MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Taylorella equigenitalis MCE9 chromosome

Total Repeats: 49

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014914	TAAAAA	2	12	26168	26179	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014914	CATCCC	2	12	162735	162746	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_014914	AACCCT	2	12	162785	162796	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_014914	TTGTTT	2	12	162911	162922	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014914	TTATAT	2	12	162976	162987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014914	TTGGAT	2	12	241928	241939	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014914	AGAAGC	2	12	242217	242228	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_014914	TTATAA	2	12	261643	261654	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014914	TTTAAG	2	12	287213	287224	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014914	AGCATA	2	12	297264	297275	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_014914	TTAGTT	2	12	299821	299832	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014914	CAATTT	2	12	330744	330755	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014914	TTTTAC	2	12	347953	347964	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_014914	AAAATT	2	12	420802	420813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014914	TTTTAA	2	12	427773	427784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014914	ATAAAA	2	12	459183	459194	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014914	CAATTT	2	12	480849	480860	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_014914	TAAAAA	2	12	488080	488091	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014914	ATTCTC	2	12	531805	531816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_014914	AATTTT	2	12	573214	573225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014914	TACCAT	2	12	580982	580993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_014914	TTTTGT	2	12	601676	601687	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014914	AAAATT	2	12	607812	607823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014914	GTAAAA	2	12	626327	626338	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014914	TATAAA	2	12	639733	639744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014914	TATCTA	2	12	645589	645600	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_014914	GTATTT	2	12	689787	689798	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014914	TGATAA	2	12	699109	699120	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014914	TAGTCA	2	12	730636	730647	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_014914	TATTTT	2	12	766651	766662	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014914	GATGTT	2	12	771045	771056	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014914	AAAATG	2	12	790805	790816	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014914	AATTGT	2	12	803084	803095	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014914	TAGAGA	2	12	824955	824966	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014914	GTAGGA	2	12	865753	865764	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014914	GAAACT	2	12	1018778	1018789	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014914	ATATTC	2	12	1044939	1044950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_014914	CAAAAT	2	12	1183071	1183082	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_014914	TTATTT	2	12	1203355	1203366	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014914	TTTTAA	2	12	1345346	1345357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014914	AAACTT	2	12	1345543	1345554	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_014914	GAAGGG	2	12	1351074	1351085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014914	AAATGA	2	12	1370488	1370499	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014914	AAATTG	2	12	1417217	1417228	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014914	TATATT	2	12	1436535	1436546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014914	TTTAAA	2	12	1443573	1443584	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014914	ATGATA	2	12	1477609	1477620	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014914	ATAAAA	2	12	1481863	1481874	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014914	TCTATT	2	12	1516596	1516607	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.