MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae F3047 chromosome

Total Repeats: 26286

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014922	GCA	2	6	59	64	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774952
2	NC_014922	TGA	2	6	73	78	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
3	NC_014922	TGA	2	6	307	312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
4	NC_014922	GTG	2	6	396	401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774952
5	NC_014922	ACA	2	6	452	457	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774952
6	NC_014922	GTT	2	6	482	487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
7	NC_014922	GCG	2	6	585	590	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774952
8	NC_014922	CAT	2	6	610	615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774952
9	NC_014922	TGT	2	6	718	723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
10	NC_014922	CTT	2	6	753	758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774952
11	NC_014922	ATG	2	6	759	764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
12	NC_014922	TGT	2	6	850	855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774952
13	NC_014922	TAG	2	6	990	995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774952
14	NC_014922	AAT	2	6	1115	1120	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014922	TTC	2	6	1136	1141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014922	CAA	3	9	1248	1256	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
17	NC_014922	ATA	2	6	1414	1419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
18	NC_014922	TCG	2	6	1546	1551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774953
19	NC_014922	TCA	2	6	1589	1594	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
20	NC_014922	ACA	2	6	1643	1648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
21	NC_014922	TTA	2	6	1678	1683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
22	NC_014922	CAA	2	6	1701	1706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
23	NC_014922	ATT	2	6	1758	1763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
24	NC_014922	GGC	2	6	1919	1924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319774953
25	NC_014922	TTC	2	6	1930	1935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774953
26	NC_014922	AGA	2	6	1961	1966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
27	NC_014922	GAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
28	NC_014922	ATT	2	6	2225	2230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774953
29	NC_014922	ATG	2	6	2247	2252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
30	NC_014922	GGA	2	6	2259	2264	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774953
31	NC_014922	AAC	2	6	2342	2347	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774953
32	NC_014922	AAT	2	6	2436	2441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774953
33	NC_014922	GTG	2	6	2455	2460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319774953
34	NC_014922	TGA	2	6	2467	2472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774953
35	NC_014922	AGA	2	6	2492	2497	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
36	NC_014922	AGA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
37	NC_014922	CAC	2	6	2629	2634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774953
38	NC_014922	ATC	2	6	2685	2690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
39	NC_014922	GAA	2	6	2745	2750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
40	NC_014922	ACT	2	6	2792	2797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774953
41	NC_014922	AGC	2	6	2827	2832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774953
42	NC_014922	AAG	2	6	3004	3009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774953
43	NC_014922	ATT	2	6	3050	3055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
44	NC_014922	TCT	2	6	3067	3072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
45	NC_014922	ATT	2	6	3096	3101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
46	NC_014922	AAT	2	6	3242	3247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
47	NC_014922	TCT	2	6	3376	3381	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774954
48	NC_014922	AAT	2	6	3390	3395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
49	NC_014922	TCA	2	6	3427	3432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
50	NC_014922	ATT	2	6	3510	3515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
51	NC_014922	TAA	2	6	3520	3525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
52	NC_014922	CAA	2	6	3647	3652	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774954
53	NC_014922	ATT	2	6	3657	3662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774954
54	NC_014922	GAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774954
55	NC_014922	TAA	2	6	3795	3800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774954
56	NC_014922	CAT	2	6	3834	3839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774954
57	NC_014922	ATT	2	6	3854	3859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774955
58	NC_014922	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774955
59	NC_014922	TTC	2	6	3924	3929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774955
60	NC_014922	AAC	2	6	3971	3976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774955
61	NC_014922	GAC	2	6	4049	4054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774955
62	NC_014922	TGG	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014922	AAT	2	6	4437	4442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014922	CCA	2	6	4447	4452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
65	NC_014922	AAG	2	6	5013	5018	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774956
66	NC_014922	TTC	2	6	5023	5028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319774956
67	NC_014922	AGG	2	6	5040	5045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	319774956
68	NC_014922	ATT	2	6	5118	5123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774956
69	NC_014922	TGT	2	6	5177	5182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774956
70	NC_014922	AGC	2	6	5215	5220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774956
71	NC_014922	ATC	2	6	5273	5278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014922	GTG	2	6	5288	5293	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014922	TTG	2	6	5459	5464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014922	TTA	2	6	5548	5553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014922	CAT	2	6	5642	5647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_014922	ATC	2	6	5701	5706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_014922	GAA	2	6	5766	5771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014922	ATC	2	6	5785	5790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014922	TGA	2	6	5958	5963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014922	GAA	2	6	6004	6009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014922	TGA	2	6	6048	6053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014922	ACA	2	6	6084	6089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_014922	CTT	2	6	6180	6185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_014922	GAA	2	6	6196	6201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014922	GAT	2	6	6300	6305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014922	TAT	2	6	6511	6516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014922	ATG	2	6	6544	6549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014922	TGA	2	6	6650	6655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014922	ATC	2	6	6786	6791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014922	ATG	2	6	6821	6826	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014922	ACT	2	6	6868	6873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_014922	AGA	3	9	6882	6890	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014922	GAA	2	6	6994	6999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014922	TGA	2	6	7203	7208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014922	ACA	3	9	7213	7221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_014922	CCG	2	6	7344	7349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_014922	CAT	2	6	7367	7372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_014922	GTA	2	6	7618	7623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014922	AGA	2	6	7650	7655	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014922	CAA	2	6	7697	7702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_014922	ATC	2	6	7756	7761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014922	TCG	2	6	7848	7853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_014922	TTA	2	6	8027	8032	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014922	TTG	2	6	8194	8199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014922	TTG	2	6	8216	8221	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014922	CAC	2	6	8232	8237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014922	GAA	2	6	8253	8258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014922	TAT	2	6	8398	8403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014922	ATT	2	6	8566	8571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
110	NC_014922	TAT	2	6	8572	8577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774957
111	NC_014922	TGC	2	6	8579	8584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774957
112	NC_014922	TGA	2	6	8729	8734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
113	NC_014922	CAA	2	6	8767	8772	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
114	NC_014922	AGA	2	6	8807	8812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
115	NC_014922	CAG	2	6	8852	8857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
116	NC_014922	AGC	2	6	8906	8911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319774957
117	NC_014922	CAA	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774957
118	NC_014922	ATA	2	6	8926	8931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774957
119	NC_014922	GAA	2	6	9129	9134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
120	NC_014922	ATG	2	6	9186	9191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
121	NC_014922	GAT	2	6	9228	9233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774957
122	NC_014922	GAA	2	6	9264	9269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
123	NC_014922	AGA	2	6	9314	9319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774957
124	NC_014922	ATT	2	6	9355	9360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014922	CCA	2	6	9403	9408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319774958
126	NC_014922	ATA	2	6	9420	9425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
127	NC_014922	AAT	2	6	9556	9561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
128	NC_014922	ATT	2	6	9660	9665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
129	NC_014922	ATT	2	6	9702	9707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774958
130	NC_014922	ATA	2	6	9796	9801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774958
131	NC_014922	GCT	2	6	9814	9819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
132	NC_014922	TTG	2	6	9824	9829	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774959
133	NC_014922	TGA	2	6	9849	9854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319774959
134	NC_014922	TGC	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774959
135	NC_014922	CAA	2	6	10058	10063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319774959
136	NC_014922	AGA	2	6	10194	10199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319774959
137	NC_014922	TTA	2	6	10260	10265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014922	AAT	2	6	10277	10282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014922	TAA	2	6	10296	10301	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014922	TAT	2	6	10380	10385	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
141	NC_014922	TAT	2	6	10535	10540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319774960
142	NC_014922	TCG	2	6	10702	10707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319774960
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146	NC_014922	AAT	2	6	11333	11338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014922	TAT	2	6	11348	11353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_014922	TCA	2	6	11412	11417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319774961
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257	NC_014922	AAT	2	6	20913	20918	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774968
258	NC_014922	TAA	2	6	20981	20986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774968
259	NC_014922	AAT	2	6	21072	21077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319774968
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261	NC_014922	GTT	3	9	21296	21304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319774969
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