522	25 %	25 %	25 %	25 %	320101570
66	NC_014962	GAGT	2	8	19537	19544	25 %	25 %	50 %	0 %	320101570
67	NC_014962	AACC	2	8	20799	20806	50 %	0 %	0 %	50 %	320101571
68	NC_014962	ACCA	2	8	22097	22104	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014962	TCGG	2	8	22392	22399	0 %	25 %	50 %	25 %	320101573
70	NC_014962	AAAC	2	8	22454	22461	75 %	0 %	0 %	25 %	320101573
71	NC_014962	GAGT	2	8	23298	23305	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014962	TCAT	2	8	23306	23313	25 %	50 %	0 %	25 %	320101574
73	NC_014962	GCGG	2	8	23564	23571	0 %	0 %	75 %	25 %	320101574
74	NC_014962	ATCC	2	8	23902	23909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014962	GAAC	2	8	23956	23963	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014962	AGCC	2	8	24679	24686	25 %	0 %	25 %	50 %	320101575
77	NC_014962	GGCG	2	8	24996	25003	0 %	0 %	75 %	25 %	320101575
78	NC_014962	CGAC	2	8	25044	25051	25 %	0 %	25 %	50 %	320101575
79	NC_014962	GCGG	2	8	25306	25313	0 %	0 %	75 %	25 %	320101575
80	NC_014962	GACG	2	8	25360	25367	25 %	0 %	50 %	25 %	320101575
81	NC_014962	CAAC	2	8	25608	25615	50 %	0 %	0 %	50 %	320101576
82	NC_014962	GGTC	2	8	26158	26165	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014962	GTAG	2	8	26323	26330	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014962	CCTG	2	8	26561	26568	0 %	25 %	25 %	50 %	320101577
85	NC_014962	TCGT	2	8	27049	27056	0 %	50 %	25 %	25 %	320101577
86	NC_014962	ACGG	2	8	27110	27117	25 %	0 %	50 %	25 %	320101578
87	NC_014962	GTCG	2	8	27162	27169	0 %	25 %	50 %	25 %	320101578
88	NC_014962	TCTT	2	8	27193	27200	0 %	75 %	0 %	25 %	320101578
89	NC_014962	AGGC	2	8	27480	27487	25 %	0 %	50 %	25 %	320101579
90	NC_014962	CAGA	2	8	27668	27675	50 %	0 %	25 %	25 %	320101579
91	NC_014962	GGCG	2	8	27745	27752	0 %	0 %	75 %	25 %	320101579
92	NC_014962	CCGT	2	8	28088	28095	0 %	25 %	25 %	50 %	320101579
93	NC_014962	CGGG	2	8	28174	28181	0 %	0 %	75 %	25 %	320101579
94	NC_014962	ATCA	2	8	28300	28307	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014962	GCCG	2	8	28580	28587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014962	CCCA	2	8	29235	29242	25 %	0 %	0 %	75 %	320101580
97	NC_014962	CGCC	2	8	29428	29435	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014962	CCGC	2	8	29766	29773	0 %	0 %	25 %	75 %	320101581
99	NC_014962	CAGG	2	8	29792	29799	25 %	0 %	50 %	25 %	320101581
100	NC_014962	ACAG	2	8	30055	30062	50 %	0 %	25 %	25 %	320101581
101	NC_014962	CGAA	2	8	30146	30153	50 %	0 %	25 %	25 %	320101581
102	NC_014962	TGGT	2	8	31092	31099	0 %	50 %	50 %	0 %	320101582
103	NC_014962	AGCC	2	8	31650	31657	25 %	0 %	25 %	50 %	320101582
104	NC_014962	CTTG	2	8	31891	31898	0 %	50 %	25 %	25 %	320101582
105	NC_014962	CGGC	2	8	31918	31925	0 %	0 %	50 %	50 %	320101582
106	NC_014962	AAGG	2	8	32606	32613	50 %	0 %	50 %	0 %	320101582
107	NC_014962	GTCG	2	8	34046	34053	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014962	GTGG	2	8	34162	34169	0 %	25 %	75 %	0 %	320101583
109	NC_014962	CGGG	3	12	34256	34267	0 %	0 %	75 %	25 %	320101583
110	NC_014962	CGCT	2	8	34951	34958	0 %	25 %	25 %	50 %	320101583
111	NC_014962	GGGC	2	8	36058	36065	0 %	0 %	75 %	25 %	320101585
112	NC_014962	GGCG	2	8	36627	36634	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014962	GCCA	2	8	37707	37714	25 %	0 %	25 %	50 %	320101586
114	NC_014962	CGTG	2	8	39684	39691	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_014962	CGAG	2	8	40134	40141	25 %	0 %	50 %	25 %	320101590
116	NC_014962	GTCG	2	8	42169	42176	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
117	NC_014962	GCGG	2	8	43068	43075	0 %	0 %	75 %	25 %	320101591
118	NC_014962	GGGC	2	8	43382	43389	0 %	0 %	75 %	25 %	320101591
119	NC_014962	GGCC	2	8	43529	43536	0 %	0 %	50 %	50 %	320101591
120	NC_014962	GCTC	2	8	43618	43625	0 %	25 %	25 %	50 %	320101591
121	NC_014962	CCGA	2	8	43682	43689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014962	ACCG	2	8	44135	44142	25 %	0 %	25 %	50 %	320101592
123	NC_014962	CGCC	2	8	44356	44363	0 %	0 %	25 %	75 %	320101592
124	NC_014962	GCGG	2	8	44383	44390	0 %	0 %	75 %	25 %	320101592
125	NC_014962	TCGC	2	8	45139	45146	0 %	25 %	25 %	50 %	320101593
126	NC_014962	GCTG	2	8	45439	45446	0 %	25 %	50 %	25 %	320101593
127	NC_014962	GGTC	2	8	46447	46454	0 %	25 %	50 %	25 %	320101593
128	NC_014962	GATC	2	8	46905	46912	25 %	25 %	25 %	25 %	320101594
129	NC_014962	TGCT	2	8	47498	47505	0 %	50 %	25 %	25 %	320101595
130	NC_014962	TCGC	2	8	48170	48177	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_014962	TCCC	2	8	48349	48356	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_014962	TCCC	2	8	48361	48368	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_014962	TTCG	2	8	48416	48423	0 %	50 %	25 %	25 %	320101597
134	NC_014962	GGCT	2	8	48996	49003	0 %	25 %	50 %	25 %	320101597
135	NC_014962	CGGA	2	8	49188	49195	25 %	0 %	50 %	25 %	320101597
136	NC_014962	TTCG	2	8	49204	49211	0 %	50 %	25 %	25 %	320101597
137	NC_014962	CGAT	2	8	49236	49243	25 %	25 %	25 %	25 %	320101597
138	NC_014962	GGGC	2	8	49426	49433	0 %	0 %	75 %	25 %	320101597
139	NC_014962	ACCC	2	8	50070	50077	25 %	0 %	0 %	75 %	320101597
140	NC_014962	CCGC	2	8	50363	50370	0 %	0 %	25 %	75 %	320101597
141	NC_014962	ATCC	2	8	50373	50380	25 %	25 %	0 %	50 %	320101597
142	NC_014962	GGGC	2	8	50623	50630	0 %	0 %	75 %	25 %	320101597
143	NC_014962	CCAC	2	8	51125	51132	25 %	0 %	0 %	75 %	320101597
144	NC_014962	CCTT	2	8	51150	51157	0 %	50 %	0 %	50 %	320101597
145	NC_014962	ATCT	2	8	52385	52392	25 %	50 %	0 %	25 %	320101597
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