MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Thermovibrio ammonificans HB-1 plasmid pTHEAM01

Total Repeats: 60

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014917	T	6	6	2473	2478	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014917	T	7	7	2594	2600	0 %	100 %	0 %	0 %	319774852
3	NC_014917	C	6	6	4528	4533	0 %	0 %	0 %	100 %	319774853
4	NC_014917	T	6	6	4859	4864	0 %	100 %	0 %	0 %	319774853
5	NC_014917	T	6	6	8090	8095	0 %	100 %	0 %	0 %	319774857
6	NC_014917	T	6	6	8163	8168	0 %	100 %	0 %	0 %	319774857
7	NC_014917	T	6	6	10754	10759	0 %	100 %	0 %	0 %	319774861
8	NC_014917	A	8	8	12968	12975	100 %	0 %	0 %	0 %	319774864
9	NC_014917	G	6	6	14777	14782	0 %	0 %	100 %	0 %	319774866
10	NC_014917	C	7	7	14978	14984	0 %	0 %	0 %	100 %	319774866
11	NC_014917	A	7	7	18752	18758	100 %	0 %	0 %	0 %	319774871
12	NC_014917	A	6	6	23483	23488	100 %	0 %	0 %	0 %	319774879
13	NC_014917	A	6	6	25592	25597	100 %	0 %	0 %	0 %	319774881
14	NC_014917	C	6	6	26665	26670	0 %	0 %	0 %	100 %	319774882
15	NC_014917	A	6	6	28240	28245	100 %	0 %	0 %	0 %	319774886
16	NC_014917	G	6	6	28475	28480	0 %	0 %	100 %	0 %	319774886
17	NC_014917	T	6	6	28868	28873	0 %	100 %	0 %	0 %	319774887
18	NC_014917	A	7	7	28941	28947	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
19	NC_014917	A	6	6	29467	29472	100 %	0 %	0 %	0 %	319774887
20	NC_014917	T	6	6	30358	30363	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
21	NC_014917	T	6	6	30399	30404	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
22	NC_014917	T	7	7	30417	30423	0 %	100 %	0 %	0 %	319774889
23	NC_014917	A	6	6	33052	33057	100 %	0 %	0 %	0 %	319774891
24	NC_014917	G	6	6	33163	33168	0 %	0 %	100 %	0 %	319774891
25	NC_014917	G	6	6	33595	33600	0 %	0 %	100 %	0 %	319774892
26	NC_014917	T	6	6	35565	35570	0 %	100 %	0 %	0 %	319774896
27	NC_014917	T	6	6	36167	36172	0 %	100 %	0 %	0 %	319774896
28	NC_014917	T	9	9	36364	36372	0 %	100 %	0 %	0 %	319774896
29	NC_014917	T	6	6	36899	36904	0 %	100 %	0 %	0 %	319774897
30	NC_014917	T	6	6	36935	36940	0 %	100 %	0 %	0 %	319774897
31	NC_014917	G	6	6	38585	38590	0 %	0 %	100 %	0 %	319774900
32	NC_014917	T	6	6	40146	40151	0 %	100 %	0 %	0 %	319774901
33	NC_014917	A	6	6	41097	41102	100 %	0 %	0 %	0 %	319774902
34	NC_014917	G	6	6	43970	43975	0 %	0 %	100 %	0 %	319774906
35	NC_014917	A	6	6	45294	45299	100 %	0 %	0 %	0 %	319774909
36	NC_014917	A	6	6	46897	46902	100 %	0 %	0 %	0 %	319774910
37	NC_014917	G	6	6	47849	47854	0 %	0 %	100 %	0 %	319774910
38	NC_014917	C	6	6	47937	47942	0 %	0 %	0 %	100 %	319774910
39	NC_014917	C	6	6	48406	48411	0 %	0 %	0 %	100 %	319774911
40	NC_014917	T	6	6	51539	51544	0 %	100 %	0 %	0 %	319774914
41	NC_014917	A	8	8	52206	52213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014917	A	6	6	52384	52389	100 %	0 %	0 %	0 %	319774915
43	NC_014917	T	7	7	52881	52887	0 %	100 %	0 %	0 %	319774916
44	NC_014917	G	6	6	56465	56470	0 %	0 %	100 %	0 %	319774919
45	NC_014917	G	6	6	57223	57228	0 %	0 %	100 %	0 %	319774921
46	NC_014917	G	7	7	63616	63622	0 %	0 %	100 %	0 %	319774931
47	NC_014917	C	6	6	63718	63723	0 %	0 %	0 %	100 %	319774931
48	NC_014917	A	6	6	66108	66113	100 %	0 %	0 %	0 %	319774934
49	NC_014917	A	6	6	66410	66415	100 %	0 %	0 %	0 %	319774935
50	NC_014917	G	6	6	67073	67078	0 %	0 %	100 %	0 %	319774936
51	NC_014917	T	6	6	69236	69241	0 %	100 %	0 %	0 %	319774940
52	NC_014917	G	6	6	70546	70551	0 %	0 %	100 %	0 %	319774943
53	NC_014917	T	6	6	71647	71652	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014917	G	6	6	72609	72614	0 %	0 %	100 %	0 %	319774944
55	NC_014917	C	6	6	72667	72672	0 %	0 %	0 %	100 %	319774944
56	NC_014917	A	6	6	72966	72971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014917	A	6	6	74280	74285	100 %	0 %	0 %	0 %	319774946
58	NC_014917	C	6	6	74576	74581	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
59	NC_014917	C	6	6	76365	76370	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_014917	A	6	6	76457	76462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.