MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Alicycliphilus denitrificans BC plasmid pALIDE02

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014911	TGTCGG	2	12	3033	3044	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	319765071
2	NC_014911	GCGCTC	2	12	6124	6135	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765073
3	NC_014911	TCGCGG	2	12	6689	6700	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319765073
4	NC_014911	CGGCGA	2	12	7568	7579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319765074
5	NC_014911	GTAGCC	2	12	7617	7628	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319765074
6	NC_014911	GCCACG	2	12	9483	9494	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765075
7	NC_014911	GATGTG	2	12	11668	11679	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	319765076
8	NC_014911	CCTGGG	2	12	14623	14634	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	319765081
9	NC_014911	GCTCCT	2	12	14644	14655	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	319765081
10	NC_014911	GCTGCC	2	12	16700	16711	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765083
11	NC_014911	TCGCCG	2	12	17215	17226	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765084
12	NC_014911	GCAATT	2	12	23992	24003	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_014911	GCTCGC	2	12	28550	28561	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	319765096
14	NC_014911	CGGTGG	2	12	28588	28599	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319765096
15	NC_014911	CAGGCC	2	12	28701	28712	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765096
16	NC_014911	CGAGCG	2	12	28787	28798	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	319765096
17	NC_014911	CGACTC	2	12	29814	29825	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319765097
18	NC_014911	CGCAAA	2	12	30130	30141	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	319765097
19	NC_014911	CGCGAA	2	12	32643	32654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319765102
20	NC_014911	GCCAGT	2	12	33772	33783	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319765102
21	NC_014911	CGCCGA	2	12	33830	33841	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765102
22	NC_014911	GTTCGA	2	12	34577	34588	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	319765102
23	NC_014911	CTTTGA	2	12	39100	39111	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_014911	GATCAA	2	12	43657	43668	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	319765110
25	NC_014911	CTTCAT	2	12	50162	50173	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	319765119
26	NC_014911	TCGCCA	2	12	52736	52747	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319765121
27	NC_014911	CGCCCT	2	12	53525	53536	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	319765122
28	NC_014911	GCCGAC	2	12	56106	56117	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765124
29	NC_014911	CCGGCA	2	12	57542	57553	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765126
30	NC_014911	AGGGCA	2	12	57777	57788	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	319765126
31	NC_014911	TGCCGA	2	12	58086	58097	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	319765126
32	NC_014911	CATCGC	2	12	61412	61423	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319765132
33	NC_014911	GCCGAC	2	12	67102	67113	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765136
34	NC_014911	GGTCGG	2	12	67386	67397	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319765136
35	NC_014911	ACGCCG	2	12	68281	68292	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765137
36	NC_014911	AGCTTA	2	12	72865	72876	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_014911	CCCAGC	2	12	73600	73611	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	319765146
38	NC_014911	CGGTGG	2	12	75399	75410	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	319765148
39	NC_014911	CGACCT	2	12	75835	75846	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	319765149
40	NC_014911	AGCCGC	2	12	77237	77248	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	319765153
41	NC_014911	ACGCCA	2	12	78340	78351	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	319765155

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.