MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	TAAGAA	2	12	29065	29076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014925	TTGATA	2	12	29223	29234	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014925	ATTACT	2	12	29425	29436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014925	CGACAG	2	12	95773	95784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_014925	TTTAAT	2	12	111261	111272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014925	TAAAAA	2	12	157210	157221	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014925	TTTTAA	2	12	163719	163730	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014925	TGATGT	2	12	172657	172668	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014925	TAAAAT	2	12	175348	175359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014925	ATATCA	2	12	182046	182057	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014925	AATAGG	2	12	182391	182402	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014925	TGTCTT	3	18	231996	232013	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014925	TTTTTA	2	12	263148	263159	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014925	TGATTA	2	12	280316	280327	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014925	TTTTCA	2	12	308180	308191	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_014925	GGATAA	2	12	359583	359594	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014925	GATAAT	2	12	366837	366848	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014925	TTTAAA	2	12	384775	384786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014925	CTTTTT	2	12	385223	385234	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014925	TGAATA	2	12	402320	402331	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014925	TGAGGC	2	12	426155	426166	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014925	TCAATA	2	12	437605	437616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_014925	AGTGAA	2	12	441789	441800	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014925	TTATAG	2	12	464861	464872	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014925	GGAATG	2	12	486051	486062	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014925	CAAACC	2	12	524289	524300	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_014925	AACTAG	2	12	531645	531656	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014925	TTTAGT	2	12	533030	533041	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014925	AGATTT	2	12	558221	558232	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014925	ATTATA	2	12	559343	559354	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014925	GTAGCA	2	12	588770	588781	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014925	TTAAAT	2	12	608941	608952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014925	ACGTAT	2	12	622681	622692	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014925	AAAATG	2	12	624420	624431	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014925	TATACA	2	12	640326	640337	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014925	CTTTAT	2	12	661561	661572	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014925	TTATTT	2	12	690247	690258	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014925	ACACAT	2	12	690577	690588	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014925	AGGAAT	2	12	697167	697178	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014925	TTTAAT	2	12	698680	698691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014925	TTCATT	2	12	698799	698810	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014925	TATTCA	2	12	717103	717114	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014925	GTTTTG	2	12	721677	721688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014925	TTATTT	2	12	730070	730081	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014925	AGTTGG	2	12	743687	743698	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014925	AAAGCA	2	12	748670	748681	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_014925	CTAAAA	2	12	762394	762405	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_014925	ATTCTG	2	12	803044	803055	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014925	TAGAAG	2	12	831174	831185	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014925	AGTAAA	2	12	849925	849936	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014925	AGTTGA	2	12	876906	876917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014925	GTTTAG	2	12	953739	953750	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014925	GAAATA	2	12	953943	953954	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014925	AAATAC	2	12	978257	978268	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014925	TAATGG	2	12	989664	989675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014925	TAAAAT	2	12	1045711	1045722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014925	TAACTT	2	12	1108690	1108701	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014925	TTAATC	2	12	1115560	1115571	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014925	ATTAAG	2	12	1122300	1122311	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014925	TTAACG	2	12	1132540	1132551	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_014925	TTTAAA	2	12	1186497	1186508	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014925	ATCAAT	2	12	1255300	1255311	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014925	TAATAT	2	12	1258101	1258112	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014925	TGATAT	2	12	1269475	1269486	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014925	ATGGAG	2	12	1284887	1284898	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014925	TTTCTA	2	12	1337294	1337305	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014925	AATTCC	2	12	1367244	1367255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014925	TTAAAA	2	12	1381821	1381832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014925	TCATAC	2	12	1413820	1413831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014925	AAAAAT	2	12	1546639	1546650	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014925	TAAAAA	2	12	1550063	1550074	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014925	ATAAAA	2	12	1550368	1550379	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014925	TATAAA	2	12	1624562	1624573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014925	TTAAAT	2	12	1624916	1624927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014925	CCTACA	2	12	1626565	1626576	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_014925	TTGCTA	2	12	1633706	1633717	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014925	CGTTAT	2	12	1658936	1658947	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014925	GTATTA	2	12	1668190	1668201	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014925	GAAACA	2	12	1668473	1668484	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014925	TTTAAA	2	12	1681417	1681428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014925	ATTGCA	2	12	1681720	1681731	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014925	ATGACA	2	12	1699391	1699402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014925	TATTTA	2	12	1724116	1724127	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014925	ATTTTT	2	12	1755614	1755625	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014925	AACTGT	2	12	1778484	1778495	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014925	GTTGAA	2	12	1803725	1803736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014925	TTAAAA	2	12	1821829	1821840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014925	CCTATA	2	12	1829864	1829875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014925	AATTTT	2	12	1846987	1846998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014925	AAAAAT	2	12	1853524	1853535	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014925	AATCAA	2	12	1874973	1874984	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_014925	CCAACA	2	12	1877490	1877501	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_014925	ACATTA	4	24	1883700	1883723	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014925	TTTAAT	2	12	1888883	1888894	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014925	TACAAA	2	12	1911662	1911673	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014925	TGAAAA	2	12	1915355	1915366	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014925	TTCATT	2	12	1915502	1915513	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_014925	ACTTAT	2	12	1938807	1938818	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_014925	CTCCTA	2	12	1963214	1963225	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_014925	TTATAC	2	12	2027962	2027973	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014925	TCATCT	2	12	2033677	2033688	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014925	GATAAA	2	12	2098065	2098076	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014925	TAGGTT	2	12	2124113	2124124	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014925	TTTATA	2	12	2130858	2130869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014925	ATAAAA	2	12	2157349	2157360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014925	AGTTTA	2	12	2165458	2165469	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014925	GTTAAA	2	12	2165943	2165954	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014925	TTTATT	2	12	2168401	2168412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014925	ATAAAA	2	12	2170289	2170300	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014925	TCTTTC	2	12	2175530	2175541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014925	ATTTCA	2	12	2231611	2231622	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014925	ATTGTT	2	12	2234720	2234731	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014925	AATTTA	2	12	2240055	2240066	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014925	TTAAAT	2	12	2248066	2248077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014925	AGGAAA	2	12	2248170	2248181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014925	ATTCAA	2	12	2266021	2266032	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_014925	AACCAA	2	12	2280921	2280932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014925	GTTAAA	2	12	2289104	2289115	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014925	TAAAAA	2	12	2295924	2295935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014925	TTATTT	2	12	2299128	2299139	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014925	ATTATC	2	12	2309053	2309064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_014925	TAATAT	2	12	2336450	2336461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014925	TTTAAC	2	12	2341795	2341806	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_014925	TCTATC	2	12	2346913	2346924	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_014925	ATTTTT	2	12	2351064	2351075	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014925	CTATTT	2	12	2355784	2355795	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_014925	GTTATT	2	12	2360075	2360086	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014925	AAATAA	2	12	2391353	2391364	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014925	AGATAT	2	12	2399433	2399444	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014925	ACTTTA	2	12	2444855	2444866	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_014925	TCATAT	2	12	2462525	2462536	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014925	TTAGTT	2	12	2477620	2477631	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014925	TTTTCA	2	12	2482986	2482997	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014925	GAGAAA	2	12	2487665	2487676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014925	TTTAAT	2	12	2500445	2500456	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014925	GTCATT	2	12	2510630	2510641	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
137	NC_014925	AAAATT	2	12	2512816	2512827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014925	CATTTT	2	12	2564891	2564902	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
139	NC_014925	CTATAG	2	12	2572920	2572931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
140	NC_014925	ATGTAC	2	12	2583523	2583534	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
141	NC_014925	TCATAG	2	12	2615920	2615931	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.