MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 141

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	TCCG	2	8	347	354	0 %	25 %	25 %	50 %	319774849
2	NC_014917	TTGT	2	8	1246	1253	0 %	75 %	25 %	0 %	319774851
3	NC_014917	TTTG	2	8	1299	1306	0 %	75 %	25 %	0 %	319774851
4	NC_014917	CTTC	2	8	1388	1395	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
5	NC_014917	GACG	2	8	2400	2407	25 %	0 %	50 %	25 %	319774851
6	NC_014917	GGTT	2	8	3399	3406	0 %	50 %	50 %	0 %	319774853
7	NC_014917	TCCT	2	8	3612	3619	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
8	NC_014917	CTCC	2	8	3937	3944	0 %	25 %	0 %	75 %	319774853
9	NC_014917	GAGG	2	8	5195	5202	25 %	0 %	75 %	0 %	319774853
10	NC_014917	TCCC	2	8	6914	6921	0 %	25 %	0 %	75 %	319774855
11	NC_014917	TACC	2	8	7302	7309	25 %	25 %	0 %	50 %	319774855
12	NC_014917	TCCC	2	8	8284	8291	0 %	25 %	0 %	75 %	319774857
13	NC_014917	AACG	2	8	9229	9236	50 %	0 %	25 %	25 %	319774859
14	NC_014917	TCGG	2	8	9781	9788	0 %	25 %	50 %	25 %	319774860
15	NC_014917	TCTT	2	8	10049	10056	0 %	75 %	0 %	25 %	319774860
16	NC_014917	TCCC	2	8	10309	10316	0 %	25 %	0 %	75 %	319774861
17	NC_014917	CCGA	2	8	12100	12107	25 %	0 %	25 %	50 %	319774863
18	NC_014917	TGTA	2	8	12788	12795	25 %	50 %	25 %	0 %	319774864
19	NC_014917	GTGG	2	8	13604	13611	0 %	25 %	75 %	0 %	319774866
20	NC_014917	GCTT	2	8	13781	13788	0 %	50 %	25 %	25 %	319774866
21	NC_014917	CTCC	2	8	14387	14394	0 %	25 %	0 %	75 %	319774866
22	NC_014917	AAGA	2	8	15662	15669	75 %	0 %	25 %	0 %	319774867
23	NC_014917	AGAA	2	8	15722	15729	75 %	0 %	25 %	0 %	319774867
24	NC_014917	GGAG	2	8	16027	16034	25 %	0 %	75 %	0 %	319774867
25	NC_014917	AAGA	2	8	16715	16722	75 %	0 %	25 %	0 %	319774867
26	NC_014917	TCCT	2	8	17336	17343	0 %	50 %	0 %	50 %	319774869
27	NC_014917	GAGG	2	8	17387	17394	25 %	0 %	75 %	0 %	319774869
28	NC_014917	AAGG	2	8	17774	17781	50 %	0 %	50 %	0 %	319774869
29	NC_014917	TTTC	2	8	17847	17854	0 %	75 %	0 %	25 %	319774869
30	NC_014917	CTGC	2	8	18119	18126	0 %	25 %	25 %	50 %	319774869
31	NC_014917	GGAG	2	8	18202	18209	25 %	0 %	75 %	0 %	319774869
32	NC_014917	GTTC	2	8	19024	19031	0 %	50 %	25 %	25 %	319774871
33	NC_014917	CAAA	2	8	19160	19167	75 %	0 %	0 %	25 %	319774872
34	NC_014917	ACCC	2	8	19271	19278	25 %	0 %	0 %	75 %	319774872
35	NC_014917	AGGG	2	8	19779	19786	25 %	0 %	75 %	0 %	319774873
36	NC_014917	GAAG	2	8	19928	19935	50 %	0 %	50 %	0 %	319774873
37	NC_014917	CGAC	2	8	20668	20675	25 %	0 %	25 %	50 %	319774874
38	NC_014917	TGTT	2	8	21233	21240	0 %	75 %	25 %	0 %	319774874
39	NC_014917	CGAG	2	8	22088	22095	25 %	0 %	50 %	25 %	319774876
40	NC_014917	AGAA	2	8	22465	22472	75 %	0 %	25 %	0 %	319774876
41	NC_014917	CAGG	2	8	23194	23201	25 %	0 %	50 %	25 %	319774878
42	NC_014917	CTCC	2	8	23759	23766	0 %	25 %	0 %	75 %	319774879
43	NC_014917	AGGC	2	8	23908	23915	25 %	0 %	50 %	25 %	319774879
44	NC_014917	GACG	2	8	24862	24869	25 %	0 %	50 %	25 %	319774880
45	NC_014917	GAAG	2	8	25218	25225	50 %	0 %	50 %	0 %	319774880
46	NC_014917	AGGC	2	8	25873	25880	25 %	0 %	50 %	25 %	319774881
47	NC_014917	GCCT	2	8	26539	26546	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
48	NC_014917	CCCT	2	8	26701	26708	0 %	25 %	0 %	75 %	319774882
49	NC_014917	CTCG	2	8	26739	26746	0 %	25 %	25 %	50 %	319774882
50	NC_014917	CCTT	2	8	27408	27415	0 %	50 %	0 %	50 %	319774883
51	NC_014917	GCAG	2	8	27781	27788	25 %	0 %	50 %	25 %	319774884
52	NC_014917	TCAA	2	8	28080	28087	50 %	25 %	0 %	25 %	319774885
53	NC_014917	GTCC	2	8	28264	28271	0 %	25 %	25 %	50 %	319774886
54	NC_014917	ACCC	2	8	28313	28320	25 %	0 %	0 %	75 %	319774886
55	NC_014917	CCAG	2	8	29194	29201	25 %	0 %	25 %	50 %	319774887
56	NC_014917	GCAG	2	8	30142	30149	25 %	0 %	50 %	25 %	319774889
57	NC_014917	TTAT	2	8	30884	30891	25 %	75 %	0 %	0 %	319774890
58	NC_014917	CGCC	2	8	31119	31126	0 %	0 %	25 %	75 %	319774890
59	NC_014917	GGTG	2	8	31398	31405	0 %	25 %	75 %	0 %	319774890
60	NC_014917	GGCT	2	8	31513	31520	0 %	25 %	50 %	25 %	319774890
61	NC_014917	GCCC	2	8	32004	32011	0 %	0 %	25 %	75 %	319774891
62	NC_014917	CCCG	2	8	32523	32530	0 %	0 %	25 %	75 %	319774891
63	NC_014917	CGGC	2	8	32762	32769	0 %	0 %	50 %	50 %	319774891
64	NC_014917	TACT	2	8	33083	33090	25 %	50 %	0 %	25 %	319774891
65	NC_014917	TGAA	2	8	33229	33236	50 %	25 %	25 %	0 %	319774891
66	NC_014917	CCTG	2	8	33527	33534	0 %	25 %	25 %	50 %	319774892
67	NC_014917	GGAA	2	8	33676	33683	50 %	0 %	50 %	0 %	319774893
68	NC_014917	GGGC	2	8	35002	35009	0 %	0 %	75 %	25 %	319774895
69	NC_014917	GGAG	2	8	35132	35139	25 %	0 %	75 %	0 %	319774895
70	NC_014917	GTGA	2	8	35726	35733	25 %	25 %	50 %	0 %	319774896
71	NC_014917	GCTT	2	8	35889	35896	0 %	50 %	25 %	25 %	319774896
72	NC_014917	AATA	2	8	36271	36278	75 %	25 %	0 %	0 %	319774896
73	NC_014917	AAAG	2	8	36447	36454	75 %	0 %	25 %	0 %	319774896
74	NC_014917	ACGA	2	8	36525	36532	50 %	0 %	25 %	25 %	319774896
75	NC_014917	GCTT	2	8	36618	36625	0 %	50 %	25 %	25 %	319774896
76	NC_014917	TGCC	2	8	37718	37725	0 %	25 %	25 %	50 %	319774899
77	NC_014917	TTTC	2	8	37838	37845	0 %	75 %	0 %	25 %	319774899
78	NC_014917	AATA	2	8	38484	38491	75 %	25 %	0 %	0 %	319774900
79	NC_014917	CTTC	2	8	40096	40103	0 %	50 %	0 %	50 %	319774901
80	NC_014917	AAGG	2	8	40540	40547	50 %	0 %	50 %	0 %	319774901
81	NC_014917	CCGT	2	8	40823	40830	0 %	25 %	25 %	50 %	319774901
82	NC_014917	CGGT	2	8	41054	41061	0 %	25 %	50 %	25 %	319774902
83	NC_014917	GGCT	2	8	41461	41468	0 %	25 %	50 %	25 %	319774903
84	NC_014917	CCTG	2	8	42130	42137	0 %	25 %	25 %	50 %	319774904
85	NC_014917	GAAC	2	8	42906	42913	50 %	0 %	25 %	25 %	319774905
86	NC_014917	TCCT	2	8	44394	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	319774907
87	NC_014917	GCAG	2	8	44919	44926	25 %	0 %	50 %	25 %	319774908
88	NC_014917	TACT	2	8	45243	45250	25 %	50 %	0 %	25 %	319774909
89	NC_014917	GAGC	2	8	45990	45997	25 %	0 %	50 %	25 %	319774909
90	NC_014917	AGGA	2	8	46650	46657	50 %	0 %	50 %	0 %	319774909
91	NC_014917	AAGG	2	8	46917	46924	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
92	NC_014917	GAGG	2	8	47279	47286	25 %	0 %	75 %	0 %	319774910
93	NC_014917	CCGT	2	8	47666	47673	0 %	25 %	25 %	50 %	319774910
94	NC_014917	GAAG	2	8	47960	47967	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
95	NC_014917	AAAG	2	8	48002	48009	75 %	0 %	25 %	0 %	319774910
96	NC_014917	AAGG	2	8	48053	48060	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
97	NC_014917	GCTC	2	8	48519	48526	0 %	25 %	25 %	50 %	319774911
98	NC_014917	CAGG	2	8	48567	48574	25 %	0 %	50 %	25 %	319774911
99	NC_014917	GAAG	2	8	48770	48777	50 %	0 %	50 %	0 %	319774911
100	NC_014917	CCGC	2	8	49770	49777	0 %	0 %	25 %	75 %	319774913
101	NC_014917	GGCA	2	8	50655	50662	25 %	0 %	50 %	25 %	319774914
102	NC_014917	CCTT	2	8	51787	51794	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
103	NC_014917	GGCA	2	8	52076	52083	25 %	0 %	50 %	25 %	319774914
104	NC_014917	GTAA	2	8	53314	53321	50 %	25 %	25 %	0 %	319774916
105	NC_014917	TGCT	2	8	54220	54227	0 %	50 %	25 %	25 %	319774917
106	NC_014917	GTAA	2	8	54359	54366	50 %	25 %	25 %	0 %	319774918
107	NC_014917	CCTC	2	8	54841	54848	0 %	25 %	0 %	75 %	319774918
108	NC_014917	TGAA	2	8	54849	54856	50 %	25 %	25 %	0 %	319774918
109	NC_014917	GAAG	2	8	55172	55179	50 %	0 %	50 %	0 %	319774918
110	NC_014917	CTCC	2	8	55426	55433	0 %	25 %	0 %	75 %	319774918
111	NC_014917	AGGG	2	8	56460	56467	25 %	0 %	75 %	0 %	319774919
112	NC_014917	TTAC	2	8	56602	56609	25 %	50 %	0 %	25 %	319774919
113	NC_014917	CTCC	2	8	57008	57015	0 %	25 %	0 %	75 %	319774920
114	NC_014917	GAGG	2	8	57619	57626	25 %	0 %	75 %	0 %	319774921
115	NC_014917	TGGT	2	8	58297	58304	0 %	50 %	50 %	0 %	319774922
116	NC_014917	CTAC	2	8	58989	58996	25 %	25 %	0 %	50 %	319774923
117	NC_014917	CTGC	2	8	59033	59040	0 %	25 %	25 %	50 %	319774923
118	NC_014917	AGCG	2	8	60618	60625	25 %	0 %	50 %	25 %	319774924
119	NC_014917	TGCT	2	8	60781	60788	0 %	50 %	25 %	25 %	319774924
120	NC_014917	CCTC	2	8	61698	61705	0 %	25 %	0 %	75 %	319774927
121	NC_014917	CTTC	2	8	62063	62070	0 %	50 %	0 %	50 %	319774928
122	NC_014917	TCCT	2	8	62799	62806	0 %	50 %	0 %	50 %	319774929
123	NC_014917	CAGC	2	8	62935	62942	25 %	0 %	25 %	50 %	319774929
124	NC_014917	CCTT	2	8	63053	63060	0 %	50 %	0 %	50 %	319774930
125	NC_014917	CTGC	2	8	64181	64188	0 %	25 %	25 %	50 %	319774931
126	NC_014917	TTGG	2	8	64501	64508	0 %	50 %	50 %	0 %	319774931
127	NC_014917	GAAC	2	8	65224	65231	50 %	0 %	25 %	25 %	319774932
128	NC_014917	GGGA	2	8	66751	66758	25 %	0 %	75 %	0 %	319774935
129	NC_014917	CAGG	2	8	66824	66831	25 %	0 %	50 %	25 %	319774935
130	NC_014917	GGTG	2	8	67415	67422	0 %	25 %	75 %	0 %	319774937
131	NC_014917	GGTT	2	8	67818	67825	0 %	50 %	50 %	0 %	319774938
132	NC_014917	CCTG	3	12	68057	68068	0 %	25 %	25 %	50 %	319774939
133	NC_014917	TGCC	2	8	68504	68511	0 %	25 %	25 %	50 %	319774939
134	NC_014917	CAAA	2	8	68535	68542	75 %	0 %	0 %	25 %	319774939
135	NC_014917	CCCT	2	8	71850	71857	0 %	25 %	0 %	75 %	319774944
136	NC_014917	GGCT	2	8	71885	71892	0 %	25 %	50 %	25 %	319774944
137	NC_014917	CCAC	2	8	72317	72324	25 %	0 %	0 %	75 %	319774944
138	NC_014917	CCTG	2	8	73206	73213	0 %	25 %	25 %	50 %	319774945
139	NC_014917	CCTT	2	8	73222	73229	0 %	50 %	0 %	50 %	319774945
140	NC_014917	CTCC	2	8	73726	73733	0 %	25 %	0 %	75 %	319774945
141	NC_014917	TACT	2	8	75277	75284	25 %	50 %	0 %	25 %	319774949

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.