MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 chromosome

Total Repeats: 4885

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014923	CCGAA	2	10	1634	1643	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_014923	ATCCG	2	10	2874	2883	20 %	20 %	20 %	40 %	319779751
3	NC_014923	GCTCG	2	10	3353	3362	0 %	20 %	40 %	40 %	319779752
4	NC_014923	ACCGG	2	10	3530	3539	20 %	0 %	40 %	40 %	319779752
5	NC_014923	GATCG	2	10	5260	5269	20 %	20 %	40 %	20 %	319779754
6	NC_014923	TCTTA	2	10	5552	5561	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014923	CGTGC	2	10	10453	10462	0 %	20 %	40 %	40 %	319779761
8	NC_014923	TCACG	2	10	14465	14474	20 %	20 %	20 %	40 %	319779764
9	NC_014923	ACCGA	2	10	15283	15292	40 %	0 %	20 %	40 %	319779764
10	NC_014923	CCTCG	2	10	18017	18026	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_014923	CAAGC	2	10	20388	20397	40 %	0 %	20 %	40 %	319779769
12	NC_014923	TCGAT	2	10	20834	20843	20 %	40 %	20 %	20 %	319779769
13	NC_014923	GATCA	2	10	22772	22781	40 %	20 %	20 %	20 %	319779770
14	NC_014923	CGCTG	2	10	25402	25411	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014923	GCCGA	2	10	29731	29740	20 %	0 %	40 %	40 %	319779777
16	NC_014923	CGCGG	2	10	30668	30677	0 %	0 %	60 %	40 %	319779779
17	NC_014923	CGTTG	2	10	31490	31499	0 %	40 %	40 %	20 %	319779779
18	NC_014923	AAGAC	2	10	32004	32013	60 %	0 %	20 %	20 %	319779780
19	NC_014923	GCGCG	2	10	33089	33098	0 %	0 %	60 %	40 %	319779781
20	NC_014923	CATCG	2	10	35213	35222	20 %	20 %	20 %	40 %	319779783
21	NC_014923	CCAGC	2	10	35852	35861	20 %	0 %	20 %	60 %	319779784
22	NC_014923	GCGAT	2	10	35870	35879	20 %	20 %	40 %	20 %	319779784
23	NC_014923	ACGGC	2	10	39610	39619	20 %	0 %	40 %	40 %	319779788
24	NC_014923	TGCAT	2	10	41446	41455	20 %	40 %	20 %	20 %	319779790
25	NC_014923	CCGTG	2	10	41594	41603	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
26	NC_014923	GCTCG	2	10	42193	42202	0 %	20 %	40 %	40 %	319779791
27	NC_014923	CGGCG	2	10	42303	42312	0 %	0 %	60 %	40 %	319779791
28	NC_014923	TGGCG	2	10	42760	42769	0 %	20 %	60 %	20 %	319779791
29	NC_014923	GTGCC	2	10	44114	44123	0 %	20 %	40 %	40 %	319779792
30	NC_014923	GCGCA	2	10	45286	45295	20 %	0 %	40 %	40 %	319779793
31	NC_014923	CGGCT	2	10	48139	48148	0 %	20 %	40 %	40 %	319779795
32	NC_014923	GGCGA	2	10	50742	50751	20 %	0 %	60 %	20 %	319779796
33	NC_014923	GAGCG	2	10	51122	51131	20 %	0 %	60 %	20 %	319779796
34	NC_014923	CGGCA	2	10	51389	51398	20 %	0 %	40 %	40 %	319779796
35	NC_014923	CAATC	2	10	51778	51787	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
36	NC_014923	GCCAG	2	10	55746	55755	20 %	0 %	40 %	40 %	319779801
37	NC_014923	GTTCG	2	10	56308	56317	0 %	40 %	40 %	20 %	319779801
38	NC_014923	GCGAT	2	10	57641	57650	20 %	20 %	40 %	20 %	319779802
39	NC_014923	GGCCG	2	10	57733	57742	0 %	0 %	60 %	40 %	319779802
40	NC_014923	CGGCG	2	10	62104	62113	0 %	0 %	60 %	40 %	319779807
41	NC_014923	CGAGC	2	10	64171	64180	20 %	0 %	40 %	40 %	319779809
42	NC_014923	GGGCA	2	10	66183	66192	20 %	0 %	60 %	20 %	319779811
43	NC_014923	GCAAG	2	10	69200	69209	40 %	0 %	40 %	20 %	319779814
44	NC_014923	CGGAA	2	10	69301	69310	40 %	0 %	40 %	20 %	319779814
45	NC_014923	GCCGG	2	10	69994	70003	0 %	0 %	60 %	40 %	319779815
46	NC_014923	CTTGC	2	10	71429	71438	0 %	40 %	20 %	40 %	319779815
47	NC_014923	GCAAC	2	10	71518	71527	40 %	0 %	20 %	40 %	319779815
48	NC_014923	CTGGA	2	10	71645	71654	20 %	20 %	40 %	20 %	319779815
49	NC_014923	GCGCA	2	10	73939	73948	20 %	0 %	40 %	40 %	319779817
50	NC_014923	CCGCC	2	10	74450	74459	0 %	0 %	20 %	80 %	319779818
51	NC_014923	GCCGA	2	10	74844	74853	20 %	0 %	40 %	40 %	319779818
52	NC_014923	CAATG	2	10	75131	75140	40 %	20 %	20 %	20 %	319779818
53	NC_014923	GCCGC	2	10	76158	76167	0 %	0 %	40 %	60 %	319779819
54	NC_014923	TGCGC	2	10	76885	76894	0 %	20 %	40 %	40 %	319779820
55	NC_014923	GCACG	2	10	76907	76916	20 %	0 %	40 %	40 %	319779820
56	NC_014923	CGGCC	2	10	77821	77830	0 %	0 %	40 %	60 %	319779821
57	NC_014923	CGGCG	2	10	78197	78206	0 %	0 %	60 %	40 %	319779821
58	NC_014923	CGATC	2	10	79113	79122	20 %	20 %	20 %	40 %	319779822
59	NC_014923	CGCGG	2	10	79317	79326	0 %	0 %	60 %	40 %	319779822
60	NC_014923	AAGGC	2	10	79929	79938	40 %	0 %	40 %	20 %	319779823
61	NC_014923	GCGGT	2	10	81513	81522	0 %	20 %	60 %	20 %	319779824
62	NC_014923	ACTCT	2	10	83452	83461	20 %	40 %	0 %	40 %	319779825
63	NC_014923	CCAAG	2	10	83867	83876	40 %	0 %	20 %	40 %	319779826
64	NC_014923	AAACG	2	10	84383	84392	60 %	0 %	20 %	20 %	319779826
65	NC_014923	AAGCA	2	10	85261	85270	60 %	0 %	20 %	20 %	319779827
66	NC_014923	ATCGT	2	10	86211	86220	20 %	40 %	20 %	20 %	319779828
67	NC_014923	CCAGC	2	10	86302	86311	20 %	0 %	20 %	60 %	319779828
68	NC_014923	ACGCA	2	10	87692	87701	40 %	0 %	20 %	40 %	319779830
69	NC_014923	GCGCC	2	10	92369	92378	0 %	0 %	40 %	60 %	319779835
70	NC_014923	CCCGG	2	10	93034	93043	0 %	0 %	40 %	60 %	319779836
71	NC_014923	TGGTC	2	10	93089	93098	0 %	40 %	40 %	20 %	319779837
72	NC_014923	CAGTC	2	10	93267	93276	20 %	20 %	20 %	40 %	319779837
73	NC_014923	GCCTT	2	10	94276	94285	0 %	40 %	20 %	40 %	319779839
74	NC_014923	CGCGG	2	10	98924	98933	0 %	0 %	60 %	40 %	319779841
75	NC_014923	GGCGC	2	10	100318	100327	0 %	0 %	60 %	40 %	319779843
76	NC_014923	GCCTT	2	10	100502	100511	0 %	40 %	20 %	40 %	319779843
77	NC_014923	CATCA	2	10	101500	101509	40 %	20 %	0 %	40 %	319779843
78	NC_014923	CGGGC	2	10	102255	102264	0 %	0 %	60 %	40 %	319779844
79	NC_014923	TGCGC	2	10	102946	102955	0 %	20 %	40 %	40 %	319779845
80	NC_014923	CGGAG	2	10	103905	103914	20 %	0 %	60 %	20 %	319779845
81	NC_014923	CGATC	2	10	106430	106439	20 %	20 %	20 %	40 %	319779847
82	NC_014923	GACCT	2	10	106908	106917	20 %	20 %	20 %	40 %	319779847
83	NC_014923	ATGGC	2	10	110501	110510	20 %	20 %	40 %	20 %	319779851
84	NC_014923	CGGCT	2	10	112212	112221	0 %	20 %	40 %	40 %	319779852
85	NC_014923	GCCTC	2	10	113634	113643	0 %	20 %	20 %	60 %	319779853
86	NC_014923	GCCGC	2	10	114727	114736	0 %	0 %	40 %	60 %	319779855
87	NC_014923	CGGCC	2	10	117243	117252	0 %	0 %	40 %	60 %	319779858
88	NC_014923	TCGCC	2	10	117923	117932	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_014923	CGCTG	2	10	120267	120276	0 %	20 %	40 %	40 %	319779862
90	NC_014923	CGACG	2	10	122221	122230	20 %	0 %	40 %	40 %	319779864
91	NC_014923	GCCCT	2	10	128274	128283	0 %	20 %	20 %	60 %	319779869
92	NC_014923	CGGTC	2	10	132241	132250	0 %	20 %	40 %	40 %	319779872
93	NC_014923	GGCCG	2	10	132871	132880	0 %	0 %	60 %	40 %	319779872
94	NC_014923	CGGCT	2	10	134700	134709	0 %	20 %	40 %	40 %	319779873
95	NC_014923	CATGC	2	10	135432	135441	20 %	20 %	20 %	40 %	319779874
96	NC_014923	ACGGC	2	10	135760	135769	20 %	0 %	40 %	40 %	319779874
97	NC_014923	GGCCA	2	10	137079	137088	20 %	0 %	40 %	40 %	319779875
98	NC_014923	CATGC	2	10	137270	137279	20 %	20 %	20 %	40 %	319779875
99	NC_014923	GGTCT	2	10	137468	137477	0 %	40 %	40 %	20 %	319779875
100	NC_014923	CGATC	2	10	137509	137518	20 %	20 %	20 %	40 %	319779875
101	NC_014923	CGGCT	2	10	138240	138249	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014923	ACGGC	2	10	140547	140556	20 %	0 %	40 %	40 %	319779878
103	NC_014923	CGGCG	2	10	141431	141440	0 %	0 %	60 %	40 %	319779879
104	NC_014923	ATCGA	2	10	143600	143609	40 %	20 %	20 %	20 %	319779880
105	NC_014923	CGCGC	2	10	143914	143923	0 %	0 %	40 %	60 %	319779881
106	NC_014923	CGCGG	2	10	144552	144561	0 %	0 %	60 %	40 %	319779881
107	NC_014923	GCAAC	2	10	145166	145175	40 %	0 %	20 %	40 %	319779882
108	NC_014923	TCACC	2	10	145537	145546	20 %	20 %	0 %	60 %	319779883
109	NC_014923	CCCTG	2	10	147071	147080	0 %	20 %	20 %	60 %	319779884
110	NC_014923	CCAGC	2	10	147180	147189	20 %	0 %	20 %	60 %	319779884
111	NC_014923	GTGGC	2	10	150955	150964	0 %	20 %	60 %	20 %	319779888
112	NC_014923	CTGGA	2	10	152730	152739	20 %	20 %	40 %	20 %	319779888
113	NC_014923	CAAGC	2	10	153342	153351	40 %	0 %	20 %	40 %	319779888
114	NC_014923	ATCGA	2	10	153740	153749	40 %	20 %	20 %	20 %	319779889
115	NC_014923	ACGGC	2	10	155516	155525	20 %	0 %	40 %	40 %	319779891
116	NC_014923	TCGCG	2	10	155823	155832	0 %	20 %	40 %	40 %	319779891
117	NC_014923	GCTCG	2	10	156429	156438	0 %	20 %	40 %	40 %	319779892
118	NC_014923	CCTCT	2	10	157609	157618	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_014923	GTGGC	2	10	159672	159681	0 %	20 %	60 %	20 %	319779896
120	NC_014923	AGCGC	2	10	159733	159742	20 %	0 %	40 %	40 %	319779896
121	NC_014923	CTCTT	2	10	159981	159990	0 %	60 %	0 %	40 %	319779896
122	NC_014923	CGCCT	2	10	161114	161123	0 %	20 %	20 %	60 %	319779898
123	NC_014923	GGCCG	2	10	161671	161680	0 %	0 %	60 %	40 %	319779898
124	NC_014923	CCCCG	2	10	162246	162255	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_014923	GTTCA	2	10	162816	162825	20 %	40 %	20 %	20 %	319779899
126	NC_014923	GCCGC	2	10	163749	163758	0 %	0 %	40 %	60 %	319779900
127	NC_014923	AGCGC	2	10	164705	164714	20 %	0 %	40 %	40 %	319779901
128	NC_014923	GACCA	2	10	167042	167051	40 %	0 %	20 %	40 %	319779904
129	NC_014923	GTGCG	2	10	167977	167986	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014923	GCCCT	2	10	168120	168129	0 %	20 %	20 %	60 %	319779905
131	NC_014923	CTGGG	2	10	170882	170891	0 %	20 %	60 %	20 %	319779906
132	NC_014923	CGGCA	2	10	171136	171145	20 %	0 %	40 %	40 %	319779906
133	NC_014923	AGGTC	2	10	171432	171441	20 %	20 %	40 %	20 %	319779906
134	NC_014923	CGAGG	2	10	172866	172875	20 %	0 %	60 %	20 %	319779908
135	NC_014923	TCCGC	2	10	174246	174255	0 %	20 %	20 %	60 %	319779910
136	NC_014923	GAGGT	2	10	174722	174731	20 %	20 %	60 %	0 %	319779910
137	NC_014923	GTTTC	2	10	175627	175636	0 %	60 %	20 %	20 %	319779911
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139	NC_014923	CCAGG	2	10	177649	177658	20 %	0 %	40 %	40 %	319779912
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143	NC_014923	AAGGC	2	10	182431	182440	40 %	0 %	40 %	20 %	319779915
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174	NC_014923	CCTGA	2	10	210503	210512	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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237	NC_014923	TTCGC	2	10	303049	303058	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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243	NC_014923	GTTCA	2	10	311309	311318	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
244	NC_014923	TCGGC	2	10	312214	312223	0 %	20 %	40 %	40 %	319780030
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257	NC_014923	GTTGG	2	10	335516	335525	0 %	40 %	60 %	0 %	319780051
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262	NC_014923	GCGTG	2	10	342612	342621	0 %	20 %	60 %	20 %	319780057
263	NC_014923	ACCCG	2	10	342764	342773	20 %	0 %	20 %	60 %	319780057
264	NC_014923	CCGTG	2	10	343492	343501	0 %	20 %	40 %	40 %	319780058
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266	NC_014923	CAACG	2	10	344173	344182	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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284	NC_014923	GCTCG	2	10	354977	354986	0 %	20 %	40 %	40 %	319780069
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