MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 206

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	GA	3	6	94	99	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014917	GA	4	8	616	623	50 %	0 %	50 %	0 %	319774849
3	NC_014917	CT	3	6	676	681	0 %	50 %	0 %	50 %	319774850
4	NC_014917	GA	3	6	1082	1087	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
5	NC_014917	CT	4	8	1397	1404	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
6	NC_014917	TC	3	6	1443	1448	0 %	50 %	0 %	50 %	319774851
7	NC_014917	AT	4	8	1456	1463	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
8	NC_014917	AT	3	6	1480	1485	50 %	50 %	0 %	0 %	319774851
9	NC_014917	AG	3	6	1834	1839	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
10	NC_014917	AG	3	6	1974	1979	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
11	NC_014917	AG	3	6	2355	2360	50 %	0 %	50 %	0 %	319774851
12	NC_014917	CT	3	6	2832	2837	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
13	NC_014917	TC	3	6	2895	2900	0 %	50 %	0 %	50 %	319774852
14	NC_014917	TC	4	8	3370	3377	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
15	NC_014917	AG	3	6	3569	3574	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
16	NC_014917	CT	3	6	4307	4312	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
17	NC_014917	AG	3	6	4394	4399	50 %	0 %	50 %	0 %	319774853
18	NC_014917	CT	3	6	4543	4548	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
19	NC_014917	CT	4	8	5263	5270	0 %	50 %	0 %	50 %	319774853
20	NC_014917	TG	3	6	5460	5465	0 %	50 %	50 %	0 %	319774853
21	NC_014917	TC	3	6	5841	5846	0 %	50 %	0 %	50 %	319774854
22	NC_014917	AG	3	6	5929	5934	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
23	NC_014917	AG	3	6	6484	6489	50 %	0 %	50 %	0 %	319774854
24	NC_014917	TC	3	6	7137	7142	0 %	50 %	0 %	50 %	319774855
25	NC_014917	CT	3	6	7621	7626	0 %	50 %	0 %	50 %	319774855
26	NC_014917	TC	3	6	7699	7704	0 %	50 %	0 %	50 %	319774856
27	NC_014917	TC	3	6	8406	8411	0 %	50 %	0 %	50 %	319774857
28	NC_014917	TC	3	6	8946	8951	0 %	50 %	0 %	50 %	319774858
29	NC_014917	AG	5	10	9175	9184	50 %	0 %	50 %	0 %	319774858
30	NC_014917	CT	3	6	9719	9724	0 %	50 %	0 %	50 %	319774859
31	NC_014917	AG	3	6	9997	10002	50 %	0 %	50 %	0 %	319774860
32	NC_014917	CT	3	6	10260	10265	0 %	50 %	0 %	50 %	319774861
33	NC_014917	CT	3	6	10643	10648	0 %	50 %	0 %	50 %	319774861
34	NC_014917	CT	3	6	11276	11281	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
35	NC_014917	CT	3	6	11392	11397	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
36	NC_014917	CT	3	6	11582	11587	0 %	50 %	0 %	50 %	319774862
37	NC_014917	CT	3	6	11959	11964	0 %	50 %	0 %	50 %	319774863
38	NC_014917	TC	3	6	12216	12221	0 %	50 %	0 %	50 %	319774863
39	NC_014917	TC	3	6	12347	12352	0 %	50 %	0 %	50 %	319774864
40	NC_014917	AG	3	6	12538	12543	50 %	0 %	50 %	0 %	319774864
41	NC_014917	CT	3	6	12606	12611	0 %	50 %	0 %	50 %	319774864
42	NC_014917	CT	3	6	12640	12645	0 %	50 %	0 %	50 %	319774864
43	NC_014917	CT	3	6	13039	13044	0 %	50 %	0 %	50 %	319774865
44	NC_014917	TC	3	6	13080	13085	0 %	50 %	0 %	50 %	319774865
45	NC_014917	CT	3	6	13716	13721	0 %	50 %	0 %	50 %	319774866
46	NC_014917	CT	3	6	13863	13868	0 %	50 %	0 %	50 %	319774866
47	NC_014917	TC	3	6	13909	13914	0 %	50 %	0 %	50 %	319774866
48	NC_014917	TC	3	6	14417	14422	0 %	50 %	0 %	50 %	319774866
49	NC_014917	AG	3	6	14933	14938	50 %	0 %	50 %	0 %	319774866
50	NC_014917	CT	3	6	15506	15511	0 %	50 %	0 %	50 %	319774867
51	NC_014917	AG	4	8	15552	15559	50 %	0 %	50 %	0 %	319774867
52	NC_014917	CT	3	6	17732	17737	0 %	50 %	0 %	50 %	319774869
53	NC_014917	CT	3	6	17990	17995	0 %	50 %	0 %	50 %	319774869
54	NC_014917	AG	3	6	18101	18106	50 %	0 %	50 %	0 %	319774869
55	NC_014917	CT	3	6	18215	18220	0 %	50 %	0 %	50 %	319774869
56	NC_014917	AG	3	6	18623	18628	50 %	0 %	50 %	0 %	319774870
57	NC_014917	GA	3	6	19084	19089	50 %	0 %	50 %	0 %	319774871
58	NC_014917	AG	3	6	19505	19510	50 %	0 %	50 %	0 %	319774872
59	NC_014917	GA	3	6	19979	19984	50 %	0 %	50 %	0 %	319774873
60	NC_014917	TC	3	6	20044	20049	0 %	50 %	0 %	50 %	319774873
61	NC_014917	AG	3	6	20603	20608	50 %	0 %	50 %	0 %	319774874
62	NC_014917	CT	3	6	20782	20787	0 %	50 %	0 %	50 %	319774874
63	NC_014917	CT	3	6	20888	20893	0 %	50 %	0 %	50 %	319774874
64	NC_014917	TA	4	8	21408	21415	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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66	NC_014917	AG	3	6	22486	22491	50 %	0 %	50 %	0 %	319774876
67	NC_014917	TC	3	6	22565	22570	0 %	50 %	0 %	50 %	319774876
68	NC_014917	CT	3	6	22597	22602	0 %	50 %	0 %	50 %	319774876
69	NC_014917	AG	3	6	22951	22956	50 %	0 %	50 %	0 %	319774877
70	NC_014917	TC	3	6	22976	22981	0 %	50 %	0 %	50 %	319774877
71	NC_014917	AG	3	6	23393	23398	50 %	0 %	50 %	0 %	319774879
72	NC_014917	CT	3	6	23805	23810	0 %	50 %	0 %	50 %	319774879
73	NC_014917	AG	3	6	24044	24049	50 %	0 %	50 %	0 %	319774879
74	NC_014917	GA	3	6	25169	25174	50 %	0 %	50 %	0 %	319774880
75	NC_014917	TA	3	6	26394	26399	50 %	50 %	0 %	0 %	319774882
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77	NC_014917	AG	3	6	27398	27403	50 %	0 %	50 %	0 %	319774883
78	NC_014917	TC	3	6	28172	28177	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
79	NC_014917	CT	3	6	28333	28338	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
80	NC_014917	CT	3	6	28424	28429	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
81	NC_014917	TC	3	6	28564	28569	0 %	50 %	0 %	50 %	319774886
82	NC_014917	AG	3	6	29037	29042	50 %	0 %	50 %	0 %	319774887
83	NC_014917	AG	3	6	30678	30683	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014917	GA	3	6	31691	31696	50 %	0 %	50 %	0 %	319774891
85	NC_014917	GA	4	8	32361	32368	50 %	0 %	50 %	0 %	319774891
86	NC_014917	AG	3	6	32393	32398	50 %	0 %	50 %	0 %	319774891
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91	NC_014917	CT	3	6	35378	35383	0 %	50 %	0 %	50 %	319774896
92	NC_014917	CT	3	6	35560	35565	0 %	50 %	0 %	50 %	319774896
93	NC_014917	AG	3	6	36117	36122	50 %	0 %	50 %	0 %	319774896
94	NC_014917	GA	3	6	37434	37439	50 %	0 %	50 %	0 %	319774898
95	NC_014917	AG	3	6	37760	37765	50 %	0 %	50 %	0 %	319774899
96	NC_014917	TC	3	6	37844	37849	0 %	50 %	0 %	50 %	319774899
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98	NC_014917	AT	3	6	38099	38104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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103	NC_014917	AG	3	6	39955	39960	50 %	0 %	50 %	0 %	319774901
104	NC_014917	CT	3	6	40357	40362	0 %	50 %	0 %	50 %	319774901
105	NC_014917	GA	3	6	40512	40517	50 %	0 %	50 %	0 %	319774901
106	NC_014917	TC	3	6	41038	41043	0 %	50 %	0 %	50 %	319774902
107	NC_014917	TC	3	6	41400	41405	0 %	50 %	0 %	50 %	319774903
108	NC_014917	GA	3	6	42429	42434	50 %	0 %	50 %	0 %	319774905
109	NC_014917	AG	3	6	43083	43088	50 %	0 %	50 %	0 %	319774905
110	NC_014917	TC	3	6	43120	43125	0 %	50 %	0 %	50 %	319774905
111	NC_014917	CT	3	6	43126	43131	0 %	50 %	0 %	50 %	319774905
112	NC_014917	AG	3	6	43432	43437	50 %	0 %	50 %	0 %	319774905
113	NC_014917	TC	3	6	43457	43462	0 %	50 %	0 %	50 %	319774905
114	NC_014917	CT	3	6	43883	43888	0 %	50 %	0 %	50 %	319774906
115	NC_014917	TC	3	6	43920	43925	0 %	50 %	0 %	50 %	319774906
116	NC_014917	GA	3	6	45566	45571	50 %	0 %	50 %	0 %	319774909
117	NC_014917	AG	3	6	46028	46033	50 %	0 %	50 %	0 %	319774909
118	NC_014917	GA	3	6	46394	46399	50 %	0 %	50 %	0 %	319774909
119	NC_014917	AT	3	6	46661	46666	50 %	50 %	0 %	0 %	319774909
120	NC_014917	CT	3	6	46816	46821	0 %	50 %	0 %	50 %	319774909
121	NC_014917	AG	3	6	47432	47437	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
122	NC_014917	AG	3	6	47535	47540	50 %	0 %	50 %	0 %	319774910
123	NC_014917	CT	3	6	49429	49434	0 %	50 %	0 %	50 %	319774912
124	NC_014917	AG	3	6	49480	49485	50 %	0 %	50 %	0 %	319774912
125	NC_014917	CT	3	6	50079	50084	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
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127	NC_014917	CT	3	6	50437	50442	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
128	NC_014917	AG	3	6	50547	50552	50 %	0 %	50 %	0 %	319774914
129	NC_014917	TC	3	6	50801	50806	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
130	NC_014917	TC	3	6	50811	50816	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
131	NC_014917	CT	4	8	51931	51938	0 %	50 %	0 %	50 %	319774914
132	NC_014917	TC	3	6	52781	52786	0 %	50 %	0 %	50 %	319774916
133	NC_014917	AT	3	6	52808	52813	50 %	50 %	0 %	0 %	319774916
134	NC_014917	CA	3	6	53672	53677	50 %	0 %	0 %	50 %	319774916
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.