MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 127

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	GTTCTG	2	12	6509	6520	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_014920	AAATAA	2	12	7374	7385	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014920	AACTGG	2	12	8092	8103	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_014920	CACAAC	2	12	8423	8434	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014920	GAAAAA	2	12	9024	9035	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014920	AACTAA	2	12	114639	114650	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014920	GCATCA	2	12	150537	150548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_014920	ATTTCA	2	12	157809	157820	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_014920	CTTTCG	2	12	159677	159688	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014920	GCCTTC	2	12	161464	161475	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_014920	TTTTTA	2	12	169674	169685	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014920	TAATTT	2	12	194573	194584	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014920	GTTCCT	2	12	196114	196125	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_014920	AGTTAA	2	12	196290	196301	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014920	AGAAAA	2	12	221945	221956	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014920	TTACGT	2	12	227645	227656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014920	TAAATT	2	12	240493	240504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014920	TAAGGT	2	12	246427	246438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014920	CAACGC	2	12	292505	292516	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
20	NC_014920	TCCCTT	2	12	352753	352764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_014920	TGAAGT	2	12	358861	358872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014920	CAACAT	2	12	359089	359100	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_014920	TTTTCA	2	12	377957	377968	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014920	CGAAGG	2	12	383764	383775	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014920	AGCGAA	2	12	385312	385323	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014920	TGAAAT	2	12	387182	387193	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014920	TTTTTA	2	12	390720	390731	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014920	TTTAAA	2	12	396011	396022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014920	TCTTTA	2	12	537067	537078	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014920	TTTTGT	2	12	539381	539392	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014920	TTGCTA	2	12	586346	586357	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014920	TAAAAA	2	12	617364	617375	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014920	TAAAAA	2	12	618420	618431	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014920	AAAATA	2	12	626706	626717	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014920	AATTTC	2	12	637399	637410	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014920	CTTTTC	2	12	646793	646804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_014920	TAATAC	2	12	684174	684185	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014920	CTATTG	2	12	687211	687222	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014920	CTATTG	2	12	687391	687402	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_014920	TGCTAT	2	12	687503	687514	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_014920	AAGCAA	2	12	688751	688762	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014920	ACTTTT	2	12	704843	704854	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_014920	TTTTAT	2	12	726775	726786	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014920	TTAATT	2	12	730238	730249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014920	TTAATC	2	12	747496	747507	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_014920	AAATTG	2	12	747834	747845	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014920	TAAAAA	2	12	753378	753389	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014920	AAAAAT	2	12	789090	789101	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014920	AATTTA	2	12	798099	798110	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014920	AATGAT	2	12	805154	805165	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014920	CTATAT	2	12	897355	897366	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_014920	TAAATA	2	12	917909	917920	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014920	AATAAA	2	12	925401	925412	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014920	CTTTGA	2	12	999155	999166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014920	TTACAA	2	12	1002917	1002928	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_014920	ACATAT	2	12	1008486	1008497	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_014920	GCTTTA	2	12	1035354	1035365	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_014920	AAGAAT	2	12	1131069	1131080	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014920	CTTTTA	2	12	1160726	1160737	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_014920	AAAGAA	2	12	1169978	1169989	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014920	TGAAGA	2	12	1171448	1171459	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014920	GAATAT	2	12	1174838	1174849	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014920	TATAAA	2	12	1190778	1190789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014920	AAATTT	2	12	1240901	1240912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014920	GGCACC	2	12	1254575	1254586	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
66	NC_014920	TTCAAC	2	12	1260750	1260761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_014920	TCGGCT	2	12	1263323	1263334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014920	CACTGA	2	12	1266110	1266121	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_014920	AAACGT	2	12	1269000	1269011	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_014920	AAAATA	5	30	1270612	1270641	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014920	GGTGCG	2	12	1293574	1293585	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014920	TCATTA	2	12	1331388	1331399	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_014920	AACAAA	2	12	1333331	1333342	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_014920	TCCCCT	2	12	1347386	1347397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_014920	AATTAA	2	12	1354947	1354958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014920	AGAAAA	2	12	1363595	1363606	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014920	ATTTCA	2	12	1379846	1379857	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_014920	AAGTTA	2	12	1380773	1380784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014920	TTTATT	2	12	1389361	1389372	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014920	TAAAAA	2	12	1392650	1392661	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014920	TTTTTA	2	12	1394268	1394279	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014920	CTTTAG	2	12	1411019	1411030	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_014920	AAAAGA	2	12	1437270	1437281	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014920	ATCCTC	2	12	1437372	1437383	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014920	TAGTTA	2	12	1451579	1451590	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014920	CGTTAT	2	12	1451822	1451833	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014920	TTATTT	2	12	1482639	1482650	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014920	ATTTCA	2	12	1499548	1499559	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_014920	CTTTCG	2	12	1501416	1501427	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_014920	AACCCC	2	12	1502856	1502867	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_014920	GCCTTC	2	12	1502965	1502976	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014920	ATTTCA	2	12	1532793	1532804	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_014920	CTTTCG	2	12	1534661	1534672	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_014920	AACCCC	2	12	1536101	1536112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014920	GCCTTC	2	12	1536210	1536221	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
96	NC_014920	AATAAA	2	12	1539339	1539350	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014920	AGTGGT	2	12	1546043	1546054	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014920	TAAGAA	2	12	1582325	1582336	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014920	AAAATT	2	12	1582956	1582967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014920	ATTTCA	2	12	1584294	1584305	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_014920	CTTTCG	2	12	1586162	1586173	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_014920	GCCTTC	2	12	1587949	1587960	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
103	NC_014920	TTACGC	2	12	1593100	1593111	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014920	TTGCAT	2	12	1601241	1601252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_014920	ATTGAA	2	12	1601730	1601741	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014920	GGCTAG	2	12	1603186	1603197	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_014920	TTCCAG	2	12	1603252	1603263	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014920	ATCGAG	2	12	1603756	1603767	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_014920	GTTAAA	2	12	1618163	1618174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014920	CAAGCT	2	12	1625629	1625640	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014920	ATTTTT	2	12	1645159	1645170	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014920	TAAAAA	2	12	1660620	1660631	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014920	GTTGAT	2	12	1698977	1698988	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014920	AAAATA	2	12	1706694	1706705	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014920	AAGTAA	2	12	1713601	1713612	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014920	AATTTT	2	12	1725964	1725975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014920	TTTGCT	2	12	1797960	1797971	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_014920	GTTATG	2	12	1830950	1830961	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014920	TATTTT	2	12	1839443	1839454	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014920	AAAATT	2	12	1883427	1883438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014920	TTGGTA	2	12	1944874	1944885	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014920	AGAAAA	2	12	1963048	1963059	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014920	ATCCCC	2	12	1963427	1963438	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_014920	ATTTCA	2	12	1973413	1973424	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_014920	CTTTCG	2	12	1975281	1975292	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_014920	AACCCC	2	12	1976959	1976970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_014920	GCCTTC	2	12	1977068	1977079	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.