MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 7103

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	CAG	2	6	20	25	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014931	CCA	2	6	67	72	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014931	TCA	2	6	1477	1482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014931	AGA	2	6	1540	1545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014931	GAA	2	6	1547	1552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014931	GGC	2	6	2728	2733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_014931	CAG	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014931	ATT	2	6	5720	5725	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014931	TCT	2	6	5775	5780	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014931	CTT	2	6	6010	6015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014931	TGC	2	6	6060	6065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014931	CCA	2	6	6077	6082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13	NC_014931	GTT	2	6	7068	7073	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014931	GCC	2	6	7081	7086	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_014931	TCA	2	6	7204	7209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014931	ACA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_014931	ACG	2	6	7874	7879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_014931	TGG	2	6	7897	7902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014931	CGC	2	6	7938	7943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_014931	GGC	2	6	7949	7954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_014931	CGG	4	12	8497	8508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014931	CTC	2	6	8547	8552	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
23	NC_014931	GCG	2	6	8606	8611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_014931	GGT	2	6	8649	8654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014931	GAG	2	6	10413	10418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014931	TGC	2	6	10449	10454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_014931	GCA	2	6	10458	10463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_014931	TTG	2	6	10480	10485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014931	TTC	2	6	10562	10567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014931	CTT	2	6	14295	14300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_014931	GGC	2	6	14319	14324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_014931	CCT	2	6	14375	14380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_014931	GGC	2	6	14405	14410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014931	GGC	2	6	14899	14904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_014931	GCC	2	6	14961	14966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_014931	CGG	2	6	14972	14977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014931	GAA	2	6	15582	15587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014931	GCA	2	6	15603	15608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014931	ATG	2	6	15674	15679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014931	CCG	2	6	17789	17794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_014931	CAC	2	6	17799	17804	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_014931	CGC	2	6	17854	17859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_014931	CTT	2	6	25113	25118	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_014931	CGC	2	6	25137	25142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_014931	GAG	2	6	25232	25237	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014931	CGG	2	6	33348	33353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_014931	TCT	2	6	33430	33435	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014931	TTC	2	6	33444	33449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014931	TAG	4	12	33460	33471	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014931	ACA	2	6	33584	33589	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_014931	CTT	2	6	35438	35443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014931	TGG	2	6	35444	35449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014931	GCC	2	6	35475	35480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_014931	GCG	2	6	37885	37890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_014931	TGC	2	6	42165	42170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_014931	CAC	2	6	42260	42265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014931	CGT	2	6	44415	44420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_014931	CCG	2	6	46219	46224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_014931	CTG	2	6	47407	47412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_014931	TGC	2	6	50084	50089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_014931	GCT	2	6	50182	50187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_014931	CCG	2	6	50877	50882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014931	GGC	2	6	50900	50905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_014931	GGC	2	6	50950	50955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_014931	TGC	3	9	51245	51253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_014931	TGC	2	6	51281	51286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014931	CGA	2	6	51331	51336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014931	GCC	2	6	52355	52360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_014931	AGT	2	6	52401	52406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014931	GCC	3	9	55034	55042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_014931	GCC	2	6	59273	59278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_014931	GCG	2	6	62300	62305	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014931	CTC	2	6	62353	62358	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_014931	GTT	2	6	62409	62414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014931	CTG	2	6	62444	62449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014931	GGC	2	6	62452	62457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014931	GGA	2	6	63088	63093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014931	GTC	2	6	63097	63102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014931	CGC	2	6	64312	64317	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_014931	ACA	2	6	64377	64382	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014931	TCA	2	6	64402	64407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014931	CCG	2	6	65290	65295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_014931	CGC	2	6	65309	65314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
84	NC_014931	GCG	2	6	65338	65343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_014931	GCG	2	6	66334	66339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014931	TTG	2	6	66377	66382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014931	AGC	2	6	67138	67143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014931	GAC	2	6	68238	68243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014931	GGC	2	6	72251	72256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014931	CTT	2	6	74978	74983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014931	TGT	2	6	74994	74999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014931	ACA	2	6	75875	75880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_014931	CTT	2	6	75881	75886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014931	TTG	2	6	77245	77250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014931	AGA	3	9	77324	77332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014931	GCC	2	6	77340	77345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014931	CCG	2	6	77350	77355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_014931	CTT	2	6	77790	77795	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014931	CGG	2	6	77826	77831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014931	GCG	2	6	79215	79220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014931	CCT	3	9	81126	81134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_014931	GCC	2	6	83221	83226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_014931	CGG	2	6	84619	84624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014931	GTG	2	6	84655	84660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014931	TCG	2	6	87789	87794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_014931	CAG	2	6	87845	87850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_014931	ACC	2	6	87882	87887	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_014931	AGC	2	6	87894	87899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_014931	TAT	2	6	92886	92891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014931	CGA	2	6	92922	92927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014931	AGA	2	6	94729	94734	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014931	TGA	2	6	94737	94742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014931	GAG	2	6	94746	94751	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014931	TGA	2	6	94760	94765	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014931	GCG	2	6	95809	95814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_014931	CGC	2	6	97410	97415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_014931	CGA	2	6	99341	99346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014931	GGT	2	6	99416	99421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014931	GTG	2	6	99426	99431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014931	GTG	2	6	99434	99439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014931	TTC	2	6	105233	105238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_014931	GTG	2	6	105252	105257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014931	GCA	2	6	105264	105269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_014931	GCC	2	6	108905	108910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_014931	GCG	2	6	110510	110515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014931	AAG	3	9	110521	110529	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014931	GGC	2	6	110533	110538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_014931	TCT	2	6	110579	110584	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_014931	ATG	2	6	110660	110665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014931	GAA	2	6	110678	110683	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014931	ATT	2	6	110690	110695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014931	AAC	2	6	112437	112442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_014931	GCG	2	6	113923	113928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_014931	CGG	2	6	115291	115296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_014931	CAA	2	6	115831	115836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_014931	GCG	2	6	126261	126266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_014931	CCG	2	6	128308	128313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_014931	TAC	2	6	129206	129211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_014931	TCT	2	6	129284	129289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_014931	AGC	2	6	131162	131167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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142	NC_014931	TCC	2	6	138478	138483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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