MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 17411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	CTCG	2	8	744	751	0 %	25 %	25 %	50 %	319790695
2	NC_014931	CGCA	2	8	796	803	25 %	0 %	25 %	50 %	319790695
3	NC_014931	GCCG	2	8	1804	1811	0 %	0 %	50 %	50 %	319790696
4	NC_014931	GCAA	2	8	2052	2059	50 %	0 %	25 %	25 %	319790696
5	NC_014931	ACCT	2	8	2525	2532	25 %	25 %	0 %	50 %	319790696
6	NC_014931	GGCC	2	8	3043	3050	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
7	NC_014931	GCCG	2	8	3676	3683	0 %	0 %	50 %	50 %	319790697
8	NC_014931	GCAC	2	8	3705	3712	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
9	NC_014931	CCAG	2	8	3963	3970	25 %	0 %	25 %	50 %	319790697
10	NC_014931	CGCC	2	8	4857	4864	0 %	0 %	25 %	75 %	319790697
11	NC_014931	GCGG	2	8	5395	5402	0 %	0 %	75 %	25 %	319790697
12	NC_014931	GAGC	2	8	5418	5425	25 %	0 %	50 %	25 %	319790697
13	NC_014931	CGCA	2	8	5428	5435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014931	GCTG	2	8	6210	6217	0 %	25 %	50 %	25 %	319790698
15	NC_014931	GCCA	2	8	6620	6627	25 %	0 %	25 %	50 %	319790698
16	NC_014931	GGCG	2	8	6762	6769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014931	CCCG	2	8	6839	6846	0 %	0 %	25 %	75 %	319790699
18	NC_014931	GCCC	2	8	6858	6865	0 %	0 %	25 %	75 %	319790699
19	NC_014931	GCCG	2	8	6878	6885	0 %	0 %	50 %	50 %	319790699
20	NC_014931	GGCC	2	8	7123	7130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014931	GATG	2	8	7637	7644	25 %	25 %	50 %	0 %	319790700
22	NC_014931	TGGG	2	8	7711	7718	0 %	25 %	75 %	0 %	319790700
23	NC_014931	GTCA	2	8	7913	7920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014931	GGCA	2	8	8449	8456	25 %	0 %	50 %	25 %	319790701
25	NC_014931	CGGC	2	8	8469	8476	0 %	0 %	50 %	50 %	319790701
26	NC_014931	CTGG	2	8	8966	8973	0 %	25 %	50 %	25 %	319790702
27	NC_014931	GCGA	2	8	9558	9565	25 %	0 %	50 %	25 %	319790702
28	NC_014931	GCTG	2	8	9992	9999	0 %	25 %	50 %	25 %	319790703
29	NC_014931	TCGC	2	8	10183	10190	0 %	25 %	25 %	50 %	319790703
30	NC_014931	GGCC	2	8	10253	10260	0 %	0 %	50 %	50 %	319790703
31	NC_014931	CGTG	2	8	11383	11390	0 %	25 %	50 %	25 %	319790705
32	NC_014931	CCAG	2	8	11728	11735	25 %	0 %	25 %	50 %	319790705
33	NC_014931	GCGA	2	8	12125	12132	25 %	0 %	50 %	25 %	319790705
34	NC_014931	CGGC	2	8	12251	12258	0 %	0 %	50 %	50 %	319790706
35	NC_014931	CTCG	2	8	12360	12367	0 %	25 %	25 %	50 %	319790706
36	NC_014931	GAAA	2	8	12731	12738	75 %	0 %	25 %	0 %	319790706
37	NC_014931	ACCG	2	8	13167	13174	25 %	0 %	25 %	50 %	319790706
38	NC_014931	CGGC	2	8	13716	13723	0 %	0 %	50 %	50 %	319790707
39	NC_014931	GCCT	2	8	14272	14279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014931	TCCA	2	8	14420	14427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_014931	CGGC	2	8	14516	14523	0 %	0 %	50 %	50 %	319790708
42	NC_014931	GCCG	2	8	14598	14605	0 %	0 %	50 %	50 %	319790708
43	NC_014931	GCGG	2	8	15243	15250	0 %	0 %	75 %	25 %	319790709
44	NC_014931	CCGG	2	8	15254	15261	0 %	0 %	50 %	50 %	319790709
45	NC_014931	CGGC	2	8	15474	15481	0 %	0 %	50 %	50 %	319790709
46	NC_014931	CGTG	2	8	16082	16089	0 %	25 %	50 %	25 %	319790710
47	NC_014931	CGAT	2	8	16129	16136	25 %	25 %	25 %	25 %	319790710
48	NC_014931	GCCG	2	8	16334	16341	0 %	0 %	50 %	50 %	319790710
49	NC_014931	CGGC	2	8	16979	16986	0 %	0 %	50 %	50 %	319790711
50	NC_014931	TGGT	2	8	17016	17023	0 %	50 %	50 %	0 %	319790711
51	NC_014931	CGGC	2	8	17436	17443	0 %	0 %	50 %	50 %	319790711
52	NC_014931	CCAG	2	8	18338	18345	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
53	NC_014931	GGCG	2	8	18366	18373	0 %	0 %	75 %	25 %	319790712
54	NC_014931	CGGT	2	8	18634	18641	0 %	25 %	50 %	25 %	319790712
55	NC_014931	CGGC	2	8	18919	18926	0 %	0 %	50 %	50 %	319790712
56	NC_014931	CAGC	2	8	19053	19060	25 %	0 %	25 %	50 %	319790712
57	NC_014931	GCCG	2	8	19383	19390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58	NC_014931	GAGC	2	8	19549	19556	25 %	0 %	50 %	25 %	319790713
59	NC_014931	CAGC	2	8	19960	19967	25 %	0 %	25 %	50 %	319790713
60	NC_014931	CCTT	2	8	20639	20646	0 %	50 %	0 %	50 %	319790714
61	NC_014931	TCGA	2	8	20657	20664	25 %	25 %	25 %	25 %	319790714
62	NC_014931	CGTG	2	8	20694	20701	0 %	25 %	50 %	25 %	319790714
63	NC_014931	CAGC	2	8	20740	20747	25 %	0 %	25 %	50 %	319790714
64	NC_014931	GGCC	2	8	21192	21199	0 %	0 %	50 %	50 %	319790714
65	NC_014931	CGCC	2	8	21354	21361	0 %	0 %	25 %	75 %	319790714
66	NC_014931	TGCC	2	8	22685	22692	0 %	25 %	25 %	50 %	319790716
67	NC_014931	GCCA	2	8	22702	22709	25 %	0 %	25 %	50 %	319790716
68	NC_014931	AGCC	2	8	22867	22874	25 %	0 %	25 %	50 %	319790716
69	NC_014931	GTGG	2	8	24303	24310	0 %	25 %	75 %	0 %	319790717
70	NC_014931	CTTC	2	8	24320	24327	0 %	50 %	0 %	50 %	319790717
71	NC_014931	CGCC	2	8	25124	25131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_014931	GGCC	2	8	25292	25299	0 %	0 %	50 %	50 %	319790718
73	NC_014931	TGGA	2	8	25464	25471	25 %	25 %	50 %	0 %	319790718
74	NC_014931	TCGC	2	8	26217	26224	0 %	25 %	25 %	50 %	319790718
75	NC_014931	CAGC	2	8	26443	26450	25 %	0 %	25 %	50 %	319790718
76	NC_014931	GCTG	2	8	26739	26746	0 %	25 %	50 %	25 %	319790719
77	NC_014931	GCCT	2	8	27174	27181	0 %	25 %	25 %	50 %	319790719
78	NC_014931	AGCG	2	8	27303	27310	25 %	0 %	50 %	25 %	319790719
79	NC_014931	CGCT	2	8	27335	27342	0 %	25 %	25 %	50 %	319790719
80	NC_014931	CATC	2	8	28139	28146	25 %	25 %	0 %	50 %	319790720
81	NC_014931	CCGA	2	8	29050	29057	25 %	0 %	25 %	50 %	319790720
82	NC_014931	GAAG	2	8	29061	29068	50 %	0 %	50 %	0 %	319790720
83	NC_014931	GAAA	2	8	29151	29158	75 %	0 %	25 %	0 %	319790720
84	NC_014931	CATT	2	8	30480	30487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_014931	CACG	2	8	30858	30865	25 %	0 %	25 %	50 %	319790721
86	NC_014931	ATCG	2	8	31376	31383	25 %	25 %	25 %	25 %	319790722
87	NC_014931	CGTG	2	8	31732	31739	0 %	25 %	50 %	25 %	319790722
88	NC_014931	CCAG	2	8	31909	31916	25 %	0 %	25 %	50 %	319790722
89	NC_014931	CCCA	2	8	31965	31972	25 %	0 %	0 %	75 %	319790722
90	NC_014931	TGCC	2	8	32193	32200	0 %	25 %	25 %	50 %	319790722
91	NC_014931	CGGT	2	8	32229	32236	0 %	25 %	50 %	25 %	319790722
92	NC_014931	TGGC	2	8	32535	32542	0 %	25 %	50 %	25 %	319790723
93	NC_014931	TCGC	2	8	32666	32673	0 %	25 %	25 %	50 %	319790723
94	NC_014931	GCCG	2	8	32778	32785	0 %	0 %	50 %	50 %	319790723
95	NC_014931	GCCC	2	8	33081	33088	0 %	0 %	25 %	75 %	319790723
96	NC_014931	GCGG	2	8	33170	33177	0 %	0 %	75 %	25 %	319790723
97	NC_014931	TCGG	2	8	33691	33698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014931	CTCG	2	8	34196	34203	0 %	25 %	25 %	50 %	319790724
99	NC_014931	AAGG	2	8	34731	34738	50 %	0 %	50 %	0 %	319790724
100	NC_014931	ATGA	3	12	35450	35461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014931	TCGG	2	8	35635	35642	0 %	25 %	50 %	25 %	319790727
102	NC_014931	GCCG	2	8	36384	36391	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
103	NC_014931	GGCC	2	8	36904	36911	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
104	NC_014931	TGCG	2	8	37319	37326	0 %	25 %	50 %	25 %	319790727
105	NC_014931	GCCG	2	8	37431	37438	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
106	NC_014931	CGGC	2	8	37589	37596	0 %	0 %	50 %	50 %	319790727
107	NC_014931	GCCG	2	8	38115	38122	0 %	0 %	50 %	50 %	319790728
108	NC_014931	AAGC	2	8	38654	38661	50 %	0 %	25 %	25 %	319790729
109	NC_014931	ATCC	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	319790729
110	NC_014931	CGAG	2	8	38750	38757	25 %	0 %	50 %	25 %	319790729
111	NC_014931	CGGC	2	8	38789	38796	0 %	0 %	50 %	50 %	319790729
112	NC_014931	CGTT	2	8	38944	38951	0 %	50 %	25 %	25 %	319790729
113	NC_014931	GCCG	2	8	39974	39981	0 %	0 %	50 %	50 %	319790730
114	NC_014931	CGGC	2	8	40264	40271	0 %	0 %	50 %	50 %	319790730
115	NC_014931	GCAG	2	8	40736	40743	25 %	0 %	50 %	25 %	319790730
116	NC_014931	GCGA	2	8	40749	40756	25 %	0 %	50 %	25 %	319790730
117	NC_014931	GCAC	2	8	40791	40798	25 %	0 %	25 %	50 %	319790730
118	NC_014931	CAGC	2	8	40915	40922	25 %	0 %	25 %	50 %	319790730
119	NC_014931	GCGA	2	8	41111	41118	25 %	0 %	50 %	25 %	319790731
120	NC_014931	GGTC	2	8	41130	41137	0 %	25 %	50 %	25 %	319790731
121	NC_014931	GGCG	2	8	41146	41153	0 %	0 %	75 %	25 %	319790731
122	NC_014931	TCGT	2	8	41254	41261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014931	CGTT	2	8	41635	41642	0 %	50 %	25 %	25 %	319790732
124	NC_014931	TGCG	2	8	41722	41729	0 %	25 %	50 %	25 %	319790732
125	NC_014931	GCGA	2	8	41818	41825	25 %	0 %	50 %	25 %	319790732
126	NC_014931	ATCG	2	8	41964	41971	25 %	25 %	25 %	25 %	319790732
127	NC_014931	CCAT	2	8	42224	42231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014931	GGCA	2	8	42481	42488	25 %	0 %	50 %	25 %	319790733
129	NC_014931	TGCG	2	8	42625	42632	0 %	25 %	50 %	25 %	319790733
130	NC_014931	GCCC	2	8	42775	42782	0 %	0 %	25 %	75 %	319790733
131	NC_014931	GGCG	2	8	43144	43151	0 %	0 %	75 %	25 %	319790734
132	NC_014931	CTCG	2	8	43886	43893	0 %	25 %	25 %	50 %	319790734
133	NC_014931	CGAA	2	8	44013	44020	50 %	0 %	25 %	25 %	319790734
134	NC_014931	GGGA	2	8	44446	44453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014931	CTCG	2	8	44756	44763	0 %	25 %	25 %	50 %	319790735
136	NC_014931	CGGC	2	8	44820	44827	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
137	NC_014931	GCCG	2	8	44883	44890	0 %	0 %	50 %	50 %	319790735
138	NC_014931	GCGT	2	8	45160	45167	0 %	25 %	50 %	25 %	319790735
139	NC_014931	GAAG	2	8	45248	45255	50 %	0 %	50 %	0 %	319790736
140	NC_014931	TCGC	2	8	45649	45656	0 %	25 %	25 %	50 %	319790736
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142	NC_014931	CCAT	2	8	46447	46454	25 %	25 %	0 %	50 %	319790738
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