MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycoplasma fermentans M64 chromosome

Total Repeats: 208

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014921	TAATA	2	10	3282	3291	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014921	TTTGA	2	10	6792	6801	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014921	AATTT	2	10	7255	7264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014921	TTTGA	2	10	7331	7340	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014921	TTAAA	2	10	7369	7378	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014921	CAAAA	2	10	7387	7396	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014921	TATAT	2	10	8906	8915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014921	TAAAT	2	10	12262	12271	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014921	ATAGA	2	10	18144	18153	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014921	TAATT	2	10	19820	19829	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014921	TAAGC	2	10	21045	21054	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014921	AATAG	2	10	22339	22348	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014921	TGAAT	2	10	24554	24563	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014921	CTTAA	2	10	26726	26735	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014921	ATTAA	2	10	33953	33962	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014921	TAATA	2	10	38732	38741	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014921	TTTAC	2	10	38967	38976	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014921	ATTAA	2	10	44597	44606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014921	TATAT	2	10	44659	44668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014921	TTTAT	2	10	50463	50472	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014921	ATTTT	2	10	62291	62300	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014921	TTTGT	2	10	62301	62310	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014921	AAGTT	2	10	62378	62387	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014921	AAAAT	2	10	64007	64016	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014921	ATTTT	2	10	87070	87079	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014921	ATGAA	2	10	89374	89383	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014921	TAAAT	2	10	110867	110876	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014921	ATTTT	2	10	118829	118838	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014921	AATTT	2	10	121257	121266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014921	AATAA	2	10	123342	123351	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014921	AAAAT	2	10	131570	131579	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014921	ATATT	2	10	171198	171207	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014921	GGAAT	2	10	176516	176525	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014921	TTAAA	2	10	182198	182207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014921	TTTTG	2	10	194731	194740	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014921	TTTAT	2	10	226051	226060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014921	TTTTA	2	10	226143	226152	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014921	AAATT	2	10	229454	229463	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014921	TTTTA	2	10	247508	247517	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014921	TAATA	2	10	264267	264276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014921	TAATA	2	10	267841	267850	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014921	AAAAC	2	10	275296	275305	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_014921	TGATA	2	10	275675	275684	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014921	ATTAT	2	10	276318	276327	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014921	ATTAA	2	10	277300	277309	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014921	TTAAT	2	10	279547	279556	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014921	ATAAA	2	10	280635	280644	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014921	ATATA	2	10	291746	291755	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014921	TATAA	2	10	295720	295729	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014921	ATTAA	2	10	299167	299176	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014921	TAAAT	2	10	301789	301798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014921	TAAAA	2	10	301867	301876	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014921	TAAAT	2	10	313275	313284	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014921	AAATT	2	10	327197	327206	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014921	ATATT	2	10	327592	327601	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014921	AATTA	2	10	336711	336720	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014921	TTAAT	2	10	338128	338137	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014921	ATTTT	2	10	338152	338161	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014921	TTATT	2	10	345646	345655	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014921	ATTAA	2	10	360205	360214	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014921	TAAAA	2	10	373405	373414	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014921	ATTTA	2	10	380788	380797	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014921	TTATT	2	10	383028	383037	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014921	TTTAG	2	10	385626	385635	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014921	CTAAT	2	10	385636	385645	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014921	ATAAA	2	10	388185	388194	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014921	ATATT	2	10	392225	392234	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014921	TTTCT	2	10	404159	404168	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014921	AATTT	2	10	404865	404874	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014921	TTAAT	2	10	404884	404893	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014921	ATTTA	2	10	409710	409719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014921	AAATT	2	10	409964	409973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014921	TTAAA	2	10	441386	441395	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014921	AAAAT	2	10	441494	441503	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014921	ATTTT	2	10	441591	441600	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014921	AATTT	2	10	451952	451961	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014921	AAATT	2	10	469595	469604	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014921	TTTCT	2	10	470703	470712	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014921	AATTT	2	10	471409	471418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014921	TTAAT	2	10	471428	471437	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014921	ATTAA	2	10	475989	475998	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014921	TTTCT	2	10	487075	487084	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014921	AATTT	2	10	487781	487790	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014921	TTAAT	2	10	487800	487809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014921	TATTT	2	10	487932	487941	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014921	TATTT	2	10	510320	510329	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014921	ATTTA	2	10	532408	532417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014921	TCTAT	2	10	532449	532458	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_014921	ATATT	2	10	532561	532570	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014921	TATAA	2	10	537597	537606	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014921	AAAAT	2	10	539268	539277	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014921	ATTTA	2	10	539307	539316	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014921	TAAAA	2	10	539359	539368	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014921	TTAAT	2	10	551866	551875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014921	TTTAT	2	10	556574	556583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014921	TTTAG	2	10	556992	557001	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014921	ATTAT	2	10	561976	561985	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014921	ATTTT	2	10	562099	562108	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014921	ATTTT	2	10	562206	562215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014921	ATTTT	2	10	564317	564326	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014921	TAATT	2	10	564452	564461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014921	ATAAA	2	10	570064	570073	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014921	TAATT	2	10	576711	576720	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014921	ATATT	2	10	578859	578868	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014921	AGATA	2	10	590186	590195	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014921	TAATT	2	10	602502	602511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_014921	TATTT	2	10	602626	602635	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014921	TAAAA	2	10	603453	603462	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014921	TATAT	2	10	607454	607463	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014921	TTTCA	2	10	620427	620436	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014921	TTTTA	2	10	625676	625685	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014921	ACTTA	2	10	625707	625716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_014921	AAATC	2	10	625803	625812	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014921	TATAA	2	10	638418	638427	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014921	ATAAA	2	10	646371	646380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014921	ATAAA	2	10	648312	648321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014921	AAATT	2	10	649215	649224	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_014921	AATTT	2	10	664631	664640	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014921	TAATT	2	10	672817	672826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014921	AATTA	2	10	676591	676600	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014921	ATTTA	2	10	681915	681924	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014921	ATAAA	2	10	681934	681943	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014921	AAAGA	2	10	682845	682854	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014921	ATTTT	2	10	682948	682957	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014921	AATTT	2	10	692589	692598	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014921	GCAAG	2	10	694153	694162	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014921	ATTTT	2	10	694442	694451	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014921	ATTTA	2	10	698793	698802	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014921	CGTAG	2	10	699167	699176	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
130	NC_014921	CACGA	2	10	699457	699466	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
131	NC_014921	CAAAA	2	10	700044	700053	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
132	NC_014921	TCCTT	2	10	701287	701296	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_014921	AACTA	2	10	702431	702440	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_014921	TTTTA	2	10	726186	726195	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014921	AATTA	2	10	729228	729237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014921	TTTTA	2	10	741995	742004	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014921	ATATT	2	10	767283	767292	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014921	CAAAT	2	10	767323	767332	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_014921	TTAAA	2	10	767827	767836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_014921	TAATT	2	10	774773	774782	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_014921	AAAAT	2	10	774796	774805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_014921	ATTAA	2	10	775358	775367	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_014921	ATATT	2	10	780665	780674	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014921	ATTTA	2	10	789881	789890	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014921	CGTAG	2	10	790255	790264	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014921	CACGA	2	10	790545	790554	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
147	NC_014921	CAAAA	2	10	791132	791141	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014921	AATTT	2	10	808728	808737	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014921	AACTA	2	10	808876	808885	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_014921	TAAAA	2	10	816891	816900	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014921	TTAAT	2	10	818888	818897	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_014921	AAAAG	2	10	826317	826326	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014921	TATAA	2	10	827117	827126	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014921	TAAAA	2	10	855552	855561	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_014921	ATGAT	2	10	856625	856634	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
156	NC_014921	CATTA	2	10	856809	856818	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
157	NC_014921	AAGAA	2	10	858355	858364	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
158	NC_014921	ACAAT	2	10	858675	858684	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014921	ATTAA	2	10	859267	859276	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_014921	ATTTG	2	10	859414	859423	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
161	NC_014921	TTATT	2	10	861807	861816	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014921	TAAAA	2	10	872537	872546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_014921	TAAAT	2	10	880216	880225	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_014921	TTTAA	2	10	885645	885654	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_014921	AAAAT	2	10	919047	919056	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_014921	AAAAT	2	10	919075	919084	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_014921	TATTT	2	10	936285	936294	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014921	TATAA	2	10	960242	960251	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_014921	TAAAG	2	10	960553	960562	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014921	ATTTT	2	10	962314	962323	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014921	TAATT	2	10	965710	965719	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014921	TTAAA	2	10	965840	965849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014921	AACAA	2	10	969183	969192	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
174	NC_014921	TTTAT	2	10	969206	969215	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_014921	TAAAA	2	10	969906	969915	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_014921	ATTAT	2	10	971826	971835	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_014921	TTGAT	2	10	984440	984449	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014921	TGGTG	2	10	984459	984468	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014921	TAAGT	2	10	984538	984547	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
180	NC_014921	TAAAA	2	10	984569	984578	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_014921	TTTCA	2	10	984742	984751	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_014921	ATTTT	2	10	989957	989966	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014921	TCAAA	2	10	989971	989980	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
184	NC_014921	TTATT	2	10	990302	990311	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014921	TGGTT	2	10	990367	990376	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014921	TATTT	2	10	992745	992754	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_014921	TGTTT	2	10	992760	992769	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
188	NC_014921	TAAAA	2	10	998421	998430	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_014921	TTTAA	2	10	1021295	1021304	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_014921	TTTTC	2	10	1028105	1028114	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_014921	GGTCA	2	10	1030266	1030275	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
192	NC_014921	TTAAA	2	10	1030736	1030745	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014921	ATTTT	2	10	1032956	1032965	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_014921	TAATA	2	10	1034718	1034727	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014921	AGAAA	2	10	1038729	1038738	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014921	TTTAA	2	10	1051488	1051497	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014921	AAATT	2	10	1053534	1053543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_014921	ATTAA	2	10	1054561	1054570	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_014921	AGAGA	2	10	1054580	1054589	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
200	NC_014921	ATTTT	2	10	1060052	1060061	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_014921	TTAAT	2	10	1061492	1061501	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_014921	TATAT	2	10	1083564	1083573	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
203	NC_014921	TAATT	2	10	1088957	1088966	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
204	NC_014921	AAATA	2	10	1094061	1094070	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
205	NC_014921	TGTAT	2	10	1094876	1094885	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
206	NC_014921	TTATT	2	10	1099219	1099228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
207	NC_014921	TAAAA	2	10	1101092	1101101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
208	NC_014921	TTACA	2	10	1115509	1115518	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.