MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Anaerolinea thermophila UNI-1

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014960	GAAAA	2	10	456	465	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014960	GGGGA	2	10	6610	6619	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014960	CAAAA	2	10	8426	8435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014960	CTCTG	2	10	31405	31414	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_014960	ATACC	2	10	41563	41572	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014960	CTTTC	2	10	69000	69009	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014960	GCGGG	2	10	84657	84666	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014960	TCCCG	2	10	86624	86633	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014960	GCAAA	2	10	90613	90622	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_014960	CAAGA	2	10	129167	129176	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014960	AATGG	2	10	136443	136452	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014960	CTCGG	2	10	138595	138604	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014960	GTTCA	2	10	155272	155281	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014960	GCCCT	2	10	168816	168825	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014960	AATTG	2	10	173131	173140	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014960	GAAAA	2	10	180842	180851	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014960	GCGGG	2	10	182202	182211	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014960	CACAC	2	10	185265	185274	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
19	NC_014960	TTATT	2	10	192766	192775	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014960	GGGTA	2	10	196625	196634	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014960	TCGTG	2	10	196863	196872	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014960	CGTCA	2	10	197183	197192	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014960	CGATC	2	10	197728	197737	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014960	AGAAT	2	10	197881	197890	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014960	GCTGA	2	10	199540	199549	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014960	CCGAA	2	10	199900	199909	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014960	AGGGG	2	10	208206	208215	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014960	TATAG	2	10	236964	236973	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014960	AGAGG	2	10	248852	248861	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014960	TCACT	2	10	250006	250015	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
31	NC_014960	AGAGA	2	10	255836	255845	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014960	TTTAT	2	10	264537	264546	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014960	CTTTC	2	10	277562	277571	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014960	ATACA	2	10	281715	281724	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014960	TTGCA	2	10	307563	307572	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014960	TCCTT	2	10	308018	308027	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
37	NC_014960	ATTTT	2	10	331569	331578	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014960	GTGAT	2	10	335679	335688	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014960	GTACT	2	10	346816	346825	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014960	AGGGG	2	10	349752	349761	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014960	CCCTT	2	10	349777	349786	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014960	AGGGG	2	10	368206	368215	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014960	ACCGA	2	10	382400	382409	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014960	AAAAC	2	10	396177	396186	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014960	CTGCC	2	10	401695	401704	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014960	CTTGC	2	10	403248	403257	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014960	CCCTT	2	10	405125	405134	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
48	NC_014960	GGAAG	2	10	418263	418272	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014960	CAAGT	2	10	447514	447523	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014960	AAGAT	2	10	453741	453750	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014960	TTTGC	2	10	473593	473602	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014960	TATAG	2	10	473710	473719	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014960	GGGGA	2	10	474527	474536	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014960	AAAAC	2	10	476882	476891	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014960	AAGGG	2	10	482104	482113	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014960	GGTGA	2	10	489471	489480	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014960	TCAAA	2	10	494531	494540	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014960	ATTTT	2	10	509921	509930	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014960	TACCT	2	10	521592	521601	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014960	ACAAT	2	10	521671	521680	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014960	TTTAT	2	10	521814	521823	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014960	CCATT	2	10	528730	528739	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
63	NC_014960	TAAAA	2	10	532676	532685	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014960	AATCG	2	10	559298	559307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014960	GGGGA	2	10	588909	588918	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014960	GGAAG	2	10	611184	611193	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014960	GCAGG	2	10	651366	651375	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014960	TCGTG	2	10	670370	670379	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014960	CGTCA	2	10	670690	670699	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014960	AGAAT	2	10	671060	671069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014960	GGAAG	2	10	672144	672153	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014960	CCGAA	2	10	673082	673091	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014960	AATAC	2	10	711738	711747	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014960	CTTTT	2	10	741000	741009	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014960	ATCCT	2	10	757282	757291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
76	NC_014960	GACCC	2	10	760944	760953	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_014960	TCTAT	2	10	765306	765315	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014960	GTTTT	2	10	767522	767531	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014960	TTTTC	2	10	769177	769186	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014960	AATTG	2	10	770589	770598	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014960	AGATG	2	10	786624	786633	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014960	ATATC	2	10	827842	827851	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014960	AAATA	2	10	834087	834096	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014960	AGAGA	2	10	840904	840913	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014960	TATCA	2	10	860240	860249	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014960	CATAG	2	10	888413	888422	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014960	AGATT	2	10	953778	953787	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014960	AGGGG	2	10	973139	973148	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014960	TCCAG	2	10	979501	979510	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_014960	CTCTT	2	10	996285	996294	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014960	ATAAG	2	10	1071167	1071176	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014960	CAGGA	2	10	1108464	1108473	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014960	GTTAT	2	10	1151386	1151395	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014960	AGGAA	2	10	1202618	1202627	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014960	TCCAA	2	10	1210285	1210294	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014960	TGTTT	2	10	1227472	1227481	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014960	CAGTA	2	10	1283192	1283201	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014960	CATAA	2	10	1301712	1301721	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014960	GGGCA	2	10	1318851	1318860	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014960	TTCAT	2	10	1370607	1370616	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014960	CACTG	2	10	1377833	1377842	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014960	CACTG	2	10	1378298	1378307	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014960	GCTCG	2	10	1378850	1378859	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014960	GTTTC	2	10	1381716	1381725	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014960	CGTTT	2	10	1382575	1382584	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014960	CTGGG	2	10	1383228	1383237	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014960	GGGTA	2	10	1384012	1384021	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014960	AAATC	2	10	1394768	1394777	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014960	GCTTT	2	10	1395828	1395837	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014960	CTGTT	2	10	1395838	1395847	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014960	TTATC	2	10	1397063	1397072	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014960	AAAGA	2	10	1421620	1421629	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014960	ACCGA	2	10	1431042	1431051	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014960	CGCTC	2	10	1455424	1455433	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
115	NC_014960	CCACG	2	10	1470945	1470954	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
116	NC_014960	GATTT	2	10	1490088	1490097	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014960	ATAGT	2	10	1517117	1517126	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014960	ATAAA	2	10	1526234	1526243	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014960	TTATT	2	10	1537551	1537560	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014960	AGGGG	2	10	1678022	1678031	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014960	ATATT	2	10	1678351	1678360	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014960	TTCAG	2	10	1703925	1703934	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014960	ATTTG	2	10	1800390	1800399	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014960	CAATC	2	10	1801426	1801435	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
125	NC_014960	ATCCA	2	10	1852564	1852573	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
126	NC_014960	GATTA	2	10	1859701	1859710	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014960	CAATA	2	10	1877869	1877878	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_014960	TTACA	2	10	1881180	1881189	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014960	ACCCG	2	10	1936402	1936411	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
130	NC_014960	TACCC	2	10	1976659	1976668	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
131	NC_014960	TGATA	2	10	1980282	1980291	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014960	TTTGA	2	10	1997400	1997409	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014960	TTTTC	2	10	1997418	1997427	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014960	TAGCA	2	10	2026870	2026879	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014960	AATAA	2	10	2028580	2028589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014960	TGAAA	2	10	2031723	2031732	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014960	TAAAA	2	10	2055293	2055302	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014960	CAACC	2	10	2072526	2072535	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
139	NC_014960	AGGAA	2	10	2090386	2090395	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014960	GAATT	2	10	2095672	2095681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014960	ATAAC	2	10	2109437	2109446	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014960	CAAAA	2	10	2122596	2122605	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014960	GGAGT	2	10	2138459	2138468	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014960	GATTC	2	10	2159431	2159440	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
145	NC_014960	AGGTG	2	10	2168905	2168914	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014960	ACCCC	2	10	2189775	2189784	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
147	NC_014960	GGTAT	2	10	2192524	2192533	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014960	ATAGA	2	10	2201162	2201171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014960	GGAAA	2	10	2241515	2241524	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014960	ACATA	2	10	2257732	2257741	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
151	NC_014960	ATCCT	2	10	2257762	2257771	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014960	ATTTC	2	10	2259296	2259305	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_014960	TTTGG	2	10	2367085	2367094	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014960	AGGTC	2	10	2379831	2379840	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014960	TGAAA	2	10	2384769	2384778	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014960	CGGGT	2	10	2419298	2419307	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014960	GATCG	2	10	2422526	2422535	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014960	GGACA	2	10	2422592	2422601	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014960	TCCCA	2	10	2423052	2423061	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
160	NC_014960	AATAA	2	10	2423395	2423404	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014960	CTTTT	2	10	2424961	2424970	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
162	NC_014960	TTTTC	2	10	2427246	2427255	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
163	NC_014960	TAAAA	2	10	2427275	2427284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014960	GTTAT	2	10	2429152	2429161	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014960	TTCCT	2	10	2451437	2451446	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
166	NC_014960	TGATA	2	10	2454450	2454459	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014960	GGCAA	2	10	2470855	2470864	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
168	NC_014960	CTGTG	2	10	2473736	2473745	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
169	NC_014960	TCCTT	2	10	2572325	2572334	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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171	NC_014960	TGCAT	2	10	2591571	2591580	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
172	NC_014960	GCGAT	2	10	2612484	2612493	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014960	CACGG	2	10	2612563	2612572	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
174	NC_014960	AAAAT	2	10	2619964	2619973	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014960	TAAAA	2	10	2623371	2623380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014960	TAGCA	2	10	2624508	2624517	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
177	NC_014960	CCGCC	2	10	2636341	2636350	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
178	NC_014960	CATCG	2	10	2636919	2636928	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
179	NC_014960	TGAAA	2	10	2640349	2640358	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014960	TTTAT	2	10	2659830	2659839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014960	GCCGC	2	10	2671137	2671146	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
182	NC_014960	CGCTC	2	10	2671462	2671471	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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185	NC_014960	ACTTG	2	10	2716557	2716566	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
186	NC_014960	GGCTG	2	10	2736941	2736950	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
187	NC_014960	TACTT	2	10	2742157	2742166	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_014960	ACCTC	2	10	2762412	2762421	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
189	NC_014960	AGGTA	2	10	2783890	2783899	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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191	NC_014960	ACCCC	2	10	2788075	2788084	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
192	NC_014960	AGAAA	2	10	2816353	2816362	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014960	CTCAC	2	10	2840162	2840171	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
194	NC_014960	ATTTT	2	10	2840248	2840257	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014960	AATGA	2	10	2848435	2848444	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_014960	TTTCC	2	10	2928277	2928286	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_014960	TTCTT	2	10	2933823	2933832	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_014960	ATATA	2	10	2942123	2942132	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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250	NC_014960	TAAGT	2	10	3493081	3493090	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
251	NC_014960	CGCGG	2	10	3506889	3506898	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
252	NC_014960	AAGGG	2	10	3514873	3514882	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
253	NC_014960	CACTT	2	10	3526452	3526461	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.