MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 62

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	CCCGGC	2	12	714	725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041923
2	NC_014957	GGTGAT	2	12	1586	1597	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	320041923
3	NC_014957	GCTCCG	2	12	3290	3301	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320041923
4	NC_014957	CGCCCT	2	12	3302	3313	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041923
5	NC_014957	CCCTCC	2	12	3418	3429	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	320041923
6	NC_014957	TTGTGT	2	12	4003	4014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	320041925
7	NC_014957	CTCGTC	2	12	7931	7942	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	320041927
8	NC_014957	CAGCGG	2	12	8418	8429	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320041927
9	NC_014957	CGGTGG	2	12	8707	8718	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041927
10	NC_014957	CTCCAG	2	12	9365	9376	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320041927
11	NC_014957	CGCCTG	2	12	10477	10488	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	320041927
12	NC_014957	CGTCAC	2	12	10848	10859	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	320041927
13	NC_014957	CGCGCC	2	12	11184	11195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041927
14	NC_014957	CGGTTG	2	12	11490	11501	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	320041927
15	NC_014957	GTCAAC	2	12	12261	12272	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320041927
16	NC_014957	GCCGCG	2	12	12445	12456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014957	GTTGGG	2	12	18440	18451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041933
18	NC_014957	GGGGCG	2	12	19842	19853	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	320041934
19	NC_014957	GCCGAC	2	12	20743	20754	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041934
20	NC_014957	GCCGAT	2	12	20767	20778	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320041934
21	NC_014957	GCGCAC	2	12	21629	21640	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041935
22	NC_014957	CAGGGG	2	12	21674	21685	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320041935
23	NC_014957	GGCCCA	2	12	24171	24182	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041937
24	NC_014957	CCACGC	2	12	24663	24674	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320041937
25	NC_014957	CGCCTC	2	12	25320	25331	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041937
26	NC_014957	CTCGAA	2	12	25862	25873	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320041938
27	NC_014957	CCCCCA	3	18	26465	26482	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	320041938
28	NC_014957	CAGGCC	2	12	29024	29035	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	320041940
29	NC_014957	TATGGC	2	12	30674	30685	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320041940
30	NC_014957	TATGGC	3	18	30692	30709	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320041940
31	NC_014957	GTCAAG	2	12	30734	30745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320041940
32	NC_014957	CAACGC	2	12	30790	30801	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	320041940
33	NC_014957	CAGACT	2	12	30828	30839	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	320041940
34	NC_014957	GGGCGT	2	12	31295	31306	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041941
35	NC_014957	CACCGC	2	12	31797	31808	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320041941
36	NC_014957	CGCGGC	2	12	33243	33254	0 %	0 %	50 %	50 %	320041942
37	NC_014957	GGCCGA	2	12	33563	33574	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	320041942
38	NC_014957	ACGCCC	2	12	34501	34512	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320041942
39	NC_014957	CTGCGT	2	12	35542	35553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	320041942
40	NC_014957	ACGCCC	2	12	35857	35868	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	320041942
41	NC_014957	CGCTGG	2	12	36526	36537	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320041942
42	NC_014957	CGCCCG	2	12	37028	37039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	320041942
43	NC_014957	AACCCA	2	12	37127	37138	50 %	0 %	0 %	50 %	320041942
44	NC_014957	ACGACC	3	18	38583	38600	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014957	AGTGGG	2	12	40571	40582	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014957	GGGTTG	2	12	40854	40865	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	320041946
47	NC_014957	GGCCTG	2	12	41008	41019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320041946
48	NC_014957	GTGGCG	2	12	41029	41040	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041946
49	NC_014957	GCCTAT	2	12	41413	41424	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	320041946
50	NC_014957	CCGCTC	2	12	42973	42984	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041948
51	NC_014957	CTCCCG	2	12	43060	43071	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	320041948
52	NC_014957	CATCTC	2	12	45813	45824	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	320041949
53	NC_014957	GGGGTG	2	12	49884	49895	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	320041950
54	NC_014957	CCCTTC	2	12	49934	49945	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	320041950
55	NC_014957	GGCTGG	2	12	49979	49990	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041950
56	NC_014957	GGGCGG	2	12	50006	50017	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	320041950
57	NC_014957	TGGACT	2	12	52853	52864	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	320041952
58	NC_014957	GGGACG	2	12	52990	53001	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	320041952
59	NC_014957	CGTGGC	2	12	54128	54139	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	320041953
60	NC_014957	GCGGGT	2	12	54167	54178	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	320041953
61	NC_014957	CGATGA	2	12	54982	54993	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	320041954
62	NC_014957	CTGAGC	2	12	56148	56159	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	320041954

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.