MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 375

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	AATTT	2	10	1074	1083	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014920	AAAAC	2	10	21895	21904	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_014920	TTAAA	2	10	25039	25048	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014920	AACAT	2	10	31910	31919	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_014920	ATAAA	2	10	34088	34097	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014920	ATTTA	2	10	73314	73323	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014920	AAATA	2	10	99782	99791	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014920	CTCTT	2	10	114762	114771	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014920	AGAAA	2	10	115664	115673	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014920	AACAG	2	10	115726	115735	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014920	ATTTT	2	10	115816	115825	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014920	ATTCA	2	10	116114	116123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_014920	TAAAA	2	10	118362	118371	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014920	GTTTT	2	10	127813	127822	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014920	AGAAA	2	10	150695	150704	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014920	AAACT	2	10	156042	156051	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_014920	TAACC	2	10	158388	158397	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
18	NC_014920	CGACT	2	10	158725	158734	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
19	NC_014920	TCGGT	2	10	159100	159109	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014920	TCGCT	2	10	159327	159336	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014920	AAATT	2	10	160225	160234	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014920	AATAA	2	10	160257	160266	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014920	TACAC	2	10	160466	160475	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014920	GCTTC	2	10	160934	160943	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
25	NC_014920	TTCAA	2	10	162188	162197	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014920	GGTGC	2	10	162417	162426	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014920	CTCAT	2	10	167695	167704	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_014920	GTTTT	2	10	172794	172803	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014920	CTTTT	2	10	184865	184874	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014920	TAAAA	2	10	186079	186088	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014920	TTGAA	2	10	192567	192576	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014920	ATTAC	2	10	196579	196588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_014920	CCCCA	2	10	196982	196991	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
34	NC_014920	ATCTT	2	10	197434	197443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014920	TTTTA	2	10	201112	201121	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014920	AATCT	2	10	205819	205828	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014920	ATTTT	2	10	206069	206078	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014920	TTTTC	2	10	227623	227632	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_014920	TTTCT	2	10	231513	231522	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_014920	TTTAT	2	10	232371	232380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014920	AATAA	2	10	264094	264103	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014920	AATTA	2	10	264715	264724	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014920	CTAGG	2	10	265536	265545	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014920	TTATT	2	10	269950	269959	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014920	GTTTT	2	10	270872	270881	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014920	TAAAG	2	10	270936	270945	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014920	ATTTA	2	10	270954	270963	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014920	AAATG	2	10	276257	276266	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014920	TTTAA	2	10	277633	277642	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014920	AAAAT	2	10	283215	283224	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014920	TGTTT	2	10	292868	292877	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014920	AATAA	2	10	302580	302589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014920	TTTTC	2	10	303978	303987	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014920	TGGAA	2	10	310785	310794	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014920	TTTTA	2	10	325655	325664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014920	GTTTT	2	10	335027	335036	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014920	TAACC	2	10	351379	351388	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
58	NC_014920	CTTTT	2	10	351592	351601	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_014920	TATTT	2	10	352767	352776	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014920	AAAGG	2	10	353115	353124	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014920	GTGCG	2	10	355291	355300	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
62	NC_014920	ATTAA	2	10	356651	356660	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014920	ATCTT	2	10	356920	356929	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
64	NC_014920	TTTTA	2	10	357574	357583	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014920	TAAAC	2	10	357625	357634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
66	NC_014920	AAAAT	2	10	359722	359731	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014920	AACAA	2	10	365789	365798	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014920	TTTTA	2	10	368376	368385	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014920	TATTT	2	10	372341	372350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014920	TCTTT	2	10	374747	374756	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014920	CTTTT	2	10	380212	380221	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014920	ATCTT	2	10	382769	382778	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014920	TTGAA	2	10	383043	383052	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014920	AGCGA	2	10	385666	385675	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_014920	AGTCG	2	10	386268	386277	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_014920	TAGGT	2	10	386603	386612	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014920	ATTAA	2	10	388459	388468	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014920	TCAAA	2	10	420438	420447	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
79	NC_014920	TCTTT	2	10	420698	420707	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_014920	TCACT	2	10	447653	447662	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
81	NC_014920	CATCC	2	10	448237	448246	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
82	NC_014920	GGTTG	2	10	448911	448920	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014920	GCGAT	2	10	453611	453620	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_014920	GCTTT	2	10	453731	453740	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014920	TTAAC	2	10	453830	453839	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014920	TTTTC	2	10	461509	461518	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_014920	GATGA	2	10	488262	488271	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_014920	ATTTA	2	10	494927	494936	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_014920	CATAA	2	10	503081	503090	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014920	TTTAT	2	10	514887	514896	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014920	TTAAT	2	10	524265	524274	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014920	AAAAG	2	10	535970	535979	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014920	GGCTG	2	10	543922	543931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
94	NC_014920	CAATA	2	10	549785	549794	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014920	ACTTA	2	10	576540	576549	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014920	TTAAA	2	10	576556	576565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_014920	ATTTA	2	10	576956	576965	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014920	AAATA	2	10	583851	583860	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014920	TAGGA	2	10	585698	585707	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014920	CTTTG	2	10	603602	603611	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
101	NC_014920	AATTC	2	10	603735	603744	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_014920	CTTTT	2	10	604015	604024	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
103	NC_014920	GCAAA	2	10	608263	608272	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
104	NC_014920	ATTGA	2	10	609292	609301	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014920	TTAAC	2	10	612720	612729	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
106	NC_014920	ACAAT	2	10	614250	614259	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_014920	GACAG	2	10	614380	614389	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
108	NC_014920	GGTTT	2	10	617644	617653	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014920	TGCAT	2	10	618338	618347	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_014920	CTAAT	2	10	621065	621074	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_014920	GTTTT	2	10	623646	623655	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_014920	GAATT	2	10	625507	625516	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_014920	ATTCA	2	10	645114	645123	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
114	NC_014920	ATTGA	2	10	649791	649800	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
115	NC_014920	AAATT	2	10	657297	657306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_014920	ATTTT	2	10	683645	683654	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_014920	TCAAG	2	10	687910	687919	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
118	NC_014920	AGTGA	2	10	704812	704821	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
119	NC_014920	ATTTA	2	10	708866	708875	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014920	TAAGA	2	10	719921	719930	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014920	AAGTT	2	10	720094	720103	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_014920	ATTCA	2	10	722481	722490	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_014920	AAGGT	2	10	726640	726649	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014920	CTTTT	2	10	746579	746588	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_014920	AATAA	2	10	747531	747540	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014920	TTTTC	2	10	753203	753212	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
127	NC_014920	TAAAT	2	10	755912	755921	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_014920	AAGAA	2	10	758472	758481	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_014920	AATTG	2	10	759182	759191	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_014920	GAAAA	2	10	759267	759276	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
131	NC_014920	AGTTT	2	10	761578	761587	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_014920	ATTTT	2	10	761711	761720	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_014920	TTAAT	2	10	771394	771403	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014920	AAATT	2	10	781054	781063	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014920	TAAAA	2	10	789013	789022	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_014920	AAAAG	2	10	793113	793122	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_014920	TATTT	2	10	794161	794170	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_014920	TTTAT	2	10	796869	796878	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_014920	CCTAA	2	10	796916	796925	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
140	NC_014920	AAAAC	2	10	798722	798731	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_014920	AAGTC	2	10	800298	800307	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_014920	TGCTT	2	10	800821	800830	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
143	NC_014920	AAATT	2	10	806144	806153	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_014920	TAAAA	2	10	809352	809361	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_014920	ACATA	2	10	822856	822865	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_014920	ATTTA	2	10	825045	825054	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_014920	CAATA	2	10	837677	837686	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
148	NC_014920	AAAAT	2	10	852452	852461	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_014920	ATTTT	2	10	852536	852545	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_014920	ATTAA	2	10	860374	860383	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_014920	CAAGC	2	10	869701	869710	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
152	NC_014920	AAAAG	2	10	874284	874293	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
153	NC_014920	AATTT	2	10	880599	880608	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_014920	CTTTT	2	10	887790	887799	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_014920	CTTTT	2	10	888022	888031	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_014920	TTTTA	2	10	889257	889266	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_014920	GCTAT	2	10	889452	889461	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
158	NC_014920	CATTT	2	10	891141	891150	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
159	NC_014920	ACTCC	2	10	892337	892346	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
160	NC_014920	CCGCA	2	10	892517	892526	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
161	NC_014920	ATTAT	2	10	898035	898044	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_014920	CCCCG	2	10	898548	898557	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
163	NC_014920	ATACA	2	10	898750	898759	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
164	NC_014920	ACTTA	2	10	898826	898835	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
165	NC_014920	GAAAC	2	10	901368	901377	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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167	NC_014920	ATTTT	2	10	906804	906813	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_014920	GACAA	2	10	907164	907173	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
169	NC_014920	GATAA	2	10	908540	908549	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
170	NC_014920	AAATT	2	10	911567	911576	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_014920	GAAAA	2	10	911603	911612	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
172	NC_014920	TAAAA	2	10	913377	913386	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_014920	ATTTT	2	10	927392	927401	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_014920	CATTC	2	10	930120	930129	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
175	NC_014920	ATACA	2	10	938091	938100	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
176	NC_014920	TTTAC	2	10	938130	938139	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
177	NC_014920	AAAAT	2	10	960459	960468	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_014920	ATAAA	2	10	963479	963488	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_014920	TCTAA	2	10	964750	964759	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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182	NC_014920	TTTGA	2	10	971351	971360	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
183	NC_014920	AGTAA	2	10	973060	973069	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
184	NC_014920	TTGAT	2	10	975422	975431	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
185	NC_014920	ATTTT	2	10	976823	976832	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_014920	AGTAC	2	10	976861	976870	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
187	NC_014920	TATCA	2	10	986516	986525	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
188	NC_014920	CTTTT	2	10	1005649	1005658	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
189	NC_014920	TATCA	2	10	1011253	1011262	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
190	NC_014920	TACAA	2	10	1019381	1019390	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
191	NC_014920	AAATC	2	10	1034625	1034634	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
192	NC_014920	TTAAA	2	10	1037744	1037753	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014920	AATTC	2	10	1047160	1047169	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
194	NC_014920	TATAT	2	10	1047379	1047388	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_014920	ATTAT	2	10	1054113	1054122	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_014920	AAAAT	2	10	1065702	1065711	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_014920	TCTAC	2	10	1066692	1066701	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
198	NC_014920	ATTAT	2	10	1083907	1083916	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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236	NC_014920	TTAAA	2	10	1305834	1305843	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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266	NC_014920	TCTTA	2	10	1495594	1495603	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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272	NC_014920	TCGGT	2	10	1500839	1500848	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
273	NC_014920	TCGCT	2	10	1501066	1501075	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
274	NC_014920	TTCAA	2	10	1503689	1503698	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
275	NC_014920	CTTAA	2	10	1506501	1506510	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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277	NC_014920	TATGA	2	10	1531308	1531317	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_014920	TAACC	2	10	1533372	1533381	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
280	NC_014920	CGACT	2	10	1533709	1533718	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
281	NC_014920	TCGGT	2	10	1534084	1534093	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
282	NC_014920	TCGCT	2	10	1534311	1534320	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
283	NC_014920	TTCAA	2	10	1536934	1536943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
284	NC_014920	TTTTA	2	10	1538080	1538089	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_014920	TATCA	2	10	1541048	1541057	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
286	NC_014920	TAAAA	2	10	1545122	1545131	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_014920	TCAGT	2	10	1548512	1548521	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.