MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Cellulophaga algicola DSM 14237 chromosome

Total Repeats: 292

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014934	TTTTTA	2	12	9708	9719	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014934	TAGAAA	2	12	18070	18081	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014934	TAGAAA	2	12	20894	20905	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014934	TCAACG	2	12	24103	24114	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014934	TTGTAA	2	12	45654	45665	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014934	TTTAAT	2	12	71147	71158	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014934	GTAATG	2	12	75133	75144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014934	TAAAAA	2	12	92069	92080	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014934	ATTGCC	2	12	120316	120327	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014934	TTGAGT	2	12	126187	126198	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014934	TAAAAC	2	12	131983	131994	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_014934	ATAGTT	2	12	150511	150522	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014934	GAAAAA	2	12	154069	154080	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014934	AAATTG	2	12	170666	170677	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014934	ATTTTG	2	12	179756	179767	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014934	AAATTA	2	12	190318	190329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014934	ACACAA	2	12	220848	220859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014934	ACACAA	2	12	227937	227948	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014934	ATTTTT	2	12	235927	235938	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014934	CTTCCC	2	12	239825	239836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_014934	ATATTT	2	12	249174	249185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014934	TTCGCT	2	12	253038	253049	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014934	ATCTTT	2	12	258794	258805	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014934	GGAAAA	2	12	261378	261389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014934	TGAAAA	2	12	261477	261488	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014934	AAAAGA	2	12	337055	337066	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014934	ATAAAA	2	12	432883	432894	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014934	AATTAA	2	12	486487	486498	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014934	TTTTAT	2	12	511522	511533	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014934	AGGTAA	2	12	512130	512141	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014934	ATAGCT	2	12	520219	520230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014934	GCAGAA	2	12	535046	535057	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014934	TAATTA	2	12	606695	606706	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014934	TTTTAG	2	12	619423	619434	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014934	AATACT	2	12	717090	717101	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014934	TTAAAA	2	12	744468	744479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014934	ATTTAG	2	12	772458	772469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014934	TTTATA	2	12	776564	776575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014934	ATATTT	2	12	778839	778850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014934	TAGATA	2	12	779724	779735	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014934	TATTTA	2	12	829378	829389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014934	TTTTTA	2	12	861049	861060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014934	TCAACG	2	12	879867	879878	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014934	TTTTAA	2	12	894688	894699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014934	TTTGAT	2	12	898930	898941	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014934	TTTCTA	2	12	928677	928688	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014934	TAAAAA	2	12	973491	973502	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014934	GTTAAT	2	12	1012065	1012076	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014934	ATACTA	2	12	1022407	1022418	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014934	TAGAAA	2	12	1067652	1067663	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014934	CTCAAC	2	12	1089155	1089166	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014934	TACAAC	2	12	1139220	1139231	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014934	ATTTAA	2	12	1175901	1175912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014934	TAATTA	2	12	1193518	1193529	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014934	AAAAAC	2	12	1193564	1193575	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014934	TAAAAA	2	12	1234783	1234794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014934	TTTCTT	2	12	1242135	1242146	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014934	TTTAAA	2	12	1242737	1242748	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014934	TAGAAA	2	12	1243755	1243766	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014934	ACTCCT	2	12	1267787	1267798	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014934	TTAAGG	2	12	1278394	1278405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014934	ATAAAA	2	12	1279345	1279356	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014934	AAATTA	2	12	1294645	1294656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014934	AAAATA	2	12	1308024	1308035	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014934	TATTTT	2	12	1308756	1308767	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014934	TTTCTG	2	12	1310912	1310923	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014934	TAGAAA	2	12	1321350	1321361	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014934	TAGAAA	2	12	1322210	1322221	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014934	TCAACG	2	12	1325406	1325417	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014934	TTTAGT	2	12	1377407	1377418	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014934	AAAGTA	2	12	1454474	1454485	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014934	TTAGAA	2	12	1462099	1462110	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014934	TAAAAA	2	12	1473408	1473419	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014934	TTTTTA	2	12	1484005	1484016	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014934	CTTAAA	2	12	1489645	1489656	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014934	TAAAAA	2	12	1516502	1516513	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014934	TAAAAA	2	12	1525574	1525585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014934	TCAAGT	2	12	1529666	1529677	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014934	TAAAAT	2	12	1559212	1559223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014934	AAATTT	2	12	1559228	1559239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014934	AATATA	2	12	1559859	1559870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014934	AAGATT	2	12	1595410	1595421	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014934	ACTAAA	2	12	1650674	1650685	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014934	ATATTT	2	12	1657969	1657980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014934	AAATTA	2	12	1660851	1660862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014934	GTTTTG	2	12	1661528	1661539	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014934	CCGCTA	2	12	1680985	1680996	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014934	CCGCTA	2	12	1681643	1681654	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014934	CGCTAC	2	12	1681843	1681854	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014934	CCGCTA	2	12	1682618	1682629	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
91	NC_014934	TCGCTA	2	12	1682740	1682751	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014934	CCGCTA	2	12	1682905	1682916	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014934	CGCTAC	2	12	1683071	1683082	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_014934	CCGCTA	2	12	1683192	1683203	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
95	NC_014934	GCTATT	2	12	1683397	1683408	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014934	TCGCTA	2	12	1683778	1683789	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014934	CCGCTA	2	12	1683943	1683954	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
98	NC_014934	GCTATT	2	12	1684651	1684662	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014934	CGCTAT	2	12	1684832	1684843	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014934	CCGCTA	2	12	1685135	1685146	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_014934	CGCTAT	2	12	1685541	1685552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014934	TCGCTA	2	12	1685863	1685874	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014934	GCTATA	2	12	1692937	1692948	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014934	TATTGT	2	12	1722804	1722815	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014934	ATATTT	2	12	1722859	1722870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014934	ATAAAA	2	12	1740188	1740199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014934	ACTTAT	2	12	1864850	1864861	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014934	ATACAA	2	12	1876519	1876530	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014934	ATATAA	2	12	1894003	1894014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014934	CCAAAT	2	12	1932858	1932869	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014934	AATTAT	2	12	1934430	1934441	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014934	ACAATA	2	12	1937566	1937577	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_014934	TTTAGA	2	12	1944163	1944174	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014934	CAAGCG	2	12	1945398	1945409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014934	AATGAA	2	12	1952059	1952070	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014934	TGATAA	2	12	1953004	1953015	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014934	ATATTT	2	12	1953503	1953514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014934	TAAAAA	2	12	1953590	1953601	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014934	GTATAG	2	12	1960021	1960032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014934	TGAGTA	2	12	1970241	1970252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014934	TTGTGG	2	12	1973692	1973703	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014934	TAAAAT	2	12	2011207	2011218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014934	GCTATA	2	12	2072980	2072991	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014934	TACTAA	2	12	2084305	2084316	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014934	TTTTAA	2	12	2089096	2089107	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014934	GTTAAG	2	12	2097563	2097574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014934	GTTAAT	2	12	2107422	2107433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014934	TATAAA	2	12	2174672	2174683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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130	NC_014934	ATGAAA	2	12	2179434	2179445	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014934	ATGAAA	2	12	2180721	2180732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_014934	ATTTAC	2	12	4187495	4187506	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
252	NC_014934	ATTCTA	2	12	4263543	4263554	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
253	NC_014934	GAGCCA	2	12	4263577	4263588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
254	NC_014934	ACTAGC	2	12	4271793	4271804	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
255	NC_014934	CTCCAT	2	12	4272550	4272561	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
256	NC_014934	TAAATG	2	12	4295954	4295965	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
257	NC_014934	TTTATA	2	12	4342389	4342400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_014934	CTAATT	2	12	4382618	4382629	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
259	NC_014934	TAGGTT	2	12	4382753	4382764	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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265	NC_014934	TATTTT	2	12	4498272	4498283	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_014934	CAAAAA	2	12	4512206	4512217	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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269	NC_014934	CTTTTT	2	12	4557140	4557151	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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281	NC_014934	TTTTCA	2	12	4705324	4705335	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.