MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 plasmid pMESCI01

Total Repeats: 150

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014918	CGGCGT	2	12	5519	5530	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319777795
2	NC_014918	GCTTCG	2	12	7470	7481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319777796
3	NC_014918	CCATCA	2	12	9976	9987	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319777800
4	NC_014918	TCGGCC	2	12	13631	13642	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319777803
5	NC_014918	CACCGC	2	12	14343	14354	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319777804
6	NC_014918	TTGGTG	2	12	23077	23088	0 %	50 %	50 %	0 %	319777811
7	NC_014918	CATTAC	2	12	24034	24045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319777812
8	NC_014918	CGCTGC	2	12	25910	25921	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319777814
9	NC_014918	GTCGCC	2	12	26353	26364	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319777814
10	NC_014918	TCGCTA	2	12	28046	28057	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319777815
11	NC_014918	GAACTG	2	12	28402	28413	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319777815
12	NC_014918	ATTGTC	2	12	32566	32577	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319777820
13	NC_014918	GACGGC	2	12	35007	35018	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319777824
14	NC_014918	CCATCG	2	12	35057	35068	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319777824
15	NC_014918	GCCCAT	2	12	36660	36671	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319777825
16	NC_014918	ATCGTC	2	12	38026	38037	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319777826
17	NC_014918	TCAGTT	2	12	40589	40600	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319777829
18	NC_014918	CGCCTC	2	12	41609	41620	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319777830
19	NC_014918	GTCGGC	2	12	46512	46523	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319777837
20	NC_014918	CATCGA	2	12	51408	51419	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319777842
21	NC_014918	ATGAAC	2	12	52763	52774	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319777842
22	NC_014918	GCATCG	2	12	54540	54551	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319777844
23	NC_014918	GCGGCC	2	12	64001	64012	0 %	0 %	50 %	50 %	319777852
24	NC_014918	GTTGAA	2	12	82772	82783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319777871
25	NC_014918	TGACGC	2	12	88385	88396	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319777875
26	NC_014918	GGCCTT	2	12	94400	94411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319777882
27	NC_014918	GACAAC	2	12	120698	120709	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319777910
28	NC_014918	TGGCGA	2	12	122759	122770	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319777913
29	NC_014918	TGGTCC	2	12	125639	125650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319777915
30	NC_014918	GGATGA	2	12	127592	127603	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	319777918
31	NC_014918	GATGGC	2	12	130624	130635	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319777923
32	NC_014918	ATGCCT	2	12	132429	132440	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319777926
33	NC_014918	CGAGGC	2	12	139226	139237	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319777933
34	NC_014918	GCGCCG	2	12	141334	141345	0 %	0 %	50 %	50 %	319777935
35	NC_014918	GAAGGC	2	12	145276	145287	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319777939
36	NC_014918	TGCCGG	2	12	147284	147295	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319777942
37	NC_014918	GATGTT	2	12	147954	147965	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	319777942
38	NC_014918	GGCATA	2	12	152266	152277	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319777946
39	NC_014918	GCCCAG	2	12	162037	162048	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319777956
40	NC_014918	GGCCAG	2	12	165683	165694	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319777960
41	NC_014918	CGAAGA	2	12	166538	166549	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319777961
42	NC_014918	GCCAAG	2	12	166803	166814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319777961
43	NC_014918	TCTATC	2	12	168408	168419	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319777962
44	NC_014918	GGCGCG	2	12	169314	169325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319777964
45	NC_014918	GGCGGG	2	12	169581	169592	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	319777964
46	NC_014918	CTGCGG	2	12	170582	170593	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319777965
47	NC_014918	TCGACT	2	12	172267	172278	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319777967
48	NC_014918	ATGCGC	2	12	174442	174453	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319777969
49	NC_014918	CGGCAT	2	12	181236	181247	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319777976
50	NC_014918	GCTTTG	2	12	184787	184798	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319777981
51	NC_014918	CCTGCT	2	12	190297	190308	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319777986
52	NC_014918	GAACAG	2	12	192337	192348	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319777987
53	NC_014918	GGCCGA	2	12	192482	192493	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319777988
54	NC_014918	ACCGGC	2	12	192990	193001	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319777988
55	NC_014918	GATGGC	2	12	194974	194985	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319777989
56	NC_014918	CGCTGG	2	12	195213	195224	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319777990
57	NC_014918	TCTCCG	2	12	199381	199392	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319777996
58	NC_014918	CCAGCG	2	12	208031	208042	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778004
59	NC_014918	GGCTGG	2	12	210282	210293	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319778006
60	NC_014918	GCGGTG	2	12	212403	212414	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319778008
61	NC_014918	GGCCTC	2	12	212607	212618	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319778008
62	NC_014918	CCAGCG	2	12	214270	214281	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778009
63	NC_014918	TCGCCG	2	12	214552	214563	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319778010
64	NC_014918	GCGCCG	2	12	214935	214946	0 %	0 %	50 %	50 %	319778010
65	NC_014918	CGGCCA	2	12	215223	215234	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778011
66	NC_014918	GGCGCT	2	12	219078	219089	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778013
67	NC_014918	CCAAGG	2	12	220276	220287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319778014
68	NC_014918	CGGCAG	2	12	220528	220539	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319778015
69	NC_014918	GCCGCT	2	12	220912	220923	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319778015
70	NC_014918	TCGCCA	2	12	221701	221712	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319778016
71	NC_014918	TTGCCG	2	12	225012	225023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778019
72	NC_014918	GACAAG	2	12	227712	227723	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	319778021
73	NC_014918	AGGTCG	2	12	228355	228366	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319778022
74	NC_014918	TCGAGA	2	12	228673	228684	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319778022
75	NC_014918	GGTGCC	2	12	228864	228875	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778022
76	NC_014918	GCCTGA	2	12	229772	229783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778023
77	NC_014918	CAAAGC	2	12	240411	240422	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319778031
78	NC_014918	TCGATT	2	12	247514	247525	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319778042
79	NC_014918	AAGGCC	2	12	257499	257510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319778050
80	NC_014918	CCAGTT	2	12	266328	266339	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319778058
81	NC_014918	CGCGCA	2	12	268308	268319	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778060
82	NC_014918	GTGCCG	2	12	268796	268807	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778060
83	NC_014918	GCCTTG	2	12	268846	268857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778060
84	NC_014918	TACACC	2	12	270907	270918	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319778062
85	NC_014918	GCCGGA	2	12	277776	277787	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319778067
86	NC_014918	TTGCTG	2	12	277892	277903	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319778067
87	NC_014918	GGCAAG	2	12	278084	278095	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319778068
88	NC_014918	TCGTGC	2	12	280840	280851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778069
89	NC_014918	CCGGAC	2	12	282282	282293	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778070
90	NC_014918	GCTCGA	2	12	285622	285633	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778072
91	NC_014918	CTTTCG	2	12	287169	287180	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	319778073
92	NC_014918	CGACCT	2	12	291689	291700	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319778075
93	NC_014918	CCTGCA	2	12	291890	291901	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319778075
94	NC_014918	TCGAGG	2	12	294070	294081	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319778077
95	NC_014918	TACCAT	2	12	294140	294151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319778077
96	NC_014918	ATCCGC	2	12	299129	299140	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319778080
97	NC_014918	GTAGAT	2	12	303030	303041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319778083
98	NC_014918	GCTGCG	2	12	304762	304773	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778084
99	NC_014918	ACCAGC	2	12	305083	305094	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319778084
100	NC_014918	GAGCCT	2	12	306748	306759	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778086
101	NC_014918	CTGCAG	2	12	307497	307508	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778086
102	NC_014918	CGATCG	2	12	315695	315706	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778089
103	NC_014918	CTCCAA	2	12	318572	318583	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	319778093
104	NC_014918	GGCTTC	2	12	319591	319602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778095
105	NC_014918	GCCGCG	2	12	323852	323863	0 %	0 %	50 %	50 %	319778098
106	NC_014918	AACGTC	2	12	331848	331859	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319778104
107	NC_014918	GCCGGC	2	12	332937	332948	0 %	0 %	50 %	50 %	319778104
108	NC_014918	TTTCGA	2	12	333656	333667	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319778105
109	NC_014918	CGCGAG	2	12	335807	335818	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319778107
110	NC_014918	GCTTTG	2	12	341171	341182	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	319778111
111	NC_014918	CCCGCA	2	12	341473	341484	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319778112
112	NC_014918	GCTCGC	2	12	343813	343824	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319778113
113	NC_014918	ATTGAT	2	12	345446	345457	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	319778115
114	NC_014918	TGGCGG	2	12	345484	345495	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319778115
115	NC_014918	CATCGA	2	12	347116	347127	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319778115
116	NC_014918	CGACGC	2	12	351745	351756	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778118
117	NC_014918	CCGGCG	2	12	357565	357576	0 %	0 %	50 %	50 %	319778123
118	NC_014918	TGCCGA	2	12	357875	357886	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778123
119	NC_014918	TCGATC	2	12	362673	362684	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319778127
120	NC_014918	GAATAC	2	12	362852	362863	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319778127
121	NC_014918	GTCGGC	2	12	364768	364779	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778129
122	NC_014918	GGTCGC	2	12	369433	369444	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778134
123	NC_014918	GCTCTC	2	12	372807	372818	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319778137
124	NC_014918	GGCGCG	2	12	373381	373392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	319778137
125	NC_014918	GGCACG	2	12	373450	373461	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319778137
126	NC_014918	CAGTGA	2	12	374228	374239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	319778137
127	NC_014918	CCGGCG	2	12	374321	374332	0 %	0 %	50 %	50 %	319778137
128	NC_014918	CGGCAC	2	12	374928	374939	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778137
129	NC_014918	CCGGCG	2	12	374999	375010	0 %	0 %	50 %	50 %	319778137
130	NC_014918	GTGACG	2	12	375058	375069	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319778137
131	NC_014918	CCGGGT	2	12	378968	378979	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778140
132	NC_014918	CAACAC	2	12	382489	382500	50 %	0 %	0 %	50 %	319778142
133	NC_014918	GATTTC	2	12	385110	385121	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	319778144
134	NC_014918	GTCATC	2	12	386304	386315	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	319778144
135	NC_014918	GACCAA	2	12	386726	386737	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319778144
136	NC_014918	TGATGC	2	12	386820	386831	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319778144
137	NC_014918	CGCTTG	2	12	387156	387167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	319778145
138	NC_014918	CGGCGC	2	12	389168	389179	0 %	0 %	50 %	50 %	319778147
139	NC_014918	ATCGCG	2	12	389763	389774	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778148
140	NC_014918	GCCGCA	2	12	390323	390334	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319778148
141	NC_014918	GGGCAG	2	12	393542	393553	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	319778151
142	NC_014918	TCGACC	2	12	394961	394972	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319778153
143	NC_014918	GGGGCA	2	12	398633	398644	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	319778156
144	NC_014918	GATCGC	2	12	404773	404784	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778160
145	NC_014918	CATGGC	2	12	412339	412350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319778166
146	NC_014918	CGAACT	2	12	418081	418092	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	319778174
147	NC_014918	CCGCTC	2	12	418438	418449	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319778175
148	NC_014918	GCGCTC	2	12	422006	422017	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319778179
149	NC_014918	GGCATG	2	12	424133	424144	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	319778182
150	NC_014918	TCGGCG	2	12	425280	425291	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319778183

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.