MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Haemophilus influenzae F3031 chromosome

Total Repeats: 1181

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014920	CGTAT	2	10	44	53	20 %	40 %	20 %	20 %	319896423
2	NC_014920	CGCAC	2	10	3258	3267	20 %	0 %	20 %	60 %	319896425
3	NC_014920	ATTCT	2	10	4317	4326	20 %	60 %	0 %	20 %	319896426
4	NC_014920	TAAAA	2	10	4768	4777	80 %	20 %	0 %	0 %	319896427
5	NC_014920	ATTTG	2	10	11745	11754	20 %	60 %	20 %	0 %	319896430
6	NC_014920	TTATT	2	10	13628	13637	20 %	80 %	0 %	0 %	319896433
7	NC_014920	CAACC	2	10	15708	15717	40 %	0 %	0 %	60 %	319896434
8	NC_014920	TTTAG	2	10	16823	16832	20 %	60 %	20 %	0 %	319896435
9	NC_014920	GTCGT	2	10	16884	16893	0 %	40 %	40 %	20 %	319896435
10	NC_014920	ATCTT	2	10	18778	18787	20 %	60 %	0 %	20 %	319896437
11	NC_014920	TCAAG	2	10	21214	21223	40 %	20 %	20 %	20 %	319896438
12	NC_014920	CCGAT	2	10	21321	21330	20 %	20 %	20 %	40 %	319896438
13	NC_014920	GAAAA	2	10	22603	22612	80 %	0 %	20 %	0 %	319896440
14	NC_014920	CACAA	2	10	24233	24242	60 %	0 %	0 %	40 %	319896441
15	NC_014920	AATAC	2	10	25656	25665	60 %	20 %	0 %	20 %	319896442
16	NC_014920	CAATT	2	10	29873	29882	40 %	40 %	0 %	20 %	319896445
17	NC_014920	CTTTT	2	10	33915	33924	0 %	80 %	0 %	20 %	319896450
18	NC_014920	AAAAT	2	10	36561	36570	80 %	20 %	0 %	0 %	319896453
19	NC_014920	TAAAC	2	10	37620	37629	60 %	20 %	0 %	20 %	319896454
20	NC_014920	CAATC	2	10	39928	39937	40 %	20 %	0 %	40 %	319896456
21	NC_014920	AAGAA	2	10	40609	40618	80 %	0 %	20 %	0 %	319896457
22	NC_014920	TTACC	2	10	43373	43382	20 %	40 %	0 %	40 %	319896458
23	NC_014920	TGGTA	2	10	44924	44933	20 %	40 %	40 %	0 %	319896459
24	NC_014920	CCCCT	2	10	45206	45215	0 %	20 %	0 %	80 %	319896460
25	NC_014920	AATGC	2	10	47625	47634	40 %	20 %	20 %	20 %	319896463
26	NC_014920	ATTTT	2	10	49111	49120	20 %	80 %	0 %	0 %	319896465
27	NC_014920	GCCAA	2	10	49951	49960	40 %	0 %	20 %	40 %	319896465
28	NC_014920	TTCCA	2	10	50567	50576	20 %	40 %	0 %	40 %	319896466
29	NC_014920	AATCA	2	10	52669	52678	60 %	20 %	0 %	20 %	319896469
30	NC_014920	AATGC	2	10	53287	53296	40 %	20 %	20 %	20 %	319896470
31	NC_014920	CCTGC	2	10	53353	53362	0 %	20 %	20 %	60 %	319896470
32	NC_014920	TTGCC	2	10	58482	58491	0 %	40 %	20 %	40 %	319896473
33	NC_014920	TAAAT	2	10	59711	59720	60 %	40 %	0 %	0 %	319896474
34	NC_014920	AATCC	2	10	60348	60357	40 %	20 %	0 %	40 %	319896474
35	NC_014920	ATTTT	2	10	64442	64451	20 %	80 %	0 %	0 %	319896479
36	NC_014920	TGAAA	2	10	69523	69532	60 %	20 %	20 %	0 %	319896482
37	NC_014920	ATGTT	2	10	71380	71389	20 %	60 %	20 %	0 %	319896482
38	NC_014920	TGCAG	2	10	72570	72579	20 %	20 %	40 %	20 %	319896483
39	NC_014920	AGGTA	2	10	73508	73517	40 %	20 %	40 %	0 %	319896484
40	NC_014920	CAACG	2	10	76427	76436	40 %	0 %	20 %	40 %	319896488
41	NC_014920	AGAAA	2	10	77787	77796	80 %	0 %	20 %	0 %	319896488
42	NC_014920	GAAGA	2	10	78141	78150	60 %	0 %	40 %	0 %	319896488
43	NC_014920	ACATC	2	10	80255	80264	40 %	20 %	0 %	40 %	319896490
44	NC_014920	TTACA	2	10	80791	80800	40 %	40 %	0 %	20 %	319896491
45	NC_014920	TGATT	2	10	81581	81590	20 %	60 %	20 %	0 %	319896492
46	NC_014920	AATTT	2	10	81739	81748	40 %	60 %	0 %	0 %	319896492
47	NC_014920	CACAT	2	10	84878	84887	40 %	20 %	0 %	40 %	319896496
48	NC_014920	CCAAT	2	10	88151	88160	40 %	20 %	0 %	40 %	319896498
49	NC_014920	CCTCT	2	10	91096	91105	0 %	40 %	0 %	60 %	319896504
50	NC_014920	CTTAC	2	10	91245	91254	20 %	40 %	0 %	40 %	319896504
51	NC_014920	ACTGT	2	10	93679	93688	20 %	40 %	20 %	20 %	319896504
52	NC_014920	ATTTT	2	10	94290	94299	20 %	80 %	0 %	0 %	319896505
53	NC_014920	GGTGA	2	10	94910	94919	20 %	20 %	60 %	0 %	319896506
54	NC_014920	GCTTC	2	10	97413	97422	0 %	40 %	20 %	40 %	319896508
55	NC_014920	CGCTG	2	10	97664	97673	0 %	20 %	40 %	40 %	319896508
56	NC_014920	GTTGA	2	10	98903	98912	20 %	40 %	40 %	0 %	319896510
57	NC_014920	CGTTT	2	10	101886	101895	0 %	60 %	20 %	20 %	319896514
58	NC_014920	AGTTT	2	10	104627	104636	20 %	60 %	20 %	0 %	319896518
59	NC_014920	CTGCT	2	10	105487	105496	0 %	40 %	20 %	40 %	319896519
60	NC_014920	CACTG	2	10	105795	105804	20 %	20 %	20 %	40 %	319896519
61	NC_014920	ACTTC	2	10	105999	106008	20 %	40 %	0 %	40 %	319896519
62	NC_014920	CTAAG	2	10	106432	106441	40 %	20 %	20 %	20 %	319896520
63	NC_014920	TGCGT	2	10	110536	110545	0 %	40 %	40 %	20 %	319896524
64	NC_014920	GTGTT	2	10	110744	110753	0 %	60 %	40 %	0 %	319896524
65	NC_014920	GTGTG	2	10	112161	112170	0 %	40 %	60 %	0 %	319896526
66	NC_014920	AGTTA	2	10	118946	118955	40 %	40 %	20 %	0 %	319896532
67	NC_014920	ATGCC	2	10	122152	122161	20 %	20 %	20 %	40 %	319896534
68	NC_014920	GCAAA	2	10	131860	131869	60 %	0 %	20 %	20 %	319896541
69	NC_014920	TGGAT	2	10	132865	132874	20 %	40 %	40 %	0 %	319896542
70	NC_014920	TGTAA	2	10	134502	134511	40 %	40 %	20 %	0 %	319896544
71	NC_014920	GTGAT	2	10	137150	137159	20 %	40 %	40 %	0 %	319896546
72	NC_014920	TACTT	2	10	137190	137199	20 %	60 %	0 %	20 %	319896546
73	NC_014920	TTACC	2	10	138071	138080	20 %	40 %	0 %	40 %	319896546
74	NC_014920	GATTT	2	10	143934	143943	20 %	60 %	20 %	0 %	319896549
75	NC_014920	GGTTG	2	10	146880	146889	0 %	40 %	60 %	0 %	319896550
76	NC_014920	AGGCA	2	10	147038	147047	40 %	0 %	40 %	20 %	319896550
77	NC_014920	TGGCG	2	10	147731	147740	0 %	20 %	60 %	20 %	319896551
78	NC_014920	GTATT	2	10	149568	149577	20 %	60 %	20 %	0 %	319896552
79	NC_014920	GCTTT	2	10	149692	149701	0 %	60 %	20 %	20 %	319896553
80	NC_014920	CAAAA	2	10	153698	153707	80 %	0 %	0 %	20 %	319896557
81	NC_014920	AATGG	2	10	153910	153919	40 %	20 %	40 %	0 %	319896557
82	NC_014920	GTTAT	2	10	155399	155408	20 %	60 %	20 %	0 %	319896557
83	NC_014920	TCAAC	2	10	163681	163690	40 %	20 %	0 %	40 %	319896559
84	NC_014920	CTTGG	2	10	166265	166274	0 %	40 %	40 %	20 %	319896560
85	NC_014920	GTGAA	2	10	166398	166407	40 %	20 %	40 %	0 %	319896560
86	NC_014920	CACGC	2	10	167567	167576	20 %	0 %	20 %	60 %	319896561
87	NC_014920	CAAAA	2	10	175797	175806	80 %	0 %	0 %	20 %	319896567
88	NC_014920	ACTAC	2	10	177653	177662	40 %	20 %	0 %	40 %	319896568
89	NC_014920	TTATT	2	10	178227	178236	20 %	80 %	0 %	0 %	319896569
90	NC_014920	TACGA	2	10	184006	184015	40 %	20 %	20 %	20 %	319896575
91	NC_014920	TGTCG	2	10	184993	185002	0 %	40 %	40 %	20 %	319896576
92	NC_014920	ATTTT	2	10	185325	185334	20 %	80 %	0 %	0 %	319896577
93	NC_014920	TTGAT	2	10	186179	186188	20 %	60 %	20 %	0 %	319896579
94	NC_014920	ATTTT	2	10	186533	186542	20 %	80 %	0 %	0 %	319896579
95	NC_014920	TTTTC	2	10	187664	187673	0 %	80 %	0 %	20 %	319896580
96	NC_014920	TCATC	2	10	188308	188317	20 %	40 %	0 %	40 %	319896580
97	NC_014920	AAATG	2	10	188835	188844	60 %	20 %	20 %	0 %	319896580
98	NC_014920	CTAAA	2	10	190785	190794	60 %	20 %	0 %	20 %	319896581
99	NC_014920	TCCTG	2	10	190877	190886	0 %	40 %	20 %	40 %	319896581
100	NC_014920	CATCG	2	10	191474	191483	20 %	20 %	20 %	40 %	319896582
101	NC_014920	ATGTA	2	10	191891	191900	40 %	40 %	20 %	0 %	319896582
102	NC_014920	GAAAC	2	10	192807	192816	60 %	0 %	20 %	20 %	319896583
103	NC_014920	GTGCG	2	10	198569	198578	0 %	20 %	60 %	20 %	319896584
104	NC_014920	CTTTT	2	10	201675	201684	0 %	80 %	0 %	20 %	319896586
105	NC_014920	AAATA	2	10	205101	205110	80 %	20 %	0 %	0 %	319896591
106	NC_014920	TGAAG	2	10	207070	207079	40 %	20 %	40 %	0 %	319896593
107	NC_014920	TTGGC	2	10	207787	207796	0 %	40 %	40 %	20 %	319896594
108	NC_014920	ACGCA	2	10	208688	208697	40 %	0 %	20 %	40 %	319896595
109	NC_014920	ATCAA	2	10	211106	211115	60 %	20 %	0 %	20 %	319896597
110	NC_014920	GAAAT	2	10	211802	211811	60 %	20 %	20 %	0 %	319896597
111	NC_014920	GTTTA	2	10	212424	212433	20 %	60 %	20 %	0 %	319896597
112	NC_014920	GCGAA	2	10	213197	213206	40 %	0 %	40 %	20 %	319896598
113	NC_014920	TAAAT	2	10	214274	214283	60 %	40 %	0 %	0 %	319896599
114	NC_014920	AAGGT	2	10	214774	214783	40 %	20 %	40 %	0 %	319896599
115	NC_014920	AAAGG	2	10	215508	215517	60 %	0 %	40 %	0 %	319896599
116	NC_014920	TCAAT	2	10	218809	218818	40 %	40 %	0 %	20 %	319896602
117	NC_014920	AAAAG	2	10	219430	219439	80 %	0 %	20 %	0 %	319896602
118	NC_014920	TTCGT	2	10	221261	221270	0 %	60 %	20 %	20 %	319896604
119	NC_014920	CCATT	2	10	226746	226755	20 %	40 %	0 %	40 %	319896609
120	NC_014920	TTTGA	2	10	228704	228713	20 %	60 %	20 %	0 %	319896610
121	NC_014920	TTGGC	2	10	230492	230501	0 %	40 %	40 %	20 %	319896612
122	NC_014920	GGTTA	2	10	231736	231745	20 %	40 %	40 %	0 %	319896614
123	NC_014920	ACGCC	2	10	233321	233330	20 %	0 %	20 %	60 %	319896615
124	NC_014920	GTACC	2	10	233427	233436	20 %	20 %	20 %	40 %	319896615
125	NC_014920	GTTTG	2	10	235615	235624	0 %	60 %	40 %	0 %	319896617
126	NC_014920	ACTGC	2	10	237530	237539	20 %	20 %	20 %	40 %	319896618
127	NC_014920	ATGCC	2	10	242852	242861	20 %	20 %	20 %	40 %	319896622
128	NC_014920	AATGG	2	10	245203	245212	40 %	20 %	40 %	0 %	319896623
129	NC_014920	TTTAC	2	10	245970	245979	20 %	60 %	0 %	20 %	319896624
130	NC_014920	TTTAC	2	10	246251	246260	20 %	60 %	0 %	20 %	319896625
131	NC_014920	ACAAA	2	10	246491	246500	80 %	0 %	0 %	20 %	319896626
132	NC_014920	GCAAA	2	10	251902	251911	60 %	0 %	20 %	20 %	319896631
133	NC_014920	TTATT	2	10	254714	254723	20 %	80 %	0 %	0 %	319896635
134	NC_014920	AAGGT	2	10	256042	256051	40 %	20 %	40 %	0 %	319896635
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258	NC_014920	TCATT	2	10	468728	468737	20 %	60 %	0 %	20 %	319896854
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260	NC_014920	GTTTA	2	10	468876	468885	20 %	60 %	20 %	0 %	319896854
261	NC_014920	TTTTG	2	10	469018	469027	0 %	80 %	20 %	0 %	319896854
262	NC_014920	TAAAA	2	10	469035	469044	80 %	20 %	0 %	0 %	319896854
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