MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 1444

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	ATCGA	2	10	1623	1632	40 %	20 %	20 %	20 %	319955762
2	NC_014935	GGAGC	2	10	4988	4997	20 %	0 %	60 %	20 %	319955764
3	NC_014935	GATCG	2	10	5811	5820	20 %	20 %	40 %	20 %	319955764
4	NC_014935	GCAGA	2	10	7630	7639	40 %	0 %	40 %	20 %	319955766
5	NC_014935	TCGCT	2	10	8159	8168	0 %	40 %	20 %	40 %	319955767
6	NC_014935	TACGA	2	10	11850	11859	40 %	20 %	20 %	20 %	319955770
7	NC_014935	GATCG	2	10	14070	14079	20 %	20 %	40 %	20 %	319955772
8	NC_014935	CTTCT	2	10	14640	14649	0 %	60 %	0 %	40 %	319955773
9	NC_014935	TTCCT	2	10	16640	16649	0 %	60 %	0 %	40 %	319955774
10	NC_014935	TCGGC	2	10	22994	23003	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_014935	TGGAT	2	10	24142	24151	20 %	40 %	40 %	0 %	319955783
12	NC_014935	GGACC	2	10	25877	25886	20 %	0 %	40 %	40 %	319955785
13	NC_014935	CACCC	2	10	26676	26685	20 %	0 %	0 %	80 %	319955785
14	NC_014935	CGGAT	2	10	27723	27732	20 %	20 %	40 %	20 %	319955786
15	NC_014935	GGCCC	2	10	28032	28041	0 %	0 %	40 %	60 %	319955787
16	NC_014935	GCCGA	2	10	28273	28282	20 %	0 %	40 %	40 %	319955787
17	NC_014935	GCTTT	2	10	30188	30197	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014935	TGGAG	2	10	30527	30536	20 %	20 %	60 %	0 %	319955789
19	NC_014935	ACCTT	2	10	31936	31945	20 %	40 %	0 %	40 %	319955791
20	NC_014935	GTTGC	2	10	32256	32265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014935	AGGAA	2	10	35465	35474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014935	AATGA	2	10	35535	35544	60 %	20 %	20 %	0 %	319955795
23	NC_014935	GGATC	2	10	35945	35954	20 %	20 %	40 %	20 %	319955795
24	NC_014935	TCGCC	2	10	37649	37658	0 %	20 %	20 %	60 %	319955796
25	NC_014935	ACCGA	2	10	38263	38272	40 %	0 %	20 %	40 %	319955796
26	NC_014935	TCGCC	2	10	38606	38615	0 %	20 %	20 %	60 %	319955796
27	NC_014935	TCTCC	2	10	38876	38885	0 %	40 %	0 %	60 %	319955796
28	NC_014935	CCGGA	2	10	40214	40223	20 %	0 %	40 %	40 %	319955796
29	NC_014935	GTATA	2	10	41216	41225	40 %	40 %	20 %	0 %	319955796
30	NC_014935	GGAGC	2	10	44159	44168	20 %	0 %	60 %	20 %	319955797
31	NC_014935	CTCCC	2	10	44647	44656	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
32	NC_014935	ATTAT	2	10	44759	44768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014935	TTCCC	2	10	45425	45434	0 %	40 %	0 %	60 %	319955798
34	NC_014935	GGTAT	2	10	45867	45876	20 %	40 %	40 %	0 %	319955798
35	NC_014935	AAGAG	2	10	46456	46465	60 %	0 %	40 %	0 %	319955798
36	NC_014935	GAGTG	2	10	46878	46887	20 %	20 %	60 %	0 %	319955799
37	NC_014935	AGCTG	2	10	47066	47075	20 %	20 %	40 %	20 %	319955799
38	NC_014935	CCCTC	2	10	49530	49539	0 %	20 %	0 %	80 %	319955802
39	NC_014935	TTCCC	2	10	50669	50678	0 %	40 %	0 %	60 %	319955803
40	NC_014935	GGAGA	2	10	52149	52158	40 %	0 %	60 %	0 %	319955804
41	NC_014935	AGAGA	2	10	54448	54457	60 %	0 %	40 %	0 %	319955805
42	NC_014935	CCGGG	2	10	54857	54866	0 %	0 %	60 %	40 %	319955806
43	NC_014935	CGCTG	2	10	55037	55046	0 %	20 %	40 %	40 %	319955806
44	NC_014935	AAGCG	2	10	56989	56998	40 %	0 %	40 %	20 %	319955809
45	NC_014935	TCGAT	2	10	57439	57448	20 %	40 %	20 %	20 %	319955810
46	NC_014935	TGATG	2	10	58122	58131	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014935	TCGGA	2	10	59027	59036	20 %	20 %	40 %	20 %	319955812
48	NC_014935	GGCAT	2	10	59675	59684	20 %	20 %	40 %	20 %	319955814
49	NC_014935	TTTCG	2	10	59704	59713	0 %	60 %	20 %	20 %	319955814
50	NC_014935	GAGGT	2	10	60322	60331	20 %	20 %	60 %	0 %	319955815
51	NC_014935	CGATC	2	10	63402	63411	20 %	20 %	20 %	40 %	319955818
52	NC_014935	ATTAT	2	10	66495	66504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014935	GGGGA	2	10	66933	66942	20 %	0 %	80 %	0 %	319955821
54	NC_014935	GAGAG	2	10	70697	70706	40 %	0 %	60 %	0 %	319955826
55	NC_014935	TCAGC	2	10	72658	72667	20 %	20 %	20 %	40 %	319955827
56	NC_014935	CCCGA	2	10	74541	74550	20 %	0 %	20 %	60 %	319955828
57	NC_014935	GCTCC	2	10	76702	76711	0 %	20 %	20 %	60 %	319955830
58	NC_014935	CTTCT	2	10	78691	78700	0 %	60 %	0 %	40 %	319955832
59	NC_014935	AGACG	2	10	79652	79661	40 %	0 %	40 %	20 %	319955833
60	NC_014935	TGGAT	2	10	81218	81227	20 %	40 %	40 %	0 %	319955834
61	NC_014935	TCCTC	2	10	85653	85662	0 %	40 %	0 %	60 %	319955838
62	NC_014935	GCCCA	2	10	85913	85922	20 %	0 %	20 %	60 %	319955838
63	NC_014935	GGGAA	2	10	86046	86055	40 %	0 %	60 %	0 %	319955838
64	NC_014935	CGATC	2	10	86302	86311	20 %	20 %	20 %	40 %	319955838
65	NC_014935	CAAAA	2	10	87539	87548	80 %	0 %	0 %	20 %	319955838
66	NC_014935	CAAAA	2	10	90091	90100	80 %	0 %	0 %	20 %	319955843
67	NC_014935	TATCA	2	10	92287	92296	40 %	40 %	0 %	20 %	319955846
68	NC_014935	GCCTG	2	10	95124	95133	0 %	20 %	40 %	40 %	319955848
69	NC_014935	GGCTG	2	10	96205	96214	0 %	20 %	60 %	20 %	319955850
70	NC_014935	GCCTT	2	10	97687	97696	0 %	40 %	20 %	40 %	319955852
71	NC_014935	GGTCG	2	10	98611	98620	0 %	20 %	60 %	20 %	319955853
72	NC_014935	CCGAT	2	10	98727	98736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
73	NC_014935	GGGAT	2	10	98863	98872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014935	AATCA	2	10	102373	102382	60 %	20 %	0 %	20 %	319955859
75	NC_014935	GAGCA	2	10	103491	103500	40 %	0 %	40 %	20 %	319955861
76	NC_014935	GATCA	2	10	106717	106726	40 %	20 %	20 %	20 %	319955868
77	NC_014935	CCGGA	2	10	108933	108942	20 %	0 %	40 %	40 %	319955874
78	NC_014935	TCAAA	2	10	111589	111598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014935	AACAG	2	10	111753	111762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014935	GCAGC	2	10	112429	112438	20 %	0 %	40 %	40 %	319955880
81	NC_014935	GTTCC	2	10	112922	112931	0 %	40 %	20 %	40 %	319955881
82	NC_014935	AGAGA	2	10	113271	113280	60 %	0 %	40 %	0 %	319955881
83	NC_014935	GGATC	2	10	115947	115956	20 %	20 %	40 %	20 %	319955885
84	NC_014935	GGATT	2	10	115960	115969	20 %	40 %	40 %	0 %	319955885
85	NC_014935	CTTTT	2	10	116053	116062	0 %	80 %	0 %	20 %	319955885
86	NC_014935	CGAAG	2	10	117174	117183	40 %	0 %	40 %	20 %	319955886
87	NC_014935	CAAAA	2	10	117364	117373	80 %	0 %	0 %	20 %	319955886
88	NC_014935	TTTGA	2	10	117514	117523	20 %	60 %	20 %	0 %	319955886
89	NC_014935	AAGAG	2	10	117959	117968	60 %	0 %	40 %	0 %	319955886
90	NC_014935	GAAGA	2	10	118687	118696	60 %	0 %	40 %	0 %	319955886
91	NC_014935	GAAAA	2	10	120511	120520	80 %	0 %	20 %	0 %	319955886
92	NC_014935	CGGAA	2	10	120687	120696	40 %	0 %	40 %	20 %	319955887
93	NC_014935	TCCGA	2	10	122623	122632	20 %	20 %	20 %	40 %	319955888
94	NC_014935	GGGTG	2	10	123568	123577	0 %	20 %	80 %	0 %	319955889
95	NC_014935	ACATC	2	10	124215	124224	40 %	20 %	0 %	40 %	319955889
96	NC_014935	GGATC	2	10	128236	128245	20 %	20 %	40 %	20 %	319955897
97	NC_014935	TCTCC	2	10	129252	129261	0 %	40 %	0 %	60 %	319955898
98	NC_014935	CTCTT	2	10	130379	130388	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014935	AGAAA	2	10	131538	131547	80 %	0 %	20 %	0 %	319955901
100	NC_014935	GCGCT	2	10	131819	131828	0 %	20 %	40 %	40 %	319955901
101	NC_014935	GGTGG	2	10	133407	133416	0 %	20 %	80 %	0 %	319955903
102	NC_014935	TCGGA	2	10	136426	136435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014935	GTGCT	2	10	137339	137348	0 %	40 %	40 %	20 %	319955906
104	NC_014935	TTTCC	2	10	137778	137787	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
105	NC_014935	AGCTC	2	10	139157	139166	20 %	20 %	20 %	40 %	319955908
106	NC_014935	TCCGT	2	10	139723	139732	0 %	40 %	20 %	40 %	319955909
107	NC_014935	GGCCT	2	10	141610	141619	0 %	20 %	40 %	40 %	319955911
108	NC_014935	GGAGC	2	10	141777	141786	20 %	0 %	60 %	20 %	319955911
109	NC_014935	GGCCA	2	10	150091	150100	20 %	0 %	40 %	40 %	319955921
110	NC_014935	TTCGC	2	10	151287	151296	0 %	40 %	20 %	40 %	319955922
111	NC_014935	GTGAA	2	10	153058	153067	40 %	20 %	40 %	0 %	319955923
112	NC_014935	CTGTC	2	10	153326	153335	0 %	40 %	20 %	40 %	319955923
113	NC_014935	GAGAA	2	10	154144	154153	60 %	0 %	40 %	0 %	319955923
114	NC_014935	TGGAT	2	10	157818	157827	20 %	40 %	40 %	0 %	319955928
115	NC_014935	CGACG	2	10	159364	159373	20 %	0 %	40 %	40 %	319955928
116	NC_014935	TGGGG	2	10	159974	159983	0 %	20 %	80 %	0 %	319955929
117	NC_014935	TCGGT	2	10	160251	160260	0 %	40 %	40 %	20 %	319955929
118	NC_014935	GTTTT	2	10	164954	164963	0 %	80 %	20 %	0 %	319955933
119	NC_014935	CCCCG	2	10	165347	165356	0 %	0 %	20 %	80 %	319955934
120	NC_014935	GAGCG	2	10	166720	166729	20 %	0 %	60 %	20 %	319955935
121	NC_014935	GCCGG	2	10	167959	167968	0 %	0 %	60 %	40 %	319955938
122	NC_014935	GACGC	2	10	173064	173073	20 %	0 %	40 %	40 %	319955942
123	NC_014935	ACGAT	2	10	173896	173905	40 %	20 %	20 %	20 %	319955943
124	NC_014935	GCCAC	2	10	175611	175620	20 %	0 %	20 %	60 %	319955945
125	NC_014935	TCGAT	2	10	178809	178818	20 %	40 %	20 %	20 %	319955949
126	NC_014935	AAGCC	2	10	179102	179111	40 %	0 %	20 %	40 %	319955950
127	NC_014935	GGGAA	2	10	180888	180897	40 %	0 %	60 %	0 %	319955952
128	NC_014935	GAAGG	2	10	183808	183817	40 %	0 %	60 %	0 %	319955955
129	NC_014935	GACGG	2	10	185046	185055	20 %	0 %	60 %	20 %	319955956
130	NC_014935	CTCCG	2	10	186296	186305	0 %	20 %	20 %	60 %	319955958
131	NC_014935	CTCCG	2	10	187606	187615	0 %	20 %	20 %	60 %	319955959
132	NC_014935	CGGAG	2	10	191405	191414	20 %	0 %	60 %	20 %	319955963
133	NC_014935	GATCG	2	10	195197	195206	20 %	20 %	40 %	20 %	319955967
134	NC_014935	TGAGC	2	10	195973	195982	20 %	20 %	40 %	20 %	319955968
135	NC_014935	AAGGG	2	10	196556	196565	40 %	0 %	60 %	0 %	319955968
136	NC_014935	CCGGC	2	10	197291	197300	0 %	0 %	40 %	60 %	319955969
137	NC_014935	GATCC	2	10	200875	200884	20 %	20 %	20 %	40 %	319955973
138	NC_014935	CCATC	2	10	203201	203210	20 %	20 %	0 %	60 %	319955975
139	NC_014935	CCCGT	2	10	204512	204521	0 %	20 %	20 %	60 %	319955976
140	NC_014935	TTTGT	2	10	204753	204762	0 %	80 %	20 %	0 %	319955976
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142	NC_014935	GGCCC	2	10	209849	209858	0 %	0 %	40 %	60 %	319955983
143	NC_014935	GGATC	2	10	212345	212354	20 %	20 %	40 %	20 %	319955985
144	NC_014935	TCGAT	2	10	213379	213388	20 %	40 %	20 %	20 %	319955986
145	NC_014935	GCGTT	2	10	214155	214164	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014935	CGCCC	2	10	215645	215654	0 %	0 %	20 %	80 %	319955989
147	NC_014935	GGGGC	2	10	218644	218653	0 %	0 %	80 %	20 %	319955992
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150	NC_014935	TGATG	2	10	227275	227284	20 %	40 %	40 %	0 %	319956000
151	NC_014935	GAATC	2	10	229211	229220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
152	NC_014935	GGGAT	2	10	230517	230526	20 %	20 %	60 %	0 %	319956003
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175	NC_014935	ATTTT	2	10	272991	273000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_014935	TCGAT	2	10	336882	336891	20 %	40 %	20 %	20 %	319956089
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233	NC_014935	TGGAT	2	10	357471	357480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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244	NC_014935	CGAAG	2	10	375845	375854	40 %	0 %	40 %	20 %	319956121
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249	NC_014935	GGGTT	2	10	386112	386121	0 %	40 %	60 %	0 %	319956132
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253	NC_014935	ATCGA	2	10	392908	392917	40 %	20 %	20 %	20 %	319956137
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257	NC_014935	TGATC	2	10	395258	395267	20 %	40 %	20 %	20 %	319956139
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259	NC_014935	GAAGC	2	10	398085	398094	40 %	0 %	40 %	20 %	319956143
260	NC_014935	ACGGG	2	10	399850	399859	20 %	0 %	60 %	20 %	319956145
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264	NC_014935	GGGAA	2	10	406964	406973	40 %	0 %	60 %	0 %	319956153
265	NC_014935	TTTGC	2	10	407445	407454	0 %	60 %	20 %	20 %	319956154
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