MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Isosphaera pallida ATCC 43644 plasmid pISOP01

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014957	GAG	2	6	11	16	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014957	GAG	2	6	18	23	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014957	GAG	2	6	39	44	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014957	GAG	2	6	53	58	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014957	GTG	2	6	248	253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014957	ACC	2	6	3482	3487	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_014957	ACC	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_014957	CGT	2	6	3506	3511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_014957	AAC	2	6	3524	3529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014957	CTT	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014957	TGT	2	6	4338	4343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014957	GGC	2	6	4370	4375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014957	GCG	2	6	4376	4381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014957	GTG	2	6	4437	4442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014957	TCC	2	6	4461	4466	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_014957	CCT	2	6	4472	4477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_014957	GGC	2	6	4492	4497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014957	TGG	2	6	4610	4615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014957	TGC	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014957	GAA	2	6	4709	4714	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014957	GTC	2	6	4814	4819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014957	GAT	2	6	5126	5131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014957	GTC	2	6	5147	5152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014957	TGA	2	6	5187	5192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014957	GAT	2	6	5314	5319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014957	GAG	2	6	5537	5542	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014957	GGC	2	6	5568	5573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014957	ATT	2	6	5715	5720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014957	ATC	2	6	7645	7650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014957	GTG	2	6	7710	7715	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014957	GGT	2	6	7774	7779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014957	ATG	2	6	7891	7896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014957	CGG	2	6	12502	12507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014957	GAG	2	6	14625	14630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014957	TGG	2	6	14684	14689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014957	AGG	2	6	14738	14743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014957	TGG	2	6	14773	14778	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014957	CAT	2	6	14865	14870	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014957	AAG	2	6	14902	14907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014957	GAG	2	6	14956	14961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014957	GCG	2	6	15013	15018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014957	TTC	2	6	16118	16123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014957	TCG	2	6	16159	16164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014957	ATC	2	6	16434	16439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014957	TTC	2	6	16466	16471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014957	TTC	2	6	16592	16597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014957	TTC	2	6	16718	16723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014957	TTC	2	6	16844	16849	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014957	TTC	2	6	16970	16975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_014957	ATC	2	6	17079	17084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014957	ATG	2	6	17118	17123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014957	GTC	2	6	17148	17153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014957	GAA	2	6	17488	17493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014957	ATG	2	6	18208	18213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014957	ATG	2	6	18222	18227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014957	TGG	3	9	18233	18241	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014957	GGT	2	6	18273	18278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014957	GGA	2	6	18309	18314	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014957	GAC	2	6	18330	18335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014957	CGA	2	6	19765	19770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014957	GGC	2	6	19780	19785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014957	GCC	2	6	21130	21135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014957	TCA	2	6	21166	21171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014957	CGC	2	6	21266	21271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014957	AGG	2	6	21272	21277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014957	GGT	2	6	21321	21326	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014957	CGC	2	6	22319	22324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_014957	TCC	2	6	23564	23569	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014957	ATC	2	6	23621	23626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014957	GCC	2	6	23730	23735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014957	GTG	2	6	23919	23924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014957	GGT	2	6	23987	23992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014957	TGG	3	9	24028	24036	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014957	ATG	2	6	24072	24077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014957	GAC	2	6	25387	25392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014957	TTC	2	6	26626	26631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014957	CTT	2	6	26674	26679	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014957	CCG	2	6	26680	26685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_014957	GTC	2	6	26738	26743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014957	CGC	2	6	26808	26813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_014957	CTT	2	6	26816	26821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014957	CGG	2	6	26855	26860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014957	TGG	2	6	26911	26916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014957	GTG	2	6	26974	26979	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014957	CAA	2	6	26991	26996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014957	TCC	2	6	27069	27074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_014957	GTC	2	6	27084	27089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014957	GGT	2	6	27159	27164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014957	CCG	2	6	32058	32063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_014957	CGC	3	9	37192	37200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014957	ACG	2	6	37990	37995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014957	ACG	2	6	38134	38139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014957	GCG	2	6	38167	38172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014957	GTC	2	6	38210	38215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_014957	TGG	2	6	38440	38445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014957	CGC	2	6	38541	38546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014957	GCG	2	6	38550	38555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014957	GAT	2	6	39601	39606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014957	TCC	2	6	39622	39627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_014957	GAC	2	6	40349	40354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014957	GTC	2	6	40394	40399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014957	CCA	2	6	40454	40459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014957	ACG	2	6	40539	40544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014957	AGG	2	6	40556	40561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014957	CAG	2	6	40608	40613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014957	CCG	2	6	40630	40635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014957	CGG	2	6	40718	40723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014957	ACG	2	6	40727	40732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014957	GAG	2	6	40768	40773	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014957	ACG	2	6	40777	40782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014957	CAC	2	6	42361	42366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_014957	GGT	2	6	42685	42690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014957	AGG	2	6	42732	42737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014957	GTT	2	6	42739	42744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014957	CAA	2	6	44345	44350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014957	CAC	2	6	44351	44356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014957	GTT	3	9	44373	44381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014957	CGG	2	6	44415	44420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014957	TCC	2	6	44457	44462	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_014957	TCC	2	6	44501	44506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014957	TCC	2	6	44522	44527	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_014957	TCC	2	6	44566	44571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_014957	TCC	2	6	44587	44592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014957	GAA	2	6	44603	44608	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014957	TCC	2	6	44609	44614	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_014957	GAA	2	6	44625	44630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014957	TCC	2	6	44631	44636	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_014957	TCC	2	6	44663	44668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_014957	TCC	2	6	44695	44700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_014957	CCG	2	6	44875	44880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_014957	CGG	2	6	44886	44891	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_014957	CGC	2	6	44935	44940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_014957	ACC	2	6	45045	45050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_014957	CGT	2	6	45157	45162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014957	CGA	2	6	46832	46837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014957	CCA	2	6	46914	46919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_014957	CGT	2	6	46963	46968	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_014957	GAC	2	6	47058	47063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014957	CGC	2	6	47122	47127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_014957	CGG	2	6	47135	47140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_014957	ACG	2	6	47322	47327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_014957	GTT	2	6	47330	47335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014957	GCC	4	12	47411	47422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
144	NC_014957	AAG	2	6	47484	47489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014957	ACG	2	6	47573	47578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_014957	CAG	2	6	47786	47791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_014957	CTC	2	6	47855	47860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_014957	CTT	2	6	48077	48082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_014957	GTG	2	6	48135	48140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014957	TGA	2	6	48214	48219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014957	GCC	2	6	48287	48292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_014957	AAC	2	6	48418	48423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
153	NC_014957	GGC	2	6	48450	48455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_014957	ACA	3	9	48664	48672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_014957	CCA	2	6	48959	48964	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_014957	GAA	2	6	49010	49015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014957	GGA	2	6	49029	49034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014957	CGG	2	6	49084	49089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
159	NC_014957	CTC	2	6	49130	49135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
160	NC_014957	GGC	2	6	49166	49171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_014957	CTG	2	6	49263	49268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
162	NC_014957	GTT	2	6	49322	49327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014957	GCT	2	6	49334	49339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_014957	CGT	2	6	49429	49434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_014957	GGA	2	6	50327	50332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014957	ACC	2	6	50375	50380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
167	NC_014957	GTG	2	6	50401	50406	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014957	CCA	2	6	50475	50480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
169	NC_014957	GCC	2	6	52323	52328	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
170	NC_014957	GGC	2	6	52337	52342	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_014957	AAC	2	6	52350	52355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_014957	AGG	2	6	52417	52422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014957	AGG	2	6	53138	53143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014957	GTG	2	6	54292	54297	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014957	GTG	2	6	54302	54307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014957	GTG	2	6	54312	54317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014957	CTT	2	6	54392	54397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_014957	TCA	2	6	54458	54463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
179	NC_014957	GCC	2	6	54876	54881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
180	NC_014957	TGG	2	6	54888	54893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014957	GAG	2	6	56183	56188	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
182	NC_014957	GAG	2	6	56211	56216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014957	GAG	2	6	56246	56251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014957	GAG	2	6	56267	56272	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014957	GAG	2	6	56316	56321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.