MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus pseudintermedius HKU10-03 chromosome

Total Repeats: 7110

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014925	TGAA	3	12	515	526	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014925	ATTA	2	8	1525	1532	50 %	50 %	0 %	0 %	319891293
3	NC_014925	TTAA	2	8	1852	1859	50 %	50 %	0 %	0 %	319891293
4	NC_014925	ACGT	2	8	2545	2552	25 %	25 %	25 %	25 %	319891293
5	NC_014925	AAGC	2	8	2581	2588	50 %	0 %	25 %	25 %	319891293
6	NC_014925	TTGA	2	8	2716	2723	25 %	50 %	25 %	0 %	319891293
7	NC_014925	CAAT	2	8	2876	2883	50 %	25 %	0 %	25 %	319891294
8	NC_014925	GTCG	2	8	3436	3443	0 %	25 %	50 %	25 %	319891294
9	NC_014925	GTTG	2	8	3491	3498	0 %	50 %	50 %	0 %	319891294
10	NC_014925	TGAT	2	8	3527	3534	25 %	50 %	25 %	0 %	319891294
11	NC_014925	CCAT	2	8	3598	3605	25 %	25 %	0 %	50 %	319891294
12	NC_014925	AAAT	2	8	4645	4652	75 %	25 %	0 %	0 %	319891294
13	NC_014925	AATT	2	8	4764	4771	50 %	50 %	0 %	0 %	319891295
14	NC_014925	CAAA	2	8	5345	5352	75 %	0 %	0 %	25 %	319891295
15	NC_014925	AAAC	2	8	6038	6045	75 %	0 %	0 %	25 %	319891296
16	NC_014925	TAAA	2	8	6382	6389	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014925	ACGT	2	8	6410	6417	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_014925	TATT	2	8	6542	6549	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014925	ATTT	2	8	6700	6707	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014925	GATG	2	8	7243	7250	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014925	TTTC	2	8	7938	7945	0 %	75 %	0 %	25 %	319891299
22	NC_014925	TTTC	2	8	8132	8139	0 %	75 %	0 %	25 %	319891300
23	NC_014925	AAAT	2	8	8844	8851	75 %	25 %	0 %	0 %	319891301
24	NC_014925	TCGT	2	8	8893	8900	0 %	50 %	25 %	25 %	319891301
25	NC_014925	TTCA	2	8	8967	8974	25 %	50 %	0 %	25 %	319891301
26	NC_014925	GACT	2	8	9250	9257	25 %	25 %	25 %	25 %	319891301
27	NC_014925	TAAT	2	8	9260	9267	50 %	50 %	0 %	0 %	319891301
28	NC_014925	GTCA	2	8	10573	10580	25 %	25 %	25 %	25 %	319891303
29	NC_014925	ATCA	2	8	10801	10808	50 %	25 %	0 %	25 %	319891303
30	NC_014925	GAAA	2	8	10913	10920	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014925	GAAT	2	8	11319	11326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014925	TCAT	2	8	11420	11427	25 %	50 %	0 %	25 %	319891305
33	NC_014925	TTGA	2	8	11494	11501	25 %	50 %	25 %	0 %	319891305
34	NC_014925	CATT	2	8	11541	11548	25 %	50 %	0 %	25 %	319891305
35	NC_014925	TCAA	2	8	12086	12093	50 %	25 %	0 %	25 %	319891305
36	NC_014925	TAAG	2	8	12636	12643	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014925	CATT	2	8	13004	13011	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_014925	TGCG	2	8	14005	14012	0 %	25 %	50 %	25 %	319891307
39	NC_014925	ACAA	2	8	14036	14043	75 %	0 %	0 %	25 %	319891307
40	NC_014925	CAAT	2	8	15187	15194	50 %	25 %	0 %	25 %	319891309
41	NC_014925	TTAC	2	8	15280	15287	25 %	50 %	0 %	25 %	319891309
42	NC_014925	TCAT	2	8	15573	15580	25 %	50 %	0 %	25 %	319891309
43	NC_014925	ATGA	2	8	15774	15781	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014925	TGCG	2	8	16364	16371	0 %	25 %	50 %	25 %	319891310
45	NC_014925	CGTA	2	8	18042	18049	25 %	25 %	25 %	25 %	319891310
46	NC_014925	TGAT	2	8	18063	18070	25 %	50 %	25 %	0 %	319891310
47	NC_014925	TAAA	2	8	18659	18666	75 %	25 %	0 %	0 %	319891311
48	NC_014925	ATGC	2	8	18941	18948	25 %	25 %	25 %	25 %	319891311
49	NC_014925	GTCG	2	8	19449	19456	0 %	25 %	50 %	25 %	319891311
50	NC_014925	ATGT	2	8	19886	19893	25 %	50 %	25 %	0 %	319891311
51	NC_014925	GTAT	2	8	20222	20229	25 %	50 %	25 %	0 %	319891311
52	NC_014925	TTGA	2	8	20430	20437	25 %	50 %	25 %	0 %	319891312
53	NC_014925	GACT	2	8	20585	20592	25 %	25 %	25 %	25 %	319891312
54	NC_014925	ATGA	2	8	20964	20971	50 %	25 %	25 %	0 %	319891312
55	NC_014925	ACGC	2	8	21332	21339	25 %	0 %	25 %	50 %	319891312
56	NC_014925	TGAA	2	8	21572	21579	50 %	25 %	25 %	0 %	319891313
57	NC_014925	AATA	2	8	22225	22232	75 %	25 %	0 %	0 %	319891313
58	NC_014925	GATA	2	8	22803	22810	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014925	CGAA	2	8	22958	22965	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014925	GAAA	2	8	23099	23106	75 %	0 %	25 %	0 %	319891314
61	NC_014925	AGGC	2	8	23434	23441	25 %	0 %	50 %	25 %	319891314
62	NC_014925	ACAT	2	8	24050	24057	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_014925	GGAA	2	8	24547	24554	50 %	0 %	50 %	0 %	319891315
64	NC_014925	TTTA	2	8	25257	25264	25 %	75 %	0 %	0 %	319891317
65	NC_014925	TGAA	2	8	25682	25689	50 %	25 %	25 %	0 %	319891317
66	NC_014925	AAGG	2	8	26098	26105	50 %	0 %	50 %	0 %	319891317
67	NC_014925	TCAT	2	8	26132	26139	25 %	50 %	0 %	25 %	319891317
68	NC_014925	GATT	2	8	26820	26827	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014925	TTTC	2	8	26885	26892	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_014925	AAAT	2	8	27253	27260	75 %	25 %	0 %	0 %	319891318
71	NC_014925	GAAT	2	8	27273	27280	50 %	25 %	25 %	0 %	319891318
72	NC_014925	TTCC	2	8	27909	27916	0 %	50 %	0 %	50 %	319891319
73	NC_014925	ATAA	2	8	28035	28042	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014925	GTTA	2	8	28060	28067	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014925	AATA	2	8	28186	28193	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014925	TAAT	2	8	28218	28225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014925	TTGT	2	8	28553	28560	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014925	TGCG	2	8	30046	30053	0 %	25 %	50 %	25 %	319891320
79	NC_014925	TATT	2	8	30623	30630	25 %	75 %	0 %	0 %	319891321
80	NC_014925	ATTT	2	8	30636	30643	25 %	75 %	0 %	0 %	319891321
81	NC_014925	CTTT	2	8	31082	31089	0 %	75 %	0 %	25 %	319891321
82	NC_014925	ATTA	2	8	31098	31105	50 %	50 %	0 %	0 %	319891321
83	NC_014925	TTTG	2	8	31236	31243	0 %	75 %	25 %	0 %	319891321
84	NC_014925	TTTA	2	8	31298	31305	25 %	75 %	0 %	0 %	319891321
85	NC_014925	TTGT	2	8	31553	31560	0 %	75 %	25 %	0 %	319891322
86	NC_014925	TTGT	2	8	31897	31904	0 %	75 %	25 %	0 %	319891322
87	NC_014925	ATTG	2	8	32787	32794	25 %	50 %	25 %	0 %	319891322
88	NC_014925	TCGC	2	8	32839	32846	0 %	25 %	25 %	50 %	319891322
89	NC_014925	AAAT	2	8	32864	32871	75 %	25 %	0 %	0 %	319891322
90	NC_014925	TTAA	2	8	33018	33025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014925	TGTA	2	8	33084	33091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014925	CGTA	2	8	33452	33459	25 %	25 %	25 %	25 %	319891323
93	NC_014925	CAAT	2	8	33939	33946	50 %	25 %	0 %	25 %	319891324
94	NC_014925	CTAT	2	8	34657	34664	25 %	50 %	0 %	25 %	319891326
95	NC_014925	ATAA	2	8	34732	34739	75 %	25 %	0 %	0 %	319891326
96	NC_014925	GAAA	2	8	34743	34750	75 %	0 %	25 %	0 %	319891326
97	NC_014925	TTTA	2	8	34979	34986	25 %	75 %	0 %	0 %	319891326
98	NC_014925	ATTT	2	8	35041	35048	25 %	75 %	0 %	0 %	319891326
99	NC_014925	GATT	2	8	35494	35501	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014925	TTAT	2	8	35526	35533	25 %	75 %	0 %	0 %	319891327
101	NC_014925	TTTA	2	8	36411	36418	25 %	75 %	0 %	0 %	319891328
102	NC_014925	TTTG	2	8	36434	36441	0 %	75 %	25 %	0 %	319891328
103	NC_014925	CATT	2	8	36695	36702	25 %	50 %	0 %	25 %	319891328
104	NC_014925	GTTG	2	8	36719	36726	0 %	50 %	50 %	0 %	319891328
105	NC_014925	TGAA	2	8	37426	37433	50 %	25 %	25 %	0 %	319891328
106	NC_014925	CTCA	2	8	37782	37789	25 %	25 %	0 %	50 %	319891328
107	NC_014925	CAAT	2	8	38210	38217	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_014925	TTGA	2	8	38477	38484	25 %	50 %	25 %	0 %	319891330
109	NC_014925	GATT	2	8	39190	39197	25 %	50 %	25 %	0 %	319891330
110	NC_014925	TAAA	2	8	39630	39637	75 %	25 %	0 %	0 %	319891331
111	NC_014925	TGTT	2	8	39723	39730	0 %	75 %	25 %	0 %	319891331
112	NC_014925	CAAT	2	8	40682	40689	50 %	25 %	0 %	25 %	319891332
113	NC_014925	AATG	2	8	40722	40729	50 %	25 %	25 %	0 %	319891332
114	NC_014925	TCGT	2	8	41391	41398	0 %	50 %	25 %	25 %	319891333
115	NC_014925	TCAT	2	8	41607	41614	25 %	50 %	0 %	25 %	319891333
116	NC_014925	ATTG	2	8	41794	41801	25 %	50 %	25 %	0 %	319891333
117	NC_014925	GAAA	2	8	41876	41883	75 %	0 %	25 %	0 %	319891333
118	NC_014925	TGAG	2	8	42128	42135	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014925	ATGT	2	8	42431	42438	25 %	50 %	25 %	0 %	319891334
120	NC_014925	AAGT	2	8	42542	42549	50 %	25 %	25 %	0 %	319891334
121	NC_014925	GTCT	2	8	42680	42687	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
122	NC_014925	ACAT	2	8	43380	43387	50 %	25 %	0 %	25 %	319891335
123	NC_014925	GAAA	2	8	43506	43513	75 %	0 %	25 %	0 %	319891335
124	NC_014925	AATC	2	8	43629	43636	50 %	25 %	0 %	25 %	319891335
125	NC_014925	TCTT	2	8	43848	43855	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_014925	GAAT	2	8	44028	44035	50 %	25 %	25 %	0 %	319891336
127	NC_014925	TGAA	2	8	44516	44523	50 %	25 %	25 %	0 %	319891336
128	NC_014925	ATCA	2	8	44593	44600	50 %	25 %	0 %	25 %	319891336
129	NC_014925	TCAA	2	8	44606	44613	50 %	25 %	0 %	25 %	319891336
130	NC_014925	TCAA	2	8	44708	44715	50 %	25 %	0 %	25 %	319891336
131	NC_014925	GCTT	2	8	44985	44992	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_014925	GATG	2	8	44998	45005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014925	TTTG	2	8	45636	45643	0 %	75 %	25 %	0 %	319891337
134	NC_014925	TGAG	2	8	45701	45708	25 %	25 %	50 %	0 %	319891337
135	NC_014925	TCTG	2	8	45915	45922	0 %	50 %	25 %	25 %	319891337
136	NC_014925	TGTC	2	8	46067	46074	0 %	50 %	25 %	25 %	319891337
137	NC_014925	ATCA	2	8	46167	46174	50 %	25 %	0 %	25 %	319891337
138	NC_014925	AATG	2	8	46257	46264	50 %	25 %	25 %	0 %	319891337
139	NC_014925	CACT	2	8	46337	46344	25 %	25 %	0 %	50 %	319891337
140	NC_014925	AAAT	2	8	47339	47346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014925	TGAT	2	8	47475	47482	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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143	NC_014925	TGAT	2	8	48000	48007	25 %	50 %	25 %	0 %	319891339
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