MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfurococcus mucosus DSM 2162 chromosome

Total Repeats: 17283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014961	GTT	2	6	74	79	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100210
2	NC_014961	ACC	2	6	114	119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100210
3	NC_014961	GAG	2	6	210	215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100210
4	NC_014961	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
5	NC_014961	AAG	2	6	286	291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
6	NC_014961	AAG	2	6	382	387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
7	NC_014961	GTG	2	6	487	492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100211
8	NC_014961	AGG	2	6	652	657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
9	NC_014961	GGC	2	6	682	687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100211
10	NC_014961	GTG	2	6	697	702	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100211
11	NC_014961	ACT	2	6	716	721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100211
12	NC_014961	CGA	2	6	738	743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100211
13	NC_014961	GAG	2	6	772	777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
14	NC_014961	GAT	2	6	961	966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100211
15	NC_014961	GCA	2	6	985	990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100211
16	NC_014961	GCT	2	6	994	999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100211
17	NC_014961	AAG	2	6	1099	1104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
18	NC_014961	GAG	2	6	1120	1125	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
19	NC_014961	AGA	2	6	1166	1171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
20	NC_014961	GAA	2	6	1179	1184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
21	NC_014961	GAG	2	6	1287	1292	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
22	NC_014961	ATG	2	6	1321	1326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100211
23	NC_014961	GGT	2	6	1377	1382	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100211
24	NC_014961	AAG	2	6	1390	1395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100211
25	NC_014961	GGT	2	6	1407	1412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100211
26	NC_014961	AGG	2	6	1415	1420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100211
27	NC_014961	ACG	3	9	1498	1506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100212
28	NC_014961	CTT	2	6	1508	1513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100212
29	NC_014961	ATC	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100212
30	NC_014961	TTG	2	6	1612	1617	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100212
31	NC_014961	CGG	2	6	1619	1624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100212
32	NC_014961	CGT	2	6	1712	1717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100212
33	NC_014961	GAG	2	6	1830	1835	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100212
34	NC_014961	ACT	2	6	1855	1860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100212
35	NC_014961	ATA	2	6	1861	1866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100212
36	NC_014961	TGA	2	6	2204	2209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100213
37	NC_014961	GCA	2	6	2314	2319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100213
38	NC_014961	GGA	2	6	2321	2326	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100213
39	NC_014961	GAG	2	6	2364	2369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100213
40	NC_014961	AGG	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100213
41	NC_014961	TCC	2	6	2722	2727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100213
42	NC_014961	ACA	2	6	2803	2808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100213
43	NC_014961	GAA	2	6	2855	2860	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100213
44	NC_014961	TAG	2	6	2926	2931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100213
45	NC_014961	CGA	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100213
46	NC_014961	ATA	2	6	3105	3110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100213
47	NC_014961	TCA	2	6	3156	3161	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100213
48	NC_014961	TTC	2	6	3190	3195	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100213
49	NC_014961	TGG	2	6	3216	3221	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100213
50	NC_014961	TGG	2	6	3270	3275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100213
51	NC_014961	TCC	2	6	3308	3313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100213
52	NC_014961	GAA	2	6	3450	3455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100213
53	NC_014961	CTG	2	6	3517	3522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100213
54	NC_014961	AGC	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100213
55	NC_014961	ACT	2	6	3661	3666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100213
56	NC_014961	CTT	2	6	3950	3955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100213
57	NC_014961	AGA	2	6	3973	3978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100213
58	NC_014961	ACT	2	6	4532	4537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100214
59	NC_014961	CTC	2	6	4576	4581	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100214
60	NC_014961	GAT	2	6	4582	4587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100214
61	NC_014961	TCA	3	9	4668	4676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100214
62	NC_014961	CTT	2	6	4741	4746	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100214
63	NC_014961	ACT	2	6	4799	4804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100214
64	NC_014961	GTT	2	6	4876	4881	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100214
65	NC_014961	CAC	2	6	4897	4902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100214
66	NC_014961	GCG	2	6	4910	4915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100214
67	NC_014961	GCG	2	6	4934	4939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100214
68	NC_014961	GAA	2	6	4948	4953	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100214
69	NC_014961	CTC	2	6	4985	4990	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100214
70	NC_014961	CGA	2	6	4992	4997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100214
71	NC_014961	CGG	2	6	4998	5003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100214
72	NC_014961	AGT	2	6	5061	5066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100214
73	NC_014961	CGG	2	6	5179	5184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100214
74	NC_014961	TAT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100214
75	NC_014961	GCT	2	6	5228	5233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100214
76	NC_014961	TCT	2	6	5250	5255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100214
77	NC_014961	CAA	2	6	5257	5262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100214
78	NC_014961	CTC	2	6	5263	5268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100214
79	NC_014961	CGC	2	6	5289	5294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100214
80	NC_014961	CGC	2	6	5313	5318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100214
81	NC_014961	TGT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100214
82	NC_014961	AGT	2	6	5442	5447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100214
83	NC_014961	CGT	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100214
84	NC_014961	CCG	2	6	5516	5521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100214
85	NC_014961	GAG	2	6	5572	5577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100214
86	NC_014961	ACT	2	6	5591	5596	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100214
87	NC_014961	AGT	2	6	5960	5965	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100215
88	NC_014961	AGC	2	6	5972	5977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100215
89	NC_014961	AGG	2	6	6044	6049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100215
90	NC_014961	TAT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100215
91	NC_014961	TAA	2	6	6260	6265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100216
92	NC_014961	CGG	2	6	6342	6347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100216
93	NC_014961	TTC	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100216
94	NC_014961	CCT	2	6	6387	6392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100216
95	NC_014961	GGC	2	6	6585	6590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100216
96	NC_014961	GAG	2	6	6597	6602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100216
97	NC_014961	TAC	2	6	6640	6645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100216
98	NC_014961	GTG	2	6	6682	6687	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100216
99	NC_014961	CAA	2	6	6741	6746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100216
100	NC_014961	GTT	2	6	6847	6852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100216
101	NC_014961	AGG	2	6	6865	6870	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100216
102	NC_014961	AGG	2	6	7017	7022	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100216
103	NC_014961	TGT	2	6	7221	7226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100216
104	NC_014961	CGG	2	6	7299	7304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	320100216
105	NC_014961	GTT	2	6	7338	7343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100216
106	NC_014961	ACG	2	6	7351	7356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100216
107	NC_014961	CTG	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100216
108	NC_014961	GCT	2	6	7480	7485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100216
109	NC_014961	GTT	2	6	7497	7502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100216
110	NC_014961	CCT	3	9	7734	7742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100217
111	NC_014961	TTC	2	6	7800	7805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100217
112	NC_014961	GTC	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100217
113	NC_014961	AGT	2	6	7901	7906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100217
114	NC_014961	CTC	2	6	8014	8019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100217
115	NC_014961	AAC	2	6	8022	8027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100217
116	NC_014961	TAG	2	6	8037	8042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100217
117	NC_014961	GCT	2	6	8066	8071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100217
118	NC_014961	CTA	2	6	8141	8146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100217
119	NC_014961	TCC	2	6	8149	8154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100217
120	NC_014961	GAG	2	6	8175	8180	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100217
121	NC_014961	CGA	2	6	8192	8197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100217
122	NC_014961	CGC	2	6	8261	8266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100217
123	NC_014961	GGT	2	6	8273	8278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100217
124	NC_014961	CGC	2	6	8300	8305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100217
125	NC_014961	CTC	2	6	8388	8393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100217
126	NC_014961	CTT	2	6	8445	8450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100217
127	NC_014961	AGC	2	6	8511	8516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100217
128	NC_014961	TGA	2	6	8558	8563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100217
129	NC_014961	TTC	2	6	8638	8643	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100217
130	NC_014961	CTC	2	6	8802	8807	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100217
131	NC_014961	CAG	2	6	8844	8849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100217
132	NC_014961	CTT	2	6	8892	8897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100217
133	NC_014961	AGA	2	6	8966	8971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100217
134	NC_014961	CAG	2	6	8980	8985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100217
135	NC_014961	TGC	2	6	9031	9036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100217
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153	NC_014961	TGG	2	6	10387	10392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100219
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252	NC_014961	CCT	2	6	17545	17550	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100228
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255	NC_014961	CTC	2	6	17833	17838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100228
256	NC_014961	ATC	2	6	17842	17847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100228
257	NC_014961	CTT	2	6	18099	18104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100228
258	NC_014961	CGC	2	6	18120	18125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100228
259	NC_014961	CGA	2	6	18132	18137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100228
260	NC_014961	TTC	2	6	18309	18314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	320100229
261	NC_014961	TGA	2	6	18379	18384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100229
262	NC_014961	CTG	2	6	18389	18394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100229
263	NC_014961	CCA	2	6	18558	18563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100229
264	NC_014961	AAC	2	6	18608	18613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100229
265	NC_014961	GCA	2	6	18817	18822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100229
266	NC_014961	ATA	2	6	18914	18919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100229
267	NC_014961	GGA	2	6	18960	18965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100229
268	NC_014961	TTG	2	6	18993	18998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320100229
269	NC_014961	CGA	2	6	19036	19041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100229
270	NC_014961	CCT	2	6	19051	19056	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100229
271	NC_014961	TGA	2	6	19093	19098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100229
272	NC_014961	CAC	2	6	19204	19209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100229
273	NC_014961	AGC	2	6	19227	19232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100229
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275	NC_014961	GTC	2	6	19392	19397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100229
276	NC_014961	ATA	2	6	19427	19432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	320100229
277	NC_014961	CCA	2	6	19450	19455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	320100229
278	NC_014961	TAC	2	6	19460	19465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100229
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280	NC_014961	AGC	2	6	19645	19650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100230
281	NC_014961	GCT	2	6	19670	19675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100230
282	NC_014961	CGT	2	6	20033	20038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100230
283	NC_014961	TGG	2	6	20044	20049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100230
284	NC_014961	ATT	2	6	20132	20137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100230
285	NC_014961	TAG	2	6	20152	20157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100230
286	NC_014961	GTC	2	6	20352	20357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100230
287	NC_014961	GAC	2	6	20677	20682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100231
288	NC_014961	GAG	2	6	20718	20723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100231
289	NC_014961	TGG	2	6	20744	20749	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100231
290	NC_014961	TGG	2	6	20810	20815	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100231
291	NC_014961	GTG	2	6	20819	20824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100231
292	NC_014961	GCT	2	6	20875	20880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100231
293	NC_014961	AGC	2	6	20901	20906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100231
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298	NC_014961	GCA	2	6	21292	21297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100232
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300	NC_014961	CTG	2	6	21439	21444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100232
301	NC_014961	AGT	2	6	21529	21534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	320100232
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325	NC_014961	TAT	2	6	22934	22939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100232
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330	NC_014961	ACT	2	6	23198	23203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100233
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333	NC_014961	GTG	2	6	23335	23340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320100233
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343	NC_014961	TCC	2	6	24204	24209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100234
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380	NC_014961	TCA	2	6	26611	26616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100236
381	NC_014961	GTC	2	6	26676	26681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320100236
382	NC_014961	CGC	2	6	26736	26741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320100236
383	NC_014961	TCA	2	6	26833	26838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	320100236
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454	NC_014961	TCC	3	9	32826	32834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100243
455	NC_014961	CCT	2	6	32841	32846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100243
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460	NC_014961	ATT	2	6	33233	33238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	320100243
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491	NC_014961	AGC	2	6	35695	35700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100245
492	NC_014961	GAA	2	6	35716	35721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	320100245
493	NC_014961	AAC	2	6	35744	35749	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	320100245
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496	NC_014961	AGG	2	6	35943	35948	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100245
497	NC_014961	CTC	2	6	36141	36146	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320100246
498	NC_014961	AGC	2	6	36215	36220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	320100246
499	NC_014961	GAG	2	6	36264	36269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100246
500	NC_014961	GAG	2	6	36468	36473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	320100246

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