MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 2047

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	CGCA	2	8	5428	5435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2	NC_014931	GGCG	2	8	6762	6769	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014931	GGCC	2	8	7123	7130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014931	GTCA	2	8	7913	7920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_014931	GCCT	2	8	14272	14279	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_014931	TCCA	2	8	14420	14427	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_014931	GCCG	2	8	19383	19390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_014931	CGCC	2	8	25124	25131	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_014931	CATT	2	8	30480	30487	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_014931	TCGG	2	8	33691	33698	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11	NC_014931	ATGA	3	12	35450	35461	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014931	TCGT	2	8	41254	41261	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_014931	CCAT	2	8	42224	42231	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_014931	GGGA	2	8	44446	44453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014931	GGCC	2	8	50169	50176	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_014931	GCGG	2	8	52301	52308	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_014931	TCGT	2	8	58228	58235	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014931	GAGC	2	8	60781	60788	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_014931	GTGC	2	8	63135	63142	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_014931	CTTT	2	8	65276	65283	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_014931	TTTG	2	8	67095	67102	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014931	TCCG	2	8	72223	72230	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_014931	GGCG	2	8	77256	77263	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
24	NC_014931	TTAC	2	8	86893	86900	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_014931	CCTT	2	8	87807	87814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_014931	GTTC	3	12	91907	91918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_014931	AATC	2	8	94816	94823	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_014931	CCAT	2	8	99332	99339	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_014931	GAAC	2	8	99442	99449	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_014931	TGCG	2	8	99470	99477	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_014931	GGCT	2	8	105244	105251	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014931	CTTG	2	8	105311	105318	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_014931	GAAG	2	8	119586	119593	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014931	GAAT	2	8	119594	119601	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014931	GGCG	2	8	128341	128348	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
36	NC_014931	TCAC	2	8	129261	129268	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014931	ATTC	2	8	136788	136795	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014931	ACTC	2	8	136846	136853	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_014931	CCGG	2	8	139345	139352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014931	GATG	2	8	143919	143926	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014931	CCGG	2	8	143946	143953	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_014931	GGCG	3	12	144072	144083	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
43	NC_014931	CGGG	2	8	148725	148732	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
44	NC_014931	AGGA	2	8	148810	148817	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014931	GAGG	2	8	152158	152165	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014931	CAGG	2	8	159406	159413	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014931	TGCA	2	8	167600	167607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_014931	ATGC	2	8	167746	167753	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_014931	CATG	2	8	170202	170209	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014931	CGAC	2	8	170476	170483	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014931	TAGA	2	8	172142	172149	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014931	GCTC	2	8	172207	172214	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
53	NC_014931	GCTC	2	8	172227	172234	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_014931	GCTC	2	8	172247	172254	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_014931	GCTC	2	8	172267	172274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014931	TTAG	2	8	172281	172288	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014931	CGAG	2	8	172331	172338	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_014931	GCGA	2	8	175254	175261	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_014931	AAAC	2	8	175793	175800	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014931	AAAG	2	8	176087	176094	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014931	TTGA	2	8	176867	176874	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014931	CAAG	2	8	177946	177953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014931	CCGC	2	8	180302	180309	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
64	NC_014931	CAGG	2	8	184233	184240	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_014931	CGGG	2	8	189209	189216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_014931	ACCG	2	8	192925	192932	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_014931	TCCC	2	8	198633	198640	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
68	NC_014931	CCTT	2	8	199644	199651	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014931	CTGT	2	8	199691	199698	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014931	CGGC	2	8	199716	199723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_014931	TACA	2	8	199804	199811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_014931	AGAA	2	8	200496	200503	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014931	CGTT	2	8	210009	210016	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_014931	GCCG	2	8	212998	213005	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_014931	GTTG	2	8	219116	219123	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014931	ACAG	2	8	219394	219401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_014931	GAGC	2	8	230653	230660	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_014931	CATC	2	8	237316	237323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_014931	ACTT	2	8	237486	237493	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014931	GCGG	2	8	242655	242662	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
81	NC_014931	GCTG	2	8	249982	249989	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_014931	GCCG	2	8	254035	254042	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014931	TCTT	2	8	258465	258472	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
84	NC_014931	AATG	2	8	266241	266248	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014931	TTTC	2	8	266253	266260	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_014931	CATT	2	8	267698	267705	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_014931	CATC	2	8	271294	271301	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
88	NC_014931	GGCC	2	8	273832	273839	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
89	NC_014931	CGGC	2	8	273863	273870	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_014931	AATG	2	8	283892	283899	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014931	CGGC	2	8	285375	285382	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014931	TTGC	2	8	286475	286482	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_014931	ACGG	2	8	291296	291303	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014931	CTCC	2	8	293581	293588	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
95	NC_014931	CTCA	2	8	293626	293633	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014931	GGGA	2	8	299422	299429	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014931	GATC	2	8	304958	304965	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
98	NC_014931	CGGC	2	8	309525	309532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014931	TGGG	2	8	314535	314542	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014931	GGTG	2	8	314635	314642	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014931	TGCG	2	8	314661	314668	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_014931	CTGC	2	8	319019	319026	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014931	GGGA	2	8	319052	319059	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014931	GAAC	2	8	320162	320169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
105	NC_014931	CACC	2	8	322502	322509	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
106	NC_014931	GGGC	2	8	322526	322533	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014931	TCCT	2	8	339871	339878	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_014931	TCCC	2	8	343749	343756	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_014931	GCCG	2	8	345591	345598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014931	TCCA	2	8	349202	349209	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_014931	GCGG	2	8	354462	354469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
112	NC_014931	CAGA	2	8	363193	363200	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_014931	TTGT	2	8	363987	363994	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014931	GAAA	2	8	364507	364514	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014931	CGCC	2	8	366689	366696	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
116	NC_014931	TCCC	2	8	377298	377305	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
117	NC_014931	CTGC	2	8	377358	377365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_014931	TGAC	2	8	380878	380885	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_014931	TTCT	3	12	381887	381898	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_014931	GCCT	2	8	392867	392874	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_014931	CTTT	2	8	392914	392921	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014931	CTGA	2	8	396047	396054	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_014931	AGAC	2	8	397058	397065	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_014931	AGCG	2	8	397799	397806	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_014931	AATG	2	8	397884	397891	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014931	GATT	2	8	397934	397941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014931	TGTT	3	12	399085	399096	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014931	AATG	2	8	399196	399203	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014931	CTTC	2	8	400389	400396	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_014931	GAGG	2	8	407349	407356	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014931	GCCG	2	8	407872	407879	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132	NC_014931	GCAC	2	8	412713	412720	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014931	AGCC	2	8	434130	434137	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
134	NC_014931	ATTG	2	8	434159	434166	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014931	CGAG	2	8	434277	434284	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_014931	ACCC	2	8	434310	434317	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
137	NC_014931	GCCG	2	8	435941	435948	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
138	NC_014931	ATCA	2	8	435998	436005	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_014931	TATC	2	8	444240	444247	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
140	NC_014931	GCAT	2	8	444502	444509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_014931	GGCA	2	8	444517	444524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_014931	CAAA	2	8	456022	456029	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_014931	GAGG	2	8	458560	458567	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014931	CTGA	2	8	458700	458707	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_014931	GGAC	2	8	458711	458718	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
146	NC_014931	GCAA	2	8	460910	460917	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
147	NC_014931	CGAC	2	8	461049	461056	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_014931	CATC	2	8	462253	462260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_014931	GCGG	2	8	464440	464447	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
150	NC_014931	CGCC	2	8	464448	464455	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
151	NC_014931	GTCC	2	8	464468	464475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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162	NC_014931	GAAT	2	8	503638	503645	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014931	GAAA	2	8	505243	505250	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_014931	TAAA	2	8	511792	511799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_014931	GCCC	2	8	598332	598339	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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271	NC_014931	CAGC	2	8	822940	822947	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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277	NC_014931	ACTT	2	8	852839	852846	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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279	NC_014931	CCAG	2	8	864115	864122	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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281	NC_014931	AGCA	2	8	867602	867609	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
282	NC_014931	ACGA	2	8	869971	869978	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_014931	AGCA	2	8	871929	871936	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
284	NC_014931	AAAG	2	8	877140	877147	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014931	GTGC	2	8	877205	877212	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
286	NC_014931	CGAT	2	8	877261	877268	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
287	NC_014931	GATT	3	12	881365	881376	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014931	AATT	2	8	881377	881384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014931	GCCT	2	8	885475	885482	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
290	NC_014931	GGCC	3	12	894785	894796	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
291	NC_014931	GCAG	2	8	894935	894942	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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294	NC_014931	TCCC	2	8	902758	902765	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
295	NC_014931	GCCC	2	8	902817	902824	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
296	NC_014931	GAGC	2	8	906911	906918	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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470	NC_014931	CAAG	2	8	1539947	1539954	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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497	NC_014931	TGGT	2	8	1613847	1613854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
498	NC_014931	TTGA	2	8	1615018	1615025	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
499	NC_014931	AGGG	2	8	1615285	1615292	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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