MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC52 plasmid pGYMC5201

Total Repeats: 105

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014916	AAGA	2	8	880	887	75 %	0 %	25 %	0 %	319768579
2	NC_014916	TGGA	2	8	1141	1148	25 %	25 %	50 %	0 %	319768579
3	NC_014916	TGAA	2	8	1226	1233	50 %	25 %	25 %	0 %	319768579
4	NC_014916	TTGT	2	8	2486	2493	0 %	75 %	25 %	0 %	319768580
5	NC_014916	GGCC	2	8	2866	2873	0 %	0 %	50 %	50 %	319768580
6	NC_014916	CCCT	2	8	3402	3409	0 %	25 %	0 %	75 %	319768581
7	NC_014916	ACGC	2	8	3880	3887	25 %	0 %	25 %	50 %	319768581
8	NC_014916	GAAT	2	8	3926	3933	50 %	25 %	25 %	0 %	319768581
9	NC_014916	TGTC	2	8	3945	3952	0 %	50 %	25 %	25 %	319768581
10	NC_014916	TGTT	2	8	4020	4027	0 %	75 %	25 %	0 %	319768581
11	NC_014916	AAGC	2	8	5013	5020	50 %	0 %	25 %	25 %	319768582
12	NC_014916	GCAA	2	8	5035	5042	50 %	0 %	25 %	25 %	319768582
13	NC_014916	TTTC	2	8	5222	5229	0 %	75 %	0 %	25 %	319768582
14	NC_014916	GTTT	2	8	5917	5924	0 %	75 %	25 %	0 %	319768583
15	NC_014916	ATCC	2	8	6281	6288	25 %	25 %	0 %	50 %	319768583
16	NC_014916	AATC	2	8	6315	6322	50 %	25 %	0 %	25 %	319768583
17	NC_014916	AGCC	2	8	6404	6411	25 %	0 %	25 %	50 %	319768583
18	NC_014916	ACAA	2	8	6785	6792	75 %	0 %	0 %	25 %	319768583
19	NC_014916	ATTG	2	8	7453	7460	25 %	50 %	25 %	0 %	319768584
20	NC_014916	ATCC	2	8	7492	7499	25 %	25 %	0 %	50 %	319768584
21	NC_014916	ACGC	2	8	7774	7781	25 %	0 %	25 %	50 %	319768584
22	NC_014916	AGGA	2	8	7892	7899	50 %	0 %	50 %	0 %	319768584
23	NC_014916	TTTC	2	8	8547	8554	0 %	75 %	0 %	25 %	319768584
24	NC_014916	TTCT	2	8	8715	8722	0 %	75 %	0 %	25 %	319768585
25	NC_014916	AATA	2	8	8939	8946	75 %	25 %	0 %	0 %	319768585
26	NC_014916	GAAA	2	8	8955	8962	75 %	0 %	25 %	0 %	319768585
27	NC_014916	CTTC	2	8	8993	9000	0 %	50 %	0 %	50 %	319768585
28	NC_014916	CTTG	2	8	9278	9285	0 %	50 %	25 %	25 %	319768585
29	NC_014916	GCTT	2	8	9358	9365	0 %	50 %	25 %	25 %	319768585
30	NC_014916	GGTT	2	8	9444	9451	0 %	50 %	50 %	0 %	319768585
31	NC_014916	CATT	2	8	9480	9487	25 %	50 %	0 %	25 %	319768585
32	NC_014916	TTCC	2	8	10112	10119	0 %	50 %	0 %	50 %	319768586
33	NC_014916	TTTC	2	8	10480	10487	0 %	75 %	0 %	25 %	319768586
34	NC_014916	AATT	2	8	10838	10845	50 %	50 %	0 %	0 %	319768586
35	NC_014916	AGTT	2	8	11183	11190	25 %	50 %	25 %	0 %	319768586
36	NC_014916	TCGT	2	8	11424	11431	0 %	50 %	25 %	25 %	319768586
37	NC_014916	TCAT	2	8	12910	12917	25 %	50 %	0 %	25 %	319768587
38	NC_014916	TTGT	2	8	13183	13190	0 %	75 %	25 %	0 %	319768589
39	NC_014916	TCCT	2	8	15649	15656	0 %	50 %	0 %	50 %	319768591
40	NC_014916	GACC	2	8	15773	15780	25 %	0 %	25 %	50 %	319768591
41	NC_014916	ATCC	2	8	16221	16228	25 %	25 %	0 %	50 %	319768591
42	NC_014916	AGAA	2	8	17437	17444	75 %	0 %	25 %	0 %	319768592
43	NC_014916	ATGG	2	8	18539	18546	25 %	25 %	50 %	0 %	319768594
44	NC_014916	TCCA	2	8	19283	19290	25 %	25 %	0 %	50 %	319768594
45	NC_014916	TCAT	2	8	19363	19370	25 %	50 %	0 %	25 %	319768594
46	NC_014916	TGAA	2	8	19432	19439	50 %	25 %	25 %	0 %	319768594
47	NC_014916	CCAT	2	8	20919	20926	25 %	25 %	0 %	50 %	319768595
48	NC_014916	GACG	2	8	21035	21042	25 %	0 %	50 %	25 %	319768595
49	NC_014916	TCAA	2	8	21362	21369	50 %	25 %	0 %	25 %	319768596
50	NC_014916	AGAT	2	8	21371	21378	50 %	25 %	25 %	0 %	319768596
51	NC_014916	GTCC	2	8	21424	21431	0 %	25 %	25 %	50 %	319768596
52	NC_014916	CTTT	2	8	21451	21458	0 %	75 %	0 %	25 %	319768596
53	NC_014916	TTGG	2	8	21480	21487	0 %	50 %	50 %	0 %	319768596
54	NC_014916	GGTC	2	8	21531	21538	0 %	25 %	50 %	25 %	319768596
55	NC_014916	GCTC	2	8	21958	21965	0 %	25 %	25 %	50 %	319768597
56	NC_014916	GGAT	2	8	22654	22661	25 %	25 %	50 %	0 %	319768598
57	NC_014916	GCTT	2	8	23062	23069	0 %	50 %	25 %	25 %	319768598
58	NC_014916	CAGC	2	8	23591	23598	25 %	0 %	25 %	50 %	319768598
59	NC_014916	CATC	2	8	23804	23811	25 %	25 %	0 %	50 %	319768598
60	NC_014916	CCAC	2	8	23870	23877	25 %	0 %	0 %	75 %	319768598
61	NC_014916	CTTG	2	8	23892	23899	0 %	50 %	25 %	25 %	319768598
62	NC_014916	CGAA	2	8	24188	24195	50 %	0 %	25 %	25 %	319768598
63	NC_014916	CATT	2	8	24235	24242	25 %	50 %	0 %	25 %	319768598
64	NC_014916	TAAT	2	8	24672	24679	50 %	50 %	0 %	0 %	319768599
65	NC_014916	ATTC	2	8	25368	25375	25 %	50 %	0 %	25 %	319768600
66	NC_014916	AATA	2	8	25584	25591	75 %	25 %	0 %	0 %	319768600
67	NC_014916	TTCA	2	8	25710	25717	25 %	50 %	0 %	25 %	319768600
68	NC_014916	ATAG	2	8	25797	25804	50 %	25 %	25 %	0 %	319768600
69	NC_014916	GCCT	2	8	27953	27960	0 %	25 %	25 %	50 %	319768601
70	NC_014916	TCGA	2	8	28268	28275	25 %	25 %	25 %	25 %	319768601
71	NC_014916	ACTG	2	8	29869	29876	25 %	25 %	25 %	25 %	319768602
72	NC_014916	CTTT	2	8	30011	30018	0 %	75 %	0 %	25 %	319768602
73	NC_014916	TCAA	2	8	30573	30580	50 %	25 %	0 %	25 %	319768603
74	NC_014916	GTGG	2	8	30966	30973	0 %	25 %	75 %	0 %	319768603
75	NC_014916	CTGT	2	8	31057	31064	0 %	50 %	25 %	25 %	319768603
76	NC_014916	TCCA	2	8	32275	32282	25 %	25 %	0 %	50 %	319768604
77	NC_014916	GGAA	2	8	32789	32796	50 %	0 %	50 %	0 %	319768604
78	NC_014916	ATTC	2	8	32997	33004	25 %	50 %	0 %	25 %	319768604
79	NC_014916	TGCT	2	8	33081	33088	0 %	50 %	25 %	25 %	319768604
80	NC_014916	CCAA	2	8	33137	33144	50 %	0 %	0 %	50 %	319768604
81	NC_014916	CATC	2	8	33396	33403	25 %	25 %	0 %	50 %	319768604
82	NC_014916	CTGT	2	8	33923	33930	0 %	50 %	25 %	25 %	319768605
83	NC_014916	CAAT	2	8	34184	34191	50 %	25 %	0 %	25 %	319768605
84	NC_014916	AATT	2	8	35024	35031	50 %	50 %	0 %	0 %	319768605
85	NC_014916	TCCA	2	8	35388	35395	25 %	25 %	0 %	50 %	319768605
86	NC_014916	GATT	2	8	35403	35410	25 %	50 %	25 %	0 %	319768605
87	NC_014916	TAGA	2	8	35554	35561	50 %	25 %	25 %	0 %	319768606
88	NC_014916	TATC	2	8	35755	35762	25 %	50 %	0 %	25 %	319768606
89	NC_014916	AAGC	2	8	35782	35789	50 %	0 %	25 %	25 %	319768606
90	NC_014916	CTTT	2	8	35911	35918	0 %	75 %	0 %	25 %	319768606
91	NC_014916	TATC	2	8	37602	37609	25 %	50 %	0 %	25 %	319768608
92	NC_014916	AGCT	2	8	38255	38262	25 %	25 %	25 %	25 %	319768608
93	NC_014916	TTGC	2	8	38394	38401	0 %	50 %	25 %	25 %	319768608
94	NC_014916	CGGC	2	8	39415	39422	0 %	0 %	50 %	50 %	319768608
95	NC_014916	CTTC	2	8	40066	40073	0 %	50 %	0 %	50 %	319768609
96	NC_014916	TCAT	2	8	40531	40538	25 %	50 %	0 %	25 %	319768610
97	NC_014916	ACGC	2	8	40794	40801	25 %	0 %	25 %	50 %	319768610
98	NC_014916	CTTT	2	8	41932	41939	0 %	75 %	0 %	25 %	319768611
99	NC_014916	GGTT	2	8	42078	42085	0 %	50 %	50 %	0 %	319768611
100	NC_014916	TCGC	2	8	42530	42537	0 %	25 %	25 %	50 %	319768612
101	NC_014916	ACAA	2	8	44222	44229	75 %	0 %	0 %	25 %	319768616
102	NC_014916	GTTC	2	8	44432	44439	0 %	50 %	25 %	25 %	319768617
103	NC_014916	CTGC	2	8	44447	44454	0 %	25 %	25 %	50 %	319768617
104	NC_014916	AATA	2	8	44588	44595	75 %	25 %	0 %	0 %	319768617
105	NC_014916	CCTT	2	8	44695	44702	0 %	50 %	0 %	50 %	319768617

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.