MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Cellulophaga algicola DSM 14237 chromosome

Total Repeats: 2253

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014934	ATCAAA	2	12	4876	4887	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951599
2	NC_014934	AATGAA	2	12	7856	7867	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319951602
3	NC_014934	CAAGAG	2	12	12761	12772	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319951606
4	NC_014934	ACTTTT	2	12	13694	13705	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951607
5	NC_014934	GATACA	2	12	16206	16217	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951608
6	NC_014934	TGATTT	2	12	16571	16582	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319951608
7	NC_014934	TACAGA	2	12	29136	29147	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951614
8	NC_014934	TAATTC	2	12	30220	30231	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951616
9	NC_014934	ACCGTC	2	12	33464	33475	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319951618
10	NC_014934	ATGAGG	2	12	37018	37029	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319951622
11	NC_014934	TGCTTT	2	12	38653	38664	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319951623
12	NC_014934	ATTCTT	2	12	39439	39450	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951623
13	NC_014934	TCTGCT	2	12	39716	39727	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319951623
14	NC_014934	ATTAAT	2	12	40337	40348	50 %	50 %	0 %	0 %	319951625
15	NC_014934	TTTCTC	2	12	44231	44242	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319951629
16	NC_014934	ATCAAA	2	12	45534	45545	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951629
17	NC_014934	TTTCCT	2	12	46411	46422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319951630
18	NC_014934	AGCTAA	2	12	47487	47498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951632
19	NC_014934	TTAAAT	2	12	48790	48801	50 %	50 %	0 %	0 %	319951634
20	NC_014934	CAAATA	2	12	50096	50107	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951635
21	NC_014934	TTGATG	2	12	50139	50150	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319951635
22	NC_014934	GTGGCG	2	12	50892	50903	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319951635
23	NC_014934	CGGTGG	2	12	50926	50937	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319951635
24	NC_014934	AGCAAA	2	12	51092	51103	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319951635
25	NC_014934	TAAACC	2	12	51447	51458	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319951636
26	NC_014934	TGCTAT	2	12	52175	52186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319951637
27	NC_014934	AATTTC	2	12	58625	58636	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951643
28	NC_014934	CATCTT	2	12	60066	60077	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319951645
29	NC_014934	ATCTTT	2	12	60649	60660	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951646
30	NC_014934	GTCATG	2	12	61724	61735	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319951648
31	NC_014934	TTAGGC	2	12	62146	62157	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319951649
32	NC_014934	CTGCTA	2	12	64260	64271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319951650
33	NC_014934	TTTCAT	2	12	66156	66167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951652
34	NC_014934	TACAGA	2	12	79642	79653	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951665
35	NC_014934	ATTGAT	2	12	81470	81481	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951667
36	NC_014934	TTTATG	2	12	81683	81694	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319951667
37	NC_014934	TCTGCT	2	12	84013	84024	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319951668
38	NC_014934	TCTTTT	2	12	84623	84634	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319951668
39	NC_014934	AGCTCC	2	12	85794	85805	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319951668
40	NC_014934	CATTAA	2	12	87036	87047	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319951670
41	NC_014934	CTTTTA	2	12	89654	89665	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951674
42	NC_014934	GTAAAA	2	12	91993	92004	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319951675
43	NC_014934	TGATAG	2	12	95958	95969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319951680
44	NC_014934	TTTTTA	2	12	97363	97374	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319951681
45	NC_014934	TGCTGG	2	12	102304	102315	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319951686
46	NC_014934	CTGGTG	2	12	103737	103748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319951687
47	NC_014934	TTTCTT	2	12	107395	107406	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319951689
48	NC_014934	TAAGTT	2	12	107939	107950	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951689
49	NC_014934	CCATCA	2	12	108822	108833	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319951689
50	NC_014934	GAAAAA	2	12	112727	112738	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319951692
51	NC_014934	TGGTGT	2	12	114451	114462	0 %	50 %	50 %	0 %	319951692
52	NC_014934	CGTAAA	2	12	116148	116159	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951693
53	NC_014934	ATGGGT	2	12	116707	116718	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319951694
54	NC_014934	AACAAA	2	12	116837	116848	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	319951694
55	NC_014934	TTATAT	2	12	118051	118062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319951694
56	NC_014934	TTCCTT	2	12	120886	120897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319951696
57	NC_014934	CTACGA	2	12	120980	120991	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319951696
58	NC_014934	ATGATT	2	12	122422	122433	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951696
59	NC_014934	CCGTAA	2	12	122497	122508	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319951696
60	NC_014934	ATAAAA	2	12	123216	123227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319951697
61	NC_014934	TGGCGG	2	12	124392	124403	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319951698
62	NC_014934	ACCACT	2	12	126955	126966	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319951700
63	NC_014934	TATATC	2	12	128924	128935	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951701
64	NC_014934	GTGAAT	2	12	129970	129981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319951702
65	NC_014934	AGATTT	2	12	134621	134632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951706
66	NC_014934	TGGTTC	2	12	136357	136368	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319951707
67	NC_014934	ATGGTT	2	12	138757	138768	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319951710
68	NC_014934	AGAAAA	2	12	140926	140937	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319951713
69	NC_014934	TAAATC	2	12	143801	143812	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319951716
70	NC_014934	AAGGAC	2	12	144128	144139	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319951717
71	NC_014934	CAAGAA	2	12	144685	144696	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319951717
72	NC_014934	ATAGAA	2	12	148307	148318	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319951721
73	NC_014934	TAAAAC	2	12	149696	149707	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951722
74	NC_014934	ACACTA	2	12	150343	150354	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319951723
75	NC_014934	GATATT	2	12	152681	152692	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951725
76	NC_014934	TTAACA	2	12	160372	160383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319951731
77	NC_014934	AAAAGA	2	12	167077	167088	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319951740
78	NC_014934	AATTCT	2	12	175899	175910	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951748
79	NC_014934	AGATAA	2	12	178757	178768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319951752
80	NC_014934	AGCTAA	2	12	182317	182328	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951755
81	NC_014934	ATAAAA	2	12	182744	182755	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319951756
82	NC_014934	TAAAAT	2	12	183039	183050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319951756
83	NC_014934	GATGTA	2	12	184367	184378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319951758
84	NC_014934	AAACAA	2	12	187841	187852	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	319951761
85	NC_014934	TATTCA	2	12	191364	191375	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951764
86	NC_014934	GATATT	2	12	195772	195783	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951769
87	NC_014934	TTAGAT	2	12	195808	195819	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951769
88	NC_014934	AGTGTT	2	12	197074	197085	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319951770
89	NC_014934	GGTAAA	2	12	198154	198165	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319951771
90	NC_014934	AAATAC	2	12	200137	200148	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951773
91	NC_014934	AGCAAT	2	12	201339	201350	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951773
92	NC_014934	TTTTGA	2	12	201870	201881	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319951774
93	NC_014934	CTTTTT	2	12	202037	202048	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319951774
94	NC_014934	TCTTAA	2	12	210334	210345	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951782
95	NC_014934	AGATAC	2	12	211210	211221	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951782
96	NC_014934	ATTGGT	2	12	211507	211518	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319951783
97	NC_014934	GATTTA	2	12	213383	213394	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951785
98	NC_014934	CTAAAG	2	12	215125	215136	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951786
99	NC_014934	AGTTTT	2	12	218426	218437	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319951788
100	NC_014934	TAATTT	2	12	219367	219378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319951789
101	NC_014934	CAAAAT	2	12	222234	222245	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951791
102	NC_014934	AATAGA	2	12	223378	223389	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319951791
103	NC_014934	AAATAT	2	12	223596	223607	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319951791
104	NC_014934	AAAAGC	2	12	224382	224393	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319951791
105	NC_014934	AATAAA	2	12	234131	234142	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319951799
106	NC_014934	AACAGA	2	12	238084	238095	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319951804
107	NC_014934	AACTTA	2	12	238886	238897	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319951804
108	NC_014934	AATGGA	2	12	244530	244541	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319951808
109	NC_014934	TTTAAA	2	12	250671	250682	50 %	50 %	0 %	0 %	319951813
110	NC_014934	CAACAG	2	12	260032	260043	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319951819
111	NC_014934	TACAAA	2	12	276641	276652	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319951832
112	NC_014934	GCAAAT	2	12	279398	279409	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951835
113	NC_014934	TCATAT	2	12	286507	286518	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319951842
114	NC_014934	AAAGGC	2	12	289578	289589	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319951845
115	NC_014934	TTCCTT	2	12	290908	290919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319951847
116	NC_014934	TTGGTG	2	12	292236	292247	0 %	50 %	50 %	0 %	319951848
117	NC_014934	TTTTAT	2	12	293278	293289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319951850
118	NC_014934	GATGGC	2	12	294787	294798	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319951853
119	NC_014934	ATGGAG	2	12	295376	295387	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319951853
120	NC_014934	AGATGG	2	12	295746	295757	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319951853
121	NC_014934	CTTAGA	2	12	295770	295781	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319951853
122	NC_014934	TTAGAA	2	12	297368	297379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319951854
123	NC_014934	CGATGA	2	12	301832	301843	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319951855
124	NC_014934	CTATTT	2	12	304921	304932	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951856
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126	NC_014934	AAATAT	2	12	316873	316884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319951866
127	NC_014934	AATTGA	2	12	317450	317461	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319951867
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131	NC_014934	CATTTT	2	12	326044	326055	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951874
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133	NC_014934	CTATCT	2	12	328899	328910	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319951876
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142	NC_014934	AGATGC	2	12	350734	350745	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319951892
143	NC_014934	TTAGAT	2	12	350987	350998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951892
144	NC_014934	AGATGG	2	12	351505	351516	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319951892
145	NC_014934	TTAGAT	2	12	351737	351748	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951892
146	NC_014934	TTAGAT	2	12	351917	351928	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951892
147	NC_014934	GACGGT	2	12	351974	351985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319951892
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149	NC_014934	TAGATT	2	12	352122	352133	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319951892
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153	NC_014934	TACAGA	2	12	353659	353670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951892
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155	NC_014934	TGATGG	2	12	355012	355023	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319951892
156	NC_014934	TACAGA	2	12	355366	355377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319951892
157	NC_014934	TGACGG	2	12	355477	355488	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319951892
158	NC_014934	TGACGG	2	12	355810	355821	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319951892
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218	NC_014934	TTCTAT	2	12	462942	462953	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319951978
219	NC_014934	ATCCAG	2	12	464729	464740	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319951979
220	NC_014934	TTACTG	2	12	465953	465964	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319951980
221	NC_014934	TTGGTA	2	12	468399	468410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319951982
222	NC_014934	GATCTT	2	12	469628	469639	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319951983
223	NC_014934	CATTAG	2	12	487251	487262	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319951998
224	NC_014934	TAGGAT	2	12	496749	496760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319952003
225	NC_014934	AAAAGA	2	12	500093	500104	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319952005
226	NC_014934	GATTTT	2	12	501180	501191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319952006
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230	NC_014934	ATGAAA	2	12	507159	507170	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319952009
231	NC_014934	ATGGCG	2	12	508926	508937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319952009
232	NC_014934	AGGAAT	2	12	510743	510754	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319952010
233	NC_014934	TGTTCT	2	12	513561	513572	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319952011
234	NC_014934	TTTCTC	2	12	515678	515689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319952013
235	NC_014934	ATGCAT	2	12	517243	517254	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319952013
236	NC_014934	TTTTGT	2	12	518543	518554	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319952014
237	NC_014934	TTTCAT	2	12	520802	520813	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319952015
238	NC_014934	TATTTA	2	12	521420	521431	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319952016
239	NC_014934	TAATTT	2	12	523849	523860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319952020
240	NC_014934	CAGGAT	2	12	529680	529691	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319952026
241	NC_014934	TATTAA	2	12	532883	532894	50 %	50 %	0 %	0 %	319952027
242	NC_014934	TTTTGT	2	12	533499	533510	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319952027
243	NC_014934	TAAATC	2	12	536788	536799	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319952028
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245	NC_014934	TTCTGC	2	12	539740	539751	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319952029
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249	NC_014934	TGTAAT	2	12	553079	553090	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319952040
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252	NC_014934	TAGCTG	2	12	554261	554272	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319952040
253	NC_014934	ATCTGC	2	12	556467	556478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319952041
254	NC_014934	ATCGTA	2	12	556813	556824	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319952042
255	NC_014934	GAACCA	2	12	557341	557352	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319952042
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259	NC_014934	CAAGTA	2	12	564784	564795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319952045
260	NC_014934	CTGGTA	2	12	566419	566430	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319952047
261	NC_014934	TCTATA	2	12	567582	567593	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319952048
262	NC_014934	TTCAGT	2	12	568863	568874	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319952049
263	NC_014934	ATTATA	2	12	573635	573646	50 %	50 %	0 %	0 %	319952055
264	NC_014934	CTTTTC	2	12	574370	574381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319952055
265	NC_014934	TCAAAA	2	12	575608	575619	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319952056
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267	NC_014934	AAACCT	2	12	579018	579029	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319952060
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269	NC_014934	TCTCAA	2	12	579570	579581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319952060
270	NC_014934	ACTACA	2	12	582455	582466	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319952064
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305	NC_014934	TTAAAT	2	12	676694	676705	50 %	50 %	0 %	0 %	319952150
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330	NC_014934	CTCTGG	2	12	724178	724189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319952205
331	NC_014934	CCAAAA	2	12	724786	724797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319952205
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333	NC_014934	TCTAAA	2	12	732360	732371	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319952214
334	NC_014934	TAATGC	2	12	733631	733642	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319952214
335	NC_014934	TATAGA	2	12	736123	736134	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319952217
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340	NC_014934	TTAAAA	2	12	740936	740947	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319952217
341	NC_014934	ACGATT	2	12	742440	742451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319952219
342	NC_014934	CTTTTA	2	12	743908	743919	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319952220
343	NC_014934	TAAGCT	2	12	744880	744891	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319952222
344	NC_014934	AATAAG	2	12	746506	746517	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319952223
345	NC_014934	TGTGTT	2	12	748048	748059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319952225
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347	NC_014934	TTTGCA	2	12	749815	749826	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319952229
348	NC_014934	TTTGCA	2	12	751063	751074	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319952231
349	NC_014934	TTTGCA	2	12	752306	752317	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319952233
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463	NC_014934	TCCTAA	2	12	996674	996685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319952430
464	NC_014934	AGTTTA	2	12	997312	997323	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319952430
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