MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 181

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	TCGGC	2	10	22994	23003	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014935	GCTTT	2	10	30188	30197	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014935	GTTGC	2	10	32256	32265	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014935	AGGAA	2	10	35465	35474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014935	CTCCC	2	10	44647	44656	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
6	NC_014935	ATTAT	2	10	44759	44768	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014935	TGATG	2	10	58122	58131	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014935	ATTAT	2	10	66495	66504	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014935	CCGAT	2	10	98727	98736	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014935	GGGAT	2	10	98863	98872	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014935	TCAAA	2	10	111589	111598	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014935	AACAG	2	10	111753	111762	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014935	CTCTT	2	10	130379	130388	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_014935	TCGGA	2	10	136426	136435	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014935	TTTCC	2	10	137778	137787	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_014935	GCGTT	2	10	214155	214164	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014935	GAATC	2	10	229211	229220	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014935	ATTTT	2	10	272991	273000	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014935	GAAGA	2	10	275179	275188	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014935	TCAAG	2	10	283289	283298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014935	AGTAA	2	10	335180	335189	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014935	CCTAT	2	10	346959	346968	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014935	GCAAG	2	10	352572	352581	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_014935	TTTGT	2	10	357203	357212	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014935	TGGAT	2	10	357471	357480	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014935	ATACC	2	10	357623	357632	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014935	AGCAG	2	10	367176	367185	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
28	NC_014935	GAGGG	2	10	371999	372008	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014935	GAAAG	2	10	375201	375210	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014935	GAAAG	2	10	375753	375762	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014935	CCCGG	2	10	379392	379401	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
32	NC_014935	TAAAA	2	10	414446	414455	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014935	GATTG	2	10	417953	417962	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014935	TATAA	2	10	436550	436559	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014935	AGGAG	2	10	465759	465768	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014935	GAAGG	2	10	468088	468097	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014935	TAATT	2	10	480552	480561	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014935	TTTTC	2	10	483807	483816	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014935	GTTTT	2	10	483891	483900	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014935	ACGCA	2	10	490125	490134	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014935	TGCTG	2	10	508181	508190	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
42	NC_014935	AGAGG	2	10	518998	519007	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014935	TCTAC	2	10	522282	522291	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014935	CTTTA	2	10	522588	522597	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014935	AAATC	2	10	524729	524738	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014935	CTTCT	2	10	525628	525637	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_014935	GGCAG	2	10	531793	531802	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014935	CACAA	2	10	580102	580111	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_014935	TATTT	2	10	583512	583521	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014935	ATTTT	2	10	586026	586035	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014935	TCTAT	2	10	610143	610152	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014935	ATTCG	2	10	620394	620403	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014935	ATAAA	2	10	646748	646757	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014935	TGAAA	2	10	672874	672883	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014935	ACTCC	2	10	688214	688223	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
56	NC_014935	GAATG	2	10	696313	696322	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014935	AAAAG	2	10	696414	696423	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014935	AAAGG	2	10	697924	697933	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014935	AGGGG	2	10	698823	698832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014935	TTTGA	2	10	736987	736996	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014935	CGGAT	2	10	738793	738802	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014935	TGTGG	2	10	753905	753914	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014935	CAGAG	2	10	761420	761429	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014935	CATTG	2	10	777293	777302	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014935	AATTC	2	10	786270	786279	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014935	TGTAT	2	10	786318	786327	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014935	AGATT	2	10	795590	795599	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014935	TTTCA	2	10	801946	801955	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014935	CATAC	2	10	830834	830843	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014935	TTATG	2	10	846466	846475	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014935	CGTTT	2	10	852109	852118	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014935	GGAGG	2	10	868650	868659	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014935	CGGAG	2	10	878613	878622	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
74	NC_014935	GGTCA	2	10	898960	898969	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014935	AATCT	2	10	907361	907370	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014935	ATAGT	2	10	929044	929053	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014935	GGAAA	2	10	929070	929079	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014935	TCTCC	2	10	932254	932263	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
79	NC_014935	TCCCT	2	10	938903	938912	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_014935	CTTGA	2	10	956920	956929	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_014935	GGAAA	2	10	967398	967407	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014935	AGAGG	2	10	981537	981546	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014935	TAACG	2	10	984668	984677	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014935	TTCTC	2	10	987543	987552	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014935	AACGA	2	10	987565	987574	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014935	ATATT	2	10	997462	997471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014935	CCTTT	2	10	1002193	1002202	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
88	NC_014935	GGGAC	2	10	1069683	1069692	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014935	ATTGT	2	10	1077777	1077786	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014935	AAGGA	2	10	1087579	1087588	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014935	ATCGA	2	10	1096154	1096163	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_014935	AAAGT	2	10	1096448	1096457	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014935	TTTGT	2	10	1104658	1104667	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014935	TTTGA	2	10	1109255	1109264	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014935	CTTGT	2	10	1116167	1116176	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014935	TCTCT	2	10	1116357	1116366	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
97	NC_014935	TCGAT	2	10	1129137	1129146	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
98	NC_014935	GCCAA	2	10	1137505	1137514	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
99	NC_014935	TGATC	2	10	1142948	1142957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
100	NC_014935	ATCCT	2	10	1165245	1165254	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014935	TGAAT	2	10	1228285	1228294	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014935	TGAAG	2	10	1233796	1233805	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014935	CTTCT	2	10	1272355	1272364	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_014935	AATTG	2	10	1293558	1293567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014935	TAAAG	2	10	1298104	1298113	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014935	CTTTA	2	10	1299135	1299144	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014935	AATAT	2	10	1303972	1303981	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014935	TTGAA	2	10	1315228	1315237	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014935	ATCGG	2	10	1355298	1355307	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014935	GGATA	2	10	1371144	1371153	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014935	TGCGA	2	10	1374911	1374920	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
112	NC_014935	TACCG	2	10	1400227	1400236	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
113	NC_014935	ATCCA	2	10	1400330	1400339	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014935	ATCGG	2	10	1401815	1401824	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_014935	GCAAC	2	10	1427403	1427412	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014935	CATAG	2	10	1443979	1443988	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014935	AAATT	2	10	1448497	1448506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014935	GAGTG	2	10	1448666	1448675	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014935	TTGAA	2	10	1476824	1476833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014935	ATTTA	2	10	1477266	1477275	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014935	ATTGT	2	10	1482519	1482528	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014935	GTTTT	2	10	1482810	1482819	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014935	AGAGA	2	10	1487788	1487797	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014935	ATTTT	2	10	1496894	1496903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014935	TATAA	2	10	1519530	1519539	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014935	TTGTA	2	10	1543453	1543462	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014935	GAGAA	2	10	1544326	1544335	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014935	CTTCC	2	10	1563814	1563823	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
129	NC_014935	AGCAA	2	10	1569773	1569782	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014935	GAAAA	2	10	1585739	1585748	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014935	TCTCG	2	10	1592352	1592361	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
132	NC_014935	TTTCA	2	10	1618625	1618634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_014935	CGACT	2	10	1633473	1633482	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_014935	TTGAG	2	10	1637517	1637526	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014935	TTTAT	2	10	1657514	1657523	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014935	TACGG	2	10	1678819	1678828	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014935	AACTC	2	10	1681059	1681068	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
138	NC_014935	CACGA	2	10	1681405	1681414	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
139	NC_014935	TTCCC	2	10	1699672	1699681	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
140	NC_014935	CTAAA	2	10	1699761	1699770	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014935	CCAAA	2	10	1725303	1725312	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
142	NC_014935	TGAAA	2	10	1738696	1738705	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014935	CCCCT	2	10	1744195	1744204	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
144	NC_014935	TAGAA	2	10	1755394	1755403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014935	CACAC	2	10	1758091	1758100	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.