MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 120

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	GTTCTG	2	12	5849	5860	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014922	AAATAA	2	12	6714	6725	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014922	AACTGG	2	12	7432	7443	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014922	CACAAC	2	12	7763	7774	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014922	GAAAAA	2	12	8360	8371	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014922	GAATAT	2	12	120208	120219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014922	TATAAA	2	12	136152	136163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014922	CAATTT	2	12	170003	170014	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014922	GGTGCG	2	12	210667	210678	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014922	TCATTA	2	12	248344	248355	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014922	ATTTTT	2	12	250351	250362	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014922	AATTAA	2	12	271816	271827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014922	AGAAAA	2	12	288192	288203	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014922	ATTTCA	2	12	304442	304453	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014922	AAGTTA	2	12	305368	305379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014922	TTTATT	2	12	313956	313967	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014922	TAAAAA	2	12	317245	317256	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014922	TTTTTA	2	12	318863	318874	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014922	AAATGA	2	12	333299	333310	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014922	CTTTAG	2	12	335636	335647	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014922	TTTTTA	2	12	340583	340594	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014922	AATTTT	2	12	351381	351392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014922	AAAAGA	2	12	361889	361900	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014922	ATCCTC	2	12	361991	362002	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_014922	TAGTTA	2	12	376195	376206	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014922	CGTTAT	2	12	376438	376449	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014922	AAAAGA	2	12	387827	387838	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014922	ATTTCA	2	12	424694	424705	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_014922	CTTTCG	2	12	426562	426573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_014922	GCCTTC	2	12	428113	428124	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
31	NC_014922	AAAAGA	2	12	464663	464674	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014922	AAACCG	2	12	467049	467060	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014922	CACAAA	2	12	472758	472769	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_014922	TTTTAA	2	12	485035	485046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014922	AGAAAA	2	12	490511	490522	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014922	ATTTCA	2	12	493246	493257	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014922	CTCTGT	2	12	495188	495199	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014922	TTCGCT	2	12	495220	495231	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014922	GCCTTC	2	12	497006	497017	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_014922	AATAAA	2	12	500186	500197	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014922	TAAGAA	2	12	548503	548514	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014922	AAAATT	2	12	549134	549145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014922	ATTTCA	2	12	550488	550499	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014922	CTCTGT	2	12	552430	552441	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_014922	TTCGCT	2	12	552462	552473	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014922	GCCTTC	2	12	554248	554259	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014922	CAAGCT	2	12	584337	584348	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014922	AAAATA	2	12	665317	665328	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014922	AAGTAA	2	12	672224	672235	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014922	AATTTT	2	12	680851	680862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014922	TATTTT	2	12	794666	794677	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014922	TTTAAG	2	12	807408	807419	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014922	ATGTTG	2	12	841955	841966	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014922	GAAAGG	2	12	848289	848300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014922	CATTCC	2	12	890260	890271	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_014922	ACCTTA	2	12	954920	954931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014922	ACGTAA	2	12	973408	973419	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014922	TTTTCT	2	12	979116	979127	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014922	ATTTTT	2	12	995049	995060	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014922	TTTTAA	2	12	1003966	1003977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014922	TTAACT	2	12	1005168	1005179	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014922	AGGAAC	2	12	1005344	1005355	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_014922	AAATTA	2	12	1006885	1006896	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014922	TAAAAA	2	12	1031824	1031835	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014922	CGAAGG	2	12	1040032	1040043	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014922	AGCGAA	2	12	1041582	1041593	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_014922	TGAAAT	2	12	1043452	1043463	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014922	AATTTT	2	12	1134176	1134187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014922	TTTTCA	2	12	1149984	1149995	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014922	CGAAGG	2	12	1155806	1155817	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_014922	AGCGAA	2	12	1157577	1157588	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014922	GACAGA	2	12	1157608	1157619	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014922	TGAAAT	2	12	1159551	1159562	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014922	TTTTTA	2	12	1163095	1163106	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014922	ATGAAA	2	12	1183400	1183411	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014922	AATCTA	2	12	1183453	1183464	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014922	TTTAGA	2	12	1197496	1197507	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014922	TCTTTA	2	12	1277772	1277783	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_014922	TTTTGT	2	12	1280083	1280094	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014922	TAAAAA	2	12	1359960	1359971	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014922	AAAATA	2	12	1370397	1370408	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014922	TCCAGC	2	12	1376283	1376294	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_014922	AGATGA	2	12	1395253	1395264	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014922	TACATT	2	12	1396053	1396064	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_014922	TGCTGG	2	12	1421569	1421580	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_014922	GTTACA	2	12	1424396	1424407	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014922	ATTTTT	2	12	1457770	1457781	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014922	TCAATT	2	12	1499449	1499460	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014922	GATTAA	2	12	1499788	1499799	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014922	AATTAA	2	12	1517037	1517048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014922	ATAAAA	2	12	1520500	1520511	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014922	AAAAGT	2	12	1542419	1542430	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014922	TGCTTG	2	12	1560538	1560549	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_014922	CAATAG	2	12	1561866	1561877	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_014922	CAATAG	2	12	1561980	1561991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_014922	TAAAAT	2	12	1602927	1602938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014922	TTGGTG	2	12	1648185	1648196	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014922	AACACC	2	12	1687717	1687728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_014922	CAAAGA	2	12	1688067	1688078	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_014922	TAAATA	2	12	1700926	1700937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014922	AATAAA	2	12	1708416	1708427	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014922	TTATAG	2	12	1719903	1719914	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014922	TTACAA	2	12	1785515	1785526	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014922	ACATAT	2	12	1791079	1791090	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014922	CACTTC	2	12	1842964	1842975	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014922	AAAGTA	2	12	1876756	1876767	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014922	TAAAAA	2	12	1936643	1936654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014922	AACAAA	2	12	1937620	1937631	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014922	AAATTT	2	12	1945041	1945052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014922	AAACGG	2	12	1946053	1946064	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_014922	GAAATG	2	12	1946209	1946220	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014922	ATTAAT	2	12	1947139	1947150	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014922	ATAATC	2	12	1963612	1963623	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_014922	TCGGCT	2	12	1966335	1966346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014922	AAATGA	2	12	1984498	1984509	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014922	CAGCAT	2	12	1987786	1987797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_014922	ACATCA	2	12	1989399	1989410	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014922	ATTTCA	2	12	1994733	1994744	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_014922	CTTTCG	2	12	1996705	1996716	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_014922	GCCTTC	2	12	1998256	1998267	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.