MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 492

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014961	TGGGG	2	10	4958	4967	0 %	20 %	80 %	0 %	320100214
2	NC_014961	ATGGT	2	10	7371	7380	20 %	40 %	40 %	0 %	320100216
3	NC_014961	CATAC	2	10	7779	7788	40 %	20 %	0 %	40 %	320100217
4	NC_014961	TGTAG	2	10	7985	7994	20 %	40 %	40 %	0 %	320100217
5	NC_014961	TAGAG	2	10	8096	8105	40 %	20 %	40 %	0 %	320100217
6	NC_014961	GAAGG	2	10	10442	10451	40 %	0 %	60 %	0 %	320100219
7	NC_014961	TACTA	2	10	11224	11233	40 %	40 %	0 %	20 %	320100221
8	NC_014961	AGGGT	2	10	11638	11647	20 %	20 %	60 %	0 %	320100221
9	NC_014961	TAGCC	2	10	16063	16072	20 %	20 %	20 %	40 %	320100227
10	NC_014961	TGCTC	2	10	16508	16517	0 %	40 %	20 %	40 %	320100227
11	NC_014961	CCACT	2	10	18591	18600	20 %	20 %	0 %	60 %	320100229
12	NC_014961	GGAAT	2	10	19879	19888	40 %	20 %	40 %	0 %	320100230
13	NC_014961	GACCA	2	10	20394	20403	40 %	0 %	20 %	40 %	320100230
14	NC_014961	GCCCT	2	10	21760	21769	0 %	20 %	20 %	60 %	320100232
15	NC_014961	CCCTC	2	10	24349	24358	0 %	20 %	0 %	80 %	320100234
16	NC_014961	TACCA	2	10	27050	27059	40 %	20 %	0 %	40 %	320100236
17	NC_014961	GCTCC	2	10	28048	28057	0 %	20 %	20 %	60 %	320100236
18	NC_014961	GCATG	2	10	28612	28621	20 %	20 %	40 %	20 %	320100236
19	NC_014961	GGATG	2	10	35833	35842	20 %	20 %	60 %	0 %	320100245
20	NC_014961	TGTGC	2	10	49217	49226	0 %	40 %	40 %	20 %	320100264
21	NC_014961	AGTAG	2	10	51685	51694	40 %	20 %	40 %	0 %	320100267
22	NC_014961	CGACG	2	10	70480	70489	20 %	0 %	40 %	40 %	320100282
23	NC_014961	GTGGC	2	10	70945	70954	0 %	20 %	60 %	20 %	320100283
24	NC_014961	GGAGG	2	10	70995	71004	20 %	0 %	80 %	0 %	320100283
25	NC_014961	TGGAC	2	10	72366	72375	20 %	20 %	40 %	20 %	320100285
26	NC_014961	GGAGT	2	10	72406	72415	20 %	20 %	60 %	0 %	320100285
27	NC_014961	ACGAG	2	10	75621	75630	40 %	0 %	40 %	20 %	320100287
28	NC_014961	CCAGG	2	10	77282	77291	20 %	0 %	40 %	40 %	320100289
29	NC_014961	CAGCT	2	10	79534	79543	20 %	20 %	20 %	40 %	320100290
30	NC_014961	TACCC	2	10	80124	80133	20 %	20 %	0 %	60 %	320100291
31	NC_014961	GCCTC	2	10	81455	81464	0 %	20 %	20 %	60 %	320100293
32	NC_014961	TGGGT	2	10	82021	82030	0 %	40 %	60 %	0 %	320100294
33	NC_014961	CATGT	2	10	82210	82219	20 %	40 %	20 %	20 %	320100294
34	NC_014961	TCCTC	2	10	82768	82777	0 %	40 %	0 %	60 %	320100295
35	NC_014961	ACTCT	2	10	83694	83703	20 %	40 %	0 %	40 %	320100295
36	NC_014961	CTCAA	2	10	84557	84566	40 %	20 %	0 %	40 %	320100297
37	NC_014961	CACTA	2	10	88510	88519	40 %	20 %	0 %	40 %	320100302
38	NC_014961	CTACC	2	10	91679	91688	20 %	20 %	0 %	60 %	320100305
39	NC_014961	GCACG	2	10	93070	93079	20 %	0 %	40 %	40 %	320100307
40	NC_014961	GCGAG	2	10	94379	94388	20 %	0 %	60 %	20 %	320100308
41	NC_014961	GCATC	2	10	95264	95273	20 %	20 %	20 %	40 %	320100308
42	NC_014961	GCCTG	2	10	95331	95340	0 %	20 %	40 %	40 %	320100309
43	NC_014961	GAGCC	2	10	97470	97479	20 %	0 %	40 %	40 %	320100313
44	NC_014961	TATGC	2	10	97643	97652	20 %	40 %	20 %	20 %	320100314
45	NC_014961	TGTAG	2	10	100570	100579	20 %	40 %	40 %	0 %	320100315
46	NC_014961	GGTAG	2	10	103212	103221	20 %	20 %	60 %	0 %	320100317
47	NC_014961	ATTAC	2	10	103734	103743	40 %	40 %	0 %	20 %	320100318
48	NC_014961	CCATG	2	10	105315	105324	20 %	20 %	20 %	40 %	320100319
49	NC_014961	TCCTG	2	10	107446	107455	0 %	40 %	20 %	40 %	320100321
50	NC_014961	AGAGG	2	10	114053	114062	40 %	0 %	60 %	0 %	320100327
51	NC_014961	ATGGA	2	10	117911	117920	40 %	20 %	40 %	0 %	320100331
52	NC_014961	AAGCC	2	10	121618	121627	40 %	0 %	20 %	40 %	320100334
53	NC_014961	AGGGA	2	10	125416	125425	40 %	0 %	60 %	0 %	320100340
54	NC_014961	AGTGC	2	10	131504	131513	20 %	20 %	40 %	20 %	320100346
55	NC_014961	ATTGG	2	10	134969	134978	20 %	40 %	40 %	0 %	320100350
56	NC_014961	GGATA	2	10	140660	140669	40 %	20 %	40 %	0 %	320100358
57	NC_014961	TAGCA	2	10	141309	141318	40 %	20 %	20 %	20 %	320100358
58	NC_014961	TGGGC	2	10	141871	141880	0 %	20 %	60 %	20 %	320100359
59	NC_014961	TACCC	2	10	153402	153411	20 %	20 %	0 %	60 %	320100370
60	NC_014961	AGGGG	2	10	153869	153878	20 %	0 %	80 %	0 %	320100370
61	NC_014961	ACTAC	2	10	157466	157475	40 %	20 %	0 %	40 %	320100374
62	NC_014961	TATTC	2	10	159928	159937	20 %	60 %	0 %	20 %	320100377
63	NC_014961	ATGTA	2	10	166395	166404	40 %	40 %	20 %	0 %	320100384
64	NC_014961	GCACT	2	10	166847	166856	20 %	20 %	20 %	40 %	320100385
65	NC_014961	GGCGT	2	10	167474	167483	0 %	20 %	60 %	20 %	320100386
66	NC_014961	GCCTA	2	10	167813	167822	20 %	20 %	20 %	40 %	320100386
67	NC_014961	GCATA	2	10	172235	172244	40 %	20 %	20 %	20 %	320100392
68	NC_014961	GAGAC	2	10	176509	176518	40 %	0 %	40 %	20 %	320100396
69	NC_014961	AAGGC	2	10	178983	178992	40 %	0 %	40 %	20 %	320100400
70	NC_014961	AGACG	2	10	179722	179731	40 %	0 %	40 %	20 %	320100400
71	NC_014961	CTACG	2	10	180089	180098	20 %	20 %	20 %	40 %	320100400
72	NC_014961	ACCAG	2	10	183477	183486	40 %	0 %	20 %	40 %	320100403
73	NC_014961	ATCCC	2	10	187055	187064	20 %	20 %	0 %	60 %	320100405
74	NC_014961	CAGGA	2	10	194309	194318	40 %	0 %	40 %	20 %	320100415
75	NC_014961	GAGAG	2	10	195006	195015	40 %	0 %	60 %	0 %	320100416
76	NC_014961	GCCAG	2	10	198995	199004	20 %	0 %	40 %	40 %	320100421
77	NC_014961	GCATC	2	10	199337	199346	20 %	20 %	20 %	40 %	320100421
78	NC_014961	CTCAC	2	10	199961	199970	20 %	20 %	0 %	60 %	320100422
79	NC_014961	AAGCC	2	10	207116	207125	40 %	0 %	20 %	40 %	320100429
80	NC_014961	CGTGG	2	10	207996	208005	0 %	20 %	60 %	20 %	320100430
81	NC_014961	GATGT	2	10	209325	209334	20 %	40 %	40 %	0 %	320100431
82	NC_014961	AGTTA	2	10	210543	210552	40 %	40 %	20 %	0 %	320100432
83	NC_014961	CGCCA	2	10	214237	214246	20 %	0 %	20 %	60 %	320100437
84	NC_014961	ACCAT	2	10	215054	215063	40 %	20 %	0 %	40 %	320100437
85	NC_014961	CCTTC	2	10	216225	216234	0 %	40 %	0 %	60 %	320100440
86	NC_014961	CATCG	2	10	220501	220510	20 %	20 %	20 %	40 %	320100445
87	NC_014961	ATTCA	2	10	221941	221950	40 %	40 %	0 %	20 %	320100447
88	NC_014961	CCTCT	2	10	226549	226558	0 %	40 %	0 %	60 %	320100449
89	NC_014961	GCCTC	2	10	227298	227307	0 %	20 %	20 %	60 %	320100449
90	NC_014961	AGAGG	2	10	229208	229217	40 %	0 %	60 %	0 %	320100452
91	NC_014961	TGCGA	2	10	230521	230530	20 %	20 %	40 %	20 %	320100455
92	NC_014961	TACTC	2	10	230854	230863	20 %	40 %	0 %	40 %	320100455
93	NC_014961	TGCCC	2	10	234348	234357	0 %	20 %	20 %	60 %	320100460
94	NC_014961	GCGGT	2	10	236356	236365	0 %	20 %	60 %	20 %	320100463
95	NC_014961	GCCCC	2	10	237902	237911	0 %	0 %	20 %	80 %	320100464
96	NC_014961	GCCGG	2	10	238395	238404	0 %	0 %	60 %	40 %	320100464
97	NC_014961	CACGG	2	10	238692	238701	20 %	0 %	40 %	40 %	320100465
98	NC_014961	CTCCA	2	10	240547	240556	20 %	20 %	0 %	60 %	320100466
99	NC_014961	AGAGG	2	10	244777	244786	40 %	0 %	60 %	0 %	320100469
100	NC_014961	GAGTG	2	10	247771	247780	20 %	20 %	60 %	0 %	320100473
101	NC_014961	GCACT	2	10	248505	248514	20 %	20 %	20 %	40 %	320100474
102	NC_014961	CCTCG	2	10	250038	250047	0 %	20 %	20 %	60 %	320100475
103	NC_014961	GCTGT	2	10	250707	250716	0 %	40 %	40 %	20 %	320100475
104	NC_014961	GCCCA	2	10	252830	252839	20 %	0 %	20 %	60 %	320100477
105	NC_014961	CCACT	2	10	254187	254196	20 %	20 %	0 %	60 %	320100478
106	NC_014961	TAGGA	2	10	254870	254879	40 %	20 %	40 %	0 %	320100479
107	NC_014961	TCCAC	2	10	260323	260332	20 %	20 %	0 %	60 %	320100487
108	NC_014961	CTTCA	2	10	262667	262676	20 %	40 %	0 %	40 %	320100489
109	NC_014961	GTATT	2	10	263020	263029	20 %	60 %	20 %	0 %	320100490
110	NC_014961	CCCCT	2	10	263677	263686	0 %	20 %	0 %	80 %	320100490
111	NC_014961	GTCAA	2	10	264585	264594	40 %	20 %	20 %	20 %	320100491
112	NC_014961	CCCTG	2	10	267541	267550	0 %	20 %	20 %	60 %	320100493
113	NC_014961	CCTGG	2	10	275945	275954	0 %	20 %	40 %	40 %	320100500
114	NC_014961	CCCAG	2	10	278736	278745	20 %	0 %	20 %	60 %	320100502
115	NC_014961	TCGCC	2	10	278888	278897	0 %	20 %	20 %	60 %	320100502
116	NC_014961	AGGGT	2	10	280800	280809	20 %	20 %	60 %	0 %	320100503
117	NC_014961	CAAGC	2	10	284466	284475	40 %	0 %	20 %	40 %	320100507
118	NC_014961	CCAGC	2	10	294773	294782	20 %	0 %	20 %	60 %	320100516
119	NC_014961	GGTAT	2	10	298977	298986	20 %	40 %	40 %	0 %	320100520
120	NC_014961	TGGCG	2	10	304692	304701	0 %	20 %	60 %	20 %	320100525
121	NC_014961	CAAGT	2	10	305383	305392	40 %	20 %	20 %	20 %	320100526
122	NC_014961	TGAAG	2	10	307444	307453	40 %	20 %	40 %	0 %	320100528
123	NC_014961	AGCCC	2	10	310105	310114	20 %	0 %	20 %	60 %	320100532
124	NC_014961	TCAAC	2	10	314357	314366	40 %	20 %	0 %	40 %	320100536
125	NC_014961	GAAGG	2	10	320194	320203	40 %	0 %	60 %	0 %	320100543
126	NC_014961	GGAGC	2	10	324905	324914	20 %	0 %	60 %	20 %	320100547
127	NC_014961	AGGGT	2	10	325752	325761	20 %	20 %	60 %	0 %	320100547
128	NC_014961	GAAAG	2	10	327106	327115	60 %	0 %	40 %	0 %	320100549
129	NC_014961	GACCA	2	10	337494	337503	40 %	0 %	20 %	40 %	320100559
130	NC_014961	TAGGC	2	10	339880	339889	20 %	20 %	40 %	20 %	320100561
131	NC_014961	GCTCT	2	10	340370	340379	0 %	40 %	20 %	40 %	320100561
132	NC_014961	CCCTC	2	10	341933	341942	0 %	20 %	0 %	80 %	320100562
133	NC_014961	GTCCT	2	10	342782	342791	0 %	40 %	20 %	40 %	320100562
134	NC_014961	CTTCT	2	10	345073	345082	0 %	60 %	0 %	40 %	320100563
135	NC_014961	CTCTC	2	10	346002	346011	0 %	40 %	0 %	60 %	320100564
136	NC_014961	GGTAC	2	10	353407	353416	20 %	20 %	40 %	20 %	320100572
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147	NC_014961	GAGGT	2	10	395608	395617	20 %	20 %	60 %	0 %	320100616
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150	NC_014961	GTAGA	2	10	404562	404571	40 %	20 %	40 %	0 %	320100625
151	NC_014961	GGCTT	2	10	405254	405263	0 %	40 %	40 %	20 %	320100626
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169	NC_014961	GGGGA	2	10	452068	452077	20 %	0 %	80 %	0 %	320100664
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176	NC_014961	GAGGG	2	10	474019	474028	20 %	0 %	80 %	0 %	320100684
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259	NC_014961	TGTAG	2	10	694181	694190	20 %	40 %	40 %	0 %	320100892
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261	NC_014961	TCTCC	2	10	695128	695137	0 %	40 %	0 %	60 %	320100893
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381	NC_014961	TACAC	2	10	1047756	1047765	40 %	20 %	0 %	40 %	320101257
382	NC_014961	CGCCC	2	10	1050464	1050473	0 %	0 %	20 %	80 %	320101262
383	NC_014961	CAAGC	2	10	1051252	1051261	40 %	0 %	20 %	40 %	320101263
384	NC_014961	CCTGC	2	10	1053246	1053255	0 %	20 %	20 %	60 %	320101267
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387	NC_014961	CCTCA	2	10	1057438	1057447	20 %	20 %	0 %	60 %	320101273
388	NC_014961	CCCCT	2	10	1062020	1062029	0 %	20 %	0 %	80 %	320101277
389	NC_014961	GTCTA	2	10	1062133	1062142	20 %	40 %	20 %	20 %	320101277
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