MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014961	CGCA	2	8	2074	2081	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014961	AGCC	2	8	4329	4336	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_014961	GGGT	2	8	4350	4357	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014961	CCCG	2	8	4492	4499	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_014961	CACC	2	8	9368	9375	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_014961	CAAT	2	8	9437	9444	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014961	ATCC	2	8	13100	13107	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014961	TTAT	2	8	19532	19539	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014961	GAAA	2	8	24494	24501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014961	GGCA	2	8	25916	25923	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014961	TCAT	2	8	28803	28810	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014961	CTTA	2	8	28819	28826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014961	TTTA	2	8	39959	39966	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014961	TATT	2	8	42823	42830	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014961	ACCT	2	8	46101	46108	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014961	TAAA	2	8	46147	46154	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014961	ATCT	2	8	55765	55772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014961	GTGA	2	8	57358	57365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014961	GGGA	2	8	57561	57568	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014961	TGGG	2	8	58415	58422	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014961	CCCA	2	8	58430	58437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014961	CGAG	2	8	58682	58689	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014961	GCAG	2	8	59404	59411	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014961	CGGG	2	8	59493	59500	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014961	CCGT	2	8	59996	60003	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014961	GCCG	2	8	60632	60639	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014961	GGCG	2	8	60683	60690	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014961	CCGG	2	8	61860	61867	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014961	GCCC	2	8	62045	62052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
30	NC_014961	CAAT	2	8	70546	70553	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014961	CCCT	2	8	89936	89943	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_014961	GCCC	2	8	90010	90017	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
33	NC_014961	CAGG	2	8	92846	92853	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014961	TCAC	2	8	101509	101516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_014961	TAGG	2	8	101792	101799	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014961	GCAG	2	8	106798	106805	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014961	GGAT	2	8	107221	107228	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014961	ATTT	2	8	108131	108138	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014961	ATCA	2	8	111595	111602	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NC_014961	CATG	2	8	112740	112747	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014961	AGTG	2	8	116244	116251	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014961	TGGG	2	8	116345	116352	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014961	TGGC	2	8	129352	129359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014961	TCCC	2	8	133122	133129	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
45	NC_014961	TTAT	2	8	136113	136120	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014961	CCTG	2	8	140507	140514	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014961	AGGC	2	8	152017	152024	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014961	ATGC	2	8	155487	155494	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014961	GTTG	2	8	155855	155862	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014961	CAAA	2	8	155883	155890	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014961	ATTA	2	8	162073	162080	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014961	GCTT	2	8	170733	170740	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014961	AAGC	2	8	171208	171215	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014961	GTCA	2	8	171407	171414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014961	GCCC	2	8	176665	176672	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
56	NC_014961	ATCC	2	8	176773	176780	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_014961	TATG	2	8	177759	177766	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014961	AAAG	2	8	191370	191377	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014961	GGTT	2	8	191454	191461	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014961	CCAT	2	8	194161	194168	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014961	GAGG	2	8	194213	194220	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014961	CCCG	2	8	205214	205221	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
63	NC_014961	TGGG	2	8	209731	209738	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014961	TAGT	2	8	209784	209791	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014961	GGCG	2	8	213577	213584	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014961	AGGA	2	8	218302	218309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014961	TAAC	2	8	219126	219133	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_014961	GATC	2	8	219162	219169	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014961	GGGC	2	8	234705	234712	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014961	TAGG	2	8	234978	234985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014961	TAGA	2	8	236208	236215	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014961	GGAT	2	8	236219	236226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014961	CATT	2	8	245765	245772	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014961	ATAA	2	8	260900	260907	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014961	GCTG	2	8	275484	275491	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_014961	GATG	2	8	286734	286741	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014961	ATGG	2	8	291976	291983	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014961	GGTA	2	8	292008	292015	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014961	GCTA	2	8	292090	292097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014961	ATTC	2	8	292260	292267	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014961	TAAA	2	8	294879	294886	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014961	CCGG	2	8	308002	308009	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014961	AAGG	2	8	310833	310840	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014961	CCAC	2	8	312120	312127	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_014961	TCCC	2	8	314462	314469	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_014961	ATTT	2	8	320317	320324	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014961	TTAA	2	8	332072	332079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014961	TTAA	2	8	332884	332891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014961	AATG	2	8	349686	349693	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014961	TTGA	2	8	350217	350224	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014961	CTCC	2	8	351806	351813	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
92	NC_014961	CATA	2	8	351818	351825	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014961	GATG	2	8	357159	357166	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014961	GGGC	2	8	357256	357263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014961	GCAC	2	8	359197	359204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014961	TGAA	2	8	373592	373599	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014961	CCGC	2	8	373814	373821	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
98	NC_014961	GCCC	2	8	377408	377415	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
99	NC_014961	TTGT	2	8	382848	382855	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014961	CTCC	2	8	387487	387494	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_014961	GAAA	2	8	388111	388118	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014961	GGGC	2	8	401229	401236	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
103	NC_014961	AGCT	2	8	408131	408138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_014961	GGCT	2	8	408371	408378	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014961	ATTT	2	8	420221	420228	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014961	TAGA	2	8	421883	421890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014961	ATGT	2	8	422305	422312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014961	AATA	2	8	425472	425479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014961	TTGA	2	8	426530	426537	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014961	CATA	2	8	426908	426915	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_014961	CAGG	2	8	427426	427433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014961	CTTC	2	8	432073	432080	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_014961	CAGA	2	8	438562	438569	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014961	TGGG	2	8	439231	439238	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014961	GGCT	2	8	439246	439253	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_014961	CACC	2	8	442405	442412	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014961	CTCC	2	8	442801	442808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
118	NC_014961	GAAA	2	8	442877	442884	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014961	TTGC	2	8	444301	444308	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014961	TATT	2	8	451728	451735	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014961	CACT	2	8	456000	456007	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014961	CCGG	2	8	456215	456222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_014961	GGCG	2	8	456268	456275	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014961	TGCC	2	8	456835	456842	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_014961	TGCA	2	8	459178	459185	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014961	CTTC	2	8	459357	459364	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014961	GCTT	2	8	459383	459390	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014961	CCTT	2	8	459484	459491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_014961	ATCC	2	8	464157	464164	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014961	GGTG	2	8	485241	485248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014961	TCCC	2	8	486356	486363	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
132	NC_014961	ATTA	2	8	492555	492562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014961	CCAT	2	8	496928	496935	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014961	CTCA	2	8	496946	496953	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_014961	TACA	2	8	502661	502668	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014961	ATCA	2	8	523742	523749	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_014961	TAAC	2	8	536274	536281	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_014961	CCAC	2	8	540715	540722	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
139	NC_014961	CGCT	2	8	547817	547824	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
140	NC_014961	ATGT	2	8	547838	547845	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014961	ACCC	2	8	547880	547887	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_014961	AATG	2	8	551454	551461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014961	ATCC	2	8	551580	551587	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_014961	GCTA	2	8	558046	558053	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014961	TGCA	2	8	560492	560499	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014961	CACC	2	8	560613	560620	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
147	NC_014961	GCTG	2	8	569516	569523	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014961	ATAC	2	8	579111	579118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014961	ATTT	2	8	585887	585894	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014961	CCTC	2	8	595102	595109	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014961	TGTT	2	8	595719	595726	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014961	ATGG	2	8	595744	595751	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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297	NC_014961	GTAT	2	8	1193517	1193524	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
298	NC_014961	CATG	2	8	1204834	1204841	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
299	NC_014961	TATT	2	8	1205036	1205043	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
300	NC_014961	ATAA	2	8	1207349	1207356	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
301	NC_014961	GATG	2	8	1210753	1210760	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
302	NC_014961	GAGG	2	8	1221154	1221161	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
303	NC_014961	CATA	2	8	1229116	1229123	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
304	NC_014961	GGTA	2	8	1233655	1233662	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
305	NC_014961	GGAG	2	8	1236862	1236869	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
306	NC_014961	GGGA	2	8	1239688	1239695	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
307	NC_014961	TTTA	2	8	1239854	1239861	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
308	NC_014961	AGTG	2	8	1240327	1240334	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
309	NC_014961	GTGG	2	8	1240393	1240400	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
310	NC_014961	TGAT	2	8	1247130	1247137	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
311	NC_014961	TCCT	2	8	1248226	1248233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
312	NC_014961	AGGG	2	8	1248799	1248806	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
313	NC_014961	ATTC	2	8	1249215	1249222	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
314	NC_014961	TTTC	2	8	1254089	1254096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
315	NC_014961	CACC	2	8	1257260	1257267	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
316	NC_014961	AGTG	2	8	1274491	1274498	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
317	NC_014961	TAAA	2	8	1277492	1277499	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_014961	CGGC	2	8	1277512	1277519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
319	NC_014961	GAAG	2	8	1277533	1277540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
320	NC_014961	TTAA	2	8	1287107	1287114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
321	NC_014961	GCAT	2	8	1289713	1289720	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
322	NC_014961	TTAA	2	8	1299433	1299440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
323	NC_014961	TCCC	2	8	1302923	1302930	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
324	NC_014961	AAAC	2	8	1311343	1311350	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
325	NC_014961	CCGG	2	8	1314373	1314380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.