MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 379

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	AATTT	2	10	1074	1083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014922	TAAAA	2	10	6167	6176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014922	AAAAC	2	10	21207	21216	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014922	TTAAA	2	10	24363	24372	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014922	AACAT	2	10	31233	31242	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014922	ATTTA	2	10	72695	72704	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014922	TAAAA	2	10	85523	85532	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014922	GTTTT	2	10	99607	99616	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014922	ATTTT	2	10	118834	118843	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014922	TAAAC	2	10	125849	125858	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014922	TATCT	2	10	127014	127023	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014922	GTGCG	2	10	161118	161127	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014922	CTGTT	24	120	168468	168587	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014922	AAAAT	2	10	181463	181472	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014922	TAAAA	2	10	196601	196610	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014922	AAAGG	2	10	213345	213354	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014922	ATTAA	2	10	217400	217409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014922	CAAGT	2	10	223959	223968	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014922	TATTT	2	10	224414	224423	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014922	ACAGA	2	10	228802	228811	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014922	TAATT	2	10	234291	234300	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014922	TTTAC	2	10	236056	236065	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_014922	TAAAA	2	10	238808	238817	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014922	CTTAC	2	10	253771	253780	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014922	TAGCA	2	10	260571	260580	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014922	CTTTC	2	10	266488	266497	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
27	NC_014922	TAATA	2	10	285794	285803	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014922	TTAAA	2	10	301098	301107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014922	CTCAA	2	10	320881	320890	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
30	NC_014922	ATATT	2	10	333358	333367	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014922	TAATT	2	10	337976	337985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014922	TTTAT	2	10	349493	349502	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014922	AAAAT	2	10	350834	350843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014922	TTTTA	2	10	363063	363072	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014922	TTTAA	2	10	365318	365327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014922	TGTGC	2	10	373147	373156	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014922	ATATA	2	10	373197	373206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014922	GCCCT	2	10	374152	374161	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_014922	CATTT	2	10	376532	376541	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014922	AAAAG	2	10	379152	379161	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014922	GTTTT	2	10	379575	379584	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014922	TCTTT	2	10	383460	383469	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014922	ATTTC	2	10	383670	383679	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014922	AAAAT	2	10	387884	387893	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014922	GGAGC	2	10	388219	388228	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
46	NC_014922	TAATG	2	10	394893	394902	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014922	ATAAC	2	10	394903	394912	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014922	TTTAT	2	10	396407	396416	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014922	AAAAT	2	10	415191	415200	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014922	TCTTA	2	10	420688	420697	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014922	GAATT	2	10	420824	420833	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014922	ATGCT	2	10	420843	420852	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014922	AAGAA	2	10	422661	422670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014922	GCTTC	2	10	423756	423765	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014922	TAACC	2	10	425273	425282	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
56	NC_014922	CGACT	2	10	425610	425619	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_014922	TCGGT	2	10	425985	425994	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_014922	TCGCT	2	10	426212	426221	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014922	GCTTC	2	10	427583	427592	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014922	TTCAA	2	10	428837	428846	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014922	CTTAA	2	10	431643	431652	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014922	ATTTC	2	10	438682	438691	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014922	TTAAT	2	10	463725	463734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014922	AGTGC	2	10	465581	465590	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_014922	AACAG	2	10	466998	467007	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014922	GCAAT	2	10	467038	467047	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_014922	CACAC	2	10	470640	470649	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
68	NC_014922	AAAGA	2	10	476455	476464	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014922	ATTTG	2	10	476714	476723	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014922	GCATT	2	10	480353	480362	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014922	AACAA	2	10	484410	484419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014922	AACGA	2	10	484758	484767	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014922	ACACA	2	10	487014	487023	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014922	CAGTG	2	10	487098	487107	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014922	TATGA	2	10	491745	491754	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014922	GGTAT	2	10	491921	491930	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014922	TAACC	2	10	493825	493834	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_014922	CGACT	2	10	494266	494275	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
79	NC_014922	TCGGT	2	10	494641	494650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014922	TCGCT	2	10	494868	494877	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014922	AAATT	2	10	495767	495776	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014922	AATAA	2	10	495799	495808	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014922	TACAC	2	10	496008	496017	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014922	GCTTC	2	10	496476	496485	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
85	NC_014922	CTCAT	2	10	497506	497515	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_014922	TTCAA	2	10	497729	497738	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014922	TTTTA	2	10	498927	498936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014922	TATCA	2	10	501895	501904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014922	TAAAA	2	10	505976	505985	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014922	GAAAA	2	10	510234	510243	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014922	ATTAA	2	10	523488	523497	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014922	ACATA	2	10	538468	538477	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
93	NC_014922	CTTTT	2	10	538657	538666	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014922	TAACC	2	10	551067	551076	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
95	NC_014922	CGACT	2	10	551508	551517	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
96	NC_014922	TCGGT	2	10	551883	551892	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
97	NC_014922	TCGCT	2	10	552110	552119	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
98	NC_014922	AAATT	2	10	553009	553018	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014922	AATAA	2	10	553041	553050	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014922	TACAC	2	10	553250	553259	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014922	GCTTC	2	10	553718	553727	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
102	NC_014922	TTCAA	2	10	554972	554981	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014922	TTTTC	2	10	561228	561237	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014922	GTGCG	2	10	564713	564722	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_014922	CTTTG	2	10	595289	595298	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014922	TTTGC	2	10	595619	595628	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014922	TAAAA	2	10	602269	602278	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014922	AGAAA	2	10	605005	605014	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014922	TAAAA	2	10	611787	611796	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014922	AAAAT	2	10	615021	615030	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014922	ATATA	2	10	622908	622917	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014922	AAAAT	2	10	624927	624936	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014922	ATTCT	2	10	627636	627645	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014922	AAAAG	2	10	632158	632167	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014922	CTTTC	2	10	640524	640533	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
116	NC_014922	ATTCA	2	10	643048	643057	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_014922	TATTT	2	10	645705	645714	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014922	CTAAT	2	10	651726	651735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_014922	ATAAA	2	10	662708	662717	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014922	GAAGA	2	10	667501	667510	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014922	AAGAT	2	10	674251	674260	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014922	TTTAA	2	10	676440	676449	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014922	ATTTT	2	10	676462	676471	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014922	TACAA	2	10	685137	685146	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014922	TTAAC	2	10	687583	687592	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_014922	TATTT	2	10	703310	703319	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_014922	TTTCC	2	10	717292	717301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_014922	AACTT	2	10	722355	722364	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_014922	ATTGT	2	10	729413	729422	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014922	TTTTC	2	10	737535	737544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
131	NC_014922	GATGA	2	10	747755	747764	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014922	TAAAA	2	10	751892	751901	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014922	TAAAC	2	10	753923	753932	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014922	AATGA	2	10	777405	777414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014922	TCAGG	2	10	789610	789619	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_014922	ATAAA	2	10	793350	793359	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014922	AAGAG	13	65	794359	794423	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014922	AAAAT	2	10	794476	794485	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014922	TATAA	2	10	794532	794541	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014922	TAAAA	2	10	794625	794634	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014922	TATGA	2	10	797871	797880	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014922	TAAAA	2	10	801842	801851	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014922	AAAAG	2	10	807337	807346	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014922	TTGTT	2	10	808922	808931	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014922	TGTTT	2	10	828889	828898	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_014922	TAAAA	2	10	832645	832654	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014922	TTTGT	2	10	835230	835239	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014922	GTTTA	2	10	843421	843430	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014922	TAAAA	2	10	843472	843481	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014922	CCGCA	2	10	845754	845763	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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152	NC_014922	TAAAA	2	10	848277	848286	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014922	AAAAG	2	10	849454	849463	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014922	TAAAA	2	10	875391	875400	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_014922	TAAAA	2	10	995376	995385	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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170	NC_014922	TAAAA	2	10	1000336	1000345	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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172	NC_014922	TAAGA	2	10	1004014	1004023	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_014922	AGCGA	2	10	1044389	1044398	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
187	NC_014922	ATTTT	2	10	1047743	1047752	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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192	NC_014922	TGTGA	2	10	1087573	1087582	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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254	NC_014922	TCAAT	2	10	1397682	1397691	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
255	NC_014922	ACAAT	2	10	1412035	1412044	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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260	NC_014922	GGGCA	2	10	1437920	1437929	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
261	NC_014922	TCGTC	3	15	1439145	1439159	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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264	NC_014922	CTTTT	2	10	1474647	1474656	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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270	NC_014922	TCTTT	2	10	1488017	1488026	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
271	NC_014922	CAATT	2	10	1488104	1488113	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
272	NC_014922	ATTTA	2	10	1491374	1491383	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_014922	GAAAA	2	10	1494083	1494092	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
274	NC_014922	AAAAG	2	10	1500707	1500716	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
275	NC_014922	ATTTA	2	10	1512163	1512172	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_014922	CCAAG	2	10	1512185	1512194	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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279	NC_014922	ACCTT	2	10	1520637	1520646	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_014922	TGAAT	2	10	1524796	1524805	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
281	NC_014922	TCTTA	2	10	1527356	1527365	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014922	AATAA	2	10	1537143	1537152	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_014922	TAAAT	2	10	1538378	1538387	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_014922	TTTAT	2	10	1539737	1539746	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014922	TCACT	2	10	1542452	1542461	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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287	NC_014922	TAAAA	2	10	1583620	1583629	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_014922	TTTTA	2	10	1590393	1590402	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_014922	AATTT	2	10	1592115	1592124	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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291	NC_014922	CCTAA	2	10	1598030	1598039	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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322	NC_014922	TAAAA	2	10	1696396	1696405	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.