MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesorhizobium ciceri biovar biserrulae WSM1271 plasmid pMESCI01

Total Repeats: 84

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014918	CGAGG	2	10	95	104	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
2	NC_014918	CTGAC	2	10	2881	2890	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
3	NC_014918	GCGGG	2	10	7578	7587	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_014918	AGCCC	2	10	11175	11184	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5	NC_014918	TGGCG	2	10	15351	15360	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_014918	GGCAC	2	10	15418	15427	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7	NC_014918	TAAAC	2	10	23628	23637	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_014918	CAGCG	2	10	30973	30982	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
9	NC_014918	GCCGG	2	10	33243	33252	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
10	NC_014918	GGCGA	2	10	36143	36152	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_014918	ACTGA	2	10	36435	36444	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_014918	GATTT	2	10	38604	38613	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014918	TGGAC	2	10	42854	42863	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_014918	CCCGA	2	10	47350	47359	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_014918	GGAAC	2	10	56418	56427	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
16	NC_014918	CAACC	2	10	60344	60353	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
17	NC_014918	CAGGG	2	10	64833	64842	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
18	NC_014918	AACTT	2	10	65649	65658	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_014918	GAAGC	2	10	65885	65894	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_014918	TGAGG	2	10	67822	67831	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014918	GCCTT	2	10	67868	67877	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
22	NC_014918	GCCTG	2	10	73193	73202	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
23	NC_014918	CCGGG	2	10	77630	77639	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_014918	ATTCA	2	10	80645	80654	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_014918	CTGTT	2	10	89431	89440	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_014918	ATGAA	2	10	95551	95560	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014918	GCGCC	2	10	103074	103083	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
28	NC_014918	TCCCG	2	10	103769	103778	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_014918	TGGCG	2	10	106098	106107	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
30	NC_014918	GACGG	2	10	112392	112401	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
31	NC_014918	GACGA	2	10	112707	112716	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
32	NC_014918	GGCCC	2	10	115619	115628	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
33	NC_014918	CGCTG	2	10	115884	115893	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
34	NC_014918	AGGCA	2	10	117492	117501	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
35	NC_014918	GGGGA	2	10	117625	117634	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014918	AGGCG	2	10	120819	120828	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
37	NC_014918	CCGCC	2	10	123117	123126	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
38	NC_014918	GGCCG	2	10	131063	131072	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
39	NC_014918	GTGAA	2	10	135722	135731	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014918	CGGGC	2	10	150703	150712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
41	NC_014918	CCGGA	2	10	184329	184338	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
42	NC_014918	GGCCG	2	10	203269	203278	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
43	NC_014918	AGCCA	2	10	203891	203900	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_014918	GCAAG	2	10	203995	204004	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_014918	CTTCT	2	10	223740	223749	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
46	NC_014918	CATTG	2	10	234360	234369	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_014918	GAACA	2	10	235337	235346	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_014918	AGGGT	2	10	235799	235808	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014918	GGCTG	2	10	237230	237239	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
50	NC_014918	GCCGG	2	10	237471	237480	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
51	NC_014918	TCGGC	2	10	237529	237538	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
52	NC_014918	GCATC	2	10	241497	241506	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_014918	TTGCA	2	10	243859	243868	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
54	NC_014918	CGATG	2	10	245946	245955	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_014918	CGGAT	2	10	245961	245970	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
56	NC_014918	CAATT	2	10	249902	249911	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_014918	CCAAC	2	10	252994	253003	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
58	NC_014918	GGTCC	2	10	263306	263315	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_014918	CCCGA	2	10	274303	274312	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
60	NC_014918	TGCGA	2	10	274553	274562	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
61	NC_014918	ACCGC	2	10	276010	276019	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
62	NC_014918	ACATT	2	10	279858	279867	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_014918	CCTGG	2	10	283201	283210	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
64	NC_014918	GCTTC	2	10	283741	283750	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_014918	TTGAG	2	10	286796	286805	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014918	ACGGC	2	10	289989	289998	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_014918	CGATG	2	10	290156	290165	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
68	NC_014918	CGGAT	2	10	290171	290180	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
69	NC_014918	GGCGC	2	10	299748	299757	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
70	NC_014918	GCAGG	2	10	303263	303272	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
71	NC_014918	TGGCG	2	10	313372	313381	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
72	NC_014918	AGGGC	2	10	342317	342326	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_014918	CCCCT	2	10	344567	344576	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
74	NC_014918	CGCTG	2	10	360441	360450	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
75	NC_014918	CCCTC	2	10	361932	361941	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
76	NC_014918	CCGCT	2	10	361949	361958	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
77	NC_014918	AAATC	2	10	363464	363473	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
78	NC_014918	AGGGG	2	10	366926	366935	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014918	GTCCA	2	10	378121	378130	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_014918	ACCGC	2	10	384305	384314	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
81	NC_014918	TGCGC	2	10	392879	392888	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_014918	CTGGG	2	10	400117	400126	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
83	NC_014918	GCGCG	2	10	405024	405033	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
84	NC_014918	CTCAC	2	10	415093	415102	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.