MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Geobacillus sp. Y412MC52 chromosome

Total Repeats: 185

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014915	GTTTTT	2	12	1509	1520	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014915	CGAAGG	2	12	13562	13573	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_014915	TGCGTC	2	12	14086	14097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_014915	CGAAGG	2	12	17222	17233	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_014915	AAGCGA	2	12	23224	23235	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_014915	CGAAGG	2	12	32802	32813	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_014915	CGAAGG	2	12	36364	36375	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014915	ATTTTT	2	12	51133	51144	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014915	TTTGCG	2	12	58869	58880	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_014915	TGCGTC	2	12	93383	93394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_014915	TGCGTC	2	12	93671	93682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_014915	CGAAGG	2	12	96806	96817	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014915	AGTAAG	2	12	97238	97249	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014915	AGTCAA	2	12	97259	97270	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_014915	GTTCCG	2	12	117367	117378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_014915	CGAAGG	2	12	156822	156833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_014915	CGAAGG	2	12	159894	159905	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014915	TTTTGT	2	12	234735	234746	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014915	CGAAGG	2	12	247631	247642	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_014915	CTTTTT	2	12	247957	247968	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_014915	TTCTTT	2	12	258700	258711	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_014915	ATGGGT	2	12	277476	277487	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014915	CGAAGG	2	12	279268	279279	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014915	GGAAAC	2	12	279707	279718	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_014915	GGATAC	2	12	312917	312928	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_014915	AGTAAA	2	12	313476	313487	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014915	TTCGAT	2	12	363658	363669	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_014915	AAAGAA	2	12	402193	402204	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014915	GCATAA	2	12	409165	409176	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014915	TGCAAA	2	12	409577	409588	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_014915	AGACGG	2	12	423887	423898	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_014915	TTAACG	2	12	425586	425597	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_014915	TCAATG	2	12	436930	436941	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_014915	TCATTG	2	12	438797	438808	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_014915	TGACGG	2	12	439921	439932	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_014915	GCCGCT	2	12	463806	463817	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
37	NC_014915	GTTTTT	2	12	485410	485421	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014915	GTTCCA	2	12	498260	498271	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_014915	ATGGAT	2	12	507225	507236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014915	TAATTT	2	12	511243	511254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014915	TGCGTC	2	12	529280	529291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_014915	TGCGTC	2	12	529455	529466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_014915	CGAAGG	2	12	529628	529639	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_014915	CGAAGG	2	12	532822	532833	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_014915	GAAGAG	2	12	534013	534024	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014915	GAAAAT	2	12	556707	556718	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014915	GAAAAG	2	12	562971	562982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014915	AACGAA	2	12	563553	563564	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_014915	GAAAAA	2	12	624993	625004	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014915	TTTCGT	2	12	669571	669582	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_014915	GAAAGA	2	12	677228	677239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014915	GGATAG	2	12	677513	677524	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014915	AGAAAA	2	12	687855	687866	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014915	CTTTTT	2	12	747148	747159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_014915	GAGATG	2	12	747984	747995	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014915	CTTTTC	2	12	785394	785405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_014915	GAGAAA	2	12	807043	807054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014915	GCGGAT	2	12	816452	816463	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_014915	TCCCCG	2	12	829128	829139	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_014915	GAAAAA	2	12	845176	845187	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014915	GTTCAT	2	12	848120	848131	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_014915	GAAAAG	2	12	866736	866747	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014915	ACAGAG	2	12	876574	876585	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_014915	CTGAAA	2	12	881506	881517	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_014915	TTTTCA	2	12	885592	885603	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_014915	ATGGGT	2	12	926763	926774	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014915	TGACTT	2	12	929489	929500	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_014915	AAGGAG	2	12	930556	930567	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014915	GTATCC	2	12	952957	952968	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014915	CTATCG	2	12	988029	988040	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014915	CTTTTT	2	12	991092	991103	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_014915	GGCCTT	2	12	995014	995025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_014915	CCAATT	2	12	995867	995878	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014915	ACAAGC	2	12	1002343	1002354	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014915	GGTGGA	2	12	1004967	1004978	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014915	GCAAGG	2	12	1025516	1025527	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_014915	GGCCAA	2	12	1094213	1094224	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_014915	TCCATT	2	12	1200184	1200195	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_014915	TTTCTT	2	12	1219648	1219659	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_014915	CTCAAA	2	12	1240079	1240090	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_014915	TTTCTT	2	12	1266283	1266294	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_014915	AAAATA	2	12	1274157	1274168	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014915	GTTTTT	2	12	1307421	1307432	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014915	CCCTTA	2	12	1332475	1332486	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_014915	CTTTTC	2	12	1411662	1411673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_014915	CATATA	2	12	1533279	1533290	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_014915	CAAAAA	2	12	1581716	1581727	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_014915	CCGGAA	2	12	1586443	1586454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014915	CAAAAA	2	12	1623279	1623290	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_014915	CGATCG	2	12	1624963	1624974	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_014915	TGCCGC	2	12	1651737	1651748	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
92	NC_014915	TTGTTT	2	12	1652592	1652603	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014915	AAATGG	2	12	1661476	1661487	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014915	GCTCCC	2	12	1694508	1694519	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_014915	AAAGGA	2	12	1703195	1703206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_014915	CTTTTT	2	12	1710514	1710525	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_014915	TGAAAA	2	12	1722646	1722657	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014915	AGAAAA	2	12	1736916	1736927	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_014915	ACGCAA	2	12	1743027	1743038	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_014915	TTTTGG	2	12	1799554	1799565	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014915	TTCCGC	2	12	1833733	1833744	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_014915	GGTAAA	2	12	1849838	1849849	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014915	TTGTTC	2	12	1857034	1857045	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_014915	AGAATA	2	12	1868736	1868747	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014915	TTTGAG	2	12	1877624	1877635	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_014915	CCCGCT	2	12	1958822	1958833	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_014915	TTTCGT	2	12	1995588	1995599	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_014915	ATTGTT	2	12	1995601	1995612	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014915	CTTCGC	2	12	1995847	1995858	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_014915	GTCGGC	2	12	1995892	1995903	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_014915	CAAAAT	2	12	1996375	1996386	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_014915	ACCTCC	2	12	2038510	2038521	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_014915	AAAAGA	2	12	2051265	2051276	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_014915	ATTACC	2	12	2094754	2094765	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_014915	GTAACA	2	12	2137391	2137402	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_014915	GCTGCC	2	12	2152577	2152588	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
117	NC_014915	AGCCTG	2	12	2158334	2158345	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_014915	TTCCAT	2	12	2169266	2169277	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_014915	TGGTTT	2	12	2169298	2169309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_014915	AAGGAT	2	12	2189204	2189215	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_014915	CCTTCG	2	12	2190873	2190884	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
122	NC_014915	ATTTTT	2	12	2202767	2202778	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_014915	TTTGTT	2	12	2214946	2214957	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_014915	AAAAGA	2	12	2223549	2223560	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_014915	GCAAAA	2	12	2344209	2344220	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_014915	CCGCTT	2	12	2375938	2375949	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
127	NC_014915	TTTCCC	2	12	2391425	2391436	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_014915	ATACGT	2	12	2394168	2394179	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_014915	TCGTCT	2	12	2398352	2398363	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_014915	GCCAAG	2	12	2419230	2419241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_014915	CGATGG	2	12	2461284	2461295	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_014915	CGTCTC	2	12	2465989	2466000	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
133	NC_014915	CGATGG	2	12	2466669	2466680	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
134	NC_014915	CATCCA	2	12	2505854	2505865	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
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137	NC_014915	CGGCCG	2	12	2537482	2537493	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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140	NC_014915	TGACTT	2	12	2590945	2590956	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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157	NC_014915	TTTTCT	2	12	3067885	3067896	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.