MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 plasmid pMESCI01

Total Repeats: 351

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014918	CGAGG	2	10	95	104	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014918	CTGAC	2	10	2881	2890	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014918	CCAGA	2	10	5033	5042	40 %	0 %	20 %	40 %	319777794
4	NC_014918	TAGCC	2	10	5162	5171	20 %	20 %	20 %	40 %	319777794
5	NC_014918	TGCGC	2	10	6039	6048	0 %	20 %	40 %	40 %	319777796
6	NC_014918	GCGGG	2	10	7578	7587	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7	NC_014918	CGGCC	2	10	10145	10154	0 %	0 %	40 %	60 %	319777800
8	NC_014918	AGCCC	2	10	11175	11184	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9	NC_014918	GGTGA	2	10	11579	11588	20 %	20 %	60 %	0 %	319777801
10	NC_014918	TGCCT	2	10	12457	12466	0 %	40 %	20 %	40 %	319777802
11	NC_014918	ACCAG	2	10	13313	13322	40 %	0 %	20 %	40 %	319777803
12	NC_014918	CGGAT	2	10	13367	13376	20 %	20 %	40 %	20 %	319777803
13	NC_014918	TGGCG	2	10	15351	15360	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014918	GGCAC	2	10	15418	15427	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
15	NC_014918	GGGCC	2	10	17512	17521	0 %	0 %	60 %	40 %	319777806
16	NC_014918	CGGCC	2	10	18101	18110	0 %	0 %	40 %	60 %	319777807
17	NC_014918	TAAAC	2	10	23628	23637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014918	GTGCA	2	10	24137	24146	20 %	20 %	40 %	20 %	319777812
19	NC_014918	CGAAC	2	10	27180	27189	40 %	0 %	20 %	40 %	319777814
20	NC_014918	CAGCG	2	10	30973	30982	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_014918	GCACG	2	10	32043	32052	20 %	0 %	40 %	40 %	319777820
22	NC_014918	GCCGG	2	10	33243	33252	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014918	TGCCG	2	10	34258	34267	0 %	20 %	40 %	40 %	319777823
24	NC_014918	CCGGC	2	10	35814	35823	0 %	0 %	40 %	60 %	319777824
25	NC_014918	GGCGA	2	10	36143	36152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014918	ACTGA	2	10	36435	36444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
27	NC_014918	GGCAA	2	10	37707	37716	40 %	0 %	40 %	20 %	319777826
28	NC_014918	CAGCG	2	10	38016	38025	20 %	0 %	40 %	40 %	319777826
29	NC_014918	GATTT	2	10	38604	38613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014918	GCAGA	2	10	39183	39192	40 %	0 %	40 %	20 %	319777828
31	NC_014918	TGCAA	2	10	39541	39550	40 %	20 %	20 %	20 %	319777828
32	NC_014918	CATCG	2	10	40452	40461	20 %	20 %	20 %	40 %	319777829
33	NC_014918	TGATC	2	10	40658	40667	20 %	40 %	20 %	20 %	319777829
34	NC_014918	CCCTG	2	10	41318	41327	0 %	20 %	20 %	60 %	319777830
35	NC_014918	TGGAC	2	10	42854	42863	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
36	NC_014918	CCCGA	2	10	47350	47359	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
37	NC_014918	ATCCT	2	10	48267	48276	20 %	40 %	0 %	40 %	319777839
38	NC_014918	CGTGG	2	10	49303	49312	0 %	20 %	60 %	20 %	319777840
39	NC_014918	GGCGA	2	10	49706	49715	20 %	0 %	60 %	20 %	319777841
40	NC_014918	CGCGG	2	10	50880	50889	0 %	0 %	60 %	40 %	319777842
41	NC_014918	GAAGT	2	10	52129	52138	40 %	20 %	40 %	0 %	319777842
42	NC_014918	CCATC	2	10	53330	53339	20 %	20 %	0 %	60 %	319777843
43	NC_014918	GGAAC	2	10	56418	56427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
44	NC_014918	TCCGG	2	10	56892	56901	0 %	20 %	40 %	40 %	319777846
45	NC_014918	CAACC	2	10	60344	60353	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_014918	GCCTG	2	10	60428	60437	0 %	20 %	40 %	40 %	319777850
47	NC_014918	GATCG	2	10	61069	61078	20 %	20 %	40 %	20 %	319777850
48	NC_014918	TCCGA	2	10	61198	61207	20 %	20 %	20 %	40 %	319777850
49	NC_014918	AGCAC	2	10	62155	62164	40 %	0 %	20 %	40 %	319777851
50	NC_014918	CAGGG	2	10	64833	64842	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
51	NC_014918	AACTT	2	10	65649	65658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_014918	GAAGC	2	10	65885	65894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_014918	TGAGG	2	10	67822	67831	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014918	GCCTT	2	10	67868	67877	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
55	NC_014918	CCATC	2	10	70875	70884	20 %	20 %	0 %	60 %	319777859
56	NC_014918	CTCTC	2	10	71651	71660	0 %	40 %	0 %	60 %	319777860
57	NC_014918	GACGC	2	10	72408	72417	20 %	0 %	40 %	40 %	319777861
58	NC_014918	GCCTG	2	10	73193	73202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014918	CCGGG	2	10	77630	77639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
60	NC_014918	GAGCG	2	10	78006	78015	20 %	0 %	60 %	20 %	319777866
61	NC_014918	TGGAA	2	10	79978	79987	40 %	20 %	40 %	0 %	319777867
62	NC_014918	ATTCA	2	10	80645	80654	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014918	CGTTC	2	10	83215	83224	0 %	40 %	20 %	40 %	319777872
64	NC_014918	ACCAG	2	10	87320	87329	40 %	0 %	20 %	40 %	319777875
65	NC_014918	GGGCC	2	10	88439	88448	0 %	0 %	60 %	40 %	319777875
66	NC_014918	CGTGG	2	10	89074	89083	0 %	20 %	60 %	20 %	319777876
67	NC_014918	CTGTT	2	10	89431	89440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014918	GGCGC	2	10	90029	90038	0 %	0 %	60 %	40 %	319777877
69	NC_014918	GCTCC	2	10	90683	90692	0 %	20 %	20 %	60 %	319777877
70	NC_014918	GCCAC	2	10	91400	91409	20 %	0 %	20 %	60 %	319777878
71	NC_014918	CGCGC	2	10	91490	91499	0 %	0 %	40 %	60 %	319777878
72	NC_014918	TTTCC	2	10	91899	91908	0 %	60 %	0 %	40 %	319777879
73	NC_014918	TTTCC	2	10	92057	92066	0 %	60 %	0 %	40 %	319777879
74	NC_014918	ATGAA	2	10	95551	95560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_014918	GCCTG	2	10	96493	96502	0 %	20 %	40 %	40 %	319777885
76	NC_014918	CTTCG	2	10	97533	97542	0 %	40 %	20 %	40 %	319777887
77	NC_014918	CATCA	2	10	99302	99311	40 %	20 %	0 %	40 %	319777888
78	NC_014918	GCTCG	2	10	99777	99786	0 %	20 %	40 %	40 %	319777888
79	NC_014918	GAGCC	2	10	102261	102270	20 %	0 %	40 %	40 %	319777890
80	NC_014918	GCGCC	2	10	103074	103083	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
81	NC_014918	TCCCG	2	10	103769	103778	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
82	NC_014918	TGGCG	2	10	106098	106107	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014918	TCCGC	2	10	109808	109817	0 %	20 %	20 %	60 %	319777898
84	NC_014918	GACGG	2	10	112392	112401	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_014918	GACGA	2	10	112707	112716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_014918	GACCA	2	10	114331	114340	40 %	0 %	20 %	40 %	319777904
87	NC_014918	GGCCC	2	10	115619	115628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
88	NC_014918	CGCTG	2	10	115884	115893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_014918	AGGCA	2	10	117492	117501	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_014918	GGGGA	2	10	117625	117634	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014918	AGGTC	2	10	118031	118040	20 %	20 %	40 %	20 %	319777907
92	NC_014918	TCACC	2	10	118394	118403	20 %	20 %	0 %	60 %	319777907
93	NC_014918	GCACC	2	10	119209	119218	20 %	0 %	20 %	60 %	319777908
94	NC_014918	AGGCG	2	10	120819	120828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_014918	CGGGA	2	10	123009	123018	20 %	0 %	60 %	20 %	319777914
96	NC_014918	CCGCC	2	10	123117	123126	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
97	NC_014918	GGCAT	2	10	123908	123917	20 %	20 %	40 %	20 %	319777915
98	NC_014918	CGGCA	2	10	124543	124552	20 %	0 %	40 %	40 %	319777915
99	NC_014918	CCGGA	2	10	124967	124976	20 %	0 %	40 %	40 %	319777915
100	NC_014918	CGTGA	2	10	126317	126326	20 %	20 %	40 %	20 %	319777915
101	NC_014918	GATGC	2	10	127446	127455	20 %	20 %	40 %	20 %	319777918
102	NC_014918	GGCCG	2	10	131063	131072	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
103	NC_014918	GGCGG	2	10	132977	132986	0 %	0 %	80 %	20 %	319777926
104	NC_014918	TCGCG	2	10	134056	134065	0 %	20 %	40 %	40 %	319777927
105	NC_014918	GCCTT	2	10	135013	135022	0 %	40 %	20 %	40 %	319777928
106	NC_014918	CGGCG	2	10	135124	135133	0 %	0 %	60 %	40 %	319777928
107	NC_014918	GTGAA	2	10	135722	135731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_014918	AGCGC	2	10	138391	138400	20 %	0 %	40 %	40 %	319777931
109	NC_014918	GGGAG	2	10	139328	139337	20 %	0 %	80 %	0 %	319777933
110	NC_014918	TGGCT	2	10	139414	139423	0 %	40 %	40 %	20 %	319777933
111	NC_014918	ATCCG	2	10	140006	140015	20 %	20 %	20 %	40 %	319777933
112	NC_014918	ATGGC	2	10	140170	140179	20 %	20 %	40 %	20 %	319777934
113	NC_014918	ATTGC	2	10	141614	141623	20 %	40 %	20 %	20 %	319777936
114	NC_014918	AGCCT	2	10	141725	141734	20 %	20 %	20 %	40 %	319777937
115	NC_014918	GGCGC	2	10	142386	142395	0 %	0 %	60 %	40 %	319777938
116	NC_014918	GCCAG	2	10	145194	145203	20 %	0 %	40 %	40 %	319777939
117	NC_014918	TTGCG	2	10	145375	145384	0 %	40 %	40 %	20 %	319777940
118	NC_014918	CGTGG	2	10	145506	145515	0 %	20 %	60 %	20 %	319777940
119	NC_014918	TGGCA	2	10	145586	145595	20 %	20 %	40 %	20 %	319777940
120	NC_014918	ACGTC	2	10	146296	146305	20 %	20 %	20 %	40 %	319777941
121	NC_014918	CTTGC	2	10	147456	147465	0 %	40 %	20 %	40 %	319777942
122	NC_014918	CCGTG	2	10	147638	147647	0 %	20 %	40 %	40 %	319777942
123	NC_014918	CGGGC	2	10	150703	150712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
124	NC_014918	CGATG	2	10	151812	151821	20 %	20 %	40 %	20 %	319777946
125	NC_014918	CGCCC	2	10	151960	151969	0 %	0 %	20 %	80 %	319777946
126	NC_014918	ATCCA	2	10	152959	152968	40 %	20 %	0 %	40 %	319777946
127	NC_014918	CCGAA	2	10	153744	153753	40 %	0 %	20 %	40 %	319777947
128	NC_014918	GAGCC	2	10	155298	155307	20 %	0 %	40 %	40 %	319777948
129	NC_014918	CGGCG	2	10	156400	156409	0 %	0 %	60 %	40 %	319777950
130	NC_014918	TGGTC	2	10	156668	156677	0 %	40 %	40 %	20 %	319777950
131	NC_014918	TGTCG	2	10	156710	156719	0 %	40 %	40 %	20 %	319777950
132	NC_014918	AGCGG	2	10	158172	158181	20 %	0 %	60 %	20 %	319777951
133	NC_014918	GTAGC	2	10	158448	158457	20 %	20 %	40 %	20 %	319777952
134	NC_014918	TCGGT	2	10	159769	159778	0 %	40 %	40 %	20 %	319777953
135	NC_014918	GCGAG	2	10	161635	161644	20 %	0 %	60 %	20 %	319777955
136	NC_014918	GCGCG	2	10	163727	163736	0 %	0 %	60 %	40 %	319777957
137	NC_014918	GCTAG	2	10	163924	163933	20 %	20 %	40 %	20 %	319777957
138	NC_014918	GGCGC	2	10	164060	164069	0 %	0 %	60 %	40 %	319777958
139	NC_014918	CTGGC	2	10	167997	168006	0 %	20 %	40 %	40 %	319777962
140	NC_014918	CCGGG	2	10	170145	170154	0 %	0 %	60 %	40 %	319777964
141	NC_014918	CAGGA	2	10	171351	171360	40 %	0 %	40 %	20 %	319777966
142	NC_014918	CTGGC	2	10	171373	171382	0 %	20 %	40 %	40 %	319777966
143	NC_014918	CTTCA	2	10	172771	172780	20 %	40 %	0 %	40 %	319777968
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152	NC_014918	GCATC	2	10	181784	181793	20 %	20 %	20 %	40 %	319777977
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155	NC_014918	CCGTG	2	10	186235	186244	0 %	20 %	40 %	40 %	319777982
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169	NC_014918	GCGGT	2	10	207685	207694	0 %	20 %	60 %	20 %	319778004
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192	NC_014918	AGGGT	2	10	235799	235808	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
193	NC_014918	CCCAG	2	10	235973	235982	20 %	0 %	20 %	60 %	319778028
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196	NC_014918	GCCGG	2	10	237471	237480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
197	NC_014918	TCGGC	2	10	237529	237538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
198	NC_014918	GAACG	2	10	239506	239515	40 %	0 %	40 %	20 %	319778031
199	NC_014918	GCATC	2	10	241497	241506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
200	NC_014918	TTGCA	2	10	243859	243868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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230	NC_014918	ACATT	2	10	279858	279867	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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235	NC_014918	GGCCG	2	10	284469	284478	0 %	0 %	60 %	40 %	319778071
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238	NC_014918	TTGAG	2	10	286796	286805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
239	NC_014918	GGTCG	2	10	287006	287015	0 %	20 %	60 %	20 %	319778073
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243	NC_014918	CGATG	2	10	290156	290165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
244	NC_014918	CGGAT	2	10	290171	290180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
245	NC_014918	GCCGA	2	10	295425	295434	20 %	0 %	40 %	40 %	319778077
246	NC_014918	GCTTG	2	10	296771	296780	0 %	40 %	40 %	20 %	319778078
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249	NC_014918	GCAGG	2	10	303263	303272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
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253	NC_014918	GAGCT	2	10	306322	306331	20 %	20 %	40 %	20 %	319778085
254	NC_014918	AGTCC	2	10	307188	307197	20 %	20 %	20 %	40 %	319778086
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260	NC_014918	GGCAA	2	10	316114	316123	40 %	0 %	40 %	20 %	319778090
261	NC_014918	CATCG	2	10	316278	316287	20 %	20 %	20 %	40 %	319778091
262	NC_014918	TGGCA	2	10	316609	316618	20 %	20 %	40 %	20 %	319778091
263	NC_014918	GCGCA	2	10	317392	317401	20 %	0 %	40 %	40 %	319778092
264	NC_014918	GCACC	2	10	317606	317615	20 %	0 %	20 %	60 %	319778092
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266	NC_014918	GAGTA	2	10	319188	319197	40 %	20 %	40 %	0 %	319778094
267	NC_014918	AGGGA	2	10	321740	321749	40 %	0 %	60 %	0 %	319778097
268	NC_014918	TCGTC	2	10	321853	321862	0 %	40 %	20 %	40 %	319778097
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303	NC_014918	AGGGG	2	10	367926	367935	20 %	0 %	80 %	0 %	319778132
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350	NC_014918	CATCG	2	10	425017	425026	20 %	20 %	20 %	40 %	319778183
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.