MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 5073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	GCATC	2	10	2433	2442	20 %	20 %	20 %	40 %	319790696
2	NC_014931	GAGCT	2	10	3512	3521	20 %	20 %	40 %	20 %	319790697
3	NC_014931	CAACC	2	10	6092	6101	40 %	0 %	0 %	60 %	319790698
4	NC_014931	GGCAC	2	10	9334	9343	20 %	0 %	40 %	40 %	319790702
5	NC_014931	GCGCG	2	10	9464	9473	0 %	0 %	60 %	40 %	319790702
6	NC_014931	CCGGC	2	10	9861	9870	0 %	0 %	40 %	60 %	319790702
7	NC_014931	CTAGG	2	10	11166	11175	20 %	20 %	40 %	20 %	319790704
8	NC_014931	ACGCC	2	10	11815	11824	20 %	0 %	20 %	60 %	319790705
9	NC_014931	GGCGC	2	10	12696	12705	0 %	0 %	60 %	40 %	319790706
10	NC_014931	CGCGG	2	10	12780	12789	0 %	0 %	60 %	40 %	319790706
11	NC_014931	CGCTG	2	10	13252	13261	0 %	20 %	40 %	40 %	319790706
12	NC_014931	GGCCA	2	10	14578	14587	20 %	0 %	40 %	40 %	319790708
13	NC_014931	GGTGG	2	10	17741	17750	0 %	20 %	80 %	0 %	319790711
14	NC_014931	GGTGG	2	10	19892	19901	0 %	20 %	80 %	0 %	319790713
15	NC_014931	GCGCC	2	10	20428	20437	0 %	0 %	40 %	60 %	319790714
16	NC_014931	CGCAG	2	10	21174	21183	20 %	0 %	40 %	40 %	319790714
17	NC_014931	GCCGG	2	10	23098	23107	0 %	0 %	60 %	40 %	319790717
18	NC_014931	CGCCA	2	10	23435	23444	20 %	0 %	20 %	60 %	319790717
19	NC_014931	TTCGG	2	10	23803	23812	0 %	40 %	40 %	20 %	319790717
20	NC_014931	CGATT	2	10	24177	24186	20 %	40 %	20 %	20 %	319790717
21	NC_014931	CGGCG	2	10	24375	24384	0 %	0 %	60 %	40 %	319790717
22	NC_014931	CACCT	2	10	25977	25986	20 %	20 %	0 %	60 %	319790718
23	NC_014931	GCGCA	2	10	26028	26037	20 %	0 %	40 %	40 %	319790718
24	NC_014931	CGCAA	2	10	26179	26188	40 %	0 %	20 %	40 %	319790718
25	NC_014931	CGCGC	2	10	26665	26674	0 %	0 %	40 %	60 %	319790718
26	NC_014931	CCCGA	2	10	28031	28040	20 %	0 %	20 %	60 %	319790720
27	NC_014931	AACGC	2	10	28061	28070	40 %	0 %	20 %	40 %	319790720
28	NC_014931	CGGTG	2	10	29268	29277	0 %	20 %	60 %	20 %	319790720
29	NC_014931	TGCGC	2	10	31855	31864	0 %	20 %	40 %	40 %	319790722
30	NC_014931	CGGCC	2	10	32717	32726	0 %	0 %	40 %	60 %	319790723
31	NC_014931	GCGCC	2	10	35784	35793	0 %	0 %	40 %	60 %	319790727
32	NC_014931	CAGCG	2	10	36087	36096	20 %	0 %	40 %	40 %	319790727
33	NC_014931	CGATG	2	10	37158	37167	20 %	20 %	40 %	20 %	319790727
34	NC_014931	GCACC	2	10	38564	38573	20 %	0 %	20 %	60 %	319790729
35	NC_014931	CGCGC	2	10	40148	40157	0 %	0 %	40 %	60 %	319790730
36	NC_014931	CGGTG	2	10	43045	43054	0 %	20 %	60 %	20 %	319790734
37	NC_014931	GCCGC	2	10	44503	44512	0 %	0 %	40 %	60 %	319790735
38	NC_014931	GCGAA	2	10	44530	44539	40 %	0 %	40 %	20 %	319790735
39	NC_014931	TCCAT	2	10	44688	44697	20 %	40 %	0 %	40 %	319790735
40	NC_014931	GGCGC	2	10	45679	45688	0 %	0 %	60 %	40 %	319790736
41	NC_014931	CGGCA	2	10	47249	47258	20 %	0 %	40 %	40 %	319790738
42	NC_014931	AGGCG	2	10	47758	47767	20 %	0 %	60 %	20 %	319790739
43	NC_014931	GTGGC	2	10	47815	47824	0 %	20 %	60 %	20 %	319790739
44	NC_014931	GCGCC	2	10	48239	48248	0 %	0 %	40 %	60 %	319790739
45	NC_014931	GCGCC	2	10	48835	48844	0 %	0 %	40 %	60 %	319790739
46	NC_014931	CGCGG	2	10	49581	49590	0 %	0 %	60 %	40 %	319790740
47	NC_014931	AAGGC	2	10	50738	50747	40 %	0 %	40 %	20 %	319790741
48	NC_014931	GTGGC	2	10	51075	51084	0 %	20 %	60 %	20 %	319790742
49	NC_014931	GCCGC	2	10	53645	53654	0 %	0 %	40 %	60 %	319790744
50	NC_014931	GCAGG	2	10	54595	54604	20 %	0 %	60 %	20 %	319790745
51	NC_014931	CTTCG	2	10	54814	54823	0 %	40 %	20 %	40 %	319790745
52	NC_014931	CCCGG	2	10	55193	55202	0 %	0 %	40 %	60 %	319790746
53	NC_014931	CGGCA	2	10	55542	55551	20 %	0 %	40 %	40 %	319790746
54	NC_014931	CCGCA	2	10	56104	56113	20 %	0 %	20 %	60 %	319790747
55	NC_014931	GCGCC	2	10	57371	57380	0 %	0 %	40 %	60 %	319790749
56	NC_014931	GCGCG	2	10	58641	58650	0 %	0 %	60 %	40 %	319790750
57	NC_014931	GACGC	2	10	62129	62138	20 %	0 %	40 %	40 %	319790754
58	NC_014931	GGGTC	2	10	63377	63386	0 %	20 %	60 %	20 %	319790756
59	NC_014931	ACGCC	2	10	65554	65563	20 %	0 %	20 %	60 %	319790760
60	NC_014931	GCAGG	2	10	65804	65813	20 %	0 %	60 %	20 %	319790760
61	NC_014931	TTGCC	2	10	67162	67171	0 %	40 %	20 %	40 %	319790762
62	NC_014931	GCCGC	2	10	69491	69500	0 %	0 %	40 %	60 %	319790764
63	NC_014931	CCGAT	2	10	70011	70020	20 %	20 %	20 %	40 %	319790764
64	NC_014931	ACGGT	2	10	70077	70086	20 %	20 %	40 %	20 %	319790764
65	NC_014931	TTCGA	2	10	71395	71404	20 %	40 %	20 %	20 %	319790765
66	NC_014931	CCCGC	2	10	71612	71621	0 %	0 %	20 %	80 %	319790765
67	NC_014931	CGGTG	2	10	72099	72108	0 %	20 %	60 %	20 %	319790765
68	NC_014931	GATCG	2	10	74448	74457	20 %	20 %	40 %	20 %	319790768
69	NC_014931	ACCAG	2	10	80585	80594	40 %	0 %	20 %	40 %	319790773
70	NC_014931	GACGC	2	10	80822	80831	20 %	0 %	40 %	40 %	319790773
71	NC_014931	TTCGC	2	10	81282	81291	0 %	40 %	20 %	40 %	319790774
72	NC_014931	TCGCG	2	10	84006	84015	0 %	20 %	40 %	40 %	319790777
73	NC_014931	CGTGC	2	10	86098	86107	0 %	20 %	40 %	40 %	319790779
74	NC_014931	GCGCG	2	10	87208	87217	0 %	0 %	60 %	40 %	319790780
75	NC_014931	CGCAC	2	10	87674	87683	20 %	0 %	20 %	60 %	319790780
76	NC_014931	ACCGA	2	10	89469	89478	40 %	0 %	20 %	40 %	319790781
77	NC_014931	AGCGC	2	10	89629	89638	20 %	0 %	40 %	40 %	319790781
78	NC_014931	GCGGG	2	10	89672	89681	0 %	0 %	80 %	20 %	319790781
79	NC_014931	GCGCC	2	10	90992	91001	0 %	0 %	40 %	60 %	319790783
80	NC_014931	CGGCG	2	10	93138	93147	0 %	0 %	60 %	40 %	319790785
81	NC_014931	TGCGC	2	10	93305	93314	0 %	20 %	40 %	40 %	319790785
82	NC_014931	CACGG	2	10	94484	94493	20 %	0 %	40 %	40 %	319790787
83	NC_014931	GCCAC	2	10	97526	97535	20 %	0 %	20 %	60 %	319790791
84	NC_014931	CCGCG	2	10	97649	97658	0 %	0 %	40 %	60 %	319790791
85	NC_014931	CGGCG	2	10	98654	98663	0 %	0 %	60 %	40 %	319790792
86	NC_014931	CAGCG	2	10	98675	98684	20 %	0 %	40 %	40 %	319790792
87	NC_014931	GCGCC	2	10	102785	102794	0 %	0 %	40 %	60 %	319790795
88	NC_014931	GCGCG	2	10	105858	105867	0 %	0 %	60 %	40 %	319790798
89	NC_014931	GCCGG	2	10	108454	108463	0 %	0 %	60 %	40 %	319790799
90	NC_014931	CGCGC	2	10	108713	108722	0 %	0 %	40 %	60 %	319790799
91	NC_014931	AGGCG	2	10	108787	108796	20 %	0 %	60 %	20 %	319790799
92	NC_014931	GCCGC	2	10	112071	112080	0 %	0 %	40 %	60 %	319790802
93	NC_014931	GCTGC	2	10	115116	115125	0 %	20 %	40 %	40 %	319790804
94	NC_014931	GGCCG	2	10	115335	115344	0 %	0 %	60 %	40 %	319790805
95	NC_014931	CGGCC	2	10	117038	117047	0 %	0 %	40 %	60 %	319790807
96	NC_014931	CGTCA	2	10	118238	118247	20 %	20 %	20 %	40 %	319790808
97	NC_014931	AGCCA	2	10	120364	120373	40 %	0 %	20 %	40 %	319790810
98	NC_014931	GCGCC	2	10	121020	121029	0 %	0 %	40 %	60 %	319790811
99	NC_014931	CCGGG	2	10	121303	121312	0 %	0 %	60 %	40 %	319790812
100	NC_014931	CGAAG	2	10	121921	121930	40 %	0 %	40 %	20 %	319790812
101	NC_014931	CGGGC	2	10	122122	122131	0 %	0 %	60 %	40 %	319790813
102	NC_014931	GCGCG	2	10	123029	123038	0 %	0 %	60 %	40 %	319790814
103	NC_014931	CTCGA	2	10	125473	125482	20 %	20 %	20 %	40 %	319790815
104	NC_014931	CCGCG	2	10	127743	127752	0 %	0 %	40 %	60 %	319790817
105	NC_014931	AGCGC	2	10	127782	127791	20 %	0 %	40 %	40 %	319790817
106	NC_014931	CGGTC	2	10	127977	127986	0 %	20 %	40 %	40 %	319790817
107	NC_014931	TGCGC	2	10	128888	128897	0 %	20 %	40 %	40 %	319790818
108	NC_014931	CCTCC	2	10	129758	129767	0 %	20 %	0 %	80 %	319790819
109	NC_014931	ATCGG	2	10	130517	130526	20 %	20 %	40 %	20 %	319790819
110	NC_014931	CACGC	2	10	132307	132316	20 %	0 %	20 %	60 %	319790821
111	NC_014931	CCGAA	2	10	132367	132376	40 %	0 %	20 %	40 %	319790821
112	NC_014931	GAAGG	2	10	133023	133032	40 %	0 %	60 %	0 %	319790822
113	NC_014931	GCCGC	2	10	136996	137005	0 %	0 %	40 %	60 %	319790826
114	NC_014931	CGCGC	2	10	139239	139248	0 %	0 %	40 %	60 %	319790829
115	NC_014931	GCGAC	2	10	141132	141141	20 %	0 %	40 %	40 %	319790831
116	NC_014931	GCGGG	2	10	141600	141609	0 %	0 %	80 %	20 %	319790831
117	NC_014931	GCGTG	2	10	144308	144317	0 %	20 %	60 %	20 %	319790835
118	NC_014931	TGCAA	2	10	145338	145347	40 %	20 %	20 %	20 %	319790836
119	NC_014931	CGCGC	2	10	145464	145473	0 %	0 %	40 %	60 %	319790836
120	NC_014931	GGCGC	2	10	146283	146292	0 %	0 %	60 %	40 %	319790837
121	NC_014931	GCGCA	2	10	147542	147551	20 %	0 %	40 %	40 %	319790838
122	NC_014931	CATCG	2	10	148111	148120	20 %	20 %	20 %	40 %	319790839
123	NC_014931	CTTCA	2	10	149234	149243	20 %	40 %	0 %	40 %	319790840
124	NC_014931	GCGCG	2	10	153080	153089	0 %	0 %	60 %	40 %	319790845
125	NC_014931	GACAA	2	10	154040	154049	60 %	0 %	20 %	20 %	319790846
126	NC_014931	GCTGA	2	10	159347	159356	20 %	20 %	40 %	20 %	319790849
127	NC_014931	CCCAG	2	10	160309	160318	20 %	0 %	20 %	60 %	319790851
128	NC_014931	ATCGG	2	10	163900	163909	20 %	20 %	40 %	20 %	319790855
129	NC_014931	GCCGC	2	10	165211	165220	0 %	0 %	40 %	60 %	319790857
130	NC_014931	GAGGT	2	10	165997	166006	20 %	20 %	60 %	0 %	319790857
131	NC_014931	CTCGC	2	10	169271	169280	0 %	20 %	20 %	60 %	319790860
132	NC_014931	TCGGC	2	10	170111	170120	0 %	20 %	40 %	40 %	319790861
133	NC_014931	AGCTG	2	10	172122	172131	20 %	20 %	40 %	20 %	319790864
134	NC_014931	AACGG	2	10	178872	178881	40 %	0 %	40 %	20 %	319790865
135	NC_014931	TGCGC	2	10	182332	182341	0 %	20 %	40 %	40 %	319790868
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