MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 131

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	GCCG	2	8	837	844	0 %	0 %	50 %	50 %	320041923
2	NC_014957	CGCC	2	8	920	927	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
3	NC_014957	GACG	2	8	1089	1096	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
4	NC_014957	CCGC	2	8	1417	1424	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
5	NC_014957	GCCA	2	8	1611	1618	25 %	0 %	25 %	50 %	320041923
6	NC_014957	CTGC	2	8	1919	1926	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
7	NC_014957	CGCT	2	8	2601	2608	0 %	25 %	25 %	50 %	320041923
8	NC_014957	CGCC	2	8	2762	2769	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
9	NC_014957	ACGG	2	8	3007	3014	25 %	0 %	50 %	25 %	320041923
10	NC_014957	CGCC	2	8	3020	3027	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
11	NC_014957	CCGC	2	8	3112	3119	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
12	NC_014957	GGTC	2	8	3146	3153	0 %	25 %	50 %	25 %	320041923
13	NC_014957	CCGC	2	8	3343	3350	0 %	0 %	25 %	75 %	320041923
14	NC_014957	GGTC	2	8	3752	3759	0 %	25 %	50 %	25 %	320041924
15	NC_014957	CATC	2	8	3905	3912	25 %	25 %	0 %	50 %	320041924
16	NC_014957	TCGC	2	8	4031	4038	0 %	25 %	25 %	50 %	320041925
17	NC_014957	CCCG	2	8	6029	6036	0 %	0 %	25 %	75 %	320041926
18	NC_014957	CCTT	2	8	6213	6220	0 %	50 %	0 %	50 %	320041926
19	NC_014957	CCCA	2	8	7337	7344	25 %	0 %	0 %	75 %	320041926
20	NC_014957	GCAG	2	8	8005	8012	25 %	0 %	50 %	25 %	320041927
21	NC_014957	GACC	2	8	8081	8088	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
22	NC_014957	CGCC	2	8	8948	8955	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
23	NC_014957	TGCA	2	8	9108	9115	25 %	25 %	25 %	25 %	320041927
24	NC_014957	CGAT	2	8	9982	9989	25 %	25 %	25 %	25 %	320041927
25	NC_014957	GCCC	2	8	10304	10311	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
26	NC_014957	CGGC	2	8	10492	10499	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
27	NC_014957	CCCG	2	8	10529	10536	0 %	0 %	25 %	75 %	320041927
28	NC_014957	ACCC	2	8	10722	10729	25 %	0 %	0 %	75 %	320041927
29	NC_014957	GCCG	2	8	10796	10803	0 %	0 %	50 %	50 %	320041927
30	NC_014957	AGCG	2	8	11667	11674	25 %	0 %	50 %	25 %	320041927
31	NC_014957	GGGA	2	8	11935	11942	25 %	0 %	75 %	0 %	320041927
32	NC_014957	GACC	2	8	12281	12288	25 %	0 %	25 %	50 %	320041927
33	NC_014957	GGCA	2	8	12797	12804	25 %	0 %	50 %	25 %	320041928
34	NC_014957	TGGT	2	8	13756	13763	0 %	50 %	50 %	0 %	320041928
35	NC_014957	CCGG	2	8	14095	14102	0 %	0 %	50 %	50 %	320041928
36	NC_014957	TGGG	2	8	14204	14211	0 %	25 %	75 %	0 %	320041928
37	NC_014957	CGGC	2	8	15298	15305	0 %	0 %	50 %	50 %	320041929
38	NC_014957	CCCG	2	8	15529	15536	0 %	0 %	25 %	75 %	320041929
39	NC_014957	CCGT	2	8	15734	15741	0 %	25 %	25 %	50 %	320041929
40	NC_014957	CCCG	2	8	15783	15790	0 %	0 %	25 %	75 %	320041929
41	NC_014957	TGGC	2	8	15875	15882	0 %	25 %	50 %	25 %	320041929
42	NC_014957	GCGG	2	8	17976	17983	0 %	0 %	75 %	25 %	320041932
43	NC_014957	GCGG	2	8	18148	18155	0 %	0 %	75 %	25 %	320041932
44	NC_014957	TGGG	2	8	18349	18356	0 %	25 %	75 %	0 %	320041933
45	NC_014957	CAGG	2	8	18366	18373	25 %	0 %	50 %	25 %	320041933
46	NC_014957	CCGC	2	8	18952	18959	0 %	0 %	25 %	75 %	320041933
47	NC_014957	TGAA	2	8	19078	19085	50 %	25 %	25 %	0 %	320041933
48	NC_014957	TTCG	2	8	19424	19431	0 %	50 %	25 %	25 %	320041933
49	NC_014957	CGGA	2	8	20592	20599	25 %	0 %	50 %	25 %	320041934
50	NC_014957	GCCA	2	8	21569	21576	25 %	0 %	25 %	50 %	320041935
51	NC_014957	GGGC	2	8	21911	21918	0 %	0 %	75 %	25 %	320041935
52	NC_014957	TGGT	2	8	22776	22783	0 %	50 %	50 %	0 %	320041936
53	NC_014957	CCAA	2	8	23010	23017	50 %	0 %	0 %	50 %	320041936
54	NC_014957	GGGC	2	8	23029	23036	0 %	0 %	75 %	25 %	320041936
55	NC_014957	GATC	2	8	23161	23168	25 %	25 %	25 %	25 %	320041936
56	NC_014957	GGCC	2	8	23467	23474	0 %	0 %	50 %	50 %	320041936
57	NC_014957	CCCG	2	8	23493	23500	0 %	0 %	25 %	75 %	320041936
58	NC_014957	TGCG	2	8	24214	24221	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
59	NC_014957	CTGG	2	8	24708	24715	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
60	NC_014957	CGAC	2	8	24810	24817	25 %	0 %	25 %	50 %	320041937
61	NC_014957	GCTG	2	8	24981	24988	0 %	25 %	50 %	25 %	320041937
62	NC_014957	GGCT	2	8	26108	26115	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
63	NC_014957	TCGG	2	8	26304	26311	0 %	25 %	50 %	25 %	320041938
64	NC_014957	GATC	2	8	26398	26405	25 %	25 %	25 %	25 %	320041938
65	NC_014957	GCGT	2	8	27288	27295	0 %	25 %	50 %	25 %	320041939
66	NC_014957	CGGG	2	8	27436	27443	0 %	0 %	75 %	25 %	320041939
67	NC_014957	CAAC	2	8	27934	27941	50 %	0 %	0 %	50 %	320041939
68	NC_014957	CGCC	2	8	28212	28219	0 %	0 %	25 %	75 %	320041940
69	NC_014957	TGGG	2	8	29076	29083	0 %	25 %	75 %	0 %	320041940
70	NC_014957	GCGG	2	8	29209	29216	0 %	0 %	75 %	25 %	320041940
71	NC_014957	CAAC	2	8	29404	29411	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
72	NC_014957	CAAC	2	8	29551	29558	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
73	NC_014957	TCAA	2	8	29559	29566	50 %	25 %	0 %	25 %	320041940
74	NC_014957	ACCA	2	8	29639	29646	50 %	0 %	0 %	50 %	320041940
75	NC_014957	ATGG	2	8	31178	31185	25 %	25 %	50 %	0 %	320041941
76	NC_014957	GGCC	2	8	31469	31476	0 %	0 %	50 %	50 %	320041941
77	NC_014957	GCCC	2	8	31593	31600	0 %	0 %	25 %	75 %	320041941
78	NC_014957	CCGC	2	8	31979	31986	0 %	0 %	25 %	75 %	320041941
79	NC_014957	TGGC	2	8	32460	32467	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
80	NC_014957	CCGC	2	8	33682	33689	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
81	NC_014957	CGCC	2	8	33782	33789	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
82	NC_014957	CGGG	2	8	33836	33843	0 %	0 %	75 %	25 %	320041942
83	NC_014957	GGTT	2	8	34180	34187	0 %	50 %	50 %	0 %	320041942
84	NC_014957	CAGG	2	8	34211	34218	25 %	0 %	50 %	25 %	320041942
85	NC_014957	CCGC	2	8	34450	34457	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
86	NC_014957	ACCC	2	8	34694	34701	25 %	0 %	0 %	75 %	320041942
87	NC_014957	GGAG	2	8	34805	34812	25 %	0 %	75 %	0 %	320041942
88	NC_014957	CGCC	2	8	35135	35142	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
89	NC_014957	AACC	2	8	35213	35220	50 %	0 %	0 %	50 %	320041942
90	NC_014957	CGCC	2	8	35375	35382	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
91	NC_014957	CCCG	2	8	35668	35675	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
92	NC_014957	GGCT	2	8	35683	35690	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
93	NC_014957	CAGT	2	8	35726	35733	25 %	25 %	25 %	25 %	320041942
94	NC_014957	GCCC	2	8	36307	36314	0 %	0 %	25 %	75 %	320041942
95	NC_014957	TCGG	2	8	36403	36410	0 %	25 %	50 %	25 %	320041942
96	NC_014957	ATCG	2	8	36828	36835	25 %	25 %	25 %	25 %	320041942
97	NC_014957	GCGG	2	8	37338	37345	0 %	0 %	75 %	25 %	320041943
98	NC_014957	CCAC	2	8	38902	38909	25 %	0 %	0 %	75 %	320041944
99	NC_014957	GGAC	2	8	39533	39540	25 %	0 %	50 %	25 %	320041944
100	NC_014957	GATT	2	8	39662	39669	25 %	50 %	25 %	0 %	320041945
101	NC_014957	TGGT	2	8	41564	41571	0 %	50 %	50 %	0 %	320041946
102	NC_014957	CCCG	2	8	41764	41771	0 %	0 %	25 %	75 %	320041946
103	NC_014957	GGCG	2	8	42068	42075	0 %	0 %	75 %	25 %	320041946
104	NC_014957	CACC	2	8	42257	42264	25 %	0 %	0 %	75 %	320041946
105	NC_014957	ATCA	2	8	43276	43283	50 %	25 %	0 %	25 %	320041948
106	NC_014957	CGGT	2	8	44123	44130	0 %	25 %	50 %	25 %	320041948
107	NC_014957	GCCA	2	8	45290	45297	25 %	0 %	25 %	50 %	320041949
108	NC_014957	GCCG	2	8	45496	45503	0 %	0 %	50 %	50 %	320041949
109	NC_014957	GCCC	2	8	45604	45611	0 %	0 %	25 %	75 %	320041949
110	NC_014957	GACC	2	8	45637	45644	25 %	0 %	25 %	50 %	320041949
111	NC_014957	CACC	2	8	45723	45730	25 %	0 %	0 %	75 %	320041949
112	NC_014957	CCGC	2	8	46125	46132	0 %	0 %	25 %	75 %	320041949
113	NC_014957	CCTT	2	8	46250	46257	0 %	50 %	0 %	50 %	320041949
114	NC_014957	GCCG	2	8	46258	46265	0 %	0 %	50 %	50 %	320041949
115	NC_014957	CAAC	2	8	46576	46583	50 %	0 %	0 %	50 %	320041949
116	NC_014957	CCCT	2	8	46642	46649	0 %	25 %	0 %	75 %	320041949
117	NC_014957	CGGG	2	8	49708	49715	0 %	0 %	75 %	25 %	320041950
118	NC_014957	TGGG	2	8	49998	50005	0 %	25 %	75 %	0 %	320041950
119	NC_014957	GGAC	2	8	50040	50047	25 %	0 %	50 %	25 %	320041950
120	NC_014957	GTCA	2	8	51206	51213	25 %	25 %	25 %	25 %	320041951
121	NC_014957	ATCG	2	8	51638	51645	25 %	25 %	25 %	25 %	320041951
122	NC_014957	GGCG	2	8	51793	51800	0 %	0 %	75 %	25 %	320041951
123	NC_014957	GCAC	2	8	51972	51979	25 %	0 %	25 %	50 %	320041951
124	NC_014957	AGGG	2	8	52653	52660	25 %	0 %	75 %	0 %	320041952
125	NC_014957	CGGG	2	8	52879	52886	0 %	0 %	75 %	25 %	320041952
126	NC_014957	AACC	2	8	53027	53034	50 %	0 %	0 %	50 %	320041952
127	NC_014957	TGCT	2	8	53326	53333	0 %	50 %	25 %	25 %	320041953
128	NC_014957	GATC	2	8	53792	53799	25 %	25 %	25 %	25 %	320041953
129	NC_014957	GCTC	2	8	53894	53901	0 %	25 %	25 %	50 %	320041953
130	NC_014957	GAGG	2	8	55044	55051	25 %	0 %	75 %	0 %	320041954
131	NC_014957	GGCC	2	8	55319	55326	0 %	0 %	50 %	50 %	320041954

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.