MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	AAAAAT	2	12	16732	16743	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014935	CGGCCC	2	12	63531	63542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014935	TGAGTA	2	12	199981	199992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014935	ATGGTT	2	12	213445	213456	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014935	TTAAAT	2	12	309652	309663	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014935	ATCGTA	2	12	351408	351419	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014935	ATTCTT	2	12	357773	357784	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014935	CCGTTC	2	12	402187	402198	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014935	TCCTTG	2	12	410146	410157	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014935	AGGCCG	2	12	562858	562869	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014935	GTGAGA	2	12	611151	611162	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014935	GTGCTT	2	12	652555	652566	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014935	CACAGG	2	12	657024	657035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014935	TTTCTT	2	12	663678	663689	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014935	AAAGAA	2	12	663721	663732	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014935	AAAAGG	2	12	688160	688171	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014935	ATTTAA	2	12	739995	740006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014935	CGGTGA	2	12	781627	781638	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_014935	GAATAA	2	12	801212	801223	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014935	TCAATG	2	12	808894	808905	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014935	ATAGGA	2	12	926659	926670	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014935	CTGTTG	2	12	932541	932552	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014935	CTTTTT	2	12	1063105	1063116	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014935	GTGCTG	2	12	1070030	1070041	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014935	TCTCCC	2	12	1070767	1070778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_014935	GGCCTG	2	12	1070892	1070903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014935	GAAAAA	2	12	1109597	1109608	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014935	TAGCAT	2	12	1140416	1140427	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014935	CCTTAT	2	12	1150703	1150714	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014935	GGGGGT	2	12	1190940	1190951	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014935	CAAAAT	2	12	1372772	1372783	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014935	AAACCA	2	12	1390049	1390060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014935	ATCTAA	2	12	1399843	1399854	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014935	AACTCT	2	12	1402058	1402069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014935	GCAGAG	2	12	1471982	1471993	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014935	TTCCAT	2	12	1633332	1633343	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014935	AAATAT	2	12	1671868	1671879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014935	GCCGAA	2	12	1749567	1749578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014935	AATCAA	2	12	1755407	1755418	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014935	CTTTAT	2	12	1771971	1771982	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014935	GAATAA	2	12	1823359	1823370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014935	TAAAAA	2	12	1861802	1861813	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014935	GAAAAT	2	12	1895515	1895526	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014935	GTAACG	2	12	1906783	1906794	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014935	TCGGAA	2	12	1955000	1955011	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014935	GCATAT	2	12	1955964	1955975	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014935	GCTTTA	2	12	1971288	1971299	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014935	CTATTT	2	12	2065614	2065625	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014935	CTTTAA	2	12	2100575	2100586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.