MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 44

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	TGTT	2	8	127	134	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014957	AAGC	2	8	3540	3547	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014957	AGTG	2	8	4248	4255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014957	GAAG	2	8	4295	4302	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014957	ATCG	2	8	4426	4433	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_014957	GTTC	2	8	4719	4726	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_014957	GACG	2	8	4749	4756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014957	CTTG	2	8	5409	5416	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014957	GACG	2	8	5551	5558	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014957	CCGG	2	8	5575	5582	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014957	ACGG	2	8	5758	5765	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_014957	CCCA	2	8	7829	7836	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_014957	GATC	2	8	12408	12415	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_014957	GCCG	2	8	14299	14306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_014957	CGGG	2	8	14329	14336	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014957	GCCG	2	8	14503	14510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_014957	CAAG	2	8	17224	17231	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014957	GGCG	2	8	19757	19764	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014957	GGGA	2	8	19789	19796	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014957	CGGG	2	8	22383	22390	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014957	CCCA	2	8	23591	23598	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
22	NC_014957	GCCA	2	8	23712	23719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014957	GGAT	2	8	23859	23866	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014957	CACC	2	8	26845	26852	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
25	NC_014957	AGGG	2	8	27030	27037	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014957	TCGG	2	8	27135	27142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014957	GCCC	2	8	32015	32022	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_014957	CGAC	2	8	32188	32195	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014957	ACGC	2	8	37161	37168	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_014957	ACCC	2	8	38011	38018	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
31	NC_014957	CTTC	2	8	38202	38209	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_014957	TGGT	2	8	39587	39594	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014957	GTCC	2	8	40600	40607	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_014957	GCCC	2	8	40677	40684	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
35	NC_014957	TTGA	2	8	40745	40752	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014957	GAGG	2	8	42374	42381	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014957	TGAA	2	8	46852	46859	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014957	TGGG	2	8	49292	49299	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014957	GGAA	2	8	50349	50356	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014957	CAAA	2	8	50526	50533	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_014957	ACGA	2	8	50567	50574	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_014957	CCCG	2	8	53110	53117	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
43	NC_014957	TCGA	2	8	54857	54864	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014957	GGGC	2	8	54912	54919	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.