MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Deinococcus maricopensis DSM 21211 chromosome

Total Repeats: 3542

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014958	GCCGC	2	10	4380	4389	0 %	0 %	40 %	60 %	320332621
2	NC_014958	CGGCC	2	10	4525	4534	0 %	0 %	40 %	60 %	320332622
3	NC_014958	GACCT	2	10	5018	5027	20 %	20 %	20 %	40 %	320332622
4	NC_014958	TGGCG	2	10	5857	5866	0 %	20 %	60 %	20 %	320332622
5	NC_014958	CGCGC	3	15	7450	7464	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6	NC_014958	CCCGC	2	10	8107	8116	0 %	0 %	20 %	80 %	320332625
7	NC_014958	GCCCT	2	10	8118	8127	0 %	20 %	20 %	60 %	320332625
8	NC_014958	CGGCG	2	10	8533	8542	0 %	0 %	60 %	40 %	320332625
9	NC_014958	GCCGC	2	10	8589	8598	0 %	0 %	40 %	60 %	320332625
10	NC_014958	CCACC	3	15	8599	8613	20 %	0 %	0 %	80 %	320332625
11	NC_014958	CCTGG	2	10	9278	9287	0 %	20 %	40 %	40 %	320332626
12	NC_014958	ACGGC	2	10	13088	13097	20 %	0 %	40 %	40 %	320332627
13	NC_014958	CAGGA	2	10	13244	13253	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014958	CCGGC	2	10	13465	13474	0 %	0 %	40 %	60 %	320332628
15	NC_014958	TGGGG	2	10	14268	14277	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014958	CACCC	2	10	15291	15300	20 %	0 %	0 %	80 %	320332630
17	NC_014958	GCGTC	2	10	15629	15638	0 %	20 %	40 %	40 %	320332630
18	NC_014958	GGGCT	2	10	16114	16123	0 %	20 %	60 %	20 %	320332630
19	NC_014958	CGCGG	2	10	16380	16389	0 %	0 %	60 %	40 %	320332631
20	NC_014958	TCACC	2	10	17130	17139	20 %	20 %	0 %	60 %	320332631
21	NC_014958	CACCC	2	10	17170	17179	20 %	0 %	0 %	80 %	320332632
22	NC_014958	CGGCG	2	10	17334	17343	0 %	0 %	60 %	40 %	320332632
23	NC_014958	GCCGC	2	10	18085	18094	0 %	0 %	40 %	60 %	320332633
24	NC_014958	GGGGA	2	10	18328	18337	20 %	0 %	80 %	0 %	320332633
25	NC_014958	GCACG	2	10	18361	18370	20 %	0 %	40 %	40 %	320332633
26	NC_014958	GAGGG	2	10	19604	19613	20 %	0 %	80 %	0 %	320332634
27	NC_014958	ACGCG	2	10	20708	20717	20 %	0 %	40 %	40 %	320332636
28	NC_014958	CCGCG	2	10	20735	20744	0 %	0 %	40 %	60 %	320332636
29	NC_014958	CACGC	2	10	21347	21356	20 %	0 %	20 %	60 %	320332637
30	NC_014958	GCTGA	2	10	21640	21649	20 %	20 %	40 %	20 %	320332637
31	NC_014958	TGGGG	2	10	22026	22035	0 %	20 %	80 %	0 %	320332638
32	NC_014958	GCGCG	2	10	22077	22086	0 %	0 %	60 %	40 %	320332638
33	NC_014958	AAGAA	2	10	22934	22943	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014958	CCGCG	2	10	23990	23999	0 %	0 %	40 %	60 %	320332639
35	NC_014958	TGCTC	2	10	24403	24412	0 %	40 %	20 %	40 %	320332640
36	NC_014958	GGCCG	2	10	25313	25322	0 %	0 %	60 %	40 %	320332640
37	NC_014958	TGCTC	2	10	26329	26338	0 %	40 %	20 %	40 %	320332640
38	NC_014958	AGCGC	2	10	26578	26587	20 %	0 %	40 %	40 %	320332640
39	NC_014958	ACGCG	2	10	26662	26671	20 %	0 %	40 %	40 %	320332640
40	NC_014958	GGCCA	2	10	27239	27248	20 %	0 %	40 %	40 %	320332641
41	NC_014958	CGCGG	2	10	27784	27793	0 %	0 %	60 %	40 %	320332642
42	NC_014958	CGCGG	2	10	27853	27862	0 %	0 %	60 %	40 %	320332642
43	NC_014958	GCGCC	2	10	27948	27957	0 %	0 %	40 %	60 %	320332642
44	NC_014958	CGCGC	2	10	28731	28740	0 %	0 %	40 %	60 %	320332643
45	NC_014958	CCTCG	2	10	28962	28971	0 %	20 %	20 %	60 %	320332643
46	NC_014958	CCGGC	2	10	29012	29021	0 %	0 %	40 %	60 %	320332643
47	NC_014958	CACCT	2	10	29496	29505	20 %	20 %	0 %	60 %	320332644
48	NC_014958	TCACG	2	10	30444	30453	20 %	20 %	20 %	40 %	320332645
49	NC_014958	GCGCC	2	10	30582	30591	0 %	0 %	40 %	60 %	320332645
50	NC_014958	ACGCC	2	10	32315	32324	20 %	0 %	20 %	60 %	320332649
51	NC_014958	AGCGC	2	10	33797	33806	20 %	0 %	40 %	40 %	320332650
52	NC_014958	GCCCG	2	10	34136	34145	0 %	0 %	40 %	60 %	320332650
53	NC_014958	GCCGC	2	10	34567	34576	0 %	0 %	40 %	60 %	320332650
54	NC_014958	CGGCC	2	10	35497	35506	0 %	0 %	40 %	60 %	320332651
55	NC_014958	GGCGC	2	10	36111	36120	0 %	0 %	60 %	40 %	320332651
56	NC_014958	CGCAA	2	10	39654	39663	40 %	0 %	20 %	40 %	320332656
57	NC_014958	TTCGC	2	10	40747	40756	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014958	CTTTT	2	10	40856	40865	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014958	GGGCG	2	10	41694	41703	0 %	0 %	80 %	20 %	320332659
60	NC_014958	CGAAG	2	10	41778	41787	40 %	0 %	40 %	20 %	320332659
61	NC_014958	GCCGG	2	10	46610	46619	0 %	0 %	60 %	40 %	320332662
62	NC_014958	TGATG	2	10	47698	47707	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014958	CGGCC	2	10	50736	50745	0 %	0 %	40 %	60 %	320332665
64	NC_014958	CGGGC	2	10	50815	50824	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014958	CTTTT	2	10	53840	53849	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014958	GTCAG	2	10	54553	54562	20 %	20 %	40 %	20 %	320332670
67	NC_014958	CGCGG	2	10	54711	54720	0 %	0 %	60 %	40 %	320332670
68	NC_014958	CGCGC	2	10	55637	55646	0 %	0 %	40 %	60 %	320332670
69	NC_014958	CGTAC	2	10	56098	56107	20 %	20 %	20 %	40 %	320332670
70	NC_014958	GCGCC	2	10	58070	58079	0 %	0 %	40 %	60 %	320332671
71	NC_014958	GGCGC	2	10	58686	58695	0 %	0 %	60 %	40 %	320332672
72	NC_014958	TCGCG	2	10	60465	60474	0 %	20 %	40 %	40 %	320332673
73	NC_014958	GCGGG	2	10	61093	61102	0 %	0 %	80 %	20 %	320332673
74	NC_014958	CGCGG	2	10	61281	61290	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014958	CCGGC	2	10	63746	63755	0 %	0 %	40 %	60 %	320332676
76	NC_014958	GGGCC	2	10	64259	64268	0 %	0 %	60 %	40 %	320332676
77	NC_014958	GGCGG	2	10	64383	64392	0 %	0 %	80 %	20 %	320332676
78	NC_014958	CGGCG	2	10	65333	65342	0 %	0 %	60 %	40 %	320332677
79	NC_014958	CGCGC	2	10	65362	65371	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014958	GCGGT	2	10	66478	66487	0 %	20 %	60 %	20 %	320332679
81	NC_014958	GCGCG	2	10	67367	67376	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014958	GCGCC	2	10	68580	68589	0 %	0 %	40 %	60 %	320332681
83	NC_014958	GCAGC	2	10	68947	68956	20 %	0 %	40 %	40 %	320332681
84	NC_014958	CGCGG	2	10	69803	69812	0 %	0 %	60 %	40 %	320332681
85	NC_014958	CTGAC	2	10	70897	70906	20 %	20 %	20 %	40 %	320332682
86	NC_014958	TGGTG	2	10	72034	72043	0 %	40 %	60 %	0 %	320332684
87	NC_014958	GCGGA	2	10	73157	73166	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
88	NC_014958	GGCGT	2	10	73676	73685	0 %	20 %	60 %	20 %	320332686
89	NC_014958	GGGAG	2	10	74596	74605	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014958	ACACT	2	10	75612	75621	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
91	NC_014958	GAAGT	2	10	75645	75654	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014958	AATTG	2	10	76086	76095	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014958	CGGAT	2	10	76799	76808	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014958	GCTGA	2	10	76929	76938	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014958	GTCCG	2	10	78998	79007	0 %	20 %	40 %	40 %	320332687
96	NC_014958	TGACC	2	10	79008	79017	20 %	20 %	20 %	40 %	320332687
97	NC_014958	GCCCG	2	10	81202	81211	0 %	0 %	40 %	60 %	320332689
98	NC_014958	GAGCT	2	10	81489	81498	20 %	20 %	40 %	20 %	320332689
99	NC_014958	TGGCG	2	10	81697	81706	0 %	20 %	60 %	20 %	320332689
100	NC_014958	ACGGA	2	10	82076	82085	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014958	CGGAA	2	10	82120	82129	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014958	CGGCG	2	10	82434	82443	0 %	0 %	60 %	40 %	320332690
103	NC_014958	CCGCG	2	10	82808	82817	0 %	0 %	40 %	60 %	320332690
104	NC_014958	GCGCC	2	10	84735	84744	0 %	0 %	40 %	60 %	320332692
105	NC_014958	CGCGG	2	10	84892	84901	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014958	CGGTC	2	10	86619	86628	0 %	20 %	40 %	40 %	320332694
107	NC_014958	GCACG	2	10	89662	89671	20 %	0 %	40 %	40 %	320332697
108	NC_014958	GAACG	2	10	89711	89720	40 %	0 %	40 %	20 %	320332698
109	NC_014958	GCAGG	2	10	90571	90580	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014958	TCAGG	2	10	90591	90600	20 %	20 %	40 %	20 %	320332699
111	NC_014958	GAGCG	2	10	90707	90716	20 %	0 %	60 %	20 %	320332699
112	NC_014958	CCCCG	2	10	93199	93208	0 %	0 %	20 %	80 %	320332701
113	NC_014958	CCGCG	2	10	94444	94453	0 %	0 %	40 %	60 %	320332702
114	NC_014958	CGACC	2	10	94568	94577	20 %	0 %	20 %	60 %	320332702
115	NC_014958	ACGCC	2	10	97661	97670	20 %	0 %	20 %	60 %	320332705
116	NC_014958	CACGC	2	10	98328	98337	20 %	0 %	20 %	60 %	320332705
117	NC_014958	CTGGG	2	10	98602	98611	0 %	20 %	60 %	20 %	320332705
118	NC_014958	GGGCG	2	10	98788	98797	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014958	CGCCC	2	10	100510	100519	0 %	0 %	20 %	80 %	320332707
120	NC_014958	GCGCG	2	10	100550	100559	0 %	0 %	60 %	40 %	320332707
121	NC_014958	CGACC	2	10	101195	101204	20 %	0 %	20 %	60 %	320332707
122	NC_014958	CGCCC	2	10	101652	101661	0 %	0 %	20 %	80 %	320332707
123	NC_014958	GCCGT	2	10	101980	101989	0 %	20 %	40 %	40 %	320332708
124	NC_014958	CCGTC	2	10	107028	107037	0 %	20 %	20 %	60 %	320332716
125	NC_014958	CCGCG	2	10	109556	109565	0 %	0 %	40 %	60 %	320332718
126	NC_014958	ACGAC	2	10	110792	110801	40 %	0 %	20 %	40 %	320332719
127	NC_014958	CAGGT	2	10	114324	114333	20 %	20 %	40 %	20 %	320332723
128	NC_014958	GCCGC	2	10	114521	114530	0 %	0 %	40 %	60 %	320332723
129	NC_014958	CGCGG	2	10	116436	116445	0 %	0 %	60 %	40 %	320332724
130	NC_014958	GTCGC	2	10	118184	118193	0 %	20 %	40 %	40 %	320332725
131	NC_014958	GGCGC	2	10	118705	118714	0 %	0 %	60 %	40 %	320332725
132	NC_014958	GCGTG	3	15	118836	118850	0 %	20 %	60 %	20 %	320332725
133	NC_014958	GGCGC	2	10	118901	118910	0 %	0 %	60 %	40 %	320332725
134	NC_014958	CGCGC	2	10	119519	119528	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
135	NC_014958	GCGCC	2	10	119952	119961	0 %	0 %	40 %	60 %	320332726
136	NC_014958	GTCGG	2	10	122015	122024	0 %	20 %	60 %	20 %	320332728
137	NC_014958	GGCCA	2	10	122713	122722	20 %	0 %	40 %	40 %	320332728
138	NC_014958	GCGTC	2	10	122808	122817	0 %	20 %	40 %	40 %	320332728
139	NC_014958	GACGC	2	10	124380	124389	20 %	0 %	40 %	40 %	320332730
140	NC_014958	CGGGC	2	10	124481	124490	0 %	0 %	60 %	40 %	320332730
141	NC_014958	GCGCT	2	10	124617	124626	0 %	20 %	40 %	40 %	320332730
142	NC_014958	GCGCC	2	10	124667	124676	0 %	0 %	40 %	60 %	320332731
143	NC_014958	CCCGA	2	10	126024	126033	20 %	0 %	20 %	60 %	320332732
144	NC_014958	CCGGC	2	10	127279	127288	0 %	0 %	40 %	60 %	320332733
145	NC_014958	CGTCC	2	10	127319	127328	0 %	20 %	20 %	60 %	320332733
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147	NC_014958	GCGTG	2	10	129313	129322	0 %	20 %	60 %	20 %	320332734
148	NC_014958	ACGTG	2	10	129737	129746	20 %	20 %	40 %	20 %	320332734
149	NC_014958	TTCGC	2	10	131216	131225	0 %	40 %	20 %	40 %	320332735
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152	NC_014958	GCGGG	2	10	136862	136871	0 %	0 %	80 %	20 %	320332740
153	NC_014958	CGGCC	2	10	137827	137836	0 %	0 %	40 %	60 %	320332741
154	NC_014958	AGCGG	2	10	138704	138713	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014958	CGGTC	2	10	138764	138773	0 %	20 %	40 %	40 %	320332742
156	NC_014958	GGGCC	2	10	139862	139871	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
157	NC_014958	GCCGC	2	10	140589	140598	0 %	0 %	40 %	60 %	320332744
158	NC_014958	CGACG	2	10	142308	142317	20 %	0 %	40 %	40 %	320332745
159	NC_014958	GCTTT	2	10	145563	145572	0 %	60 %	20 %	20 %	320332748
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161	NC_014958	CGCAG	2	10	147737	147746	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
162	NC_014958	ACCCC	2	10	148042	148051	20 %	0 %	0 %	80 %	320332749
163	NC_014958	CCGCG	2	10	150123	150132	0 %	0 %	40 %	60 %	320332751
164	NC_014958	CGTTC	2	10	150315	150324	0 %	40 %	20 %	40 %	320332751
165	NC_014958	CCCGT	2	10	150709	150718	0 %	20 %	20 %	60 %	320332751
166	NC_014958	GCGCC	2	10	152557	152566	0 %	0 %	40 %	60 %	320332753
167	NC_014958	CGGCG	2	10	153724	153733	0 %	0 %	60 %	40 %	320332755
168	NC_014958	CCGCG	2	10	154301	154310	0 %	0 %	40 %	60 %	320332756
169	NC_014958	CTGCC	2	10	154462	154471	0 %	20 %	20 %	60 %	320332756
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171	NC_014958	CGCGG	2	10	156682	156691	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
172	NC_014958	ACGTG	2	10	156693	156702	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
173	NC_014958	CAGGG	2	10	156833	156842	20 %	0 %	60 %	20 %	320332760
174	NC_014958	TCCCC	2	10	157927	157936	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
175	NC_014958	GGGCG	2	10	161337	161346	0 %	0 %	80 %	20 %	320332763
176	NC_014958	GCCGC	2	10	161818	161827	0 %	0 %	40 %	60 %	320332763
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178	NC_014958	CGGGC	2	10	164481	164490	0 %	0 %	60 %	40 %	320332765
179	NC_014958	CGGCT	2	10	165007	165016	0 %	20 %	40 %	40 %	320332765
180	NC_014958	GCCGC	2	10	165191	165200	0 %	0 %	40 %	60 %	320332765
181	NC_014958	CCCCA	2	10	165608	165617	20 %	0 %	0 %	80 %	320332765
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183	NC_014958	GCCGC	2	10	167186	167195	0 %	0 %	40 %	60 %	320332767
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188	NC_014958	GTCGC	2	10	168521	168530	0 %	20 %	40 %	40 %	320332768
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191	NC_014958	CGGCC	2	10	169855	169864	0 %	0 %	40 %	60 %	320332769
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199	NC_014958	CGGCG	2	10	178998	179007	0 %	0 %	60 %	40 %	320332774
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222	NC_014958	CACGT	2	10	196769	196778	20 %	20 %	20 %	40 %	320332789
223	NC_014958	GTCCT	2	10	197087	197096	0 %	40 %	20 %	40 %	320332789
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231	NC_014958	CCGCG	2	10	204878	204887	0 %	0 %	40 %	60 %	320332795
232	NC_014958	GCCGC	3	15	204973	204987	0 %	0 %	40 %	60 %	320332795
233	NC_014958	TGCGT	2	10	205259	205268	0 %	40 %	40 %	20 %	320332795
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235	NC_014958	GGCGT	2	10	206801	206810	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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240	NC_014958	TGCCC	2	10	210686	210695	0 %	20 %	20 %	60 %	320332800
241	NC_014958	CGCAG	2	10	211664	211673	20 %	0 %	40 %	40 %	320332802
242	NC_014958	ACGCG	2	10	211755	211764	20 %	0 %	40 %	40 %	320332802
243	NC_014958	CGGCG	2	10	212951	212960	0 %	0 %	60 %	40 %	320332803
244	NC_014958	GGCGC	2	10	213283	213292	0 %	0 %	60 %	40 %	320332803
245	NC_014958	CGCGG	2	10	213602	213611	0 %	0 %	60 %	40 %	320332803
246	NC_014958	GCGTT	2	10	219010	219019	0 %	40 %	40 %	20 %	320332808
247	NC_014958	GGGGT	2	10	219823	219832	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
248	NC_014958	CGCCC	2	10	219997	220006	0 %	0 %	20 %	80 %	320332809
249	NC_014958	CTGCC	2	10	223242	223251	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
250	NC_014958	GCGCG	2	10	225131	225140	0 %	0 %	60 %	40 %	320332813
251	NC_014958	GCCGC	2	10	226224	226233	0 %	0 %	40 %	60 %	320332814
252	NC_014958	GGCGG	2	10	227650	227659	0 %	0 %	80 %	20 %	320332815
253	NC_014958	GCCCG	2	10	229969	229978	0 %	0 %	40 %	60 %	320332818
254	NC_014958	CGGCG	2	10	230257	230266	0 %	0 %	60 %	40 %	320332818
255	NC_014958	TCGCG	2	10	230723	230732	0 %	20 %	40 %	40 %	320332819
256	NC_014958	GACGT	2	10	231357	231366	20 %	20 %	40 %	20 %	320332820
257	NC_014958	GCAGC	2	10	231445	231454	20 %	0 %	40 %	40 %	320332820
258	NC_014958	CGACG	2	10	233410	233419	20 %	0 %	40 %	40 %	320332821
259	NC_014958	CGCGC	2	10	234165	234174	0 %	0 %	40 %	60 %	320332822
260	NC_014958	GCGGG	2	10	234516	234525	0 %	0 %	80 %	20 %	320332822
261	NC_014958	GCGCG	2	10	234587	234596	0 %	0 %	60 %	40 %	320332823
262	NC_014958	GCTCG	2	10	236427	236436	0 %	20 %	40 %	40 %	320332825
263	NC_014958	ACCCG	2	10	239548	239557	20 %	0 %	20 %	60 %	320332827
264	NC_014958	GGTGA	2	10	240023	240032	20 %	20 %	60 %	0 %	320332827
265	NC_014958	CGCGG	2	10	240301	240310	0 %	0 %	60 %	40 %	320332827
266	NC_014958	ACGAC	2	10	240531	240540	40 %	0 %	20 %	40 %	320332827
267	NC_014958	GCACG	2	10	240892	240901	20 %	0 %	40 %	40 %	320332827
268	NC_014958	GGCGC	2	10	241373	241382	0 %	0 %	60 %	40 %	320332827
269	NC_014958	CGCGC	2	10	244348	244357	0 %	0 %	40 %	60 %	320332828
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271	NC_014958	GGTCG	2	10	245198	245207	0 %	20 %	60 %	20 %	320332829
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292	NC_014958	GCGCG	2	10	263419	263428	0 %	0 %	60 %	40 %	320332845
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