MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 45

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	ACGAG	2	10	157	166	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014957	ATGGG	2	10	4278	4287	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014957	GGAAG	2	10	4348	4357	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014957	CGAAT	2	10	4511	4520	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014957	GGCCG	2	10	4669	4678	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6	NC_014957	ATCGA	2	10	4737	4746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014957	GCGGA	2	10	4788	4797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014957	GATGA	2	10	4859	4868	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014957	GTCGC	2	10	4933	4942	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014957	GGAAA	2	10	4966	4975	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014957	GTTCC	2	10	4989	4998	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
12	NC_014957	CATTC	2	10	5003	5012	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
13	NC_014957	GTGAT	2	10	5132	5141	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014957	AACCG	2	10	5174	5183	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014957	GTCAT	2	10	5458	5467	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014957	CTCGT	2	10	5496	5505	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_014957	CTGGT	3	15	5506	5520	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014957	GTTGT	2	10	7725	7734	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014957	CGCGG	2	10	7752	7761	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_014957	GCAGG	2	10	17471	17480	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014957	CTGGT	2	10	19805	19814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_014957	ATCCC	3	15	23786	23800	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
23	NC_014957	CGGAC	3	15	23818	23832	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014957	CGGAC	4	20	23838	23857	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014957	GTAAC	2	10	24057	24066	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014957	ATGTT	2	10	24080	24089	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014957	CAGGG	2	10	25371	25380	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014957	GAGGG	2	10	26697	26706	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014957	AGGGG	2	10	26714	26723	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014957	TCGGG	3	15	26750	26764	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014957	GGCAT	2	10	32030	32039	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014957	CCCAA	2	10	38474	38483	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014957	ACGAC	2	10	40408	40417	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014957	TTGTT	3	15	44361	44375	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014957	GGACG	2	10	45023	45032	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014957	TGGGG	2	10	45083	45092	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014957	TTAAG	2	10	46709	46718	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014957	GTTCC	2	10	47792	47801	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014957	TTGAG	2	10	50646	50655	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014957	ACGGA	5	25	52290	52314	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
41	NC_014957	CACCT	3	15	53179	53193	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014957	TCACC	2	10	53208	53217	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
43	NC_014957	TGGTG	5	25	54313	54337	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014957	CTGAA	2	10	54727	54736	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014957	CTTGA	2	10	54826	54835	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.