MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 745

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	CTACAA	2	12	1003	1014	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319896423
2	NC_014920	TTTCCT	2	12	4613	4624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896427
3	NC_014920	TGGCAA	2	12	13117	13128	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319896432
4	NC_014920	AAACCA	2	12	15470	15481	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896434
5	NC_014920	CACGCT	2	12	16332	16343	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319896434
6	NC_014920	AGCTAA	2	12	17287	17298	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896435
7	NC_014920	TCGTTA	2	12	19300	19311	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319896437
8	NC_014920	AAGATG	2	12	29402	29413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319896444
9	NC_014920	AAGCGA	2	12	30130	30141	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319896445
10	NC_014920	ACCAAA	2	12	38037	38048	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319896454
11	NC_014920	TTTACT	2	12	45453	45464	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319896460
12	NC_014920	CTTTAT	2	12	45950	45961	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319896460
13	NC_014920	TACTTT	2	12	45980	45991	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319896460
14	NC_014920	CTTGTA	2	12	46353	46364	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319896461
15	NC_014920	AAAGCA	2	12	49876	49887	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319896465
16	NC_014920	TGGAAT	2	12	56811	56822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896472
17	NC_014920	TCTAAA	2	12	57683	57694	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319896473
18	NC_014920	TGCCAA	2	12	59163	59174	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896474
19	NC_014920	TTAGAT	2	12	63667	63678	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896477
20	NC_014920	ATCAAG	2	12	69366	69377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896482
21	NC_014920	TGCGCC	2	12	70932	70943	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319896482
22	NC_014920	AGAACA	2	12	74380	74391	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319896485
23	NC_014920	CAAATT	2	12	75605	75616	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319896487
24	NC_014920	TTTGGT	2	12	76927	76938	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896488
25	NC_014920	ATTAAA	2	12	80817	80828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319896491
26	NC_014920	TGGGCT	2	12	81536	81547	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319896492
27	NC_014920	TATGCG	2	12	86637	86648	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319896497
28	NC_014920	GCAAAA	2	12	96678	96689	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319896508
29	NC_014920	TCGTTT	2	12	102766	102777	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319896515
30	NC_014920	TTTTAT	2	12	109615	109626	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	319896523
31	NC_014920	CAAGTC	3	18	111460	111477	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896526
32	NC_014920	TGAAAA	2	12	112984	112995	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896526
33	NC_014920	CTTCAA	2	12	121042	121053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896534
34	NC_014920	AGTTCA	2	12	121062	121073	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319896534
35	NC_014920	TTCGCC	2	12	135327	135338	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319896544
36	NC_014920	GCAAAG	2	12	138392	138403	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319896546
37	NC_014920	ACTCAA	2	12	139056	139067	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319896546
38	NC_014920	CCCAAT	2	12	143274	143285	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319896549
39	NC_014920	ATTGCG	2	12	144417	144428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319896549
40	NC_014920	TACTTC	2	12	144749	144760	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319896549
41	NC_014920	ATTGGA	2	12	144935	144946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319896549
42	NC_014920	CACCCA	2	12	146347	146358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	319896550
43	NC_014920	AGGTGC	2	12	164262	164273	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319896559
44	NC_014920	AATCCT	2	12	165187	165198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896560
45	NC_014920	AACAAA	2	12	173331	173342	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	319896566
46	NC_014920	TATTGA	2	12	177024	177035	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896568
47	NC_014920	AATGTT	2	12	177369	177380	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896568
48	NC_014920	CAAATG	2	12	177733	177744	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896568
49	NC_014920	TCAATT	2	12	182395	182406	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319896574
50	NC_014920	GTTGCC	2	12	184025	184036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896575
51	NC_014920	GAGAAA	2	12	198944	198955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896584
52	NC_014920	CTTTTC	2	12	201693	201704	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319896586
53	NC_014920	TTCTGG	2	12	201765	201776	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319896586
54	NC_014920	ATTCCA	2	12	201918	201929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896586
55	NC_014920	CTGTCA	2	12	202280	202291	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896587
56	NC_014920	GATATT	2	12	204872	204883	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896591
57	NC_014920	ATCTTG	2	12	206838	206849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319896593
58	NC_014920	TGTTTG	2	12	208439	208450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896595
59	NC_014920	AACGAT	2	12	208636	208647	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896595
60	NC_014920	ACCATC	2	12	211161	211172	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319896597
61	NC_014920	TAAAGA	2	12	212148	212159	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896597
62	NC_014920	GATTAA	2	12	213213	213224	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319896598
63	NC_014920	ATGGCA	12	72	214678	214749	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319896599
64	NC_014920	GATAAA	2	12	215406	215417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896599
65	NC_014920	AAGATA	2	12	215422	215433	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896599
66	NC_014920	TACGGG	2	12	215435	215446	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319896599
67	NC_014920	ATTTAG	2	12	216043	216054	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896599
68	NC_014920	TCAAAT	2	12	216717	216728	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319896599
69	NC_014920	AATGAA	2	12	221536	221547	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896604
70	NC_014920	TGAAAA	2	12	221721	221732	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896604
71	NC_014920	TGCCAA	2	12	222290	222301	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896605
72	NC_014920	TAATTT	2	12	225187	225198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896608
73	NC_014920	TTAGCT	2	12	228132	228143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319896610
74	NC_014920	CATCAA	2	12	231793	231804	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319896614
75	NC_014920	AGAAAG	2	12	233714	233725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896615
76	NC_014920	ACTTGA	2	12	240786	240797	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319896621
77	NC_014920	TACCGT	2	12	242900	242911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896622
78	NC_014920	TGGTTT	2	12	247599	247610	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896628
79	NC_014920	GGTTGT	2	12	251541	251552	0 %	50 %	50 %	0 %	319896631
80	NC_014920	CAATCA	2	12	252411	252422	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319896632
81	NC_014920	TTCGTG	2	12	253974	253985	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319896634
82	NC_014920	TGCCGA	2	12	254092	254103	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319896634
83	NC_014920	CTTTAT	2	12	256156	256167	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319896635
84	NC_014920	ATTGAA	2	12	256773	256784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319896636
85	NC_014920	CTTGCA	2	12	264325	264336	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896646
86	NC_014920	GATTAA	2	12	265056	265067	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319896647
87	NC_014920	ATCACG	2	12	267777	267788	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896649
88	NC_014920	TACGAG	2	12	273749	273760	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319896656
89	NC_014920	TGTCAC	2	12	276603	276614	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896659
90	NC_014920	AATGAC	2	12	277784	277795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896661
91	NC_014920	ACGGCA	2	12	281385	281396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319896663
92	NC_014920	ATCCGA	2	12	286082	286093	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896667
93	NC_014920	ATCAAG	2	12	287426	287437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319896669
94	NC_014920	AATTTA	2	12	288307	288318	50 %	50 %	0 %	0 %	319896671
95	NC_014920	AAGGCT	2	12	290953	290964	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319896672
96	NC_014920	CGGTCA	2	12	295785	295796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319896676
97	NC_014920	TTTGGT	2	12	297767	297778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	319896678
98	NC_014920	ACAAAA	2	12	300638	300649	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	319896682
99	NC_014920	CATATT	2	12	303342	303353	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319896684
100	NC_014920	ACACTG	2	12	309507	309518	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896691
101	NC_014920	CAAGTG	2	12	310643	310654	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319896692
102	NC_014920	CCACAA	2	12	321767	321778	50 %	0 %	0 %	50 %	319896705
103	NC_014920	TAATTC	2	12	322213	322224	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	319896706
104	NC_014920	TGTTGC	2	12	327856	327867	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319896712
105	NC_014920	ATTTTA	2	12	331847	331858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319896716
106	NC_014920	TCCAAT	2	12	334040	334051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896719
107	NC_014920	AAATCA	2	12	337798	337809	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319896722
108	NC_014920	TCAATA	2	12	338484	338495	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319896723
109	NC_014920	CTTACG	2	12	340623	340634	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319896727
110	NC_014920	CGCTCA	2	12	344797	344808	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319896733
111	NC_014920	TTTTCT	2	12	349502	349513	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319896738
112	NC_014920	AAAGGG	2	12	355248	355259	50 %	0 %	50 %	0 %	319896747
113	NC_014920	GGCGTG	2	12	360729	360740	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319896753
114	NC_014920	TGAAGA	2	12	366042	366053	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319896760
115	NC_014920	ATGAGA	2	12	368906	368917	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319896765
116	NC_014920	AAAGGA	2	12	369388	369399	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319896765
117	NC_014920	ATCGCA	2	12	370661	370672	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319896768
118	NC_014920	AAAAAT	2	12	370746	370757	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319896768
119	NC_014920	TGGACG	2	12	371396	371407	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319896769
120	NC_014920	TGATAT	2	12	373843	373854	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896771
121	NC_014920	TTTTAG	2	12	376723	376734	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319896773
122	NC_014920	TCATGG	2	12	377426	377437	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319896774
123	NC_014920	TCATGA	2	12	377474	377485	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319896774
124	NC_014920	AATTTG	2	12	378313	378324	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319896775
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130	NC_014920	CTATTG	2	12	399632	399643	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319896788
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146	NC_014920	ACTATC	2	12	459408	459419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319896846
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153	NC_014920	ATAAAG	2	12	472202	472213	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319896858
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223	NC_014920	GAAGAT	2	12	631161	631172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319896984
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229	NC_014920	ATTGTG	2	12	634451	634462	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319896986
230	NC_014920	TGTGGT	2	12	634638	634649	0 %	50 %	50 %	0 %	319896986
231	NC_014920	TGTGCC	2	12	634736	634747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319896986
232	NC_014920	GGGCTT	2	12	638219	638230	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319896987
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235	NC_014920	CTTTTT	2	12	652221	652232	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	319896999
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244	NC_014920	ATTTAA	2	12	674155	674166	50 %	50 %	0 %	0 %	319897015
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324	NC_014920	CCACGA	2	12	886679	886690	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319897221
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326	NC_014920	TTGCTT	2	12	894862	894873	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	319897229
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329	NC_014920	TAACAA	2	12	903453	903464	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319897237
330	NC_014920	CAAAGA	2	12	906366	906377	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	319897240
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332	NC_014920	ATTGGT	2	12	916551	916562	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319897249
333	NC_014920	AGCATT	2	12	917384	917395	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	319897249
334	NC_014920	TCATAA	2	12	919066	919077	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319897250
335	NC_014920	GACCAC	2	12	919760	919771	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319897251
336	NC_014920	GGAAGT	2	12	920611	920622	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319897253
337	NC_014920	GATGAA	2	12	921586	921597	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319897254
338	NC_014920	AAAACC	2	12	923948	923959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	319897256
339	NC_014920	ATCAAT	2	12	924308	924319	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319897256
340	NC_014920	ATTGCG	2	12	925979	925990	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319897257
341	NC_014920	AGAAAT	2	12	929337	929348	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319897260
342	NC_014920	GATATG	2	12	929686	929697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319897260
343	NC_014920	CAAAAT	2	12	931467	931478	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	319897261
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450	NC_014920	ACAAAA	2	12	1194415	1194426	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	319897490
451	NC_014920	AAATGA	2	12	1196796	1196807	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319897493
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453	NC_014920	AAAATA	2	12	1198340	1198351	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	319897493
454	NC_014920	TTTAGG	2	12	1200343	1200354	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319897494
455	NC_014920	GGGCAA	2	12	1200703	1200714	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319897494
456	NC_014920	GAAAAA	2	12	1202173	1202184	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	319897495
457	NC_014920	ATTGAT	2	12	1202509	1202520	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319897495
458	NC_014920	GTTTAA	2	12	1203707	1203718	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319897496
459	NC_014920	TAAAGA	2	12	1205813	1205824	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	319897498
460	NC_014920	CAGATC	2	12	1206364	1206375	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319897498
461	NC_014920	AGTTTT	2	12	1210566	1210577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	319897498
462	NC_014920	TACCAA	2	12	1212281	1212292	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	319897500
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472	NC_014920	GAAATG	2	12	1242069	1242080	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319897528
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474	NC_014920	AATTTA	2	12	1245151	1245162	50 %	50 %	0 %	0 %	319897529
475	NC_014920	TAATAT	2	12	1245994	1246005	50 %	50 %	0 %	0 %	319897530
476	NC_014920	GGCTGA	2	12	1246121	1246132	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319897530
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481	NC_014920	ATAATC	2	12	1259757	1259768	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	319897544
482	NC_014920	TTGTTT	2	12	1265261	1265272	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	319897549
483	NC_014920	CGGTGG	2	12	1269484	1269495	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319897552
484	NC_014920	AAAGTG	2	12	1278490	1278501	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	319897562
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487	NC_014920	AATTGA	2	12	1285002	1285013	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	319897567
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489	NC_014920	ATCTTT	2	12	1290327	1290338	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319897573
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498	NC_014920	TTACGT	2	12	1313079	1313090	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319897594
499	NC_014920	CTATTT	2	12	1313510	1313521	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	319897594
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