MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC52 plasmid pGYMC5201

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014916	AGCTG	2	10	584	593	20 %	20 %	40 %	20 %	319768579
2	NC_014916	TCAAA	2	10	963	972	60 %	20 %	0 %	20 %	319768579
3	NC_014916	GAAGC	2	10	5055	5064	40 %	0 %	40 %	20 %	319768582
4	NC_014916	CCAAT	2	10	5963	5972	40 %	20 %	0 %	40 %	319768583
5	NC_014916	AAAAT	2	10	6146	6155	80 %	20 %	0 %	0 %	319768583
6	NC_014916	GTAGC	2	10	7948	7957	20 %	20 %	40 %	20 %	319768584
7	NC_014916	GTAAA	2	10	7994	8003	60 %	20 %	20 %	0 %	319768584
8	NC_014916	TCTTG	2	10	11401	11410	0 %	60 %	20 %	20 %	319768586
9	NC_014916	CTTTA	2	10	13204	13213	20 %	60 %	0 %	20 %	319768589
10	NC_014916	CTGTT	2	10	18745	18754	0 %	60 %	20 %	20 %	319768594
11	NC_014916	AAGAC	2	10	19459	19468	60 %	0 %	20 %	20 %	319768594
12	NC_014916	TCATT	2	10	21757	21766	20 %	60 %	0 %	20 %	319768597
13	NC_014916	GTTCG	2	10	22727	22736	0 %	40 %	40 %	20 %	319768598
14	NC_014916	AATAT	2	10	26062	26071	60 %	40 %	0 %	0 %	319768600
15	NC_014916	CATCG	2	10	27602	27611	20 %	20 %	20 %	40 %	319768601
16	NC_014916	TTCTT	2	10	31752	31761	0 %	80 %	0 %	20 %	319768604
17	NC_014916	ATCCA	2	10	35192	35201	40 %	20 %	0 %	40 %	319768605
18	NC_014916	AAACA	2	10	37172	37181	80 %	0 %	0 %	20 %	319768607
19	NC_014916	CCAAG	2	10	41126	41135	40 %	0 %	20 %	40 %	319768610
20	NC_014916	ATTGT	2	10	42006	42015	20 %	60 %	20 %	0 %	319768611
21	NC_014916	TTTCC	2	10	42990	42999	0 %	60 %	0 %	40 %	319768614

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.