MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 85

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014961	AGGGT	2	10	4437	4446	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014961	CCGGC	2	10	58166	58175	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
3	NC_014961	GAGGG	2	10	59004	59013	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014961	GGCCC	2	10	59021	59030	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014961	GGGTC	2	10	59034	59043	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014961	GGCTC	2	10	59347	59356	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014961	CCAAA	2	10	59588	59597	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_014961	ACGGC	2	10	59914	59923	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014961	CAGCC	2	10	60308	60317	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_014961	CCAGG	2	10	61175	61184	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014961	CCTGG	2	10	61489	61498	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014961	GCGTA	2	10	61605	61614	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014961	GTCAT	2	10	63439	63448	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014961	CCGCC	2	10	86535	86544	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_014961	AATAG	2	10	90117	90126	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014961	CCCGG	2	10	101748	101757	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014961	AAGTA	3	15	108103	108117	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014961	TACAT	2	10	113378	113387	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014961	AGGGG	2	10	156274	156283	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014961	ACCAT	2	10	208636	208645	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014961	GCACT	2	10	314478	314487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014961	AGGGG	2	10	332087	332096	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014961	CCGAT	2	10	368654	368663	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014961	CGAGC	2	10	373571	373580	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014961	GCCGG	2	10	382920	382929	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014961	GATGC	2	10	383392	383401	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014961	CTTGA	2	10	403997	404006	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014961	CGGCT	2	10	413622	413631	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_014961	TAGAG	2	10	420182	420191	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014961	ATGCG	2	10	421860	421869	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014961	GCTAC	2	10	422372	422381	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_014961	GATTG	2	10	432838	432847	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014961	TCTCG	2	10	438739	438748	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014961	GATGT	2	10	439204	439213	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014961	GGCCC	2	10	442623	442632	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
36	NC_014961	TCCCC	2	10	456423	456432	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
37	NC_014961	CCCGC	2	10	456450	456459	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_014961	GTGTA	2	10	459418	459427	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014961	CAGGG	2	10	482926	482935	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014961	GGTGT	2	10	490512	490521	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014961	ATGCG	2	10	513698	513707	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014961	CAGGG	2	10	551498	551507	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014961	CGGGG	2	10	612245	612254	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014961	AGGAA	2	10	614421	614430	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014961	TCGCC	2	10	615002	615011	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014961	CCAAG	2	10	644541	644550	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014961	CGGGG	2	10	701084	701093	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014961	CTCGT	2	10	715530	715539	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014961	CGGGG	2	10	795677	795686	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014961	CGGGG	2	10	799088	799097	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014961	GGGGC	2	10	823177	823186	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014961	TGCTA	2	10	834588	834597	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014961	CCATT	2	10	836397	836406	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
54	NC_014961	AATAA	2	10	847219	847228	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014961	CCCAC	2	10	852433	852442	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
56	NC_014961	AGTGC	2	10	877662	877671	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014961	CTGAG	2	10	900099	900108	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014961	GGCTT	2	10	904546	904555	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014961	GCCCC	2	10	933182	933191	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
60	NC_014961	TTTAA	2	10	938822	938831	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014961	GGAAG	2	10	972255	972264	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014961	TTAGG	2	10	984362	984371	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014961	GGGTC	2	10	996952	996961	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014961	ACACC	2	10	1028194	1028203	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
65	NC_014961	CGGGA	2	10	1031069	1031078	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014961	CCACT	2	10	1031638	1031647	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
67	NC_014961	GTAAG	2	10	1031858	1031867	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014961	AAAGT	2	10	1032405	1032414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014961	TGAAG	2	10	1034420	1034429	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014961	CACCT	2	10	1043718	1043727	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
71	NC_014961	CCTTG	2	10	1140607	1140616	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
72	NC_014961	CCTCC	2	10	1156437	1156446	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
73	NC_014961	CGAGG	2	10	1156549	1156558	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014961	AGGGG	2	10	1178424	1178433	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014961	CGGCC	2	10	1178863	1178872	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
76	NC_014961	AGTGG	2	10	1183609	1183618	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014961	TTCAT	2	10	1218987	1218996	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014961	TCACT	2	10	1225726	1225735	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014961	CTGTG	2	10	1229225	1229234	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014961	CTAGG	2	10	1247342	1247351	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014961	ACTAT	2	10	1248052	1248061	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_014961	GGCAG	2	10	1248691	1248700	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014961	CGGGG	2	10	1263872	1263881	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014961	GAGCT	2	10	1263953	1263962	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014961	AGCTT	2	10	1299272	1299281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.