MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Geobacillus sp. Y412MC52 plasmid pGYMC5201

Total Repeats: 140

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014916	AAGA	2	8	880	887	75 %	0 %	25 %	0 %	319768579
2	NC_014916	TGGA	2	8	1141	1148	25 %	25 %	50 %	0 %	319768579
3	NC_014916	TGAA	2	8	1226	1233	50 %	25 %	25 %	0 %	319768579
4	NC_014916	CCGG	2	8	1503	1510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_014916	TTTA	2	8	1631	1638	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014916	TTGT	2	8	2486	2493	0 %	75 %	25 %	0 %	319768580
7	NC_014916	GGCC	2	8	2866	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	319768580
8	NC_014916	TCGC	2	8	3160	3167	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_014916	CCCT	2	8	3402	3409	0 %	25 %	0 %	75 %	319768581
10	NC_014916	ACGC	2	8	3880	3887	25 %	0 %	25 %	50 %	319768581
11	NC_014916	GAAT	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	319768581
12	NC_014916	TGTC	2	8	3945	3952	0 %	50 %	25 %	25 %	319768581
13	NC_014916	TGTT	2	8	4020	4027	0 %	75 %	25 %	0 %	319768581
14	NC_014916	AAGC	2	8	5013	5020	50 %	0 %	25 %	25 %	319768582
15	NC_014916	GCAA	2	8	5035	5042	50 %	0 %	25 %	25 %	319768582
16	NC_014916	TTTC	2	8	5222	5229	0 %	75 %	0 %	25 %	319768582
17	NC_014916	GTTT	2	8	5917	5924	0 %	75 %	25 %	0 %	319768583
18	NC_014916	ATCC	2	8	6281	6288	25 %	25 %	0 %	50 %	319768583
19	NC_014916	AATC	2	8	6315	6322	50 %	25 %	0 %	25 %	319768583
20	NC_014916	AGCC	2	8	6404	6411	25 %	0 %	25 %	50 %	319768583
21	NC_014916	ACAA	2	8	6785	6792	75 %	0 %	0 %	25 %	319768583
22	NC_014916	CTGA	2	8	7262	7269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_014916	ATTG	2	8	7453	7460	25 %	50 %	25 %	0 %	319768584
24	NC_014916	ATCC	2	8	7492	7499	25 %	25 %	0 %	50 %	319768584
25	NC_014916	ACGC	2	8	7774	7781	25 %	0 %	25 %	50 %	319768584
26	NC_014916	AGGA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	50 %	0 %	319768584
27	NC_014916	TTTC	2	8	8547	8554	0 %	75 %	0 %	25 %	319768584
28	NC_014916	TTCT	2	8	8715	8722	0 %	75 %	0 %	25 %	319768585
29	NC_014916	AATA	2	8	8939	8946	75 %	25 %	0 %	0 %	319768585
30	NC_014916	GAAA	2	8	8955	8962	75 %	0 %	25 %	0 %	319768585
31	NC_014916	CTTC	2	8	8993	9000	0 %	50 %	0 %	50 %	319768585
32	NC_014916	CTTG	2	8	9278	9285	0 %	50 %	25 %	25 %	319768585
33	NC_014916	GCTT	2	8	9358	9365	0 %	50 %	25 %	25 %	319768585
34	NC_014916	GGTT	2	8	9444	9451	0 %	50 %	50 %	0 %	319768585
35	NC_014916	CATT	2	8	9480	9487	25 %	50 %	0 %	25 %	319768585
36	NC_014916	TTCC	2	8	10112	10119	0 %	50 %	0 %	50 %	319768586
37	NC_014916	TTTC	2	8	10480	10487	0 %	75 %	0 %	25 %	319768586
38	NC_014916	AATT	2	8	10838	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	319768586
39	NC_014916	AGTT	2	8	11183	11190	25 %	50 %	25 %	0 %	319768586
40	NC_014916	TCGT	2	8	11424	11431	0 %	50 %	25 %	25 %	319768586
41	NC_014916	GATT	2	8	11718	11725	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014916	GGGA	2	8	11772	11779	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014916	GGAG	2	8	11793	11800	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014916	GGAG	2	8	11897	11904	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014916	TTGA	2	8	12699	12706	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014916	ACAG	2	8	12808	12815	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_014916	TCAT	2	8	12910	12917	25 %	50 %	0 %	25 %	319768587
48	NC_014916	TTGT	2	8	13183	13190	0 %	75 %	25 %	0 %	319768589
49	NC_014916	AAAC	2	8	14031	14038	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014916	TAAA	2	8	14293	14300	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014916	ACCA	2	8	14690	14697	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_014916	AATC	2	8	14773	14780	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_014916	AGCA	2	8	14942	14949	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_014916	TCCT	2	8	15649	15656	0 %	50 %	0 %	50 %	319768591
55	NC_014916	GACC	2	8	15773	15780	25 %	0 %	25 %	50 %	319768591
56	NC_014916	ATCC	2	8	16221	16228	25 %	25 %	0 %	50 %	319768591
57	NC_014916	CCCT	2	8	16322	16329	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_014916	ATTT	2	8	16530	16537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014916	GCAG	2	8	16893	16900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_014916	CCGG	2	8	16962	16969	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_014916	TTAT	2	8	17129	17136	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014916	AGAA	2	8	17437	17444	75 %	0 %	25 %	0 %	319768592
63	NC_014916	ATGG	2	8	18539	18546	25 %	25 %	50 %	0 %	319768594
64	NC_014916	TCCA	2	8	19283	19290	25 %	25 %	0 %	50 %	319768594
65	NC_014916	TCAT	2	8	19363	19370	25 %	50 %	0 %	25 %	319768594
66	NC_014916	TGAA	2	8	19432	19439	50 %	25 %	25 %	0 %	319768594
67	NC_014916	CCAT	2	8	20919	20926	25 %	25 %	0 %	50 %	319768595
68	NC_014916	GACG	2	8	21035	21042	25 %	0 %	50 %	25 %	319768595
69	NC_014916	TCAA	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	319768596
70	NC_014916	AGAT	2	8	21371	21378	50 %	25 %	25 %	0 %	319768596
71	NC_014916	GTCC	2	8	21424	21431	0 %	25 %	25 %	50 %	319768596
72	NC_014916	CTTT	2	8	21451	21458	0 %	75 %	0 %	25 %	319768596
73	NC_014916	TTGG	2	8	21480	21487	0 %	50 %	50 %	0 %	319768596
74	NC_014916	GGTC	2	8	21531	21538	0 %	25 %	50 %	25 %	319768596
75	NC_014916	GCTC	2	8	21958	21965	0 %	25 %	25 %	50 %	319768597
76	NC_014916	CACC	2	8	22394	22401	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
77	NC_014916	GTTT	2	8	22413	22420	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014916	ATAC	2	8	22511	22518	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_014916	CAAA	2	8	22574	22581	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_014916	GGAT	2	8	22654	22661	25 %	25 %	50 %	0 %	319768598
81	NC_014916	GCTT	2	8	23062	23069	0 %	50 %	25 %	25 %	319768598
82	NC_014916	CAGC	2	8	23591	23598	25 %	0 %	25 %	50 %	319768598
83	NC_014916	CATC	2	8	23804	23811	25 %	25 %	0 %	50 %	319768598
84	NC_014916	CCAC	2	8	23870	23877	25 %	0 %	0 %	75 %	319768598
85	NC_014916	CTTG	2	8	23892	23899	0 %	50 %	25 %	25 %	319768598
86	NC_014916	CGAA	2	8	24188	24195	50 %	0 %	25 %	25 %	319768598
87	NC_014916	CATT	2	8	24235	24242	25 %	50 %	0 %	25 %	319768598
88	NC_014916	TAAT	2	8	24672	24679	50 %	50 %	0 %	0 %	319768599
89	NC_014916	ATTC	2	8	25368	25375	25 %	50 %	0 %	25 %	319768600
90	NC_014916	AATA	2	8	25584	25591	75 %	25 %	0 %	0 %	319768600
91	NC_014916	TTCA	2	8	25710	25717	25 %	50 %	0 %	25 %	319768600
92	NC_014916	ATAG	2	8	25797	25804	50 %	25 %	25 %	0 %	319768600
93	NC_014916	ATCT	2	8	26665	26672	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_014916	TAAA	2	8	27172	27179	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014916	CAAA	2	8	27262	27269	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_014916	AACC	2	8	27313	27320	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_014916	GCCT	2	8	27953	27960	0 %	25 %	25 %	50 %	319768601
98	NC_014916	TCGA	2	8	28268	28275	25 %	25 %	25 %	25 %	319768601
99	NC_014916	CAAA	2	8	29048	29055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_014916	ACTG	2	8	29869	29876	25 %	25 %	25 %	25 %	319768602
101	NC_014916	CTTT	2	8	30011	30018	0 %	75 %	0 %	25 %	319768602
102	NC_014916	TCAA	2	8	30573	30580	50 %	25 %	0 %	25 %	319768603
103	NC_014916	GTGG	2	8	30966	30973	0 %	25 %	75 %	0 %	319768603
104	NC_014916	CTGT	2	8	31057	31064	0 %	50 %	25 %	25 %	319768603
105	NC_014916	TCCA	2	8	32275	32282	25 %	25 %	0 %	50 %	319768604
106	NC_014916	GGAA	2	8	32789	32796	50 %	0 %	50 %	0 %	319768604
107	NC_014916	ATTC	2	8	32997	33004	25 %	50 %	0 %	25 %	319768604
108	NC_014916	TGCT	2	8	33081	33088	0 %	50 %	25 %	25 %	319768604
109	NC_014916	CCAA	2	8	33137	33144	50 %	0 %	0 %	50 %	319768604
110	NC_014916	CATC	2	8	33396	33403	25 %	25 %	0 %	50 %	319768604
111	NC_014916	CTGT	2	8	33923	33930	0 %	50 %	25 %	25 %	319768605
112	NC_014916	CAAT	2	8	34184	34191	50 %	25 %	0 %	25 %	319768605
113	NC_014916	AATT	2	8	35024	35031	50 %	50 %	0 %	0 %	319768605
114	NC_014916	TCCA	2	8	35388	35395	25 %	25 %	0 %	50 %	319768605
115	NC_014916	GATT	2	8	35403	35410	25 %	50 %	25 %	0 %	319768605
116	NC_014916	TAGA	2	8	35554	35561	50 %	25 %	25 %	0 %	319768606
117	NC_014916	TATC	2	8	35755	35762	25 %	50 %	0 %	25 %	319768606
118	NC_014916	AAGC	2	8	35782	35789	50 %	0 %	25 %	25 %	319768606
119	NC_014916	CTTT	2	8	35911	35918	0 %	75 %	0 %	25 %	319768606
120	NC_014916	TATC	2	8	37602	37609	25 %	50 %	0 %	25 %	319768608
121	NC_014916	AGCT	2	8	38255	38262	25 %	25 %	25 %	25 %	319768608
122	NC_014916	TTGC	2	8	38394	38401	0 %	50 %	25 %	25 %	319768608
123	NC_014916	CGGC	2	8	39415	39422	0 %	0 %	50 %	50 %	319768608
124	NC_014916	CTTC	2	8	40066	40073	0 %	50 %	0 %	50 %	319768609
125	NC_014916	TAAT	2	8	40168	40175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_014916	CAAA	2	8	40356	40363	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_014916	TCAT	2	8	40531	40538	25 %	50 %	0 %	25 %	319768610
128	NC_014916	ACGC	2	8	40794	40801	25 %	0 %	25 %	50 %	319768610
129	NC_014916	CTTT	2	8	41932	41939	0 %	75 %	0 %	25 %	319768611
130	NC_014916	GGTT	2	8	42078	42085	0 %	50 %	50 %	0 %	319768611
131	NC_014916	TCGC	2	8	42530	42537	0 %	25 %	25 %	50 %	319768612
132	NC_014916	TATC	2	8	42901	42908	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_014916	GGGA	2	8	43113	43120	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_014916	GAAG	2	8	43689	43696	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_014916	ACAA	2	8	44222	44229	75 %	0 %	0 %	25 %	319768616
136	NC_014916	GTTC	2	8	44432	44439	0 %	50 %	25 %	25 %	319768617
137	NC_014916	CTGC	2	8	44447	44454	0 %	25 %	25 %	50 %	319768617
138	NC_014916	AATA	2	8	44588	44595	75 %	25 %	0 %	0 %	319768617
139	NC_014916	CCTT	2	8	44695	44702	0 %	50 %	0 %	50 %	319768617
140	NC_014916	CATG	2	8	44930	44937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.