MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 1556

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319896423
2	NC_014920	AATTT	2	10	1074	1083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_014920	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	319896425
4	NC_014920	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	319896426
5	NC_014920	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	319896427
6	NC_014920	ATTTG	2	10	11745	11754	20 %	60 %	20 %	0 %	319896430
7	NC_014920	TTATT	2	10	13628	13637	20 %	80 %	0 %	0 %	319896433
8	NC_014920	CAACC	2	10	15708	15717	40 %	0 %	0 %	60 %	319896434
9	NC_014920	TTTAG	2	10	16823	16832	20 %	60 %	20 %	0 %	319896435
10	NC_014920	GTCGT	2	10	16884	16893	0 %	40 %	40 %	20 %	319896435
11	NC_014920	ATCTT	2	10	18778	18787	20 %	60 %	0 %	20 %	319896437
12	NC_014920	TCAAG	2	10	21214	21223	40 %	20 %	20 %	20 %	319896438
13	NC_014920	CCGAT	2	10	21321	21330	20 %	20 %	20 %	40 %	319896438
14	NC_014920	AAAAC	2	10	21895	21904	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_014920	GAAAA	2	10	22603	22612	80 %	0 %	20 %	0 %	319896440
16	NC_014920	CACAA	2	10	24233	24242	60 %	0 %	0 %	40 %	319896441
17	NC_014920	TTAAA	2	10	25039	25048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014920	AATAC	2	10	25656	25665	60 %	20 %	0 %	20 %	319896442
19	NC_014920	CAATT	2	10	29873	29882	40 %	40 %	0 %	20 %	319896445
20	NC_014920	AACAT	2	10	31910	31919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_014920	CTTTT	2	10	33915	33924	0 %	80 %	0 %	20 %	319896450
22	NC_014920	ATAAA	2	10	34088	34097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014920	AAAAT	2	10	36561	36570	80 %	20 %	0 %	0 %	319896453
24	NC_014920	TAAAC	2	10	37620	37629	60 %	20 %	0 %	20 %	319896454
25	NC_014920	CAATC	2	10	39928	39937	40 %	20 %	0 %	40 %	319896456
26	NC_014920	AAGAA	2	10	40609	40618	80 %	0 %	20 %	0 %	319896457
27	NC_014920	TTACC	2	10	43373	43382	20 %	40 %	0 %	40 %	319896458
28	NC_014920	TGGTA	2	10	44924	44933	20 %	40 %	40 %	0 %	319896459
29	NC_014920	CCCCT	2	10	45206	45215	0 %	20 %	0 %	80 %	319896460
30	NC_014920	AATGC	2	10	47625	47634	40 %	20 %	20 %	20 %	319896463
31	NC_014920	ATTTT	2	10	49111	49120	20 %	80 %	0 %	0 %	319896465
32	NC_014920	GCCAA	2	10	49951	49960	40 %	0 %	20 %	40 %	319896465
33	NC_014920	TTCCA	2	10	50567	50576	20 %	40 %	0 %	40 %	319896466
34	NC_014920	AATCA	2	10	52669	52678	60 %	20 %	0 %	20 %	319896469
35	NC_014920	AATGC	2	10	53287	53296	40 %	20 %	20 %	20 %	319896470
36	NC_014920	CCTGC	2	10	53353	53362	0 %	20 %	20 %	60 %	319896470
37	NC_014920	TTGCC	2	10	58482	58491	0 %	40 %	20 %	40 %	319896473
38	NC_014920	TAAAT	2	10	59711	59720	60 %	40 %	0 %	0 %	319896474
39	NC_014920	AATCC	2	10	60348	60357	40 %	20 %	0 %	40 %	319896474
40	NC_014920	ATTTT	2	10	64442	64451	20 %	80 %	0 %	0 %	319896479
41	NC_014920	TGAAA	2	10	69523	69532	60 %	20 %	20 %	0 %	319896482
42	NC_014920	ATGTT	2	10	71380	71389	20 %	60 %	20 %	0 %	319896482
43	NC_014920	TGCAG	2	10	72570	72579	20 %	20 %	40 %	20 %	319896483
44	NC_014920	ATTTA	2	10	73314	73323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014920	AGGTA	2	10	73508	73517	40 %	20 %	40 %	0 %	319896484
46	NC_014920	CAACG	2	10	76427	76436	40 %	0 %	20 %	40 %	319896488
47	NC_014920	AGAAA	2	10	77787	77796	80 %	0 %	20 %	0 %	319896488
48	NC_014920	GAAGA	2	10	78141	78150	60 %	0 %	40 %	0 %	319896488
49	NC_014920	ACATC	2	10	80255	80264	40 %	20 %	0 %	40 %	319896490
50	NC_014920	TTACA	2	10	80791	80800	40 %	40 %	0 %	20 %	319896491
51	NC_014920	TGATT	2	10	81581	81590	20 %	60 %	20 %	0 %	319896492
52	NC_014920	AATTT	2	10	81739	81748	40 %	60 %	0 %	0 %	319896492
53	NC_014920	CACAT	2	10	84878	84887	40 %	20 %	0 %	40 %	319896496
54	NC_014920	CCAAT	2	10	88151	88160	40 %	20 %	0 %	40 %	319896498
55	NC_014920	CCTCT	2	10	91096	91105	0 %	40 %	0 %	60 %	319896504
56	NC_014920	CTTAC	2	10	91245	91254	20 %	40 %	0 %	40 %	319896504
57	NC_014920	ACTGT	2	10	93679	93688	20 %	40 %	20 %	20 %	319896504
58	NC_014920	ATTTT	2	10	94290	94299	20 %	80 %	0 %	0 %	319896505
59	NC_014920	GGTGA	2	10	94910	94919	20 %	20 %	60 %	0 %	319896506
60	NC_014920	GCTTC	2	10	97413	97422	0 %	40 %	20 %	40 %	319896508
61	NC_014920	CGCTG	2	10	97664	97673	0 %	20 %	40 %	40 %	319896508
62	NC_014920	GTTGA	2	10	98903	98912	20 %	40 %	40 %	0 %	319896510
63	NC_014920	AAATA	2	10	99782	99791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014920	CGTTT	2	10	101886	101895	0 %	60 %	20 %	20 %	319896514
65	NC_014920	AGTTT	2	10	104627	104636	20 %	60 %	20 %	0 %	319896518
66	NC_014920	CTGCT	2	10	105487	105496	0 %	40 %	20 %	40 %	319896519
67	NC_014920	CACTG	2	10	105795	105804	20 %	20 %	20 %	40 %	319896519
68	NC_014920	ACTTC	2	10	105999	106008	20 %	40 %	0 %	40 %	319896519
69	NC_014920	CTAAG	2	10	106432	106441	40 %	20 %	20 %	20 %	319896520
70	NC_014920	TGCGT	2	10	110536	110545	0 %	40 %	40 %	20 %	319896524
71	NC_014920	GTGTT	2	10	110744	110753	0 %	60 %	40 %	0 %	319896524
72	NC_014920	GTGTG	2	10	112161	112170	0 %	40 %	60 %	0 %	319896526
73	NC_014920	CTCTT	2	10	114762	114771	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
74	NC_014920	AGAAA	2	10	115664	115673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014920	AACAG	2	10	115726	115735	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014920	ATTTT	2	10	115816	115825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014920	ATTCA	2	10	116114	116123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014920	TAAAA	2	10	118362	118371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014920	AGTTA	2	10	118946	118955	40 %	40 %	20 %	0 %	319896532
80	NC_014920	ATGCC	2	10	122152	122161	20 %	20 %	20 %	40 %	319896534
81	NC_014920	GTTTT	2	10	127813	127822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_014920	GCAAA	2	10	131860	131869	60 %	0 %	20 %	20 %	319896541
83	NC_014920	TGGAT	2	10	132865	132874	20 %	40 %	40 %	0 %	319896542
84	NC_014920	TGTAA	2	10	134502	134511	40 %	40 %	20 %	0 %	319896544
85	NC_014920	GTGAT	2	10	137150	137159	20 %	40 %	40 %	0 %	319896546
86	NC_014920	TACTT	2	10	137190	137199	20 %	60 %	0 %	20 %	319896546
87	NC_014920	TTACC	2	10	138071	138080	20 %	40 %	0 %	40 %	319896546
88	NC_014920	GATTT	2	10	143934	143943	20 %	60 %	20 %	0 %	319896549
89	NC_014920	GGTTG	2	10	146880	146889	0 %	40 %	60 %	0 %	319896550
90	NC_014920	AGGCA	2	10	147038	147047	40 %	0 %	40 %	20 %	319896550
91	NC_014920	TGGCG	2	10	147731	147740	0 %	20 %	60 %	20 %	319896551
92	NC_014920	GTATT	2	10	149568	149577	20 %	60 %	20 %	0 %	319896552
93	NC_014920	GCTTT	2	10	149692	149701	0 %	60 %	20 %	20 %	319896553
94	NC_014920	AGAAA	2	10	150695	150704	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014920	CAAAA	2	10	153698	153707	80 %	0 %	0 %	20 %	319896557
96	NC_014920	AATGG	2	10	153910	153919	40 %	20 %	40 %	0 %	319896557
97	NC_014920	GTTAT	2	10	155399	155408	20 %	60 %	20 %	0 %	319896557
98	NC_014920	AAACT	2	10	156042	156051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
99	NC_014920	TAACC	2	10	158388	158397	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
100	NC_014920	CGACT	2	10	158725	158734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_014920	TCGGT	2	10	159100	159109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014920	TCGCT	2	10	159327	159336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014920	AAATT	2	10	160225	160234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_014920	AATAA	2	10	160257	160266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014920	TACAC	2	10	160466	160475	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
106	NC_014920	GCTTC	2	10	160934	160943	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
107	NC_014920	TTCAA	2	10	162188	162197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014920	GGTGC	2	10	162417	162426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
109	NC_014920	TCAAC	2	10	163681	163690	40 %	20 %	0 %	40 %	319896559
110	NC_014920	CTTGG	2	10	166265	166274	0 %	40 %	40 %	20 %	319896560
111	NC_014920	GTGAA	2	10	166398	166407	40 %	20 %	40 %	0 %	319896560
112	NC_014920	CACGC	2	10	167567	167576	20 %	0 %	20 %	60 %	319896561
113	NC_014920	CTCAT	2	10	167695	167704	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
114	NC_014920	GTTTT	2	10	172794	172803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014920	CAAAA	2	10	175797	175806	80 %	0 %	0 %	20 %	319896567
116	NC_014920	ACTAC	2	10	177653	177662	40 %	20 %	0 %	40 %	319896568
117	NC_014920	TTATT	2	10	178227	178236	20 %	80 %	0 %	0 %	319896569
118	NC_014920	TACGA	2	10	184006	184015	40 %	20 %	20 %	20 %	319896575
119	NC_014920	CTTTT	2	10	184865	184874	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
120	NC_014920	TGTCG	2	10	184993	185002	0 %	40 %	40 %	20 %	319896576
121	NC_014920	ATTTT	2	10	185325	185334	20 %	80 %	0 %	0 %	319896577
122	NC_014920	TAAAA	2	10	186079	186088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014920	TTGAT	2	10	186179	186188	20 %	60 %	20 %	0 %	319896579
124	NC_014920	ATTTT	2	10	186533	186542	20 %	80 %	0 %	0 %	319896579
125	NC_014920	TTTTC	2	10	187664	187673	0 %	80 %	0 %	20 %	319896580
126	NC_014920	TCATC	2	10	188308	188317	20 %	40 %	0 %	40 %	319896580
127	NC_014920	AAATG	2	10	188835	188844	60 %	20 %	20 %	0 %	319896580
128	NC_014920	CTAAA	2	10	190785	190794	60 %	20 %	0 %	20 %	319896581
129	NC_014920	TCCTG	2	10	190877	190886	0 %	40 %	20 %	40 %	319896581
130	NC_014920	CATCG	2	10	191474	191483	20 %	20 %	20 %	40 %	319896582
131	NC_014920	ATGTA	2	10	191891	191900	40 %	40 %	20 %	0 %	319896582
132	NC_014920	TTGAA	2	10	192567	192576	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014920	GAAAC	2	10	192807	192816	60 %	0 %	20 %	20 %	319896583
134	NC_014920	ATTAC	2	10	196579	196588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_014920	CCCCA	2	10	196982	196991	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
136	NC_014920	ATCTT	2	10	197434	197443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
137	NC_014920	GTGCG	2	10	198569	198578	0 %	20 %	60 %	20 %	319896584
138	NC_014920	TTTTA	2	10	201112	201121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014920	CTTTT	2	10	201675	201684	0 %	80 %	0 %	20 %	319896586
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142	NC_014920	ATTTT	2	10	206069	206078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_014920	ATCTT	2	10	356920	356929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
265	NC_014920	TTTTA	2	10	357574	357583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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