MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitratifractor salsuginis DSM 16511 chromosome

Total Repeats: 481

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014935	ATAA	2	8	6712	6719	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014935	TCTT	2	8	6775	6782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014935	CCCT	2	8	22264	22271	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_014935	TCAA	2	8	22293	22300	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014935	GATA	2	8	30179	30186	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014935	TGAG	2	8	33142	33149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014935	CAAA	2	8	35122	35129	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_014935	ATCT	2	8	36066	36073	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014935	AATA	2	8	41943	41950	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014935	TATT	2	8	41997	42004	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014935	AAAG	2	8	42336	42343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014935	CTTA	2	8	44690	44697	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014935	AATA	2	8	46523	46530	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014935	ATTA	2	8	46693	46700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014935	CGAT	2	8	46714	46721	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_014935	AAGT	2	8	58103	58110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014935	CTTT	2	8	69129	69136	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014935	AAAG	2	8	69176	69183	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014935	GTCA	2	8	69205	69212	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014935	AGAA	2	8	78491	78498	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014935	CGGA	2	8	97091	97098	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_014935	CGCT	2	8	97211	97218	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014935	GGGT	2	8	97386	97393	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014935	AAAG	2	8	98794	98801	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014935	TTCC	2	8	100438	100445	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014935	GTCG	2	8	111652	111659	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014935	GGTT	2	8	111705	111712	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014935	GGCT	2	8	113341	113348	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_014935	GGGA	2	8	126148	126155	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014935	CAAC	2	8	127769	127776	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014935	TTTC	2	8	130434	130441	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014935	TTTA	2	8	132282	132289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014935	GCTT	2	8	136844	136851	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_014935	ATAG	2	8	139539	139546	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014935	TTCA	2	8	162570	162577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014935	TTCT	2	8	169775	169782	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_014935	CAAA	2	8	170490	170497	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014935	AAAT	2	8	179025	179032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014935	TGGA	2	8	180654	180661	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014935	TCCT	2	8	184651	184658	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014935	TGTA	2	8	195441	195448	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014935	ATCC	2	8	199902	199909	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_014935	ATGA	2	8	202114	202121	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014935	TCAC	2	8	202901	202908	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_014935	TTTG	2	8	203455	203462	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014935	CCGG	2	8	205934	205941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014935	CTCG	2	8	210535	210542	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_014935	AGGC	2	8	210590	210597	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014935	AGGT	2	8	210906	210913	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014935	TTTC	2	8	226557	226564	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_014935	GCCG	2	8	236438	236445	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014935	AGGG	2	8	246821	246828	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014935	CTTA	2	8	248427	248434	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014935	AATC	2	8	259810	259817	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_014935	GGAT	2	8	265304	265311	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014935	TAAA	2	8	272955	272962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014935	ATTG	2	8	277830	277837	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014935	CCGT	2	8	292989	292996	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_014935	GGAA	2	8	295115	295122	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014935	TTGC	2	8	304245	304252	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_014935	CTAT	2	8	309442	309449	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_014935	CTTC	2	8	316003	316010	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_014935	TTAT	2	8	352415	352422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014935	ATTA	2	8	352466	352473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014935	AGGG	2	8	357565	357572	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014935	TGAT	2	8	357720	357727	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014935	AAAT	2	8	364672	364679	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014935	CGAG	2	8	369677	369684	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
69	NC_014935	CTCA	2	8	369827	369834	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_014935	AATT	2	8	372235	372242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014935	AAAG	2	8	372292	372299	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014935	CCAT	2	8	377481	377488	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_014935	TCAG	2	8	391187	391194	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014935	AAGC	2	8	401093	401100	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_014935	TCCA	2	8	402064	402071	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014935	TTTA	2	8	402210	402217	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014935	TCTT	2	8	402297	402304	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014935	CCTC	2	8	443457	443464	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_014935	ACTT	2	8	443476	443483	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014935	CTTT	2	8	449581	449588	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014935	CGAT	2	8	463771	463778	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014935	ATCG	2	8	468025	468032	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_014935	GTTT	2	8	474856	474863	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014935	ATCA	2	8	475768	475775	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014935	CTTA	2	8	476107	476114	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014935	TTTA	2	8	481038	481045	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014935	TAAA	2	8	481142	481149	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014935	GAAC	2	8	481881	481888	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_014935	CGCT	2	8	490157	490164	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014935	CCGG	2	8	491180	491187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014935	TCGA	2	8	495680	495687	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
92	NC_014935	GAAG	2	8	498706	498713	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014935	GAAA	2	8	498862	498869	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014935	TCTT	2	8	501603	501610	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_014935	TTGT	2	8	510866	510873	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014935	CAGA	2	8	510875	510882	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
97	NC_014935	GTCA	2	8	510942	510949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014935	GGAT	2	8	518931	518938	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014935	TTTA	2	8	518941	518948	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014935	AAAG	2	8	525799	525806	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014935	CATT	2	8	526542	526549	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014935	ACCA	2	8	535513	535520	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014935	AGGA	2	8	539015	539022	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014935	AGGA	2	8	542679	542686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014935	GGAA	2	8	546563	546570	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014935	ATTG	2	8	554278	554285	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014935	ACTT	2	8	562570	562577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014935	GGTA	2	8	562581	562588	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014935	TTCG	2	8	562703	562710	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_014935	TTGA	2	8	570240	570247	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014935	TATG	2	8	570688	570695	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014935	TGAT	2	8	578118	578125	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014935	CTTT	2	8	583504	583511	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_014935	ATGG	2	8	591795	591802	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014935	GTTT	2	8	595573	595580	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014935	GATG	2	8	596264	596271	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014935	ACAG	2	8	597220	597227	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_014935	GATA	2	8	598836	598843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014935	TAAA	2	8	600353	600360	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014935	TGCA	2	8	603255	603262	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_014935	GATG	2	8	603312	603319	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014935	GACT	2	8	606784	606791	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014935	ATTA	2	8	611199	611206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014935	TAAA	2	8	614016	614023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014935	TGAA	2	8	620314	620321	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014935	GAGC	2	8	621013	621020	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014935	ATCA	2	8	631193	631200	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
128	NC_014935	CAGG	2	8	631263	631270	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_014935	GGCA	2	8	631383	631390	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130	NC_014935	ACAA	2	8	633866	633873	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_014935	ATGG	2	8	641257	641264	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014935	GGCA	2	8	642619	642626	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014935	TCAT	2	8	661204	661211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_014935	TCTT	2	8	672583	672590	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_014935	TAAA	2	8	672638	672645	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014935	TGTA	2	8	672684	672691	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014935	CATC	2	8	673074	673081	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014935	AGGA	2	8	678686	678693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014935	AAAT	2	8	695043	695050	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014935	TCCT	2	8	696192	696199	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_014935	GAAA	2	8	708521	708528	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014935	CCTT	2	8	716377	716384	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_014935	GGAA	2	8	719494	719501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014935	GATT	2	8	730615	730622	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014935	TATG	2	8	743822	743829	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014935	TCCA	2	8	743982	743989	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_014935	CTGG	2	8	744065	744072	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
148	NC_014935	CTAA	2	8	744184	744191	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_014935	ATTC	2	8	744209	744216	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014935	CGAA	2	8	744568	744575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_014935	ACTC	2	8	768201	768208	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.