MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides helcogenes P 36-108 chromosome

Total Repeats: 167

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014933	GCAAAA	2	12	25333	25344	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014933	CATTCA	2	12	28703	28714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_014933	GTTTAT	2	12	113120	113131	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014933	AGAATA	2	12	166579	166590	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014933	AATTTA	2	12	181895	181906	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014933	TCGCTT	2	12	202637	202648	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014933	AGTGGA	2	12	203544	203555	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014933	GAAGGG	2	12	205983	205994	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014933	TTTGCA	2	12	223632	223643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014933	TACAAA	2	12	223661	223672	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014933	AATCCG	2	12	233202	233213	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014933	CTCATA	2	12	272744	272755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_014933	TCGCTT	2	12	280605	280616	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014933	AGTGGA	2	12	281512	281523	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014933	TAAAAA	2	12	372695	372706	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014933	AACTAA	2	12	399564	399575	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014933	TAAAAA	2	12	419783	419794	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014933	TTTCCC	2	12	420719	420730	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_014933	GATTAA	2	12	456103	456114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014933	AAATGA	2	12	487512	487523	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014933	AACTGT	2	12	535733	535744	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014933	TTAAAT	2	12	629035	629046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014933	CGAAGC	2	12	642005	642016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014933	CCGAGA	2	12	642131	642142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014933	TTGTTA	2	12	675154	675165	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014933	TTTCGC	2	12	811762	811773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014933	ATAACA	2	12	820105	820116	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014933	TAACAA	2	12	901671	901682	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014933	GTATGT	2	12	926334	926345	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014933	CAAATA	2	12	1009055	1009066	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014933	TGAAAA	2	12	1014021	1014032	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014933	CTTTTT	2	12	1087266	1087277	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014933	TGCTAT	2	12	1102607	1102618	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014933	TTCTTA	2	12	1115381	1115392	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014933	AAACAA	2	12	1117233	1117244	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014933	GTGTTT	2	12	1131730	1131741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014933	ATTGTT	2	12	1135088	1135099	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014933	AGAAGG	2	12	1138337	1138348	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014933	AAAAAG	2	12	1158548	1158559	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014933	GATTTT	2	12	1174894	1174905	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014933	AAAAGA	2	12	1181869	1181880	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014933	TGAAGT	2	12	1282875	1282886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014933	TTTGCA	2	12	1295225	1295236	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014933	AGAAAA	2	12	1322760	1322771	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014933	CCCTTC	2	12	1392379	1392390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_014933	TTTCCC	2	12	1392641	1392652	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014933	AAGCGA	2	12	1395648	1395659	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014933	GTTAGT	2	12	1425459	1425470	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014933	TTTTGC	2	12	1491340	1491351	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_014933	CCTTTT	2	12	1491364	1491375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014933	AATTTA	2	12	1525367	1525378	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014933	AAGTAA	2	12	1545028	1545039	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014933	GTTGCA	2	12	1651589	1651600	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_014933	AAAAAC	2	12	1672593	1672604	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014933	AGATTT	2	12	1682117	1682128	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014933	ATTGCT	2	12	1702616	1702627	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014933	TCTTTT	2	12	1804872	1804883	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014933	TTTTTC	2	12	1807174	1807185	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014933	ACTTAT	2	12	1808989	1809000	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014933	TGATGT	2	12	1841959	1841970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014933	TGCAAA	2	12	1843452	1843463	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014933	TCTTTT	2	12	1973687	1973698	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014933	TTCTTT	2	12	1986686	1986697	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014933	TTGAAG	2	12	2010237	2010248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014933	ATGGTT	2	12	2078399	2078410	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014933	GAGAAT	2	12	2093209	2093220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014933	AAAACT	2	12	2137923	2137934	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014933	CTCTTT	2	12	2170041	2170052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014933	AATTAA	2	12	2175346	2175357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014933	TTTATT	2	12	2176864	2176875	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014933	AAAAGT	2	12	2178152	2178163	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014933	TGTTTA	2	12	2179461	2179472	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014933	CCAGTC	2	12	2186884	2186895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
74	NC_014933	TGTACC	2	12	2187364	2187375	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014933	GGACTT	2	12	2195239	2195250	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_014933	TAAATT	2	12	2205171	2205182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014933	GCGCAG	2	12	2217539	2217550	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014933	TGAGAT	2	12	2238501	2238512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014933	GCTTCT	2	12	2239238	2239249	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_014933	ATGTAT	2	12	2300336	2300347	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014933	TAAGTT	2	12	2303866	2303877	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014933	TTTGCT	2	12	2355821	2355832	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014933	CTGTTT	2	12	2360862	2360873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_014933	TTTTAA	2	12	2405178	2405189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014933	GGTTGG	2	12	2409476	2409487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014933	TTAAAA	2	12	2442007	2442018	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014933	AAGCGA	2	12	2465334	2465345	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014933	ATAAAG	2	12	2475805	2475816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014933	TTTTGT	2	12	2497195	2497206	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014933	AGGTAA	2	12	2497444	2497455	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014933	AAATAT	2	12	2500211	2500222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014933	GTTTAG	2	12	2500335	2500346	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014933	CTAAAC	2	12	2500351	2500362	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014933	TGTTTA	2	12	2515567	2515578	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014933	TTTGAG	2	12	2590536	2590547	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014933	GTTGAT	2	12	2629051	2629062	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014933	AGGAAC	2	12	2660598	2660609	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014933	GTATTT	2	12	2674530	2674541	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014933	CAAAAA	2	12	2693076	2693087	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014933	TTTTAA	2	12	2714210	2714221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014933	TAATTT	2	12	2738342	2738353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014933	AATAGT	2	12	2781207	2781218	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014933	GTAAAT	2	12	2782273	2782284	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014933	AAATAG	2	12	2885371	2885382	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014933	CTATTT	2	12	2885411	2885422	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_014933	ATAAAA	2	12	2899479	2899490	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014933	ATAATT	2	12	2899952	2899963	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014933	CTTGCT	2	12	2914772	2914783	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014933	ATATTA	2	12	2938760	2938771	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014933	GTTTTT	2	12	2974382	2974393	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014933	TTGCGA	2	12	2986294	2986305	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014933	AAAAAG	2	12	2998667	2998678	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014933	CACATA	2	12	3009121	3009132	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_014933	TACACT	2	12	3042519	3042530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014933	TTTCAT	2	12	3042740	3042751	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014933	AATTAA	2	12	3058505	3058516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014933	TAAACA	2	12	3071388	3071399	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014933	CATTAA	2	12	3077534	3077545	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014933	GAAACC	2	12	3079082	3079093	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014933	ATCCCC	2	12	3083030	3083041	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_014933	TTAAGA	2	12	3101156	3101167	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014933	ATATAA	2	12	3118500	3118511	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014933	AAATAC	2	12	3122434	3122445	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014933	CTGAAA	2	12	3126312	3126323	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014933	ACAGGA	2	12	3156124	3156135	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014933	TGCCAG	2	12	3192699	3192710	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.