MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Variovorax paradoxus EPS chromosome

Total Repeats: 113724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014931	AGC	2	6	158	163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
2	NC_014931	CGA	2	6	204	209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
3	NC_014931	CGC	2	6	285	290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
4	NC_014931	CTC	2	6	341	346	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790695
5	NC_014931	TGA	2	6	380	385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790695
6	NC_014931	CGC	3	9	516	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
7	NC_014931	CGG	2	6	576	581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790695
8	NC_014931	GCT	2	6	627	632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
9	NC_014931	CGA	2	6	765	770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
10	NC_014931	TTC	2	6	778	783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
11	NC_014931	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790695
12	NC_014931	GAA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
13	NC_014931	TTC	2	6	811	816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
14	NC_014931	AAG	2	6	841	846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
15	NC_014931	TGA	2	6	857	862	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790695
16	NC_014931	GCC	2	6	948	953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790695
17	NC_014931	CAA	2	6	984	989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790695
18	NC_014931	TTC	2	6	1030	1035	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790695
19	NC_014931	CTG	2	6	1159	1164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
20	NC_014931	AGA	2	6	1202	1207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790695
21	NC_014931	ACT	2	6	1217	1222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790695
22	NC_014931	CGG	2	6	1350	1355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790695
23	NC_014931	ACG	2	6	1366	1371	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
24	NC_014931	TGC	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790695
25	NC_014931	CAG	2	6	1408	1413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
26	NC_014931	CAG	2	6	1429	1434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790695
27	NC_014931	TCG	2	6	1617	1622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790696
28	NC_014931	GCG	2	6	1624	1629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
29	NC_014931	CGG	2	6	1672	1677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
30	NC_014931	ACC	2	6	1691	1696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
31	NC_014931	CAC	2	6	1720	1725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
32	NC_014931	CGG	2	6	1735	1740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
33	NC_014931	CGA	2	6	1741	1746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790696
34	NC_014931	CAC	3	9	1756	1764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790696
35	NC_014931	GGC	2	6	1859	1864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
36	NC_014931	CCG	2	6	1893	1898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790696
37	NC_014931	GCC	2	6	1922	1927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790696
38	NC_014931	CTA	2	6	2017	2022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790696
39	NC_014931	AAG	2	6	2133	2138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
40	NC_014931	CCT	2	6	2176	2181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790696
41	NC_014931	AAC	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790696
42	NC_014931	CGG	2	6	2242	2247	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
43	NC_014931	GAA	2	6	2308	2313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
44	NC_014931	AAC	2	6	2444	2449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790696
45	NC_014931	GAA	2	6	2459	2464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790696
46	NC_014931	CGG	2	6	2491	2496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790696
47	NC_014931	CGT	2	6	2638	2643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790696
48	NC_014931	AGA	2	6	2806	2811	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790697
49	NC_014931	GTC	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
50	NC_014931	CGA	2	6	3031	3036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
51	NC_014931	CGA	2	6	3055	3060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
52	NC_014931	TCG	2	6	3063	3068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
53	NC_014931	GAC	2	6	3140	3145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
54	NC_014931	GCC	2	6	3167	3172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
55	NC_014931	GGC	2	6	3200	3205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
56	NC_014931	GGC	2	6	3236	3241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
57	NC_014931	ATC	2	6	3401	3406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
58	NC_014931	AAC	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
59	NC_014931	AAC	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
60	NC_014931	CTG	2	6	3548	3553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
61	NC_014931	GAC	2	6	3575	3580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
62	NC_014931	CGG	2	6	3592	3597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
63	NC_014931	TCA	2	6	3618	3623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
64	NC_014931	CGG	2	6	3691	3696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
65	NC_014931	CAA	2	6	3775	3780	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319790697
66	NC_014931	CGG	2	6	3796	3801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
67	NC_014931	TCA	2	6	3840	3845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
68	NC_014931	CGA	2	6	3901	3906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
69	NC_014931	TGC	2	6	3923	3928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
70	NC_014931	TCG	2	6	4020	4025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
71	NC_014931	GCC	2	6	4026	4031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
72	NC_014931	ACG	2	6	4062	4067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
73	NC_014931	ATC	2	6	4073	4078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
74	NC_014931	TCG	2	6	4089	4094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
75	NC_014931	GCC	2	6	4097	4102	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
76	NC_014931	GCC	2	6	4115	4120	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
77	NC_014931	CGC	2	6	4142	4147	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
78	NC_014931	TGG	2	6	4230	4235	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790697
79	NC_014931	CCG	2	6	4245	4250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
80	NC_014931	GCT	2	6	4345	4350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
81	NC_014931	GAT	2	6	4372	4377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319790697
82	NC_014931	CGA	2	6	4413	4418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
83	NC_014931	CGA	2	6	4435	4440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
84	NC_014931	ACC	2	6	4464	4469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790697
85	NC_014931	CAT	4	12	4471	4482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
86	NC_014931	GCT	3	9	4519	4527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790697
87	NC_014931	CTT	2	6	4531	4536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790697
88	NC_014931	GCC	2	6	4588	4593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
89	NC_014931	CGG	2	6	4699	4704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
90	NC_014931	GCC	3	9	4983	4991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
91	NC_014931	AGC	2	6	5009	5014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
92	NC_014931	AGC	2	6	5065	5070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
93	NC_014931	GCG	2	6	5118	5123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
94	NC_014931	GAA	2	6	5141	5146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790697
95	NC_014931	CGA	2	6	5152	5157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
96	NC_014931	TCA	2	6	5181	5186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319790697
97	NC_014931	AGC	2	6	5247	5252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
98	NC_014931	ACC	2	6	5261	5266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790697
99	NC_014931	GCC	2	6	5283	5288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790697
100	NC_014931	CGA	2	6	5305	5310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790697
101	NC_014931	CGG	2	6	5366	5371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790697
102	NC_014931	GCG	2	6	6176	6181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790698
103	NC_014931	GTT	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319790698
104	NC_014931	CGT	2	6	6367	6372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790698
105	NC_014931	CGG	2	6	6385	6390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790698
106	NC_014931	AGC	2	6	6409	6414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790698
107	NC_014931	CGG	2	6	6484	6489	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790698
108	NC_014931	GCA	2	6	6497	6502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790698
109	NC_014931	GAA	2	6	6551	6556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319790698
110	NC_014931	GTC	2	6	6712	6717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790698
111	NC_014931	GCC	2	6	6822	6827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790699
112	NC_014931	CCA	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319790699
113	NC_014931	CAG	3	9	6932	6940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790699
114	NC_014931	TCG	2	6	7021	7026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790699
115	NC_014931	CGG	2	6	7356	7361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790700
116	NC_014931	CAG	2	6	7390	7395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790700
117	NC_014931	GCG	3	9	7474	7482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790700
118	NC_014931	TGG	2	6	7513	7518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319790700
119	NC_014931	CGC	2	6	7519	7524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790700
120	NC_014931	CGA	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790700
121	NC_014931	ACG	2	6	7693	7698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790700
122	NC_014931	CCT	2	6	7768	7773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	319790700
123	NC_014931	CGC	2	6	7810	7815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790700
124	NC_014931	CCG	2	6	7843	7848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790700
125	NC_014931	CTT	3	9	8016	8024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319790701
126	NC_014931	GGC	2	6	8041	8046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790701
127	NC_014931	GCG	2	6	8058	8063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790701
128	NC_014931	CTG	2	6	8069	8074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790701
129	NC_014931	GTC	2	6	8083	8088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319790701
130	NC_014931	CGG	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319790701
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255	NC_014931	CCG	2	6	14617	14622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	319790708
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257	NC_014931	CGA	2	6	14726	14731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319790708
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